Гаплогруппа E-V12
Гаплогруппа E-V12 | |
---|---|
![]() Интерполированное распределение частот. [ 1 ] | |
Возможное время происхождения | в. 12300 лет назад [ 2 ] |
Возраст слияния | в. 10 500 лет назад [ 2 ] |
Возможное место происхождения | Нижний Египет / Ливия [ 3 ] или Верхний Египет /Северный Судан [ 4 ] |
Предок | Э-В68/М78 [ 5 ] |
Определение мутаций | В12, Z1216 [ 5 ] |
Гаплогруппа Y-хромосомы человека E-V12 является субкладом E-M78 , который, в свою очередь, является частью более крупной гаплогруппы E1b1b1 . [ 3 ] По данным Кручиани и др. (2007) , сублиния E-V12, вероятно, возникла в Северной Африке . Он имеет две основные ветви: E-V32, которая наиболее распространена на Африканском Роге , и E-CTS693 (ранее известная как E-V12*), которая наиболее распространена в Верхнем Египте и в меньшей степени в Судане . E-CTS693 также разбросан на низких частотах по Леванту , Анатолии , Центральному Сахелю , региону Великих африканских озер и Европе . [ 6 ] [ 3 ]
Древняя ДНК
[ редактировать ]- Один человек из бронзового века Алалаха датируется ок. 1878-1637 гг. до н. э. принадлежал к гаплогруппе E-V12. [ 7 ] Алалах был городом на севере Леванта, населенным амореями и некоторыми хурритами . [ 7 ]
- Один человек из императорского Рима датирован ок. 2000-1800 лет назад (за несколько лет до настоящего времени) принадлежали к гаплогруппе E-V12. [ 8 ]
- Геном нубийских наемников I века из Сербии (Римская империя) нес гаплогруппу E-V32 и L2a1j. На PCA особь-выброс сгруппирована с современными популяциями Восточной Африки. [ 9 ]
- Один средневековый человек, датированный ок. 1130-520 лн из Вилла Магна , Центральная Италия, принадлежали к гаплогруппе E-V12. [ 8 ]
Недифференцированные линии E-V12*
[ редактировать ]Недифференцированные линии E-V12* (не E-V32 или E-M224, поэтому названные «E-V12*») имеют пик частоты среди южных египтян (до 74,5%). [ 10 ] Субклады также широко разбросаны в небольших количествах как в Северной Африке, так и в Европе, но практически не распространены в Западной Азии, за исключением Турции. [ 3 ] Эти линии E-V12* ранее были включены (наряду со многими линиями E-V22*) [ Примечание 1 ] ) в оригинальном (2004) «дельта-кластере» Кручиани и др., который он определил с помощью Y-STR профилей . С открытием определяющего SNP Cruciani et al. (2007) сообщили, что самые высокие концентрации V12* были обнаружены в Египте, особенно в Южном Египте.
Хасан и др. (2008) сообщают о значительном присутствии E-V12* в соседнем Судане, включая 5/33 коптов и 5/39 нубийцев . E-V12* составлял примерно 20% суданской E-M78. Они предполагают, что субклады E-V12 и E-V22 E-M78 могли быть завезены в Судан из места своего происхождения в Северной Африке после прогрессирующего опустынивания Сахары около 6000–8000 лет назад. Внезапное изменение климата могло заставить несколько неолитических культур/людей мигрировать на север, в Средиземноморье, и на юг, в Сахель и долину Нила. [ 11 ] E-V12* Парагруппа также наблюдается в Европе (например, среди французских басков ) и Восточной Анатолии (например, у Эрзурума турок ). [ 3 ]
Небазальная субгаплогруппа E1b1b-V12/E3b1a1 чаще всего обнаруживается в различных афроазиатскоязычных популяциях Восточной Африки, включая Гарре (74,1%), Габру (58,6%), Вату (55,6%) и Борану (50,0%). ), Плохое (41,7%), Плохое (33,3%) и Рендер (29,0%). [ 12 ]
Субклады E-V12
[ редактировать ]Э-В32
