ХПО5

ХПО5
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3A6P
Идентификаторы
Псевдонимы	XPO5 , exp5, экспортин 5
Внешние идентификаторы	Опустить : 607845 ; МГИ : 1913789 ; Гомологен : 69316 ; Генные карты : XPO5 ; ОМА : XPO5 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	43,576,038 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	46,554,524 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	gonad; ; skin of arm; ; testicle; ; left testis; ; right testis; ; body of pancreas; ; ganglionic eminence; ; ventricular zone; ; bone marrow cells; ; skin of leg;
	Top expressed in
	gallbladder; ; superior surface of tongue; ; tail of embryo; ; epiblast; ; mandibular prominence; ; maxillary prominence; ; interventricular septum; ; genital tubercle; ; ventricular zone; ; spermatocyte;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	tRNA binding; mRNA binding; protein binding; RNA binding; nuclear export signal receptor activity; pre-miRNA binding;
Cellular component	cytoplasm; RNA nuclear export complex; nucleus; nucleoplasm; cytosol; nuclear RNA export factor complex;
Biological process	protein export from nucleus; positive regulation of RNA interference; protein transport; intracellular protein transport; miRNA metabolic process; gene silencing; regulation of protein export from nucleus; pre-miRNA export from nucleus; transport; nuclear export;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	57510
	72322
	ENSG00000124571
	ENSMUSG00000067150
	Q9HAV4
	Q924C1
	НМ_020750
	НМ_028198
	НП_065801
	НП_082474
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Экспортин-5 ( XPO5 ) — это белок , который у человека кодируется XPO5 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} В эукариотических клетках основной целью XPO5 является экспорт пре-микроРНК (также известной как пре-миРНК) из ядра в цитоплазму для дальнейшей обработки ферментом Dicer . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]} Попав в цитоплазму, микроРНК (также известная как микроРНК) может действовать как глушитель генов, трансляцию мРНК регулируя . Хотя XPO5 в первую очередь участвует в транспортировке пре-миРНК , сообщалось также, что он транспортирует тРНК . ^{[ 12 ]}

Многие исследования XPO5 продолжаются. МикроРНК является важной темой исследований из-за ее потенциального использования в качестве терапевтического средства, при этом уже используется несколько препаратов на основе микроРНК. ^{[ 13 ]}

Механизм

Связывание с пре-миРНК

После того, как RanGTP связывается с XPO5, комплекс XPO5-RanGTP образует U-подобную структуру, удерживающую пре-миРНК. Комплекс XPO5-RanGTP узнает пре-микроРНК по ее двухнуклеотидному 3'-выступлению — последовательности, состоящей из двух оснований на 3'-конце пре-микроРНК, которые не спарены с другими основаниями. Этот мотив уникален для пре-микроРНК, и, распознавая его, XPO5 обеспечивает специфичность транспортировки только пре-миРНК. Сама по себе пре-миРНК находится в «закрытой» конформации, с 3'-концом, перевернутым вверх по направлению к малой бороздке РНК . Однако при связывании с XPO5 3'-выступ переворачивается вниз от остальной части молекулы пре-миРНК в «открытую» конформацию. Это помогает фосфатам основной цепи этих двух нуклеотидов образовывать водородные связи со многими остатками XPO5, позволяя XPO5 распознавать РНК как пре-миРНК. Поскольку эти взаимодействия затрагивают только фосфатный остов РНК, они неспецифичны и позволяют XPO5 распознавать и транспортировать любую пре-миРНК. Остальная часть ствола пре-микроРНК связывается с XPO5 посредством взаимодействий между отрицательно заряженным фосфатным остовом и несколькими положительно заряженными внутренними остатками XPO5. ^{[ 15 ]}

XPO5 Тройной комплексный транспортный механизм

Объединенная структура XPO5, RanGTP и пре-миРНК известна как тройной комплекс . Как только тройной комплекс сформирован, он диффундирует через комплекс ядерных пор в цитоплазму, транспортируя при этом пре-миРНК в цитоплазму. Попав в цитоплазму, RanGAP гидролизует GTP до GDP, вызывая конформационные изменения, которые высвобождают пре-миРНК в цитоплазму. ^{[ 15 ]}

Экспорт из ядра

На основании данных, представленных контурными картами плотности воды, было высказано предположение, что внутренняя часть XPO5 гидрофильна , а внешняя часть XPO5 гидрофобна . ^{[ 15 ]} Таким образом, это увеличивает возможности связывания XPO5 с комплексом ядерных пор, позволяя транспортировать тройной комплекс из ядра. ^{[ 15 ]}

