CTDSP1

CTDSP1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1T9Z, 1TA0, 2GHQ, 2GHT, 3L0B, 3L0C, 3L0Y, 3PGL, 4YGY, 4YH1
Идентификаторы
Псевдонимы	CTDSP1 , NIF3, NLI-IF, NLIIF, SCP1, CTD малая фосфатаза 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 605323 ; МГИ : 2654470 ; Гомологен : 100834 ; GeneCards : CTDSP1 ; OMA : CTDSP1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	218,405,941 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 1 (mouse)
End	74,436,444 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	granulocyte; ; right coronary artery; ; gastric mucosa; ; body of stomach; ; Descending thoracic aorta; ; apex of heart; ; left uterine tube; ; right ovary; ; canal of the cervix; ; popliteal artery;
	Top expressed in
	granulocyte; ; urinary bladder; ; adrenal gland; ; white adipose tissue; ; muscle tissue; ; muscle of thigh; ; human kidney; ; lip; ; skeletal muscle tissue; ; esophagus;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	phosphatase activity; RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat phosphatase activity; protein binding; phosphoprotein phosphatase activity; hydrolase activity; metal ion binding;
Cellular component	extracellular exosome; nucleus; nucleoplasm;
Biological process	regulation of transcription by RNA polymerase II; negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle; negative regulation of protein phosphorylation; negative regulation of neurogenesis; protein dephosphorylation; negative regulation of neuron differentiation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	58190
	227292
	ENSG00000144579
	ENSMUSG00000026176
	Q9GZU7
	P58466
	НМ_001206878 ; НМ_001206879 ; НМ_021198 ; НМ_182642
	НМ_153088
	НП_001193807 ; НП_067021 ; НП_872580
	НП_694728
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Полипептид РНК-полимеразы II с карбокси-концевым доменом. Малая фосфатаза 1 представляет собой фермент , который у человека кодируется CTDSP1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что CTDSP1 взаимодействует с SNAI1 . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000144579 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026176 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Ма Х, Райт Дж., Доу С., Олсен П., Титер Л., Адамс Дж., Грависс Э. (апрель 2002 г.). «Этническая дивергенция и неравновесие по сцеплению новых SNP в гене NLI-IF человека: доказательства человеческого происхождения и отсутствие связи с восприимчивостью к туберкулезу» . Журнал генетики человека . 47 (3): 140–5. дои : 10.1007/s100380200016 . ПМИД 11950066 .
^ Йео М., Лин П.С., Дамус М.Э., Гилл Г.Н. (июль 2003 г.). «Новая фосфатаза С-концевого домена РНК-полимеразы II, которая преимущественно дефосфорилирует серин 5» . Журнал биологической химии . 278 (28): 26078–85. дои : 10.1074/jbc.M301791200 . ПМИД 12721286 .
^ «Ген Энтрез: CTDSP1 CTD (карбокси-концевой домен, РНК-полимераза II, полипептид А) малая фосфатаза 1» .
^ Ву Ю, Эверс Б.М., Чжоу Б.П. (январь 2009 г.). «Маленькая фосфатаза С-концевого домена усиливает активность улитки за счет дефосфорилирования» . Журнал биологической химии . 284 (1): 640–8. дои : 10.1074/jbc.M806916200 . ПМК 2610500 . ПМИД 19004823 .

Дальнейшее чтение

Марке С., Лепаж П., Хадсон Т.Дж., Массер Дж.М., Шурр Э. (сентябрь 2000 г.). «Полная нуклеотидная последовательность и геномная структура области гена NRAMP1 человека в области хромосомы 2q35». Геном млекопитающих . 11 (9): 755–62. дои : 10.1007/s003350010151 . ПМИД 10967134 . S2CID 11308779 .
Фернандес А.О., Кампаньони К.В., Кампф К., Фенг Дж.М., Хэндли В.В., Шонманн В. и др. (февраль 2004 г.). «Идентификация белка, который взаимодействует с основным белком голли-миелина и с ядерным интерактором LIM в нервной системе». Журнал нейробиологических исследований . 75 (4): 461–71. дои : 10.1002/jnr.10882 . ПМИД 14743429 . S2CID 29467544 .
Йео М., Ли С.К., Ли Б., Руис Э.К., Пфафф С.Л., Гилл Г.Н. (январь 2005 г.). «Маленькие CTD-фосфатазы подавляют экспрессию генов нейронов». Наука . 307 (5709): 596–600. Бибкод : 2005Sci...307..596Y . дои : 10.1126/science.1100801 . ПМИД 15681389 . S2CID 39722809 .
Сапкота Г., Нокарт М., Аларкон С., Монтальво Э., Бриванлу А.Х., Массаге Дж. (декабрь 2006 г.). «Дефосфорилирование линкерных областей Smad1 и Smad2/3 с помощью небольших фосфатаз С-концевого домена имеет разные результаты для костного морфогенетического белка и путей трансформирующего фактора роста-бета» . Журнал биологической химии . 281 (52): 40412–9. дои : 10.1074/jbc.M610172200 . ПМИД 17085434 .

Внешние ссылки

человека CTDSP1 Расположение генома CTDSP1 и страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

статья о гене на хромосоме 2 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000144579 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026176 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11950066-5] Ма Х, Райт Дж., Доу С., Олсен П., Титер Л., Адамс Дж., Грависс Э. (апрель 2002 г.). «Этническая дивергенция и неравновесие по сцеплению новых SNP в гене NLI-IF человека: доказательства человеческого происхождения и отсутствие связи с восприимчивостью к туберкулезу» . Журнал генетики человека . 47 (3): 140–5. дои : 10.1007/s100380200016 . ПМИД 11950066 .

[pmid12721286-6] Йео М., Лин П.С., Дамус М.Э., Гилл Г.Н. (июль 2003 г.). «Новая фосфатаза С-концевого домена РНК-полимеразы II, которая преимущественно дефосфорилирует серин 5» . Журнал биологической химии . 278 (28): 26078–85. дои : 10.1074/jbc.M301791200 . ПМИД 12721286 .

[entrez-7] «Ген Энтрез: CTDSP1 CTD (карбокси-концевой домен, РНК-полимераза II, полипептид А) малая фосфатаза 1» .

[pmid19004823-8] Ву Ю, Эверс Б.М., Чжоу Б.П. (январь 2009 г.). «Маленькая фосфатаза С-концевого домена усиливает активность улитки за счет дефосфорилирования» . Журнал биологической химии . 284 (1): 640–8. дои : 10.1074/jbc.M806916200 . ПМК 2610500 . ПМИД 19004823 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]