Cops6

Cops6
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	4D10, 4D18, 4QFT, 4R14, 4WSN
Идентификаторы
Псевдонимы	COPS6 , CSN6, MOV34-34KD, субъединица сигнала COP9 6
Внешние идентификаторы	Омим : 614729 ; MGI : 1349439 ; Гомологен : 4977 ; GeneCards : Cops6 ; OMA : COPS6 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 7 (human)
End	100,092,187 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	138,162,908 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	stromal cell of endometrium; ; apex of heart; ; muscle of thigh; ; right frontal lobe; ; anterior pituitary; ; muscle layer of sigmoid colon; ; body of uterus; ; nucleus accumbens; ; right hemisphere of cerebellum; ; ectocervix;
	Top expressed in
	medial ganglionic eminence; ; right kidney; ; interventricular septum; ; efferent ductule; ; lens; ; abdominal wall; ; epithelium of lens; ; endothelial cell of lymphatic vessel; ; yolk sac; ; neural tube;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	protein binding;
Cellular component	cytoplasm; COP9 signalosome; nucleus; nucleoplasm; cytosol;
Biological process	transcription-coupled nucleotide-excision repair; viral process; nucleotide-excision repair, DNA damage recognition; protein deneddylation; post-translational protein modification;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	10980
	26893
	ENSG00000168090
	EMSMUSM000000194994
	Q7L5N1
	O88545
	NM_006833
	NM_012002
	NP_006824
	NP_036132
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Комплексная субъединица 6 COP9 - это белок , который у людей кодируется COPS6 геном . ^{[ 5 ]}

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является одной из восьми субъединиц сигнала COP9, высококонсервативного белкового комплекса, который функционирует как важный регулятор в множественных сигнальных путях. Структура и функция сигнала COP9 аналогичны структуре регуляторной частицы 19S из протеасомы 26S. Было показано, что сигнал COP9 взаимодействует с убиквитин-лигазами типа E3 SCF и действует как положительный регулятор убиквитин-лигаз E3. Этот белок принадлежит к суперсемейству инициации трансляции 3 (EIF3). Он участвует в регуляции клеточного цикла и, вероятно, является клеточным кофактором для VPR VPR. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Показано, что Cops6 взаимодействует с EIF3S6 . ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000168090 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000019494 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Strausberg RL, Feingold EA, LH Cross, Derge JG, RD Clausner, Collins FS, Wagner L, CM Shenmen, GD Schuler, SF Altschul, Zeeberg B, Buetow KH, CF Schaefer, Bhat NK, RF Hopkins, Jordan H, Moore T. , Max Si, Wang J, Hsieh F, Diathchenko L, Marusina K, Farmer AA, Rubine GM, Hong L, Stapleton MB, MF Soardo, TL Cassola, Scheetz TE, MJ Brownstein, USDIN TB, Toshiyuki S, Carninci P, Penge C, Raha SS, Naquellan, Peters GJ, Abrase RD, Mullahy SJ, Bosak SA, McEwan PJ, McKernan KJ, Ja Malek, Ph's Gunaratn DK, Muzny DM, Soders EJ, Lu X, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Hongeon A, Whiding M, Madan A, Young AC, Shevchenko и Bouffard GG, Blakessley RW, Touchman JW, Green Ed, Dickson MC, AC Rodriguez, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, Butterfield YS, 2002). "Поколение и 15 000 человек в полной длине Полем Proc Natl Acad Sci USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
^ «Ген Entrez: COPS6 COP9 Конститутивный фотоморфогенный гомолог Субъединица 6 (Arabidopsis)» .
^ Hoareau Alves K, Bochard V, Réty S, Jalinot P (сентябрь 2002 г.). «Ассоциация протоонкопротеина млекопитающих Int-6 с тремя белковыми комплексами EIF3, сигнальной сигналом COP9 и протеасомой 26S» . Фебс Летт . 527 (1–3): 15–21. doi : 10.1016/s0014-5793 (02) 03147-2 . PMID 12220626 . S2CID 39308598 .