Дополнительные взаимодействия

Было показано, что XPO5 взаимодействует с ILF3. ^{[ 5 ]} и Ран . ^{[ 5 ]}

Потенциальная онкогенная роль

Недавние данные показали более высокие уровни XPO5 в клеточных линиях рака простаты in vitro, что позволяет предположить, что измененные уровни экспрессии XPO5 могут играть роль в развитии рака. Также было обнаружено, что подавление XPO5 является терапевтическим in vitro. ^{[ 16 ]} Также было показано, что он действует как онкоген при колоректальном раке. ^{[ 17 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000124571 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000067150 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Браунуэлл А.М., Макара И.Г. (январь 2002 г.). «Экспортин-5, новый кариоферин, опосредует ядерный экспорт белков, связывающих двухцепочечную РНК» . Журнал клеточной биологии . 156 (1): 53–64. дои : 10.1083/jcb.200110082 . ПМК 2173575 . ПМИД 11777942 .
^ Бонсак М.Т., Регенер К., Шваппах Б., Саффрик Р., Параскева Е., Хартманн Е., Герлих Д. (ноябрь 2002 г.). «Exp5 экспортирует eEF1A через тРНК из ядер и взаимодействует с другими транспортными путями, ограничивая трансляцию цитоплазмой» . Журнал ЭМБО . 21 (22): 6205–15. дои : 10.1093/emboj/cdf613 . ПМК 137205 . ПМИД 12426392 .
^ «Ген Энтрез: экспортин XPO5 5» .
^ Йи Р., Цинь Ю., Макара И.Г., Каллен Б.Р. (декабрь 2003 г.). «Экспортин-5 опосредует ядерный экспорт пре-микроРНК и коротких шпилечных РНК» . Гены и развитие . 17 (24): 3011–6. дои : 10.1101/gad.1158803 . ПМК 305252 . ПМИД 14681208 .
^ Уилсон Р.К., Дудна Дж.А. (2013). «Молекулярные механизмы РНК-интерференции» . Ежегодный обзор биофизики . 42 : 217–39. doi : 10.1146/annurev-biophys-083012-130404 . ПМЦ 5895182 . ПМИД 23654304 .
^ Сиоми Х, Сиоми MC (май 2010 г.). «Посттранскрипционная регуляция биогенеза микроРНК у животных» . Молекулярная клетка . 38 (3): 323–32. doi : 10.1016/j.molcel.2010.03.013 . ПМИД 20471939 .
^ Масиас С., Кординер Р.А., Касерес Х.Ф. (август 2013 г.). «Клеточные функции микропроцессора». Труды Биохимического общества . 41 (4): 838–43. дои : 10.1042/BST20130011 . hdl : 1842/25877 . ПМИД 23863141 .
^ Гупта, Асмита (2016). «Понимание структурной динамики нуклеоцитоплазматического транспорта тРНК с помощью экспортина-т» . Биофизический журнал . 110 (6): 1264–1279. Бибкод : 2016BpJ...110.1264G . дои : 10.1016/j.bpj.2016.02.015 . ПМЦ 4816717 . ПМИД 27028637 .
^ Кристофер, Аджай Фрэнсис; Каур, Раман Прит; Каур, Ганприт; Каур, Амандип; Гупта, Викас; Бансал, Парвин (2016). «Терапия микроРНК: открытие новых целей и разработка специфической терапии» . Перспективы клинических исследований . 7 (2): 68–74. дои : 10.4103/2229-3485.179431 . ISSN 2229-3485 . ПМЦ 4840794 . ПМИД 27141472 .
^ Окада, Чимари; Ямасита, Эйки; Ли, Су Джэ; Сибата, Сатоши; Катахира, Джун; Накагава, Ацуши; Йонеда, Ёсихиро; Цукихара, Томитаке (27 ноября 2009 г.). «Структура высокого разрешения механизма ядерного экспорта пре-микроРНК». Наука . 326 (5957): 1275–1279. Бибкод : 2009Sci...326.1275O . дои : 10.1126/science.1178705 . ISSN 1095-9203 . ПМИД 19965479 . S2CID 206522317 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Ван, Ся (2011). «Динамические механизмы связывания и экспорта пре-миРНК экспортином-5» . РНК . 17 (8): 1516–1517. дои : 10.1261/rna.2732611 . ПМК 3153975 . ПМИД 21712399 .
^ Хоти, Насеруддин; Ян, Шуан; Айетан, Пол; Кумар, Бинод; Ху, Инвэй; Кларк, Дэвид; Эроглу, Арифе Унал; Шах, Пунит; Джонсон, Тамара (04 сентября 2017 г.). «Сверхэкспрессия экспортина-5 подавляет ингибирующий эффект контроля регуляции микроРНК и стабилизации белков посредством посттрансляционных модификаций при раке простаты» . Неоплазия (Нью-Йорк, штат Нью-Йорк) . 19 (10): 817–829. дои : 10.1016/j.neo.2017.07.008 . ISSN 1522-8002 . ПМЦ 5587889 . ПМИД 28881308 .
^ Сигэясу, Кунитоши; Окугава, Ёсинага; Тоден, Сюсуке; Боланд, К. Ричард; Гоэл, Аджай (01 марта 2017 г.). «Функции экспортина-5 как онкогена и потенциальной терапевтической мишени при колоректальном раке» . Клинические исследования рака . 23 (5): 1312–1322. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-16-1023 . ISSN 1557-3265 . ПМЦ 5435115 . ПМИД 27553833 .

