НУДТ21

НУДТ21
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2CL3, 2J8Q, 3BAP, 3BHO, 3MDG, 3MDI, 3N9U, 3P5T, 3P6Y, 3Q2S, 3Q2T
Идентификаторы
Псевдонимы	NUDT21 , CFIM25, CPSF5, гидролаза нудикса 21
Внешние идентификаторы	Опустить : 604978 ; МГИ : 1915469 ; Гомологен : 5090 ; GeneCards : NUDT21 ; OMA : NUDT21 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 16 (human)
End	56,452,199 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 8 (mouse)
End	94,763,659 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	gonad; ; ganglionic eminence; ; ventricular zone; ; pons; ; caput epididymis; ; left testis; ; germinal epithelium; ; superior vestibular nucleus; ; Achilles tendon; ; right testis;
	Top expressed in
	superior cervical ganglion; ; spermatocyte; ; ventricular zone; ; spermatid; ; embryo; ; yolk sac; ; hand; ; embryo; ; ganglionic eminence; ; tail of embryo;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein homodimerization activity; histone deacetylase binding; protein binding; mRNA binding; hydrolase activity; RNA binding; identical protein binding; chromatin binding; mRNA 3'-UTR AU-rich region binding;
Cellular component	paraspeckles; centrosome; nucleoplasm; microtubule organizing center; mRNA cleavage factor complex; nucleus; nuclear body; cytoplasm; mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex;
Biological process	mRNA splicing, via spliceosome; termination of RNA polymerase II transcription; protein tetramerization; mRNA 3'-end processing; mRNA polyadenylation; mRNA processing; posttranscriptional regulation of gene expression; cell differentiation; positive regulation of mRNA cleavage; protein heterotetramerization; pre-mRNA cleavage required for polyadenylation; mRNA alternative polyadenylation; positive regulation of mRNA polyadenylation; messenger ribonucleoprotein complex assembly; positive regulation of stem cell differentiation; positive regulation of pro-B cell differentiation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	11051
	68219
	ENSG00000167005
	ENSMUSG00000031754
	О43809
	Q9CQF3
	НМ_007006
	НМ_026623
	НП_008937
	НП_080899
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Субъединица 5 фактора специфичности расщепления и полиаденилирования ( CPSF5 ) представляет собой фермент , который у человека кодируется NUDT21 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Он принадлежит к Nudix семейству гидролаз .

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой одну субъединицу комплекса фактора расщепления Im, необходимого для расщепления 3'-РНК и процессинга полиаденилирования. ^{[ 7 ]} Взаимодействие белка с РНК является одним из самых ранних этапов сборки комплекса процессинга 3'-конца и облегчает рекрутирование других факторов процессинга. Этот ген кодирует субъединицу белкового комплекса массой 25 кДа, состоящего из четырех полипептидов. ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000167005 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000031754 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Рюгсеггер Ю, Бланк Д, Келлер В (июль 1998 г.). «Фактор расщепления пре-мРНК человека Im связан со сплайсосомными белками SR и может быть восстановлен in vitro из рекомбинантных субъединиц» . Мол Клетка . 1 (2): 243–53. дои : 10.1016/S1097-2765(00)80025-8 . ПМИД 9659921 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: мотив 21 типа NUDT21 nudix (нуклеозиддифосфат-связанный фрагмент X)» .
^ Харди, Дж. Г.; Норбери, CJ (15 августа 2016 г.). «Фактор расщепления Im (CFIm) как регулятор альтернативного полиаденилирования» . Труды Биохимического общества . 44 (4): 1051–1057. дои : 10.1042/BST20160078 . ПМИД 27528751 . S2CID 206156045 .

