Hist1h2be

H2BC6
Доступные структуры PDB Поиск ортолога: PDBE RCSB showСписок кодов идентификаторов PDB 5KGF
Идентификаторы
Псевдонимы	H2BC6 , H2B.H, H2B/H, H2BFH, DJ221C16.8, Гистон кластер 1, H2BE, Гистоновой кластер 1 H2B Member E, Hist1h2be, H2B -кластерный гистон 6, H2BC10, H2BC8, H2BC7, H2BC4.
Внешние идентификаторы	Омим : 602805 ; MGI : 2448403 ; Гомологен : 136773 ; GeneCards : H2BC6 ; OMA : H2BC6 - ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 6 (human) Band 6p22.2 Start 26,172,059 bp End 26,184,655 bp
showМестоположение гена ( мышь ) Chr. Chromosome 13 (mouse) Band 13|13 A3.1 Start 21,899,933 bp End 21,900,313 bp
showРНК -паттерн экспрессии Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in tendon of biceps brachii bone marrow cells right ventricle testicle Achilles tendon oocyte epithelium of colon cartilage tissue thymus internal globus pallidus Top expressed in genital tubercle uterus tail of embryo spermatid bone marrow zygote embryo embryo spermatocyte morula More reference expression data BioGPS n/a
showДжин Онтология Molecular function DNA binding protein binding protein heterodimerization activity identical protein binding Cellular component chromosome nucleosome extracellular exosome nucleus nucleoplasm extracellular space cytosol Biological process nucleosome assembly innate immune response in mucosa defense response to bacterium protein ubiquitination antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 8344 319185 Набор ENSG00000274290 Ensmusg00000094338 Uniprot P62807 P10853 Refseq (мРНК) NM_003523 NM_178199 Refseq (белок) NP_003517 NP_001368918 showNP_835505 NP_00109148 NP_001300809 NP_001104025 NP_001300807 NP_835502 NP_835506 NP_835508 Расположение (UCSC) Chr 6: 26.17 - 26,18 МБ Chr 13: 21,9 - 21,9 МБ PubMed Search
Викидид
Посмотреть/редактировать человека Посмотреть/редактировать мышь

Гистон H2B типа 1-C/E/F/G/I -это белок , который у людей кодируется Hist1h2be геном .

Функция

Гистоны - это основные ядерные белки, которые ответственны за нуклеосомную структуру хромосомного волокна у эукариот . Две молекулы каждого из четырех основных гистонов (H2A, H2B, H3 и H4) образуют октамер, вокруг которого приблизительно 146 п.н. ДНК обернута в повторяющиеся единицы, называемые нуклеосом.

Гистон линкера, H1, взаимодействует с ДНК линкера между нуклеосом и функциями в уплотнении хроматина в структуры более высокого порядка. Этот ген без интрон и кодирует члена семейства гистонов H2B. Транскрипты этого гена не имеют хвостов полиа, но вместо этого содержат палиндромический элемент прекращения. Этот ген обнаружен в кластере большого гена гистон на хромосоме 6.