[ редактировать ]Кручиани и др. (2007) предполагают, что этот субклад E-V12, возникший в Северной Африке , а затем впоследствии распространившийся дальше на юг, в район Африканского Рога , где он и сейчас широко распространен, [ Примечание 2 ] с носителями кушитского языка . До открытия V32 Cruciani et al. (2004) назвали те же линии, что и «гамма-кластер», который, по оценкам, возник около 8500 лет назад. Они заявили, что «наибольшая частота встречаемости у трех кушитоязычных групп: борана из Кении (71,4%), оромо из Эфиопии (32,0%) и сомалийцев (80%). За пределами Восточной Африки он был обнаружен только у двух испытуемых из Египта (3,6%) и у одного араба из Марокко». Санчес и др. (2005) обнаружили, что это чрезвычайно заметно у сомалийских мужчин, и заявили, что «мужское население Сомали представляет собой ветвь популяции Африканского Рога, тесно связанную с оромо в Эфиопии и Северной Кении (Боранас)» и что их линии гамма-кластера «вероятно были завезен в население Сомали 4000–5000 лет назад». Совсем недавно Тиллмар и др. (2009) типировали 147 мужчин из Сомали по 12 локусам Y-STR и заметили, что 77% (113/147) имели типичные гаплотипы E-V32. В настоящее время это самая высокая частота E-V32, обнаруженная в любой выборке популяции. Сходным образом, Хасан и др. (2008) в своем исследовании отметили, что это наиболее распространенный из субкладов E-M78, обнаруженных в Судане , особенно среди беджа , масалит и фур . Бежа, как сомалийцы и оромо, говорят на афро-азиатском языке и живут вдоль «коридора» от Африканского Рога до Египта. Хасан и др. (2008) интерпретируют это как усиление «сильной корреляции между языковым и генетическим разнообразием» и признаков родства между беджа и народами Африканского Рога, такими как амхара , оромо и сомалийцы. С другой стороны, масалиты и фур живут в Дарфуре и говорят на нило-сахарском языке. В своем исследовании авторы отметили, что «масалиты обладают безусловно самой высокой частотой гаплогруппы E-M78 и E-V32», что, по их мнению, предполагает «либо недавнее узкое место в популяции, либо близость к происхождению гаплогруппа». Однако совсем недавно Тиллмар и др. (2009) типировали 147 мужчин из Сомали по 12 локусам Y-STR и заметили, что 77% (113/147) имели типичные гаплотипы E-V32. Это самая высокая частота E-V32, обнаруженная в любой выборке популяции.
Данные STR от Cruciani et al. (2007) относительно E-V12 можно резюмировать следующим образом.
Гаплотип | описание | YCAIIa | YCAIIb | ДИС413а | ДИС413б | ДИС19 | ДИС391 | ДИС393 | ДИС439 | ДИС460 | ДИС461 | А10 |
Э-В12* | капитал | 19 | 22 | 22 | 22 | 13 | 10 | 13 | 11 | 11 | 9 | 13 |
мин | 18 | 21 | 20 | 21 | 11 | 10 | 12 | 11 | 8 | 8 | 11 | |
Макс | 19 | 22 | 22 | 23 | 15 | 12 | 14 | 13 | 12 | 10 | 14 | |
число | 40 | 40 | 40 | 40 | 40 | 40 | 40 | 40 | 40 | 40 | 40 | |
Э-В32 | капитал | 19 | 21 | 22 | 23 | 11 | 10 | 13 | 12 | 10 | 10 | 13 |
мин | 19 | 19 | 20 | 21 | 11 | 9 | 12 | 11 | 9 | 10 | 11 | |
Макс | 20 | 22 | 22 | 24 | 11 | 11 | 13 | 13 | 12 | 11 | 14 | |
число | 35 | 35 | 35 | 35 | 35 | 35 | 35 | 35 | 35 | 35 | 35 | |
Все E-V12 | капитал | 19 | 22 | 22 | 23 | 11 | 10 | 13 | 11 | 11 | 10 | 13 |
мин | 18 | 19 | 20 | 21 | 11 | 9 | 12 | 11 | 8 | 8 | 11 | |
Макс | 20 | 22 | 22 | 24 | 15 | 12 | 14 | 13 | 12 | 11 | 14 | |
число | 75 | 75 | 75 | 75 | 75 | 75 | 75 | 75 | 75 | 75 | 75 | |
Субклады
[ редактировать ]- Э-В12
- E-FGC51357
- E-Y2863
- E-FGC14377
- Е FGC14378
- Э-В32
- E-Y25511 [ постоянная мертвая ссылка ]
- E-Y15945. Архивировано 2 февраля 2017 г. в Wayback Machine.
