Свиньи циркирус
| Свиньи циркирус | |
|---|---|
| |
Научная классификация 
| |
| (не вмешательство): | Вирус |
| Область : | Моноднавирия |
| Королевство: | Shotokuvirae |
| Филум: | Cressdnaviricota |
| Сорт: | Arfiviricetes |
| Заказ: | Cirlivirals |
| Семья: | Circoviridae |
| Род: | Циркирус |
| Группы включены | |
| Кладистически включено, но традиционно исключенные таксоны | |
|
(См. Circovirus ) | |
Свиная циркирус ( PCV ) - это группа из четырех человек [ 1 ] Одноцепочечные ДНК-вирусы, которые не развиваются с не сегментированным круговым геномом. Они являются членами рода Circovirus , который может заразить свиней . [ 2 ] Вирусный капсид является икосаэдрическим и приблизительно 17 нм в диаметре.
ПКВ - это наименьшие вирусы, реплицирующие автономно в эукариотических клетках. [ 3 ] Они повторяются в ядре инфицированных клеток с использованием полимеразы -хозяина для амплификации генома.
PCV-2 вызывает циркура-циркирусную циркурус или постотейный мультисистемный источник (PMWS). Эффективная вакцинация теперь доступна. Fort Dodge Animal Health ( WYETH ) запустила первую одобренную USDA вакцину в 2006 году, содержащую инактивированный вирус ( ATCVET CODE: QI09AA07 ( WHO )). [ 2 ]
Классификация
[ редактировать ]Три штамма PCV известны по состоянию на 2018 год:
- PCV-1 (впервые идентифицированный в 1974 году) легко заражает, но, как известно, не вызывает заболевания у свиней. [ 3 ]
- PCV-2 (сначала изолированный в 1997 году) вызывает PMW, что со временем приводит к значительному истощению лимфоцитов ; Посмертное исследование больных животных выявляет увеличенные лимфатические узлы и аномальную ткань легких. Тем не менее, вирусная инфекция сама по себе имеет тенденцию вызывать только легкое заболевание, и соавторы, такие как другие инфекции или иммуностимуляция, представляются необходимыми для развития тяжелых заболеваний. [ 2 ] Например, одновременная инфекция с вирусом PRRS свиной или вирусом PRRS или иммуностимуляция приводит к увеличению репликации PCV-2 и более тяжелым заболеваниям у свиней, инфицированных PCV-2. [ 2 ]
- PCV-3 (впервые описанный в 2015 году) вызывает широкий спектр проблем и может быть широко распространен среди свиней. [ 4 ]
PCV-1 и PCV-2 показывают высокую степень идентичности последовательности и аналогичную геномную организацию; Тем не менее, основа отдельной патогенности еще не была распущена. [ 3 ] Организация для PCV-3 похожа, но идентичность последовательности намного ниже. [ 4 ]
Геном
[ редактировать ]
Геном PCV является одним из самых простых из всех вирусов, требующих только капсидного белка (ORF2) и двух репликазных белков (ORF1) для репликации и продуцирования функционального вируса. Из -за простоты PCV он должен в значительной степени полагаться на воспроизведение клеточного механизма хозяина. Происхождение репликации расположено на маленькой октануклеотидной петле стебля, которая окружена палиндромическими повторами, [ 5 ] с ORF, расположенным лицом к лицу с обеих сторон Ори . В частности, ORF1 расположен по часовой стрелке, а ORF2 расположен против часовой стрелки ORI.
