S -нитрозилирование
В биохимии - S нитрозилирование — это ковалентное присоединение группы оксида азота ( −NO ) к тиолу цистеина внутри белка с образованием S -нитрозотиола (SNO). S -нитрозилирование играет разнообразную регуляторную роль в бактериях , дрожжах млекопитающих и растениях, а также во всех клетках . [ 1 ] Таким образом, он действует как фундаментальный механизм клеточной передачи сигналов на протяжении всей филогении и отвечает за большую часть биологической активности NO .
S -нитрозилирование точно направлено, [ 2 ] обратимый, [ 3 ] пространственно-временной ограниченный [ 4 ] [ 5 ] и необходим для широкого спектра клеточных реакций, [ 6 ] включая прототипный пример ауторегуляции кровотока, опосредованной эритроцитами , которая необходима для позвоночных . жизни [ 7 ] задействовано несколько химических путей Хотя первоначально считалось, что in vivo , накопленные данные позволяют предположить, что S -нитрозилирование зависит от ферментативной активности, влекущей за собой три класса ферментов ( S -нитрозилазы), которые действуют согласованно, конъюгируя NO с белками, проводя аналогию с убиквитинилированием . [ 8 ] Помимо ферментативной активности, гидрофобность и низкие значения pka также играют ключевую роль в регуляции процесса. [ 6 ] S -нитрозилирование было впервые описано Stamler et al. и предложен в качестве общего механизма контроля функции белков, включая примеры как активной, так и аллостерической регуляции белков эндогенными и экзогенными источниками NO. [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] в биологических системах . Одновременно были описаны окислительно-восстановительные химические механизмы S-нитрозилирования [ 12 ] Важные примеры белков, активность которых, как впоследствии было показано, регулируется посредством S -нитрозилирования, включают глутаматный рецептор NMDA-типа в мозге. [ 13 ] [ 14 ] Аберрантное S -нитрозилирование после стимуляции рецептора NMDA может служить прототипным примером участия S -нитрозилирования в заболевании. [ 15 ] S -нитрозилирование аналогичным образом способствует физиологии и дисфункции сердца, дыхательных путей, скелетных мышц и иммунной системы, отражая широкий спектр функций в клетках и тканях. [ 16 ] [ 17 ] [ 18 ] Подсчитано, что ~70% протеома подвергается S -нитрозилированию, и большинство этих сайтов консервативны. [ 19 ] Известно также, что S -нитрозилирование участвует в патогенезе систем болезни Паркинсона. [ 20 ] S Таким образом, установлено, что -нитрозилирование повсеместно встречается в биологии, поскольку было продемонстрировано, что оно происходит во всех филогенетических царствах. [ 21 ] и был описан как прототип сигнального механизма, основанного на окислительно-восстановительном процессе, [ 22 ]
Денитрозилирование
[ редактировать ]Обратной стороной S -нитрозилирования является денитрозилирование, главным образом процесс, контролируемый ферментами. На сегодняшний день описано множество ферментов, которые делятся на два основных класса, опосредующих денитрозилирование белка и низкомолекулярные SNO соответственно. S- нитрозоглутатионредуктаза (GSNOR) является примером низкомолекулярного класса; ускоряет распад S- нитрозоглутатиона (GSNO) и СНО-белков, находящихся в равновесии с GSNO. Фермент высоко консервативен от бактерий до человека. [ 23 ] Белки, родственные тиоредоксину (Trx), включая Trx1 и 2 у млекопитающих, катализируют прямое денитрозилирование S -нитрозопротеинов. [ 24 ] [ 25 ] [ 26 ] (помимо их роли в транснитрозилировании [ 27 ] ). Аберрантное S -нитрозилирование (и денитрозилирование) связано с множеством заболеваний, включая болезни сердца, [ 18 ] рак и астма [ 28 ] [ 29 ] [ 17 ] а также неврологические расстройства, включая инсульт, [ 30 ] хронические дегенеративные заболевания (например, болезнь Паркинсона и Альцгеймера) [ 31 ] [ 32 ] [ 33 ] и боковой амиотрофический склероз (АЛС). [ 34 ]