Дальнейшее чтение

Рюгсеггер У., Бейер К., Келлер В. (1996). «Очистка и характеристика человеческого фактора расщепления Im, участвующего в процессинге 3'-конца предшественников информационной РНК» . Ж. Биол. Хим . 271 (11): 6107–13. дои : 10.1074/jbc.271.11.6107 . ПМИД 8626397 .
де Врис Х., Рюгсеггер У., Хюбнер В. и др. (2000). «Человеческий фактор расщепления пре-мРНК IIm содержит гомологи дрожжевых белков и соединяет два других фактора расщепления» . ЭМБО Дж . 19 (21): 5895–904. дои : 10.1093/emboj/19.21.5895 . ПМК 305781 . ПМИД 11060040 .
Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш М.А. (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геном Рез . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных кДНК человека, кодирующих белки» . Геном Рез . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК 311072 . ПМИД 11230166 .
Симпсон Дж.К., Велленройтер Р., Пустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, выявленная с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК» . Представитель ЭМБО . 1 (3): 287–92. дои : 10.1093/embo-reports/kvd058 . ПМЦ 1083732 . ПМИД 11256614 .
Ким Х, Ли Ю (2002). «Взаимодействие поли(А)-полимеразы с субъединицей фактора расщепления I массой 25 кДа». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 289 (2): 513–8. дои : 10.1006/bbrc.2001.5992 . ПМИД 11716503 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Авасти С., Алвин Дж. К. (2003). «Ассоциация фактора полиаденилированного расщепления I с мяРНП U1» . РНК . 9 (11): 1400–9. дои : 10.1261/rna.5104603 . ПМК 1287061 . ПМИД 14561889 .
Браун К.М., Гилмартин Г.М. (2004). «Механизм регуляции процессинга 3' пре-мРНК человеческим фактором расщепления Im» . Мол. Клетка . 12 (6): 1467–76. дои : 10.1016/S1097-2765(03)00453-2 . ПМИД 14690600 .
Баумистер Т., Баух А., Раффнер Х. и др. (2004). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Нат. Клеточная Биол . 6 (2): 97–105. дои : 10.1038/ncb1086 . ПМИД 14743216 . S2CID 11683986 .
Деттвайлер С., Арингьери С., Кардинале С. и др. (2005). «Отличные мотивы последовательности в субъединице фактора расщепления Im массой 68 кДа опосредуют связывание РНК, белок-белковые взаимодействия и субклеточную локализацию» (PDF) . Ж. Биол. Хим . 279 (34): 35788–97. дои : 10.1074/jbc.M403927200 . ПМИД 15169763 . S2CID 39752996 .
Ленер Б., Сандерсон К.М. (2004). «Схема белкового взаимодействия для деградации мРНК человека» . Геном Рез . 14 (7): 1315–23. дои : 10.1101/гр.2122004 . ПМК 442147 . ПМИД 15231747 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Виман С., Арлт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геном Рез . 14 (10Б): 2136–44. дои : 10.1101/гр.2576704 . ПМК 528930 . ПМИД 15489336 .
Раш Дж., Мориц А., Ли К.А. и др. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Нат. Биотехнология . 23 (1): 94–101. дои : 10.1038/nbt1046 . ПМИД 15592455 . S2CID 7200157 .
Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Люнг А.К. и др. (2005). «Динамика ядрышкового протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Бибкод : 2005Natur.433...77A . дои : 10.1038/nature03207 . ПМИД 15635413 . S2CID 4344740 .
Стельзл Ю., Ворм Ю., Лаловски М. и др. (2005). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка . 122 (6): 957–68. дои : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . ПМИД 16169070 . S2CID 8235923 .
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Нуклеиновые кислоты Рез . 34 (Проблема с базой данных): D415–8. дои : 10.1093/nar/gkj139 . ПМЦ 1347501 . ПМИД 16381901 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 16 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000167005 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000031754 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9659921-5] Рюгсеггер Ю, Бланк Д, Келлер В (июль 1998 г.). «Фактор расщепления пре-мРНК человека Im связан со сплайсосомными белками SR и может быть восстановлен in vitro из рекомбинантных субъединиц» . Мол Клетка . 1 (2): 243–53. дои : 10.1016/S1097-2765(00)80025-8 . ПМИД 9659921 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: мотив 21 типа NUDT21 nudix (нуклеозиддифосфат-связанный фрагмент X)» .

[Hardy-7] Харди, Дж. Г.; Норбери, CJ (15 августа 2016 г.). «Фактор расщепления Im (CFIm) как регулятор альтернативного полиаденилирования» . Труды Биохимического общества . 44 (4): 1051–1057. дои : 10.1042/BST20160078 . ПМИД 27528751 . S2CID 206156045 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]