- E-Z813
- E-Y28701
- E-V5933 [ постоянная мертвая ссылка ]
- E-Y17750. Архивировано 2 февраля 2017 г. в Wayback Machine.
- Э-В32
- Е FGC14378
- E-CTS693
- E-FGC14377
Примечания
[ редактировать ]- ^ Кручиани и др. (2004) : «Хромосомы E-V22 и E-V12* перемешаны и нечетко дифференцированы по микросателлитным гаплотипам». В Cruciani et al. (2007) те же авторы показывают, что ветвь E-V13, обнаруженная среди арабов-друзов, также находится в дельта-кластере. (Сравните таблицы данных Cruciani et al. (2007) и Cruciani et al. (2004) ).
- ^ Кручиани и др. (2007) : Рис. 2/С
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Д'Атанасио Э; Тромбетта Б; Бонито М; Финоккио А; Ди Вито Джи; Сегиззи М; и др. (2018). «Заселение последней Зеленой Сахары, выявленное путем широкомасштабного повторения последовательности транссахарских отцов» . Геном Биол . 19 (1): 20. дои : 10.1186/s13059-018-1393-5 . ПМК 5809971 . ПМИД 29433568 .
- ^ Jump up to: а б «E-V12 YTree» .
- ^ Jump up to: а б с д и Кручиани и др. (2007)
- ^ Батталья и др. (2008)
- ^ Jump up to: а б ISOGG, авторские права принадлежат 2016 г. «ISOGG 2017 Гаплогруппа E Y-ДНК» . isogg.org . Проверено 7 января 2019 г.
{{cite web}}
: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка ) - ^ E-CTS693
- ^ Jump up to: а б Ингман, Тара; Эйзенманн, Стефани; Скуртаниоти, Эйрини; Акар, Мурат; Ильгнер, Яна; Ньекки Русконе, Гвидо Альберто; ле Ру, Петрюс; Шафик, Рула; Нойманн, Гуннар У.; Келлер, Марсель; Фройнд, Сесилия; Марзо, Сара; Лукас, Мэри; Краузе, Йоханнес; Робертс, Патрик; Йенер, К. Аслихан; Стокхаммер, Филипп В. (2021). «Человеческая мобильность в Телль-Атчане (Алалах), Хатай, Турция, во 2-м тысячелетии до нашей эры: интеграция изотопных и геномных данных» . ПЛОС ОДИН . 16 (6): e0241883. Бибкод : 2021PLoSO..1641883I . дои : 10.1371/journal.pone.0241883 . ПМИД 34191795 .
- ^ Jump up to: а б Антонио, Маргарет Л.; и др. (8 ноября 2019 г.). «Древний Рим: генетический перекресток Европы и Средиземноморья» . Наука . 366 (6466). Американская ассоциация содействия развитию науки : 708–714. Бибкод : 2019Sci...366..708A . дои : 10.1126/science.aay6826 . ПМК 7093155 . ПМИД 31699931 .
- ^ Олальде, Иньиго; Каррион, Пабло; Микич, Илия; Роланд, Надин; Маллик, Магазин; Лазаридис, Иосиф; Корач, Миомир; Голубович, Снежана; Петкович, София; Миладинович-Радмилович, Наташа; Вулович, Драгана; Стюардсон, Кристин; Лоусон, Энн Мари; Залзала, Фатма; Каллан, Ким (31 августа 2021 г.). «Космополитизм на римской дунайской границе, славянские миграции и геномное формирование современных балканских народов» . дои : 10.1101/2021.08.30.458211 . S2CID 237377452 .
{{cite journal}}
: Для цитирования журнала требуется|journal=
( помощь ) - ^ Бениамино Тромбетта (2015). «Филогеографическое уточнение и крупномасштабное генотипирование гаплогруппы E Y-хромосомы человека дают новое представление о расселении ранних скотоводов на африканском континенте» . Геномная биология и эволюция . 7 (7): 1940–1950. дои : 10.1093/gbe/evv118 . ПМЦ 4524485 . ПМИД 26108492 .