Транснитрозилирование
[ редактировать ]Другой интересный аспект S -нитрозилирования включает транснитрозилирование белка белка, которое представляет собой перенос фрагмента NO от SNO к свободным тиолам в другом белке. Тиоредоксин (Txn), протеиндисульфид-оксидоредуктаза цитозоля и каспаза 3 являются хорошим примером того, как транснитрозилирование играет важную роль в регуляции гибели клеток. [ 6 ] Другой пример: структурные изменения гемоглобина млекопитающих в SNO-Hb в условиях истощения кислорода помогают ему связываться с AE1 (анионный обмен, мембранный белок) и, в свою очередь, позже транснитрозилироваться. [ 35 ] Известно, что Cdk5 (нейронально-специфическая киназа) нитрозилируется по цистеину 83 и 157 при различных нейродегенеративных заболеваниях, таких как AD. Этот SNO-Cdk5, в свою очередь, представляет собой нитрозилированный Drp1, нитрозилированную форму которого можно рассматривать как терапевтическую мишень. [ 36 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Ананд П., Стамлер Дж.С. (март 2012 г.). «Ферментативные механизмы, регулирующие S-нитрозилирование белка: последствия для здоровья и болезней» . Журнал молекулярной медицины . 90 (3): 233–244. дои : 10.1007/s00109-012-0878-z . ПМЦ 3379879 . ПМИД 22361849 .
- ^ Сунь Дж., Синь С., Ю. Дж. П., Стамлер Дж. С., Мейснер Г. (сентябрь 2001 г.). «Цистеин-3635 отвечает за модуляцию рианодиновых рецепторов скелетных мышц под действием NO» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (20): 11158–11162. Бибкод : 2001PNAS...9811158S . дои : 10.1073/pnas.201289098 . ПМК 58700 . ПМИД 11562475 .
- ^ Пэджетт CM, Уортон AR (сентябрь 1995 г.). «S-нитрозоглутатион обратимо ингибирует ГАФД путем S-нитрозилирования». Американский журнал физиологии . 269 (3 ч. 1): C739–C749. дои : 10.1152/ajpcell.1995.269.3.C739 . ПМИД 7573405 .
- ^ Фанг М., Джеффри С.Р., Сава А., Йе К., Луо X, Снайдер Ш. (октябрь 2000 г.). «Dexras1: G-белок, специфически связанный с синтазой оксида азота нейронов через CAPON» . Нейрон . 28 (1): 183–193. дои : 10.1016/s0896-6273(00)00095-7 . ПМИД 11086993 . S2CID 10533464 .
- ^ Ивакири И., Сато А., Чаттерджи С., Тоомре Д.К., Чалуни С.М., Фултон Д. и др. (декабрь 2006 г.). «Синтаза оксида азота локально генерирует оксид азота, чтобы регулировать S-нитрозилирование разделенного белка и транспортировку белка» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (52): 19777–19782. Бибкод : 2006PNAS..10319777I . дои : 10.1073/pnas.0605907103 . ПМК 1750883 . ПМИД 17170139 .
- ^ Jump up to: а б с Хесс Д.Т., Мацумото А., Ким СО, Маршалл Х.Э., Стамлер Дж.С. (февраль 2005 г.). «Белок S-нитрозилирование: сфера применения и параметры». Обзоры природы. Молекулярно-клеточная биология . 6 (2): 150–166. дои : 10.1038/nrm1569 . ПМИД 15688001 . S2CID 11676184 .
- ^ Чжан Р., Хесс Д.Т., Цянь З., Хаусладен А., Фонсека Ф., Чаубе Р. и др. (май 2015 г.). «Гемоглобин βCys93 необходим для сердечно-сосудистой функции и комплексного ответа на гипоксию» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 112 (20): 6425–6430. Бибкод : 2015PNAS..112.6425Z . дои : 10.1073/pnas.1502285112 . ПМЦ 4443356 . ПМИД 25810253 .
