Cyth2

Cyth2
Доступные структуры PDB Поиск ортолога: PDBE RCSB showСписок кодов идентификаторов PDB 1PBV, 1R8M, 1R8Q, 1R8S, 1S9D, 4JMI, 4JMO, 4JWL, 4JXH, 4L5M, 4Z21
Идентификаторы
Псевдонимы	Cyth2 , Arno, CTS18, CTS18.1, PSCD2, PSCD2L, SEC7L, SEC7P-L, Sec7p-Like, Cytohesin 2, цитогезин-2
Внешние идентификаторы	Омим : 602488 ; MGI : 1334255 ; Гомологен : 32116 ; GeneCards : Cyth2 ; OMA : Cyth2 - ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 19 (human) Band 19q13.33 Start 48,469,208 bp End 48,482,314 bp
showМестоположение гена ( мышь ) Chr. Chromosome 7 (mouse) Band 7|7 B3 Start 45,456,061 bp End 45,464,005 bp
showРНК -паттерн экспрессии Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in ganglionic eminence left testis right testis frontal pole right lobe of thyroid gland left lobe of thyroid gland paraflocculus of cerebellum Brodmann area 10 middle frontal gyrus ventricular zone Top expressed in neural layer of retina ganglionic eminence medial ganglionic eminence ventricular zone dentate gyrus of hippocampal formation granule cell neural tube spermatid seminiferous tubule superior frontal gyrus granulocyte More reference expression data BioGPS More reference expression data
showДжин Онтология Molecular function inositol 1,4,5 trisphosphate binding protein binding guanyl-nucleotide exchange factor activity lipid binding Cellular component cytoplasm growth cone plasma membrane cell projection membrane Golgi membrane cytosol adherens junction bicellular tight junction cell junction Biological process regulation of ARF protein signal transduction endocytosis actin cytoskeleton organization Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 9266 19158 Набор ENSG00000105443 Ensmusg00000003269 Uniprot Q99418 P63034 Refseq (мРНК) NM_004228 NM_017457 NM_001112701 NM_011181 Refseq (белок) NP_004219 NP_059431 NP_001106171 NP_035311 Расположение (UCSC) Chr 19: 48,47 - 48,48 МБ Chr 7: 45,46 - 45,46 МБ PubMed Search
Викидид
Посмотреть/редактировать человека Посмотреть/редактировать мышь

Цитогезин-2 -это белок , который у людей кодируется Cyth2 геном .

Функция

Цитогезин-2 (Cyth2), ранее известный как гомология Pleckstrin, SEC7 и домены катушки/катушки 2 (PSCD2), является членом семейства цитогезинов. Члены этого семейства имеют идентичную структурную организацию, которая состоит из N-концевой мотивы с спиральной катушкой, центрального домена Sec7 и C-концевой гомологии Pleckstrin (PH). Мотив спиральной катушки участвует в гомодимеризации, домен SEC7 содержит активность белка (GEP) гуанино-нуклеотид (GEP), а домен pH взаимодействует с фосфолипидами и отвечает за ассоциацию цитов с мембранами. Члены этой семьи, по -видимому, опосредуют регуляцию сортировки белка и переноса мембран. CYTH2 демонстрирует активность GEP in vitro с ARF1, ARF3 и ARF6. Белок Cyth2 составляет 83% гомологичен Cyth1. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.

Взаимодействия

Было показано, что Cyth2 взаимодействует с Arrestin Beta 2 и Arrestin Beta 1 .