Дальнейшее чтение

Каладо А., Трейхель Н., Мюллер ЕС, Отто А., Кутай У. (ноябрь 2002 г.). «Экспортин-5-опосредованный ядерный экспорт эукариотического фактора элонгации 1А и тРНК» . Журнал ЭМБО . 21 (22): 6216–24. дои : 10.1093/emboj/cdf620 . ПМК 137209 . ПМИД 12426393 .
Гвиздек С., Оссаре-Назари Б., Браунуэлл А.М., Доглио А., Бертран Э., Макара И.Г., Даржемонт С. (февраль 2003 г.). «Экспортин-5 опосредует ядерный экспорт РНК, содержащих миниспираль» . Журнал биологической химии . 278 (8): 5505–8. дои : 10.1074/jbc.C200668200 . ПМИД 12509441 .
Гвиздек С., Оссаре-Назари Б., Браунуэлл А.М., Эверс С., Макара И.Г., Даргемонт С. (январь 2004 г.). «Миниспиральные РНК опосредуют экспортин-5-зависимый ядерный экспорт двухцепочечного РНК-связывающего белка ILF3» . Журнал биологической химии . 279 (2): 884–91. дои : 10.1074/jbc.M306808200 . ПМИД 14570900 .
Лунд Э., Гюттингер С., Каладо А., Дальберг Дж.Э., Кутай У. (январь 2004 г.). «Ядерный экспорт предшественников микроРНК» . Наука . 303 (5654): 95–8. Бибкод : 2004Sci...303...95L . дои : 10.1126/science.1090599 . ПМИД 14631048 . S2CID 30217099 .
Бонсак М.Т., Чаплински К., Горлич Д. (февраль 2004 г.). «Экспортин 5 представляет собой RanGTP-зависимый белок, связывающий дцРНК, который опосредует ядерный экспорт пре-миРНК» . РНК . 10 (2): 185–91. дои : 10.1261/rna.5167604 . ПМК 1370530 . ПМИД 14730017 .
Чен Т., Браунуэлл А.М., Макара И.Г. (август 2004 г.). «Нуклеоцитоплазматическое перемещение JAZ, нового белка-груза для экспортина-5» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (15): 6608–19. дои : 10.1128/MCB.24.15.6608-6619.2004 . ПМЦ 444848 . ПМИД 15254228 .
Йи Р., Доул Б.П., Цинь Ю., Макара И.Г., Каллен Б.Р. (февраль 2005 г.). «Сверхэкспрессия экспортина 5 усиливает интерференцию РНК, опосредованную короткими шпилечными РНК и микроРНК» . РНК . 11 (2): 220–6. дои : 10.1261/rna.7233305 . ПМК 1370710 . ПМИД 15613540 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000124571 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000067150 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11777942-5] Jump up to: ^а ^б ^с Браунуэлл А.М., Макара И.Г. (январь 2002 г.). «Экспортин-5, новый кариоферин, опосредует ядерный экспорт белков, связывающих двухцепочечную РНК» . Журнал клеточной биологии . 156 (1): 53–64. дои : 10.1083/jcb.200110082 . ПМК 2173575 . ПМИД 11777942 .