Два фермента репликазы, которые создаются из ORF1, Rep и Rep ', сохраняются между двумя типами PCV и являются частью ранней фазы вируса. Репликации различаются по тем, что Rep является полной транскрипцией ORF1 из 312 аминокислот, тогда как Rep 'является усеченной формой ORF1 в результате сплайсинга и составляет всего 168 аминокислот в длину. Промотор для Rep (Prep) содержит элемент ответа, стимулированный интерфероном (ISRE), который предполагает, что Rep и Rep регулируется вовлечением цитокинов , [ 6 ] и, вероятно, является средством для вируса, чтобы преодолеть иммунные реакции хозяина на инфекцию. Rep и Rep 'образуют димер , который связывается с двумя шестигранными областями, прилегающими к петле STEM, H1 и H2, что необходимо для репликации. Когда димер связывается с этой областью, репликазы расщепляют область петли петли ствола и остаются ковалентно связанными с областями H1 и H2 ДНК , которая становится 5 ' конец ДНК. Недавно образованный конец 3'OH образует праймер хозяина с использованием РНК -полимеразы хозяина , которая затем используется ДНК -полимеразой для начала транскрипции вирусной ДНК посредством репликации круга катания . После того, как была создана комплементарная ДНК-цепь, область стебля стволовой петли образует свободную негидрогенскую структуру ДНК в четыре раза. Эта свободно связанная структура может образовывать недолгованные ДНК-тримеры, которые образуют два шаблона для репликации, а также поддержание нуклеической целостности области стебля стволовой петли. [ 5 ] Прекращение последовательности репликации не было идентифицировано, но есть доказательства, подтверждающие, что представитель также подавляет собственный промотор, Prep.
Область ORF2 кодирует крышку белка Capside (AKA CP), которая немного отличается между PCV-1 и PCV-2. Это изменение в PCV может объяснить, почему PCV-1 непатогенный, в то время как PCV-2 патогенный [ противоречиво ] Полем Промотор для этого белка расположен в ORF1, внутри сайта, где Rep 'усечен, и сплайс от одного и того же экзона до начальной точки кодирующей области ORF2 [ 6 ] и выражается на ранних и поздних этапах. Это иммуногенная область вируса и является основной областью исследований для создания вакцины для лечения PMWS.
В противоположной ориентации есть третий ген, закодированный в противоположной ориентации на ORF1. Этот ген транскрибируется и является важным геном, участвующим в репликации вируса. [ 7 ]
Размер
[ редактировать ]Цирковирус свиньи - это реплицирующая сущность с одной из самых маленьких цепей ДНК, состоящей из простой петли ДНК.
Последовательность ДНК для штамма цирковируса свина MLP-22 составляет 1726 пары оснований. [ 8 ] [ 9 ]
Вход
[ редактировать ]PCV заражает широкий спектр типов клеток, включая гепатоциты , кардиомиоциты и макрофаги . Однако до недавнего времени было неизвестно, как именно было достигнуто привязанность и вход в эти ячейки. Исследования показали, что PCV использует клатрин-опосредованный эндоцитоз для входа в клетку, хотя предполагается, что все еще могут быть и другие факторы, которые не были выявлены. После эндоцитозации образование эндосомы и лизосом вызывает кислотный сдвиг pH, который позволяет АТФ , не выявляет вирус и позволяет ему избежать эндосомов и лизосом. После того, как вирус избегает эндосомов и лизосомов, он перемещается в ядро с помощью неизвестных средств. [ 10 ]
Побег
[ редактировать ]Помимо ORF1 и ORF2, существует также ORF3, который не обязательно требуется для выживания PCV в хосте. Исследования показали, что белок, кодируемый в ORF3, может модулировать цикл клеток клеток- , вызванный вирусом, вызванный клетками клеток и вызвать апоптоз . Использование двухгибридной системы скрининга дрожжей ORF3 против библиотеки кДНК свиньи показало, что белок ORF3 взаимодействует с PPIRH2 свиней, которая является убиквитин-лигазой E3 . Эта убиквитиновая лигаза E3 обычно взаимодействует с p53 во время цикла деления клеток и предотвращает остановку цикла деления клеток на S-фазе . Однако ORF3 также взаимодействует с PPIRH2 в той же области, что и p53, и вызывает активацию экспрессии p53. Это увеличение p53 останавливает цикл деления клеток, и результатом этого является p53 -опосредованный апоптоз, который высвобождает PCV во внеклеточную среду. [ 11 ]
Загрязнение в вакцине человека
[ редактировать ]22 марта 2010 года Управление по контролю за продуктами и лекарствами США (FDA) рекомендовало приостановить использование Rotarix , одну из двух вакцин, лицензированных в Соединенных Штатах против ротавируса из -за результатов загрязнения вирусной ДНК . [ 12 ] Последующая работа GlaxoSmithkline подтвердила загрязнение в рабочих клетках и вирусном «семенах», используемом в производстве ротарикс, также подтверждая, что материал, вероятно, присутствовал с ранних стадий разработки продукта, включая клинические испытания для одобрения FDA. [ 13 ]
Тестирование другой лицензированной вакцины против ротавирусной инфекции, RotateQ , также обнаружило некоторые компоненты как PCV-1, так и PCV-2. [ 14 ] Известно, что циркирус 1 свиная вызывает заболевание у людей или других животных. [ 12 ] [ 13 ]
По состоянию на 8 июня 2010 года FDA, основанное на тщательном обзоре различных научной информации, определила, что для клиницистов и специалистов общественного здравоохранения в Соединенных Штатах целесообразно использовать как Rotarix, так и вакцину Votateq. [ 15 ]
Смотрите также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Таксономия вируса: выпуск 2020 года» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 г. Получено 11 мая 2021 года .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый Эллис, J (март 2014 г.). «Цирковирус свиньи: историческая перспектива». Ветеринарная патология . 51 (2): 315–327. doi : 10.1177/0300985814521245 . PMID 24569612 . S2CID 1406680 .