Дальнейшее чтение

• Meacci E, Tsai SC, Adamik R, Moss J, Vaughan M (1997). «Цитогезин-1, цитозольный белок гуанинового нуклеотида-обмена для фактора ADP-рибозилирования» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 94 (5): 1745–8. Bibcode : 1997pnas ... 94.1745M . doi : 10.1073/pnas.94.5.1745 . PMC   19987 . PMID   9050849 .
• Фрэнк С., Упдер С., Хансен Ш.Х., Казанова Дж. (1998). «Arno является фактором обмена нуклеотидов гуанина для фактора ADP-рибозилирования 6» . Дж. Биол. Химический ​ 273 (1): 23–7. doi : 10.1074/jbc.273.1.23 . PMID   9417041 .
• Mossessova E, Gulbis JM, Goldberg J (1998). «Структура гуанинового нуклеотидного фактора обмена SEC7 домен ARNO человека и анализ взаимодействия с ARF GTPase» . Клетка . 92 (3): 415–23. doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 80933-2 . PMID   9476900 . S2CID   8093935 .
• Cherfils J, Ménétrey J, Mathieu M, Le Bras G, Robineau S, Béraud-Dufour S, Antonny B, Chardin P (1998). «Структура домена SEC7 фактора обмена ARF Arno». Природа . 392 (6671): 101–5. Bibcode : 1998natur.392..101c . doi : 10.1038/32210 . PMID   9510256 . S2CID   4334627 .
• Venkateswarlu K, Oatey PB, Tavaré JM, Cullen PJ (1998). «Инсулинозависимая транслокация Arno в плазматическую мембрану адипоцитов требует фосфатидилинозитол 3-киназы» . Карт Биол . 8 (8): 463–6. Bibcode : 1998cbio .... 8..463v . doi : 10.1016/s0960-9822 (98) 70181-2 . PMID   9550703 . S2CID   12974067 .
• Ким Х.С. (1998). «Назначение человеческого гена CTS18.1 PSCD2L к хромосоме 19 полоса Q13 с использованием гибридной панели отображения радиации». Цитогенет. Клеточная генера . 83 (1–2): 43. doi : 10.1159/000015163 . PMID   9925920 . S2CID   31220052 .
• Санти Л.К., Фрэнк С.Р., Хэтфилд Дж.С., Казанова Дж. (1999). «Регуляция нуклеотидного обмена арно с помощью электростатического переключателя домена pH» . Карт Биол . 9 (20): 1173–6. Bibcode : 1999cbio .... 9.1173s . doi : 10.1016/s0960-9822 (00) 80019-6 . PMID   10531036 . S2CID   17664498 .
• Огасавара М., Ким С.К., Адамик Р., Тогава А., Ферранс В.Дж., Такеда К., Кирби М., Мосс Дж., Воган М. (2000). «Сходство в функции и структуре генов цитогезина-4 и цитогезин-1, гуаниновых нуклеотидных белков для факторов ADP-рибозилирования» . Дж. Биол. Химический ​ 275 (5): 3221–30. doi : 10.1074/jbc.275.5.3221 . PMID   10652308 .
• Смит Дж.С., Тачибана I, Пол У, Ли Х.К., Танараджасингам У, Портье Б.П., Уэки К., Рамасвами С., Биллингс С.Дж., Мохренвейзер Х.В., Луи Д.Н., Дженкинс Р.Б. (2000). «Карта транскрипта в области супрессора глиомы в хромосоме 19q-Arm». Геномика . 64 (1): 44–50. doi : 10.1006/geno.1999.6101 . PMID   10708517 .
• Vitale N, Pacheco-Rodriguez G, Ferrans VJ, Riemenschneide W, Moss J, Vaughan M (2000). «Специальная вакансия белка домена цитогезина-1 и экземпляра ADP-рибозилирования домена (AD1) » Дж. Биол. Химический 275 (28): 21331–9 Doi : 10.1074/ jbc.m909642199  10748148PMID
• Macia E, Paris S, Chabre M (2000). «Связывание pH и полибазных С-концевых доменов Arno с фосфоинозитидами и с кислотными липидами». Биохимия . 39 (19): 5893–901. doi : 10.1021/bi992795w . PMID   10801341 .
• Ли Си, Похайдак Б. (2000). «N-концевое нацеливание факторов обмена нуклеотидов гуанина (GEF) для факторов рибозилирования ADP (ARF) на Гольджи». J. Cell Sci . 113 (11): 1883–9. doi : 10.1242/jcs.113.11.1883 . PMID   10806099 .
• Claing A, Chen W, Miller WE, Vitale N, Moss J, Premont RT, Lefkowitz RJ (2001). «Бета-аррестин-опосредованный фактор АДФ-рибозилирования 6 активация 6 и бета-2-адренергический рецептор эндоцитоз» . Дж. Биол. Химический ​ 276 (45): 42509–13. doi : 10.1074/jbc.m108399200 . PMID   11533043 .
• Китано Дж., Кимура К., Ямадзаки Ю., Сода Т, Шигемото Р., Накаджима Ю., Наканиши С. (2002). «Тамалин, белок, содержащий домен PDZ, связывает метаботропное глутаматное рецепторы белкового комплекса группы 1 и цитогезины гунинового нуклеотида цитогезинов» . J. Neurosci . 22 (4): 1280–9. doi : 10.1523/jneurosci.22-04-01280.2002 . PMC   6757580 . PMID   11850456 .
• Mansour M, Lee Sy, Pohajdak B (2002). «N-концевая спиральная катушка домена цитогезина/Arno семейства гуаниновых нуклеотидных обмена взаимодействует с кассом белка для каркасов» . Дж. Биол. Химический ​ 277 (35): 32302–9. doi : 10.1074/jbc.m202898200 . PMID   12052827 .
• Buchet-Poyau K, Mehenni H, Radhakrishna U, Antonarakis SE (2002). «Поиск второго локуса синдрома Пьюц-Джегера: исключение генов STK13, PRKCG, KLK10 и PSCD2 на хромосоме 19 и гена STK11IP на хромосоме 2». Цитогенет. Геном Res . 97 (3–4): 171–8. doi : 10.1159/000066620 . PMID   12438709 . S2CID   36446950 .
• Huh M, Han JH, Lim CS, Lee SH, Kim S, Kim E, Kaang BK (2003). «Регуляция неврагенеза и синаптической передачи с помощью MSEC7-1, фактора обмена нуклеотидов гуанина, в культивируемых нейронах Aplysia» . J. Neurochem . 85 (1): 282–5. doi : 10.1046/j.1471-4159.2003.01718.x . PMID   12641750 . S2CID   35888745 .