ТОС1

ТОС1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1WXP
Идентификаторы
Псевдонимы	THOC1 , HPR1, P84, P84N5, комплекс THO 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 606930 ; МГИ : 1919668 ; Гомологен : 38012 ; Генные карты : THOC1 ; ОМА : THOC1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 18 (human)
End	268,050 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 18 (mouse)
End	9,995,489 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	Achilles tendon; ; cerebellar hemisphere; ; right hemisphere of cerebellum; ; right uterine tube; ; anterior pituitary; ; corpus callosum; ; left ovary; ; left lobe of thyroid gland; ; body of pancreas; ; tibial nerve;
	Top expressed in
	cumulus cell; ; spermatocyte; ; tail of embryo; ; Gonadal ridge; ; epiblast; ; external carotid artery; ; abdominal wall; ; primitive streak; ; spermatid; ; internal carotid artery;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; protein binding; RNA binding;
Cellular component	cytoplasm; transcription export complex; nuclear matrix; intercellular bridge; THO complex; THO complex part of transcription export complex; nucleus; nucleoplasm; cytosol; nuclear speck;
Biological process	regulation of DNA recombination; mRNA transport; RNA processing; regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of DNA damage checkpoint; mRNA processing; regulation of DNA-templated transcription, elongation; viral mRNA export from host cell nucleus; transcription, DNA-templated; positive regulation of DNA-templated transcription, elongation; negative regulation of isotype switching to IgA isotypes; RNA splicing; replication fork processing; signal transduction; apoptotic process; RNA export from nucleus; mRNA export from nucleus; mRNA 3'-end processing;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9984
	225160
	ENSG00000079134
	ENSMUSG00000024287
	Q96FV9
	Q8R3N6
	НМ_005131
	НМ_153552
	НП_005122
	НП_705780
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Субъединица 1 комплекса THO представляет собой белок , который у человека кодируется THOC1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

HPR1 является частью комплекса TREX (транскрипция/экспорт) , который включает TEX1 (MIM 606929), THO2 (MIM 300395), ALY (MIM 604171) и UAP56 (MIM 606390). [предоставлено OMIM] ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что THOC1 взаимодействует с белком ретинобластомы . ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000079134 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024287 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Штрассер К., Масуда С., Мейсон П., Пфаннстил Дж., Оппицци М., Родригес-Наварро С., Рондон А.Г., Агилера А., Струл К., Рид Р., Хёрт Э. (май 2002 г.). «TREX представляет собой консервативный комплекс, сочетающий транскрипцию с экспортом информационной РНК». Природа . 417 (6886): 304–8. Бибкод : 2002Natur.417..304S . дои : 10.1038/nature746 . ПМИД 11979277 . S2CID 1112194 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: комплекс THOC1 THO 1» .
^ Дерфи, Т; Манчини М.А.; Джонс Д; Элледж С.Дж.; Ли WH (ноябрь 1994 г.). «Аминоконцевая область продукта гена ретинобластомы связывает новый белок ядерного матрикса, который локализуется совместно с центрами процессинга РНК» . Дж. Клеточная Биол . 127 (3): 609–22. дои : 10.1083/jcb.127.3.609 . ISSN 0021-9525 . ПМК 2120229 . ПМИД 7525595 .

Дальнейшее чтение

Дерфи Т., Манчини М.А., Джонс Д. и др. (1994). «Аминоконцевая область продукта гена ретинобластомы связывает новый белок ядерного матрикса, который локализуется совместно с центрами процессинга РНК» . Дж. Клеточная Биол . 127 (3): 609–22. дои : 10.1083/jcb.127.3.609 . ПМК 2120229 . ПМИД 7525595 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Сузуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Деннехи Б.К., Гатчес Д.Г., МакКонки Э.Х., Краутер К.С. (2004). «Инверсия, дупликация и изменения в контексте генов связаны с эволюцией 18-й хромосомы человека». Геномика . 83 (3): 493–501. дои : 10.1016/j.ygeno.2003.08.017 . ПМИД 14962675 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК 514446 . ПМИД 15302935 .
Гаспарри Ф., Сола Ф., Локателли Г., Муцио М. (2004). «Белок домена смерти p84N5, но не короткая изоформа p84N5s, регулируется клеточным циклом и перемещается между ядром и цитоплазмой». ФЭБС Летт . 574 (1–3): 13–9. дои : 10.1016/j.febslet.2004.07.074 . ПМИД 15358532 . S2CID 43023236 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Ли Ю, Ван Х, Чжан Х, Гудрич Д.В. (2005). «Человеческий hHpr1/p84/Thoc1 регулирует элонгацию транскрипции и физически связывает РНК-полимеразу II и факторы процессинга РНК» . Мол. Клетка. Биол . 25 (10): 4023–33. дои : 10.1128/MCB.25.10.4023-4033.2005 . ПМЦ 1087710 . ПМИД 15870275 .
Масуда С., Дас Р., Ченг Х. и др. (2005). «Привлечение человеческого комплекса TREX к мРНК во время сплайсинга» . Генс Дев . 19 (13): 1512–7. дои : 10.1101/gad.1302205 . ПМК 1172058 . ПМИД 15998806 .
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека» . Геном Рез . 16 (1): 55–65. дои : 10.1101/гр.4039406 . ПМК 1356129 . ПМИД 16344560 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .
Ли Ю, Линь АВ, Чжан Х и др. (2007). «Раковые и нормальные клетки различаются по своим потребностям в Thoc1» . Рак Рез . 67 (14): 6657–64. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-06-3234 . ПМК 2804983 . ПМИД 17638875 .
Гарнер Э., Мартинон Ф., Чопп Дж. и др. (2007). «Клетки с дефектным путем p53-p21-pRb чувствительны к апоптозу, индуцированному p84N5 через каспазу-6» . Рак Рез . 67 (16): 7631–7. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-07-0334 . ПМИД 17699767 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 18 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000079134 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024287 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11979277-5] Штрассер К., Масуда С., Мейсон П., Пфаннстил Дж., Оппицци М., Родригес-Наварро С., Рондон А.Г., Агилера А., Струл К., Рид Р., Хёрт Э. (май 2002 г.). «TREX представляет собой консервативный комплекс, сочетающий транскрипцию с экспортом информационной РНК». Природа . 417 (6886): 304–8. Бибкод : 2002Natur.417..304S . дои : 10.1038/nature746 . ПМИД 11979277 . S2CID 1112194 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: комплекс THOC1 THO 1» .

[pmid7525595-7] Дерфи, Т; Манчини М.А.; Джонс Д; Элледж С.Дж.; Ли WH (ноябрь 1994 г.). «Аминоконцевая область продукта гена ретинобластомы связывает новый белок ядерного матрикса, который локализуется совместно с центрами процессинга РНК» . Дж. Клеточная Биол . 127 (3): 609–22. дои : 10.1083/jcb.127.3.609 . ISSN 0021-9525 . ПМК 2120229 . ПМИД 7525595 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]