- ^ Сет Д., Хесс Д.Т., Хаусладен А., Ван Л., Ван Ю.Дж., Стамлер Дж.С. (февраль 2018 г.). «Мультиплексный ферментативный аппарат для S-нитрозилирования клеточных белков» . Молекулярная клетка . 69 (3): 451–464.e6. дои : 10.1016/j.molcel.2017.12.025 . ПМЦ 5999318 . ПМИД 29358078 .
- ^ Стамлер Дж.С., Саймон Д.И., Осборн Дж.А., Маллинз М.Е., Джараки О., Мишель Т. и др. (январь 1992 г.). «S-нитрозилирование белков оксидом азота: синтез и характеристика биологически активных соединений» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 89 (1): 444–448. Бибкод : 1992PNAS...89..444S . дои : 10.1073/pnas.89.1.444 . ПМЦ 48254 . ПМИД 1346070 .
- ^ Стамлер Дж.С., Саймон Д.И., Джараки О., Осборн Дж.А., Фрэнсис С., Маллинз М. и др. (сентябрь 1992 г.). «S-нитрозилирование тканевого активатора плазминогена придает ферменту сосудорасширяющие и антиагрегантные свойства» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 89 (17): 8087–8091. Бибкод : 1992PNAS...89.8087S . дои : 10.1073/pnas.89.17.8087 . ПМК 49861 . ПМИД 1325644 .
- ^ Стамлер Дж.С., Саймон Д.И., Осборн Дж.А., Маллинз М., Хараки О., Мишель Т., Сингел Д., Лоскальцо Дж. (1992). «Сравнение свойств оксида азота». В Монкада С., Марлетта М.А., Хиббс Дж.Б. (ред.). Биология оксида азота: материалы 2-го Международного совещания по биологии оксида азота, Лондон . Лондон: Портленд Пресс. стр. 20–23. OCLC 29356699 .
- ^ Стамлер Дж. С., Сингел DJ, Лоскальцо Дж. (декабрь 1992 г.). «Биохимия оксида азота и его окислительно-восстановительных форм». Наука . 258 (5090): 1898–1902. Бибкод : 1992Sci...258.1898S . дои : 10.1126/science.1281928 . ПМИД 1281928 .
- ^ Лей С.З., Пан Ж.Х., Аггарвал С.К., Чен Х.С., Хартман Дж., Сучер, Нью-Джерси, Липтон С.А. (июнь 1992 г.). «Влияние продукции оксида азота на окислительно-восстановительный участок комплекса рецептор-канал NMDA». Нейрон . 8 (6): 1087–1099. дои : 10.1016/0896-6273(92)90130-6 . ПМИД 1376999 . S2CID 24701634 .
- ^ Липтон С.А., Чой Ю.Б., Пан Ж.Х., Лей С.З., Чен Х.С., Сучер Н.Дж. и др. (август 1993 г.). «Окислительно-восстановительный механизм нейропротекторного и нейродеструктивного действия оксида азота и родственных нитрозосоединений». Природа . 364 (6438): 626–632. Бибкод : 1993Natur.364..626L . дои : 10.1038/364626a0 . ПМИД 8394509 . S2CID 4355073 .
- ^ Накамура Т., Приходько О.А., Пири Э., Нагар С., Ахтар М.В., О К.К. и др. (декабрь 2015 г.). «Аберрантное S-нитрозилирование белка способствует патофизиологии нейродегенеративных заболеваний» . Нейробиология болезней . 84 : 99–108. дои : 10.1016/j.nbd.2015.03.017 . ПМЦ 4575233 . ПМИД 25796565 .
- ^ Стамлер Дж.С., Sun QA, Hess DT (апрель 2008 г.). «Буря СНО в скелетных мышцах» . Клетка . 133 (1): 33–35. дои : 10.1016/j.cell.2008.03.013 . ПМИД 18394987 . S2CID 15149572 .
- ^ Jump up to: а б Фостер М.В., Хесс Д.Т., Стамлер Дж.С. (сентябрь 2009 г.). «S-нитрозилирование белка в здоровье и болезни: современная перспектива» . Тенденции молекулярной медицины . 15 (9): 391–404. doi : 10.1016/j.molmed.2009.06.007 . ПМК 3106339 . ПМИД 19726230 .