Дальнейшее чтение

Вольф Д.А., Чжоу С., Ви С. (2004). «Сигнал COP9: платформа сборки и технического обслуживания для Ubiquitin Ligases Cullin?». НАТ Клеточная биол . 5 (12): 1029–33. doi : 10.1038/ncb1203-1029 . PMID 14647295 . S2CID 37458780 .
Мутумани К., Чу Ай, Премкумар А., Хван Д.С., Тие К.П., Десаи Б.М., Вейнер Д.Б. (2006). «Вирус иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1) VPR-регулируемая гибель клеток: понимание механизма» . Клеточная гибель отличается . 12 (Suppl 1): 962–70. doi : 10.1038/sj.cdd.4401583 . PMID 15832179 .
Mittmeyer HJ (1976). «[Схема распределения строгого Мортиса в различных совместных регионах]». Бейт. Герихтл. Медик 33 : 85–96. PMID 1222062 .
He J, Choe S, Walker R, Di Marzio P, Morgan Do, Landau NR (1995). «Вирус вируса иммунодефицита человека типа 1 вирусного белка R (VPR) останавливает клетки в фазе G2 клеточного цикла путем ингибирования активности p34CDC2» . J. Virol . 69 (11): 6705–11. doi : 10.1128/jvi.69.11.6705-6711.1995 . PMC 189580 . PMID 7474080 .
Re F, Braaten D, Franke EK, Luban J (1995). «Вирус иммунодефицита человека типа 1 VPR оставляет клеточный цикл в G2, ингибируя активацию p34CDC2-циклина B» . J. Virol . 69 (11): 6859–64. doi : 10.1128/jvi.69.11.6859-6864.1995 . PMC 189600 . PMID 7474100 .
Di Marzio P, Choe S, Ebright M, Knoblauch R, Landau NR (1996). «Мутационный анализ остановки клеточного цикла, ядерной локализации и упаковки вириона вируса иммунодефицита человека VPR типа 1» . J. Virol . 69 (12): 7909–16. doi : 10.1128/jvi.69.12.7909-7916.1995 . PMC 189735 . PMID 7494303 .
Jowett JB, Planelles V, Poon B, Shah NP, Chen Ml, Chen Is (1995). «Остановки гена VPR вируса вируса человека типа 1, инфицированные Т -клетки в фазе G2 + M клеточного цикла» . J. Virol . 69 (10): 6304–13. doi : 10.1128/jvi.69.10.6304-6313.1995 . PMC 189529 . PMID 7666531 .
Чжао Л.Дж., Мукерджи С., Нараян О (1994). «Биохимический механизм функции ВПР ВИЧ-I. Специфическое взаимодействие с клеточным белком» . Дж. Биол. Химический 269 (22): 15577–82. doi : 10.1016/s0021-9258 (17) 40719-8 . PMID 8195203 .
Poon B, Jowett JB, Stewart SA, Armstrong RW, Rishton GM, Chen IS (1997). «Ген VPR вируса вируса человека типа 1 индуцирует фенотипические эффекты, сходные с эффектами алкилирующего агента ДНК, азотной горчицы» . J. Virol . 71 (5): 3961–71. doi : 10.1128/JVI.71.5.3961-3971.1997 . PMC 191548 . PMID 9094673 .
Асано К., Ворнлохер Х.П., Рихтер-Кук Н.Дж., Меррик В.К., Хиннебуш А.Г., Херши Дж.В. (1997). «Структура кДНК, кодирующих субъединицы эукариотического инициации человека человека. Возможная роль в связывании РНК и макромолекулярной сборке» . Дж. Биол. Химический 272 (43): 27042–52. doi : 10.1074/jbc.272.43.27042 . PMID 9341143 .
Mahalingam S, Ayyavoo V, Patel M, Kieber-Emmons T, Kao GD, Muschel RJ, Weiner DB (1998). «ВПР ВИЧ-1 взаимодействует с гомологом 34 кДа MOV34 человека, клеточного фактора, связанного с фазовым переходом G2/M в клеточном цикле млекопитающих» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 95 (7): 3419–24. Bibcode : 1998pnas ... 95.3419M . doi : 10.1073/pnas.95.7.3419 . PMC 19851 . PMID 9520381 .
Seeger M, Kraft R, Ferrell K, Bech-Otschir D, Dumdey R, Schade R, Gordon C, Naumann M, Dubiel W (1998). «Новый белковый комплекс, участвующий в трансдукции сигнала, обладающий сходством с 26S -субъединицами протеасом» . Faseb j . 12 (6): 469–78. doi : 10.1096/fasebj.12.6.469 . PMID 9535219 . S2CID 25424324 .
Wei N, Tsuge T, Serino G, Dohmae N, Takio K, Matsui M, Deng XW (1998). «Комплекс COP9 сохраняется между растениями и млекопитающими и связан с регуляторным комплексом протеасом 26S» . Карт Биол . 8 (16): 919–22. Bibcode : 1998cbio .... 8..919W . doi : 10.1016/s0960-9822 (07) 00372-7 . PMID 9707402 . S2CID 13873982 .
Elder RT, Yu M, Chen M, Edelson S, Zhao Y (2000). «Остановка клеточного цикла G2, индуцированная ВПР ВИЧ-1 у делящихся дрожжей (Schizosaccharomyces pombe) не зависит от гибели клеток и ранних генов в контрольной точке повреждения ДНК». Вирус Res . 68 (2): 161–73. doi : 10.1016/s0168-1702 (00) 00167-2 . PMID 10958988 .
MP Ramanathan, Ayyavoo V, Weiner DB (2001). «Выбор экспрессии вектор изменяет локализацию клеточного белка человека». ДНК -клеточная биол . 20 (2): 101–5. doi : 10.1089/104454901750070300 . PMID 11244567 .
Bech-otschir D, Kraft R, Huang X, Henklein P, Kapelari B, Pollmann C, Dubiel W (2001). «COP9, специфичная для специфического фосфорилирования, нацеленное на распад P53 с помощью системы убиквитина» . Embo j . 20 (7): 1630–9. doi : 10.1093/emboj/20.7.1630 . PMC 145508 . PMID 11285227 .
Lyapina S, Cope G, Shevchenko A, Serino G, Tsuge T, Zhou C, Wolf Da, Wei N, Shevchenko A, Deshaies RJ (2001). «Продвижение конъюгатного расщепления NEDD-CUL1 по сигнале COP9». Наука . 292 (5520): 1382–5. Bibcode : 2001sci ... 292.1382L . doi : 10.1126/science.1059780 . PMID 11337588 . S2CID 14224920 .
Elder RT, Yu M, Chen M, Zhu X, Yanagida M, Zhao Y (2001). «ВПР ВИЧ-1 индуцирует остановку клеточного цикла G2 у делящихся дрожжей (Schizosaccharomyces pombe) через путь, включающий регуляторные и каталитические субъединицы PP2A и действуя как на WEE1, так и на CDC25» . Вирусология . 287 (2): 359–70. doi : 10.1006/viro.2001.1007 . PMID 11531413 .
Hrimech M, Yao XJ, Branton PE, Cohen EA (2002). «Возвращение» . Embo j . 21 (14): 3918. DOI : 10.1093/emboj/cdf420 . PMC 126131 . PMID 12110603 .