[pmid12426392-6] Бонсак М.Т., Регенер К., Шваппах Б., Саффрик Р., Параскева Е., Хартманн Е., Герлих Д. (ноябрь 2002 г.). «Exp5 экспортирует eEF1A через тРНК из ядер и взаимодействует с другими транспортными путями, ограничивая трансляцию цитоплазмой» . Журнал ЭМБО . 21 (22): 6205–15. дои : 10.1093/emboj/cdf613 . ПМК 137205 . ПМИД 12426392 .

[entrez-7] «Ген Энтрез: экспортин XPO5 5» .

[yi-8] Йи Р., Цинь Ю., Макара И.Г., Каллен Б.Р. (декабрь 2003 г.). «Экспортин-5 опосредует ядерный экспорт пре-микроРНК и коротких шпилечных РНК» . Гены и развитие . 17 (24): 3011–6. дои : 10.1101/gad.1158803 . ПМК 305252 . ПМИД 14681208 .

[wilson-9] Уилсон Р.К., Дудна Дж.А. (2013). «Молекулярные механизмы РНК-интерференции» . Ежегодный обзор биофизики . 42 : 217–39. doi : 10.1146/annurev-biophys-083012-130404 . ПМЦ 5895182 . ПМИД 23654304 .

[siomi-10] Сиоми Х, Сиоми MC (май 2010 г.). «Посттранскрипционная регуляция биогенеза микроРНК у животных» . Молекулярная клетка . 38 (3): 323–32. doi : 10.1016/j.molcel.2010.03.013 . ПМИД 20471939 .

[macias-11] Масиас С., Кординер Р.А., Касерес Х.Ф. (август 2013 г.). «Клеточные функции микропроцессора». Труды Биохимического общества . 41 (4): 838–43. дои : 10.1042/BST20130011 . hdl : 1842/25877 . ПМИД 23863141 .

[12] Гупта, Асмита (2016). «Понимание структурной динамики нуклеоцитоплазматического транспорта тРНК с помощью экспортина-т» . Биофизический журнал . 110 (6): 1264–1279. Бибкод : 2016BpJ...110.1264G . дои : 10.1016/j.bpj.2016.02.015 . ПМЦ 4816717 . ПМИД 27028637 .

[13] Кристофер, Аджай Фрэнсис; Каур, Раман Прит; Каур, Ганприт; Каур, Амандип; Гупта, Викас; Бансал, Парвин (2016). «Терапия микроРНК: открытие новых целей и разработка специфической терапии» . Перспективы клинических исследований . 7 (2): 68–74. дои : 10.4103/2229-3485.179431 . ISSN 2229-3485 . ПМЦ 4840794 . ПМИД 27141472 .

[:1-14] Окада, Чимари; Ямасита, Эйки; Ли, Су Джэ; Сибата, Сатоши; Катахира, Джун; Накагава, Ацуши; Йонеда, Ёсихиро; Цукихара, Томитаке (27 ноября 2009 г.). «Структура высокого разрешения механизма ядерного экспорта пре-микроРНК». Наука . 326 (5957): 1275–1279. Бибкод : 2009Sci...326.1275O . дои : 10.1126/science.1178705 . ISSN 1095-9203 . ПМИД 19965479 . S2CID 206522317 .

[:0-15] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Ван, Ся (2011). «Динамические механизмы связывания и экспорта пре-миРНК экспортином-5» . РНК . 17 (8): 1516–1517. дои : 10.1261/rna.2732611 . ПМК 3153975 . ПМИД 21712399 .

[16] Хоти, Насеруддин; Ян, Шуан; Айетан, Пол; Кумар, Бинод; Ху, Инвэй; Кларк, Дэвид; Эроглу, Арифе Унал; Шах, Пунит; Джонсон, Тамара (04 сентября 2017 г.). «Сверхэкспрессия экспортина-5 подавляет ингибирующий эффект контроля регуляции микроРНК и стабилизации белков посредством посттрансляционных модификаций при раке простаты» . Неоплазия (Нью-Йорк, штат Нью-Йорк) . 19 (10): 817–829. дои : 10.1016/j.neo.2017.07.008 . ISSN 1522-8002 . ПМЦ 5587889 . ПМИД 28881308 .

[17] Сигэясу, Кунитоши; Окугава, Ёсинага; Тоден, Сюсуке; Боланд, К. Ричард; Гоэл, Аджай (01 марта 2017 г.). «Функции экспортина-5 как онкогена и потенциальной терапевтической мишени при колоректальном раке» . Клинические исследования рака . 23 (5): 1312–1322. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-16-1023 . ISSN 1557-3265 . ПМЦ 5435115 . ПМИД 27553833 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]