- ^ Jump up to: а б Бёв А., Ву С., Цуй С., Лю Т., Джайн М.Р., Хуан С. и др. (апрель 2016 г.). «Идентификация новых сайтов S-нитрозирования в растворимой гуанилилциклазе, рецепторе оксида азота» . Журнал протеомики . 138 : 40–47. дои : 10.1016/j.jprot.2016.02.009 . ПМК 5066868 . ПМИД 26917471 .
- ^ Стомберски CT, Hess DT, Stamler JS (апрель 2019 г.). «S-нитрозилирование белка: детерминанты специфичности и ферментативной регуляции передачи сигналов на основе S-нитрозотиола» . Антиоксиданты и окислительно-восстановительная сигнализация . 30 (10): 1331–1351. дои : 10.1089/ars.2017.7403 . ПМК 6391618 . ПМИД 29130312 .
- ^ Сиркар Э., Рай С.Р., Уилсон М.А., Шлоссмахер М.Г., Сенгупта Р. (июнь 2021 г.). «Нейродегенерация: влияние S-нитрозилированного Паркина, DJ-1 и PINK1 на патогенез болезни Паркинсона». Архив биохимии и биофизики . 704 : 108869. doi : 10.1016/j.abb.2021.108869 . ПМИД 33819447 . S2CID 233036980 .
- ^ Сет Д., Хаусладен А., Ван Ю.Дж., Стамлер Дж.С. (апрель 2012 г.). «Эндогенный белок S-нитрозилирование в E. coli: регуляция с помощью OxyR» . Наука . 336 (6080): 470–473. Бибкод : 2012Sci...336..470S . дои : 10.1126/science.1215643 . ПМЦ 3837355 . ПМИД 22539721 .
- ^ Дерахшан Б., Хао Г., Гросс СС (июль 2007 г.). «Баланс реактивности и селективности: эволюция S-нитрозилирования белка как эффектора клеточной передачи сигналов оксидом азота» . Сердечно-сосудистые исследования . 75 (2): 210–219. doi : 10.1016/j.cardiores.2007.04.023 . ЧВК 1994943 . ПМИД 17524376 .
- ^ Лю Л., Хаусладен А., Цзэн М., Цюэ Л., Хейтман Дж., Стамлер Дж.С. (март 2001 г.). «Метаболический фермент S-нитрозотиола, сохраняющийся от бактерий до человека». Природа . 410 (6827): 490–494. дои : 10.1038/35068596 . ПМИД 11260719 . S2CID 21280374 .
- ^ Стояновский Д.А., Тюрина Ю.Ю., Тюрин В.А., Ананд Д., Мандавия Д.Н., Гиус Д. и др. (ноябрь 2005 г.). «Тиоредоксин и липоевая кислота катализируют денитрозирование низкомолекулярных и белковых S-нитрозотиолов». Журнал Американского химического общества . 127 (45): 15815–15823. дои : 10.1021/ja0529135 . ПМИД 16277524 .
- ^ Сенгупта Р., Райтер С.В., Цукербраун Б.С., Ценг Э., Биллиар Т.Р., Стояновский Д.А. (июль 2007 г.). «Тиоредоксин катализирует денитрозирование низкомолекулярных масс и белков S-нитрозотиолов». Биохимия . 46 (28): 8472–8483. дои : 10.1021/bi700449x . ПМИД 17580965 .
- ^ Бенхар М., Форрестер М.Т., Хесс Д.Т., Стамлер Дж.С. (май 2008 г.). «Регулируемое денитрозилирование белков цитозольными и митохондриальными тиоредоксинами» . Наука . 320 (5879): 1050–1054. Бибкод : 2008Sci...320.1050B . дои : 10.1126/science.1158265 . ПМЦ 2754768 . ПМИД 18497292 .
