SF3B14

SF3B6
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	2F9D, 2F9J, 2FHO, 3LQV
Идентификаторы
Псевдонимы	SF3B6 , HSPC175, HT006, P14, SAP14, SAP14A, SF3B14, SF3B14A, CGI-110, Фактор сплайсинга 3B Субъединица 6
Внешние идентификаторы	Омим : 607835 ; MGI : 1913305 ; Гомологен : 9360 ; GeneCards : SF3B6 ; OMA : SF3B6 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	24,076,373 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 12 (mouse)
End	4,877,659 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	skin of arm; ; mucosa of ileum; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; Achilles tendon; ; mucosa of sigmoid colon; ; ganglionic eminence; ; cartilage tissue; ; islet of Langerhans; ; rectum; ; tibialis anterior muscle;
	Top expressed in
	saccule; ; otic placode; ; otic vesicle; ; medial ganglionic eminence; ; transitional epithelium of urinary bladder; ; migratory enteric neural crest cell; ; abdominal wall; ; cervix; ; endocardial cushion; ; ventricular zone;
	More reference expression data
	n/a
showДжин Онтология
Molecular function	nucleic acid binding; RNA binding; protein binding; mRNA binding;
Cellular component	catalytic step 2 spliceosome; U12-type spliceosomal complex; U2-type spliceosomal complex; precatalytic spliceosome; nucleus; U2 snRNP; nucleoplasm; spliceosomal complex;
Biological process	mRNA splicing, via spliceosome; mRNA processing; blastocyst formation; RNA splicing;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	51639
	66055
	ENSG00000115128
	Ensmusg00000037361
	Q9Y3B4
	P59708
	NM_016047
	NM_025323
	NP_057131
	NP_079599
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Фактор сплайсинга 3B, субъединица 14 кДа , также известная как SF3B14 , является человеческим геном . ^{[ 5 ]}

Функция

Этот ген кодирует субъединицу белка 14 кДа комплекса сплайсинга 3B. Фактор сплайсинга 3b ассоциируется с небольшими ядерными рибонуклеопротеиновыми комплексами U2 и U11/U12 (U2 SNRNP) сплицеосом. Этот белок 14 кДа взаимодействует непосредственно с субъединицей 1 комплекса сплайсинга 3B. Этот белок 14 кДа также напрямую взаимодействует с аденозином, который выполняет первую стадию сплайсинга сплайсинга в сайте ветвления до мрны. ^{[ 5 ]}

Взаимодействия

Было показано, что SF3B14 взаимодействует с SF3B1 . ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000115128 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: ENSMUSG00000037361 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: SF3B14 Фактор сплайсинга 3B, 14 кДа субъединица» .
^ Will CL, Schneider C, Macmillan AM, Katopodis NF, Neubauer G, Wilm M, Lührmann R, Query CC (август 2001 г.). «Новый белок U2 и U11/U12 SNRNP, который связывается с сайтом филиала до-мРНК» . Embo j . 20 (16): 4536–46. doi : 10.1093/emboj/20.16.4536 . PMC 125580 . PMID 11500380 .
^ Will Cl, Urlaub H, Achsel T, Gentzel M, Wilm M, Lührmann R (сентябрь 2002 г.). «Характеристика новых белков SF3B и 17S U2 SNRNP, включая гомолог PRP5P человека и белок Dead-Box SF3B» . Embo j . 21 (18): 4978–88. doi : 10.1093/emboj/cdf480 . PMC 126279 . PMID 12234937 .