Внешние ссылки

Местоположение генома Human Cops6 и Cops6 страница сведений генов в браузере генома UCSC .

Эта статья о гене о хромосоме человека 7 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000168090 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000019494 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid12477932-5] Strausberg RL, Feingold EA, LH Cross, Derge JG, RD Clausner, Collins FS, Wagner L, CM Shenmen, GD Schuler, SF Altschul, Zeeberg B, Buetow KH, CF Schaefer, Bhat NK, RF Hopkins, Jordan H, Moore T. , Max Si, Wang J, Hsieh F, Diathchenko L, Marusina K, Farmer AA, Rubine GM, Hong L, Stapleton MB, MF Soardo, TL Cassola, Scheetz TE, MJ Brownstein, USDIN TB, Toshiyuki S, Carninci P, Penge C, Raha SS, Naquellan, Peters GJ, Abrase RD, Mullahy SJ, Bosak SA, McEwan PJ, McKernan KJ, Ja Malek, Ph's Gunaratn DK, Muzny DM, Soders EJ, Lu X, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Hongeon A, Whiding M, Madan A, Young AC, Shevchenko и Bouffard GG, Blakessley RW, Touchman JW, Green Ed, Dickson MC, AC Rodriguez, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, Butterfield YS, 2002). "Поколение и 15 000 человек в полной длине Полем Proc Natl Acad Sci USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .

[entrez-6] «Ген Entrez: COPS6 COP9 Конститутивный фотоморфогенный гомолог Субъединица 6 (Arabidopsis)» .

[pmid12220626-7] Hoareau Alves K, Bochard V, Réty S, Jalinot P (сентябрь 2002 г.). «Ассоциация протоонкопротеина млекопитающих Int-6 с тремя белковыми комплексами EIF3, сигнальной сигналом COP9 и протеасомой 26S» . Фебс Летт . 527 (1–3): 15–21. doi : 10.1016/s0014-5793 (02) 03147-2 . PMID 12220626 . S2CID 39308598 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]