- ^ Ву С, Лю Т, Ван Й, Ян Л, Цуй С, Бёв А, Ли Х (2018). «Обработка биотинового переключателя и масс-спектрометрический анализ S-нитрозированного тиоредоксина и мишеней его транснитрозации». Оксид азота . Методы молекулярной биологии. Том. 1747. стр. 253–266. дои : 10.1007/978-1-4939-7695-9_20 . ISBN 978-1-4939-7694-2 . ПМК 7136013 . ПМИД 29600465 .
- ^ Аранда Э., Лопес-Педрера С., Де Ла Хаба-Родригес-младший, Родригес-Ариса А. (январь 2012 г.). «Оксид азота и рак: новая роль S-нитрозилирования». Современная молекулярная медицина . 12 (1): 50–67. дои : 10.2174/156652412798376099 . ПМИД 22082481 .
- ^ Свитцер CH, Глинн С.А., Ченг Р.Я., Риднур Л.А., Грин Дж.Э., Амбс С., Винк Д.А. (сентябрь 2012 г.). «S-нитрозилирование EGFR и Src активирует онкогенную сигнальную сеть при базальноподобном раке молочной железы человека» . Молекулярные исследования рака . 10 (9): 1203–1215. дои : 10.1158/1541-7786.MCR-12-0124 . ПМЦ 3463231 . ПМИД 22878588 .
- ^ Гу З, Каул М, Ян Б, Кридель С.Дж., Цуй Дж., Стронгин А. и др. (август 2002 г.). «S-нитрозилирование матриксных металлопротеиназ: сигнальный путь гибели нейронов». Наука . 297 (5584): 1186–1190. Бибкод : 2002Sci...297.1186G . дои : 10.1126/science.1073634 . ПМИД 12183632 . S2CID 19797348 .
- ^ Яо Д., Гу З., Накамура Т., Ши ЗК, Ма Ю., Гастон Б. и др. (июль 2004 г.). «Нитрозирующий стресс связан со спорадической болезнью Паркинсона: S-нитрозилирование паркина регулирует его активность убиквитинлигазы E3» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (29): 10810–10814. Бибкод : 2004PNAS..10110810Y . дои : 10.1073/pnas.0404161101 . ПМК 490016 . ПМИД 15252205 .
- ^ Уэхара Т., Накамура Т., Яо Д., Ши ZQ, Гу З., Ма Ю. и др. (май 2006 г.). «S-нитрозилированная протеин-дисульфид-изомераза связывает неправильное сворачивание белка с нейродегенерацией». Природа . 441 (7092): 513–517. Бибкод : 2006Natur.441..513U . дои : 10.1038/nature04782 . ПМИД 16724068 . S2CID 4423494 .
- ^ Чо Д.Х., Накамура Т., Фанг Дж., Чеплак П., Годзик А., Гу З., Липтон С.А. (апрель 2009 г.). «S-нитрозилирование Drp1 опосредует связанное с бета-амилоидом деление митохондрий и повреждение нейронов» . Наука . 324 (5923): 102–105. Бибкод : 2009Sci...324..102C . дои : 10.1126/science.1171091 . ПМЦ 2823371 . ПМИД 19342591 .
- ^ Шонхофф С.М., Мацуока М., Туммала Х., Джонсон М.А., Эстевес А.Г., Ву Р. и др. (февраль 2006 г.). «Истощение S-нитрозотиола при боковом амиотрофическом склерозе» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (7): 2404–2409. Бибкод : 2006PNAS..103.2404S . дои : 10.1073/pnas.0507243103 . ПМЦ 1413693 . ПМИД 16461917 .
- ^ Павлоски-младший, Гесс Д.Т., Стамлер Дж.С. (февраль 2001 г.). «Экспорт эритроцитами биологической активности оксида азота». Природа . 409 (6820): 622–626. дои : 10.1038/35054560 . ПМИД 11214321 . S2CID 4387513 .
- ^ Накамура Т., Lipton SA (январь 2013 г.). «Новая роль белок-белкового транснитрозилирования в клеточных сигнальных путях» . Антиоксиданты и окислительно-восстановительная сигнализация . 18 (3): 239–249. дои : 10.1089/ars.2012.4703 . ПМК 3518546 . ПМИД 22657837 .