Ignicoccus

Ignicoccus
	Неизвестная больница (с двумя меньшими, симбиотическими ездами на наноархах )
Научная классификация
Домен:	Археи
Филум:	Термопротета
Сорт:	Термоза
Заказ:	Desulfurococcales
Семья:	Desulfurococcaceae
Род:	Ignicoccus ; Huber, Burggraf, Mayer, Wyschkony, Rachel & Stetter 2000
Тип видов
	Ignicoccus Islandicus ; Huber & Stetter 2000
Разновидность
	I. Islandicus ; Я Тихоокеан ; Я больницы ;

Ignicoccus - это род гипертермофиллической археи, живущей в морских гидротермальных вентиляционных отверстиях . взятых на хребте Колбейнси к северу от Исландии , а также на Восточном Тихоокеанском подъеме (при 9 градусах с Они были обнаружены в образцах , н . ^{[ 1 ]}

Систематика

Согласно сравнению генов 16S рРНК , Ignicoccus представляет собой новую, глубоко разветвленную линию в семье Desulfurococcaceae . ^{[ 2 ]} Три вида известны: I. Islandicus , ^{[ 1 ]} Я Тихоокеан ^{[ 1 ]} и я больница штамм Kin4i. ^{[ 3 ]}

Клеточная структура

Арчая рода Ignicoccus имеет крошечные коккоидные клетки диаметром около 2 мкм , которые демонстрируют гладкую поверхность, внешнюю мембрану и без S-слоя . ^{[ 4 ]}

Они имеют ранее неизвестную структуру огибающей клеток -цитоплазматическая мембрана, периплазматическое пространство (с переменной шириной от 20 до 400 нм, содержащее мембрановые пузырьки) и внешней мембраны (приблизительно 10 нм, напоминающая внешнюю мембрану грамма -Неративные бактерии). Последний содержит многочисленные плотно, нерегулярно упакованные отдельные частицы (диаметр около 8 нм) и поры диаметром 24 нм, окруженные крошечными частицами, расположенными в кольце (диаметром 130 нм) и кластерами до восьми частиц 12 нм в диаметре каждый. ^{[ 4 ]}

Два слоя мембраны, которые ранее сообщались, на самом деле являются типом эндомембранной системы, состоящей из цитоплазматических выступов. В I. Hospitalis эти структуры питаются эндосимбиотическими археонами нанорхахейв . ^{[ 3 ]}

Физиология

Ignicocci живут в температурном диапазоне 70–98 ° C (оптимально около 90 ° C). Они получают энергию путем восстановления элементарной серы до сероводорода с использованием молекулярного водорода в качестве донора электронов . ^{[ 2 ]} уникальном симбиозе с (или паразитизмом) нанорхахей . Также сообщалось о ^{[ 2 ]}

Филогения

Принятая в настоящее время таксономия основана на списке прокариотических имен в номенклатуре (LPSN) ^{[ 5 ]} и Национальный центр информации о биотехнологии (NCBI) ^{[ 6 ]}

16S RRNA на основе LTP _06_2022 ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

53 маркерные белки на основе GTDB 08-RS214 ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}

Ignicoccus

I. Hospitalis Paper et al. 2007

	I. Islandicus Huber et al. 2000

	I. Pacificus Huber et al. 2000

Ignicoccus

	Я больницы

	I. Islandicus

Смотрите также

Список родов археи

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Huber H, Burggraf S, Mayer T, Rachel R, Stetter KO (ноябрь 2000 г.). «Genicoccus Gen. Nov., Новый род гипертермофильной, хемолитоаутотрофной археи, представленной двумя новыми видами, Ignicoccus Islandicus sp Nov и Ignicoccus pacificus sp. Nov. И Ignicoccus pacificus sp. Nov» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 50 (6): 2093–2100. doi : 10.1099/00207713-50-6-2093 . PMID 11155984 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Huber H, Hohn MJ, Rachel R, Fuchs T, Wimmer VC, Stetter KO (2 мая 2002 г.). «Новый тип археи, представленный нанозированным гипертермофильным симбионтом» . Природа . 417 (6884): 63–67. Bibcode : 2002natur.417 ... 63h . doi : 10.1038/417063a . PMID 11986665 . S2CID 4395094 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Homorl T, Flechler J, Pickl C, Heinz V, Swucker B, Sleeck J, Wanner G, Opper S, Samson RY, Bell SD, Wurch L, Podar M, Rachel R (13 июня 2017 г.). «Сложная система эндомбранов в госпитализации археонов Ignicoccucus, навязанной нанорхахейвцами » . Фронтинки по микробиологии . 8 : 1072. DOI : 10 3389/fmicb.2017,01072 . PMC 546817 . PMID 28659892 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Рэйчел Р., Вискони И., Риль С., Хубер Х (март 2002 г.). «Ультраструктура Ignicoccus: свидетельство новой внешней мембраны и для внутриклеточного почкования везикул в археонах» . Археи . 1 (1): 9–18. doi : 10.1155/2002/307480 . PMC 685547 . PMID 15803654 .
^ JP Euzéby. "Ignicoccus" . Список прокариотических имен с стоянием в номенклатуре (LPSN) . Получено 2023-06-10 .
^ Sayers; и др. "Ignicoccus" . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) База данных таксономии . Получено 2023-06-10 .
^ "LTP" . Получено 10 мая 2023 года .
^ «Дерево LTP_ALL в формате Newick» . Получено 10 мая 2023 года .
^ «LTP_06_2022 Notes» (PDF) . Получено 10 мая 2023 года .
^ "GTDB Release 08-RS214" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
^ "AR53_R214.sp_label" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
^ «История таксонов» . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .

Дальнейшее чтение

Huber H, Kueper U, Daxer S, Rachel R (август 2012 г.). «Необычная клеточная биология гипертермофильной госпитализации Crenarchaeon Ignicoccus» . Антони Ван Леувенхук . 102 (2): 203–219. doi : 10.1007/s10482-012-9748-5 . PMID 22653377 . S2CID 7732441 .
Насс Б., Опрос У, Лангер Д.Д., Крейтер Л., Купер У, Флехлер Дж., Хеймер Т., Рэйчел Р., Хубер Х., Клетцин А (2014). «Три мультигамских цитохрома C из гипертермофильного археона Ignicoccus Hospitalis: очистка, свойства и локализация» . Микробиология . 6 (160): 1278–1289. doi : 10.1099/mic.0.077792-0 . PMID 24705227 .

Внешние ссылки

Ignicoccus при бак -мистере -н

[huber2000-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Huber H, Burggraf S, Mayer T, Rachel R, Stetter KO (ноябрь 2000 г.). «Genicoccus Gen. Nov., Новый род гипертермофильной, хемолитоаутотрофной археи, представленной двумя новыми видами, Ignicoccus Islandicus sp Nov и Ignicoccus pacificus sp. Nov. И Ignicoccus pacificus sp. Nov» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 50 (6): 2093–2100. doi : 10.1099/00207713-50-6-2093 . PMID 11155984 .

[huber2002-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Huber H, Hohn MJ, Rachel R, Fuchs T, Wimmer VC, Stetter KO (2 мая 2002 г.). «Новый тип археи, представленный нанозированным гипертермофильным симбионтом» . Природа . 417 (6884): 63–67. Bibcode : 2002natur.417 ... 63h . doi : 10.1038/417063a . PMID 11986665 . S2CID 4395094 .

[heimerl2017-3] Jump up to: ^а ^{беременный} Homorl T, Flechler J, Pickl C, Heinz V, Swucker B, Sleeck J, Wanner G, Opper S, Samson RY, Bell SD, Wurch L, Podar M, Rachel R (13 июня 2017 г.). «Сложная система эндомбранов в госпитализации археонов Ignicoccucus, навязанной нанорхахейвцами » . Фронтинки по микробиологии . 8 : 1072. DOI : 10 3389/fmicb.2017,01072 . PMC 546817 . PMID 28659892 .

[rachel2002-4] Jump up to: ^а ^{беременный} Рэйчел Р., Вискони И., Риль С., Хубер Х (март 2002 г.). «Ультраструктура Ignicoccus: свидетельство новой внешней мембраны и для внутриклеточного почкования везикул в археонах» . Археи . 1 (1): 9–18. doi : 10.1155/2002/307480 . PMC 685547 . PMID 15803654 .

[5] JP Euzéby. "Ignicoccus" . Список прокариотических имен с стоянием в номенклатуре (LPSN) . Получено 2023-06-10 .

[NCBI-6] Sayers; и др. "Ignicoccus" . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) База данных таксономии . Получено 2023-06-10 .

[7] "LTP" . Получено 10 мая 2023 года .

[8] «Дерево LTP_ALL в формате Newick» . Получено 10 мая 2023 года .

[9] «LTP_06_2022 Notes» (PDF) . Получено 10 мая 2023 года .

[about-10] "GTDB Release 08-RS214" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .

[tree-11] "AR53_R214.sp_label" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .

[taxon_history-12] «История таксонов» . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]