- ^ Хасан и др. (2008)
- ^ Хирбо, Джибрил Бору. «Комплексная генетическая история человеческих популяций Восточной Африки» (PDF) . Университет Мэриленда, Колледж-Парк . Проверено 13 июля 2017 г.
Источники
[ редактировать ]- Батталья, Винченца; Форнарино, Симона; Аль-Захери, Надя; Оливьери, Анна; Лопата, Мэри; Майрес, Натали М; Кинг, Рой Дж; Корни, Сирия; и др. (2008), «Y-хромосомные свидетельства культурного распространения сельского хозяйства в юго-восточной Европе», European Journal of Human Genetics , 17 (6): 820–830, doi : 10.1038/ejhg.2008.249 , PMC 2947100 , PMID 19107149
- Кручиани, Фульвио; Ла Фратта, Роберта; Сантоламазца, Пьеро; Селитто, Даниэле; Пасконе, Роберто; Мораль, Педро; Уотсон, Элизабет; Гид Валентина; Коломб, Элиан Беро; Захарова, Бориана; Лавинья, Жуан; Вона, Джузеппе; Аман, Рашид; Кали, Франческо; Акар, Неджат; Ричардс, Мартин; Торрони, Антонио; Новеллетто, Андреа; Скоццари, Розария (май 2004 г.). «Филогеографический анализ Y-хромосом гаплогруппы E3b (E-M215) выявляет множественные миграционные события внутри Африки и из нее» . Американский журнал генетики человека . 74 (5): 1014–1022. дои : 10.1086/386294 . ПМК 1181964 . ПМИД 15042509 .
- Кручиани; Ла Фратта; Торрони; Андерхилл; Скоццари (2006), «Молекулярное рассечение гаплогруппы E-M78 (E3b1a) Y-хромосомы: апостериорная оценка подхода, основанного на микросателлитных сетях, с помощью шести новых биаллельных маркеров», Human Mutation , 27 (8): 831–2, doi : 10.1002/humu.9445 , PMID 16835895 , S2CID 26886757
- Кручиани, Ф.; Ла Фратта, Р.; Тромбетта, Б.; Сантоламазца, П.; Селитто, Д.; Коломб, Э.Б.; Дюгужон, Ж.-М.; Кривелларо, Ф.; и др. (2007), «Отслеживание прошлых перемещений мужчин-мужчин в Северной/Восточной Африке и Западной Евразии: новые подсказки по гаплогруппам Y-хромосомы E-M78 и J-M12» , Molecular Biology and Evolution , 24 (6): 1300–1311, doi : 10.1093/molbev/msm049 , PMID 17351267 , заархивировано из оригинала 10 октября 2017 г.
- Хасан, Хишам Ю.; Андерхилл, Питер А.; Кавалли-Сфорца, Лука Л.; Ибрагим, Мунтасер Э. (2008), «Вариации Y-хромосомы среди суданцев: ограниченный поток генов, соответствие языку, географии и истории» (PDF) , Американский журнал физической антропологии , 137 (3): 316–23, doi : 10.1002/ajpa.20876 , PMID 18618658 , заархивировано из оригинала (PDF) 4 марта 2009 г.
- Санчес, Хуан Дж; Халленберг, Шарлотта; Бёрстинг, Клаус; Эрнандес, Алексис; Морлинг, Нильс (9 марта 2005 г.). «Высокая частота линий Y-хромосомы, характеризующихся E3b1, DYS19-11, DYS392-12 у сомалийских мужчин» . Европейский журнал генетики человека . 13 (7): 856–866. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201390 . ПМИД 15756297 .
- Тиллмар, Андреас О.; Монтелиус, Керстин (декабрь 2009 г.). «Популяционные данные по 12 локусам Y-STR из сомалийского населения». Forensic Science International: Серия дополнений по генетике . 2 (1): 413–415. дои : 10.1016/j.fsigss.2009.08.078 .
- Андерхилл, Пенсильвания; Пассарино, Г.; Лин, А.А.; Шен, П.; Миразон Лар, М.; Фоли, РА; Оефнер, П.Дж.; Кавалли-Сфорца, LL (январь 2001 г.). «Филогеография бинарных гаплотипов Y-хромосомы и происхождение современных человеческих популяций» . Анналы генетики человека . 65 (1): 43–62. дои : 10.1046/j.1469-1809.2001.6510043.x . ПМИД 11415522 .