- ^ Jump up to: а беременный в Манкерц П. (2008). «Молекулярная биология циркувирусов свиньи» . Вирусы животных: молекулярная биология . Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-22-6 .
- ^ Jump up to: а беременный Клауманн, Франсини; Корреа-Физ, Флорсия; Францо, Джованни; Сибила, Марина; Norialez, Хосе I.; Segalés, Хоаким (12 декабря 2018 г.). «Современные знания о свиньи Circovirus 3 (PCV-3): новый вирус с еще неизвестным воздействием на индустрию свиней» . Границы в ветеринарной науке . 5 : 315. DOI : 10.3389/fvets.2018.00315 . PMC 6315159 . PMID 30631769 .
- ^ Jump up to: а беременный F. Faurez; и др. (Май 2009 г.). «Репликация циркирусов свиньи» . Virology Journal . 6 : 60. doi : 10.1186/1743-422x-6-60 . PMC 2690592 . PMID 19450240 .
- ^ Jump up to: а беременный А. Манкерц; и др. (2004). «Молекулярная биология« цировируса свиньи »: анализ экспрессии генов и репликации вируса». Ветеринарная микробиология . 98 (2): 81–88. doi : 10.1016/j.vetmic.2003.10.014 . PMID 14741119 .
- ^ He JL, Dai D, Zhou N, Zhou JY (2012) Анализ предполагаемого гена ORF3 в цикле свиньи типа 2. Гибридома (LARCHMT) 31 (3): 180-187
- ^ «Геномы - геном - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Получено 27 декабря 2018 года .
- ^ Mukhere, p., Sen, A, Das, S, Milton, AP, Shakutala, I., Ghatak, S., Barkalita, LM и Borah, p. "Циквирус-цирквирус свиней 2 MLP-22, полный геном " www.ncbi.nlm.nih.gov Получено 21 , апреля
{{cite web}}: Cs1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Дж. Лю; и др. (Сентябрь 2007 г.). «Белок ORF3 цирковирусного 2 -х свиней взаимодействует с лигазой лигазы свиньи -лигазы Pirh2 свиньи и облегчает экспрессию p53 при вирусной инфекции» . Журнал вирусологии . 81 (71): 9560–9567. doi : 10.1128/jvi.00681-07 . PMC 1951394 . PMID 17581998 .
- ^ Г. Мисинзо; и др. (Июль 2005 г.). «Характеристики связывания и ввода циркувируса свиньи 2 в Ceslls моноцитарной линии свиней 3D4/31» . Журнал общей вирусологии . 86 (7): 2057–2068. doi : 10.1099/vir.0.80652-0 . PMID 15958685 .
- ^ Jump up to: а беременный «Компоненты постороннего вируса, обнаруженные в вакцине против ротарикс; не известный риск безопасности» , Управление по контролю за продуктами и лекарствами США , 22 марта 2010 г.
- ^ Jump up to: а беременный «Обнаружение ДНК из PCV1 в Rotarix» , FDA
- ^ «ДНК вирусов свиньи, обнаруженная в вакцине Merck» , The Wall Street Journal , 7 мая 2010 г.
- ^ «Обновление о вакцинах ротавируса» . fda.gov . Получено 27 декабря 2018 года .
Внешние ссылки
[ редактировать ]