Дальнейшее чтение

Lai CH, Chou Cy, Chang Ly, Liu CS, Lin W (2000). «Идентификация новых генов человека эволюционно консервативно сохранена у Caenorhabditis elegans по сравнительной протеомике» . Геном Res . 10 (5): 703–13. doi : 10.1101/gr.10.5.703 . PMC 310876 . PMID 10810093 .
Hu RM, Han ZG, Song HD, Peng YD, Huang QH, Ren SX, Gu YJ, Huang CH, Li YB, Jiang CL, Fu G, Zhang QH, Gu BW, Dai M, Mao YF, Gao Gf, Rong R R, Rong R, Rong R, Rong R, Rong R, Rong R, Rong R, Ронг Р. , Ye M, Zhou J, Xu Sh, Gu J, Shi JX, Jin WR, Zhang CK, Wu TM, Huang Gy, Chen Z, Chen MD, Chen JL (2000). «Профилирование экспрессии генов у человеческой гипоталамус-гипофизационной оси и клонирования кДНК в полноразмерной длине» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 97 (17): 9543–8. Bibcode : 2000pnas ... 97.9543H . doi : 10.1073/pnas.160270997 . PMC 16901 . PMID 10931946 .
Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan Hy, Lu G, Zhong M, Xu xr, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (2000). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми кадрами считывания для 300 ранее неопределенных генов, экспрессируемых в CD34+ гемопоэтических стволовых/клетках -предшественниках» . Геном Res . 10 (10): 1546–60. doi : 10.1101/gr.140200 . PMC 310934 . PMID 11042152 .
Харрингтон Дж.Дж., Шерф Б., Рунлетт С., Джексон П.Д., Перри Р., Каин С., Левенталь С., Торнтон М., Рамачандран Р., Уиттингтон Дж., Лернер Л., Костанзо Д., Макллигот , Klika A, Hess J, Cothren K, Lo K, Offenbacher J, Danzig J, Ducar M (2001). «Создание библиотек экспрессии белка в масштабах генома с использованием случайной активации экспрессии генов». НАТ Биотехнол . 19 (5): 440–5. doi : 10.1038/88107 . PMID 11329013 . S2CID 25064683 .
Will CL, Schneider C, Macmillan AM, Katopodis NF, Neubauer G, Wilm M, Lührmann R, Query CC (2001). «Новый белок U2 и U11/U12 SNRNP, который связывается с сайтом филиала до-мРНК» . Embo j . 20 (16): 4536–46. doi : 10.1093/emboj/20.16.4536 . PMC 125580 . PMID 11500380 .
Will CL, Urlaub H, Achsel T, Gentzel M, Wilm M, Lührmann R (2002). «Характеристика новых белков SF3B и 17S U2 SNRNP, включая гомолог PRP5P человека и белок Dead-Box SF3B» . Embo j . 21 (18): 4978–88. doi : 10.1093/emboj/cdf480 . PMC 126279 . PMID 12234937 .
Golas MM, Sander B, Will CL, Lührmann R, Stark H (2003). «Молекулярная архитектура мультипротеинового фактора сплайсинга SF3B». Наука . 300 (5621): 980–4. Bibcode : 2003sci ... 300..980g . doi : 10.1126/science.1084155 . PMID 12738865 . S2CID 31046270 .
Will CL, Schneider C, Hossbach M, Urlaub H, Rauhut R, Elbashir S, Tuschl T, Lührmann R (2004). «Человек 18S U11/U12 SNRNP содержит набор новых белков, не обнаруженных в U2-зависимой сплайсосоме» . РНК . 10 (6): 929–41. doi : 10.1261/rna.7320604 . PMC 1370585 . PMID 15146077 .
Раш Дж., Мориц А., Ли Ка, Го А., Госс В.Л., Спек Э.Дж., Чжан Х., Чжа XM, Полакевич Р.Д., Комп М.Дж. (2005). «Иммуноаффиническое профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». НАТ Биотехнол . 23 (1): 94–101. doi : 10.1038/nbt1046 . PMID 15592455 . S2CID 7200157 .
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (2005). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Bibcode : 2005natur.433 ... 77a . doi : 10.1038/nature03207 . PMID 15635413 . S2CID 4344740 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х, Тейлор П., Клили С., МакБрум-Сираджевский Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарзее М., Хо Й., Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Ducewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). «Крупномасштабное картирование взаимодействия белка белка человека с помощью масс-спектрометрии» . Мол Система Биол . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 2 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000115128 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: ENSMUSG00000037361 - ENSEMBL , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: SF3B14 Фактор сплайсинга 3B, 14 кДа субъединица» .

[pmid11500380-6] Will CL, Schneider C, Macmillan AM, Katopodis NF, Neubauer G, Wilm M, Lührmann R, Query CC (август 2001 г.). «Новый белок U2 и U11/U12 SNRNP, который связывается с сайтом филиала до-мРНК» . Embo j . 20 (16): 4536–46. doi : 10.1093/emboj/20.16.4536 . PMC 125580 . PMID 11500380 .

[pmid12234937-7] Will Cl, Urlaub H, Achsel T, Gentzel M, Wilm M, Lührmann R (сентябрь 2002 г.). «Характеристика новых белков SF3B и 17S U2 SNRNP, включая гомолог PRP5P человека и белок Dead-Box SF3B» . Embo j . 21 (18): 4978–88. doi : 10.1093/emboj/cdf480 . PMC 126279 . PMID 12234937 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]