ФАХД1

ФАХД1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1SAW
Идентификаторы
Псевдонимы	FAHD1 , C16orf36, YISKL, домен фумарилацетоацетатгидролазы, содержащий 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 616320 ; МГИ : 1915886 ; Гомологен : 6774 ; Генные карты : FAHD1 ; ОМА : FAHD1 – ортологи
Номер ЕС	4.1.1.112
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	25,069,338 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	pancreatic ductal cell; ; jejunal mucosa; ; endothelial cell; ; duodenum; ; kidney; ; renal medulla; ; vastus lateralis muscle; ; human penis; ; liver; ; right ventricle;
	Top expressed in
	Ileal epithelium; ; right kidney; ; human kidney; ; cardiac muscle tissue of left ventricle; ; duodenum; ; extensor digitorum longus muscle; ; interventricular septum; ; jejunum; ; plantaris muscle; ; left lobe of liver;
	More reference expression data
	n/a
показывать Генная онтология
Molecular function	acetylpyruvate hydrolase activity; acylpyruvate hydrolase activity; catalytic activity; hydrolase activity; fumarylpyruvate hydrolase activity; metal ion binding; lyase activity; oxaloacetate decarboxylase activity;
Cellular component	cytosol; mitochondrion; nucleoplasm; cytoplasm; mitochondrial matrix;
Biological process	metabolism; tricarboxylic acid cycle;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	81889
	68636
	н/д
	ENSMUSG00000045316
	Q6P587
	Q8R0F8
	НМ_031208 ; НМ_001018104 ; НМ_001142398
	НМ_023480
	НП_001018114 ; НП_001135870 ; НП_112485
	НП_075969
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 1, содержащий домен фумарилацетоацетатгидролазы , также известный как белок FLJ36880, представляет собой фермент , который у человека кодируется FAHD1 геном на хромосоме 16 . ^{[ 4 ]}

Структура

Ген FAHD1 кодирует белок массой 24 кДа, который локализован в митохондриях и принадлежит к фумарилацетоацетатгидролазы . семейству белков ^{[ 5 ]} Структура FAHD1 была решена с помощью рентгеновской кристаллографии с разрешением 2,2 Å. Общая структура аналогична С-концевому домену бифункционального фермента HpcE из Escherichia coli C, фумарилацетоацетатгидролазы из Mus musculus и YcgM (Apc5008) из E. coli 1262. ^{[ 5 ]} Ряд консервативных аминокислот, включая Asp-102 и Arg-106 FAHD1, по-видимому, важны для его каталитической активности. ^{[ 6 ]}

Функция

Было показано, что белок FAHD1 функционирует оксалоацетатдекарбоксилаза как у эукариот . ^{[ 7 ]} Белок FAHD1, вероятно, также действует как ацилпируваза , поскольку в экспериментах in vitro было показано, что он гидролиз ацетилпирувата катализирует и фумарилпирувата . ^{[ 5 ]} Mg(2+) был необходим для максимальной активности фермента. ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000045316 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Энтрез: домен фумарилацетоацетатгидролазы FAHD1, содержащий 1» .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Маньясетти Б.А., Нисен Ф.Х., Дельбрюк Х., Гётц Ф., Зиверт В., Бюссов К., Бельке Дж., Хайнеманн Ю. (2004). «Рентгеновская структура члена семейства фумарилацетоацетатгидролаз Homo sapiens FLJ36880». Биол . 385 (10): 935–42. дои : 10.1515/BC.2004.122 . ПМИД 15551868 . S2CID 16759973 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Пирчер Х., Страганц Г.Д., Эхалт Д., Морроу Г., Танге Р.М., Янсен-Дюрр П. (2011). «Идентификация белка 1, содержащего домен фумарилацетоацетатгидролазы человека (FAHD1), как новой митохондриальной ацилпирувазы» . Ж. Биол. Хим . 286 (42): 36500–8. дои : 10.1074/jbc.M111.264770 . ПМК 3196145 . ПМИД 21878618 .
^ Пирчер Х., фон Графенштайн С., Динер Т., Мецгер С., Альбертини Е., Тафернер А., Унтерлуггауэр Х., Крамер С., Лидл К.Р., Янсен-Дюрр П. (2015). «Идентификация белка 1, содержащего домен FAH (FAHD1), как оксалоацетатдекарбоксилазы» . Дж. Биол . 290 (11): 6755–62. дои : 10.1074/jbc.M114.609305 . ПМК 4358102 . ПМИД 25575590 .