Дальнейшее чтение

• Ohe Y, Hayashi H, Iwai K (1979). «Гистон -гистон человека H2B. Выделение и аминокислотная последовательность». J. Biochem . 85 (2): 615–24. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a132371 . PMID   422550 .
• Dobner T, Wolf I, Mai B, Lipp M (1992). «Новая дивергентно транскрибированная пара генов человеческого гистона H2A/H2B». ДНК SEQ . 1 (6): 409–13. doi : 10.3109/10425179109020799 . PMID   1768865 .
• Albig W, Doenecke D (1998). «Колстер генов человеческого гена в локусе D6S105». Гул Генет . 101 (3): 284–94. doi : 10.1007/s004390050630 . PMID   9439656 . S2CID   38539096 .
• Эль Харруби А., Пирас Г., Зенсен Р., Мартин М.А. (1998). «Транскрипционная активация интегрированного хроматина, ассоциированного с вирусом иммунодефицита человека, промотора типа 1 типа» . Мол Клетка. Биол . 18 (5): 2535–44. doi : 10.1128/mcb.18.5.2535 . PMC   110633 . PMID   9566873 .
• Deng L, De La Fuente C, Fu P, et al. (2001). «Ацетилирование ВИЧ-1 ТАТ с помощью CBP/P300 увеличивает транскрипцию интегрированного генома ВИЧ-1 и усиливает связывание с основными гистонами» . Вирусология . 277 (2): 278–95. doi : 10.1006/viro.2000.0593 . PMID   11080476 .
• Deng L, Wang D, De La Fuente C, et al. (2001). «Улучшение активности HAT P300 с помощью ВИЧ-1 ТАТ на ДНК хроматина» . Вирусология . 289 (2): 312–26. doi : 10.1006/viro.2001.1129 . PMID   11689053 .
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Генерация и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC   139241 . PMID   12477932 .
• Cheung WL, Ajiro K, Somejima K, et al. (2003). «Апоптотическое фосфорилирование гистона H2B опосредовано стерильной двадцатью киназой млекопитающих» . Клетка . 113 (4): 507–17. doi : 10.1016/s0092-8674 (03) 00355-6 . PMID   12757711 . S2CID   21854 .
• Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK, et al. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы человека 6» . Природа . 425 (6960): 805–11. Bibcode : 2003natur.425..805m . doi : 10.1038/nature02055 . PMID   14574404 .
• Лусич М., Марчелло А., Церето А., Джакка М. (2004). «Регуляция экспрессии гена ВИЧ-1 путем ацетилирования гистонов и рекрутирования фактора на промоторе LTR» . Embo j . 22 (24): 6550–61. doi : 10.1093/emboj/cdg631 . PMC   291826 . PMID   14657027 .
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). «Статус, качество и расширение полноразмерного проекта кДНК NIH: коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Res . 14 (10b): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC   528928 . PMID   15489334 .
• Голебиовский Ф., Каспрзак К.С. (2007). «Ингибирование ацетилирования основных гистонов канцерогенным никелем (II)» . Мол Клетка. Биохимия . 279 (1–2): 133–9. doi : 10.1007/s11010-005-8285-1 . PMID   16283522 . S2CID   25071586 .
• Zhu B, Zheng Y, Pham AD, et al. (2006). «Моноубиквитинирование человеческого гистона H2B: факторы, связанные с факторами и их роль в регуляции гена HOX» . Мол Клетка . 20 (4): 601–11. doi : 10.1016/j.molcel.2005.09.025 . PMID   16307923 .
• Bonenfant D, Coulot M, Towbin H, et al. (2006). «Характеристика вариантов гистона H2A и H2B и их посттрансляционные модификации с помощью масс-спектрометрии» . Мол Клетка. Протеомика . 5 (3): 541–52. doi : 10.1074/mcp.m500288-mcp200 . PMID   16319397 .
• Beck HC, Nielsen EC, Matthiesen R, et al. (2006). «Количественный протеомный анализ посттрансляционных модификаций человеческих гистонов» . Мол Клетка. Протеомика . 5 (7): 1314–25. doi : 10.1074/mcp.m600007-mcp200 . PMID   16627869 .
• Pavri R, Zhu B, Li G, et al. (2006). «Моноубиквитинирование гистона H2B совместно с фактом совместно регулировать удлинение РНК -полимеразой II» . Клетка . 125 (4): 703–17. doi : 10.1016/j.cell.2006.04.029 . PMID   16713563 . S2CID   2614680 .
• Kim SC, Sprung R, Chen Y, et al. (2006). «Субстрат и функциональное разнообразие ацетилирования лизина, выявленное протеомическим обзором» . Мол Клетка . 23 (4): 607–18. doi : 10.1016/j.molcel.2006.06.026 . PMID   16916647 .