Дальнейшее чтение

Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш М.А. (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геном Рез . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Дэниелс Р.Дж., Педен Дж.Ф., Ллойд С. и др. (2001). «Последовательность, структура и патология полностью аннотированного конца 2 МБ короткого плеча 16 хромосомы человека» . Хм. Мол. Жене . 10 (4): 339–52. дои : 10.1093/хмг/10.4.339 . ПМИД 11157797 .
Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Геном Рез . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК 311072 . ПМИД 11230166 .
Симпсон Дж.К., Велленройтер Р., Пустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, выявленная с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК» . Представитель ЭМБО . 1 (3): 287–92. дои : 10.1093/embo-reports/kvd058 . ПМЦ 1083732 . ПМИД 11256614 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Ленер Б., Сандерсон К.М. (2004). «Схема взаимодействия белков для деградации мРНК человека» . Геном Рез . 14 (7): 1315–23. дои : 10.1101/гр.2122004 . ПМК 442147 . ПМИД 15231747 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Виман С., Арлт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геном Рез . 14 (10Б): 2136–44. дои : 10.1101/гр.2576704 . ПМК 528930 . ПМИД 15489336 .
Манджасетти Б.А., Нисен Ф.Х., Дельбрюк Х. и др. (2005). «Рентгеновская структура члена семейства фумарилацетоацетатгидролаз Homo sapiens FLJ36880». Биол. Хим . 385 (10): 935–42. дои : 10.1515/BC.2004.122 . ПМИД 15551868 . S2CID 16759973 .
Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Нуклеиновые кислоты Рез . 34 (Проблема с базой данных): D415–8. дои : 10.1093/nar/gkj139 . ПМЦ 1347501 . ПМИД 16381901 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 16 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCm38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000045316 – Ensembl , май 2017 г.

[2] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[3] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-4] «Ген Энтрез: домен фумарилацетоацетатгидролазы FAHD1, содержащий 1» .

[Manjasetty_BA_2004-5] Перейти обратно: ^а ^б ^с Маньясетти Б.А., Нисен Ф.Х., Дельбрюк Х., Гётц Ф., Зиверт В., Бюссов К., Бельке Дж., Хайнеманн Ю. (2004). «Рентгеновская структура члена семейства фумарилацетоацетатгидролаз Homo sapiens FLJ36880». Биол . 385 (10): 935–42. дои : 10.1515/BC.2004.122 . ПМИД 15551868 . S2CID 16759973 .

[ReferenceA-6] Перейти обратно: ^а ^б Пирчер Х., Страганц Г.Д., Эхалт Д., Морроу Г., Танге Р.М., Янсен-Дюрр П. (2011). «Идентификация белка 1, содержащего домен фумарилацетоацетатгидролазы человека (FAHD1), как новой митохондриальной ацилпирувазы» . Ж. Биол. Хим . 286 (42): 36500–8. дои : 10.1074/jbc.M111.264770 . ПМК 3196145 . ПМИД 21878618 .

[7] Пирчер Х., фон Графенштайн С., Динер Т., Мецгер С., Альбертини Е., Тафернер А., Унтерлуггауэр Х., Крамер С., Лидл К.Р., Янсен-Дюрр П. (2015). «Идентификация белка 1, содержащего домен FAH (FAHD1), как оксалоацетатдекарбоксилазы» . Дж. Биол . 290 (11): 6755–62. дои : 10.1074/jbc.M114.609305 . ПМК 4358102 . ПМИД 25575590 .

[1]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]