СНАИ1

СНАИ1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2Y48, 3W5K, 4QLI
Идентификаторы
Псевдонимы	SNAI1 , SLUGH2, SNA, SNAH, SNAIL, SNAIL1, dJ710H13.1, цинковый палец 1 семейства улиток, репрессор транскрипции 1 семейства улиток
Внешние идентификаторы	ПРОПУСКАТЬ : 604238 ; МГИ : 98330 ; Гомологен : 4363 ; Генные карты : СНАИ1 ; ОМА : СНАИ1 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 20 (human)
End	49,988,886 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	167,384,734 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	gallbladder; ; left uterine tube; ; gonad; ; right lobe of thyroid gland; ; left lobe of thyroid gland; ; ascending aorta; ; upper lobe of left lung; ; right lung; ; left coronary artery; ; right auricle;
	Top expressed in
	lamina propria of urethra; ; neural crest; ; tail of embryo; ; lamina propria of vagina; ; desmocranium; ; mesoderm; ; embryo; ; Primary palate; ; granulocyte; ; calvaria;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	sequence-specific DNA binding; DNA binding; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; metal ion binding; kinase binding; protein binding; DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; nucleic acid binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; E-box binding;
Cellular component	nucleus; cytoplasm; nucleoplasm; pericentric heterochromatin; cytosol;
Biological process	trophoblast giant cell differentiation; roof of mouth development; regulation of bicellular tight junction assembly; positive regulation of cell migration; regulation of transcription by RNA polymerase II; epithelial to mesenchymal transition involved in endocardial cushion formation; negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage; multicellular organism development; negative regulation of vitamin D biosynthetic process; positive regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator; osteoblast differentiation; negative regulation of cell differentiation involved in embryonic placenta development; cartilage morphogenesis; hair follicle morphogenesis; left/right pattern formation; mesoderm development; negative regulation of transcription, DNA-templated; cell migration; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; Notch signaling involved in heart development; mesoderm formation; epithelial to mesenchymal transition; positive regulation of epithelial to mesenchymal transition; heterochromatin organization; aortic valve morphogenesis;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6615
	20613
	ENSG00000124216
	ENSMUSG00000042821
	О95863
	Q02085
	НМ_005985
	НМ_011427
	НП_005976
	НП_035557
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок цинковых пальцев SNAI1 (иногда называемый улиткой ) — это белок , который у человека кодируется SNAI1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Улитка представляет собой семейство транскрипционных факторов, которые способствуют репрессии молекулы адгезии E-кадгерина, регулируя эпителиально- мезенхимальный переход (ЕМТ) во время эмбрионального развития.

Функция

, Эмбриональный белок SNAI1 дрозофилы широко известный как улитка, представляет собой с цинковыми пальцами транскрипции репрессор , который подавляет экспрессию эктодермальных генов в мезодерме . Ядерный белок, кодируемый этим геном, структурно подобен белку улитки дрозофилы и также считается критическим для формирования мезодермы у развивающегося эмбриона. На хромосоме 2 обнаружено как минимум два варианта аналогичного процессированного псевдогена. ^{[ 6 ]} Цинковые пальцы SNAI1 (ZF) связываются с E-box, областью промотора E-кадгерина, ^{[ 7 ]} и подавляет экспрессию молекулы адгезии, которая заставляет прочно связанные эпителиальные клетки отрываться друг от друга и мигрировать в развивающийся эмбрион, чтобы стать мезенхимальными клетками. Этот процесс позволяет сформировать мезодермальный слой у развивающегося эмбриона. Хотя показано, что SNAI1 подавляет экспрессию E-кадгерина в эпителиальных клетках, исследования показали, что гомозиготные мутантные эмбрионы все еще способны формировать мезодермальный слой. ^{[ 8 ]} Однако присутствующий мезодермальный слой демонстрирует характеристики эпителиальных, а не мезенхимальных клеток (мутантные клетки мезодермы проявляют поляризованное состояние). Другие исследования показывают, что мутации специфических ZF способствуют снижению репрессии E-кадгерина SNAI1. ^{[ 7 ]}

SNAI1 и другие гены эпителиально-мезенхимального перехода (EMT) регулируются несколькими генами и молекулами, включая Wnt и простагландины. Wnt3a является главным регулятором параксиальных пресоматических клеток мезодермы (PSM), которые дифференцируются в мышечный скелет туловища и хвоста. Другие гены, большинство из которых действуют ниже Wnt, включают Msx1, Pax3 и Mesogenin 1 (Msgn1). Msgn1 активирует SNAI1, связываясь с его энхансером и активируя SNAI1, чтобы индуцировать ЕМТ. MSGN1 также регулирует многие из тех же генов, что и SNAI1, чтобы обеспечить активацию EMT, обеспечивая избыточность системы. Это предполагает, что Msgn1 и SNAI1 действуют вместе посредством механизма прямой связи. Когда Msgn1 удаляется, мезодермальные предшественники не перемещаются из примитивной полоски (PS), но все еще демонстрируют мезенхимальную морфологию. Это предполагает, что ось Msgn1/SNAI1 в основном управляет движением клеток. ^{[ 9 ]} Простагландин E2 (PE2), важный гормон гомеостаза и поддержания нормальной фертильности и беременности, стабилизирует SNAI1 посттранскрипционно и, следовательно, также играет роль в эмбриогенезе. Когда сигнальный путь простагландинов нарушен, активность репрессора транскрипции SNAI1 снижается, увеличивая уровни белка E-кадгерина во время гаструляции. Однако это не предотвращает возникновение гаструляции. ^{[ 10 ]}

Клиническое значение

Ген улитки может играть роль в рецидиве рака молочной железы, подавляя E-кадгерин и индуцируя переход эпителия в мезенхиму . ^{[ 11 ]} Процесс ЕМТ также отмечен как важный и заслуживающий внимания процесс роста опухоли посредством инвазии и метастазирования опухолевых клеток из-за репрессии молекул адгезии E-кадгерина. С помощью нокаутных моделей одно исследование показало важность SNAI1 в росте клеток рака молочной железы. ^{[ 12 ]} Нокаутные модели показали значительное снижение инвазивности рака и поэтому могут использоваться в качестве терапевтической меры для лечения рака молочной железы перед химиотерапией. ^{[ 12 ]}

Взаимодействия

Было показано, что SNAI1 взаимодействует с CTDSPL . ^{[ 13 ]} CTDSP1 ^{[ 13 ]} и CTDSP2 . ^{[ 13 ]} Snail1 влияет на полярность клеток, взаимодействуя с членами семейства Crumbs, включая CRUMBS3. ^{[ 14 ]} и CRB1 . ^{[ 15 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000124216 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042821 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Пазнекас В.А., Окадзима К., Шерцер М., Вуд С., Джабс Э.В. (ноябрь 1999 г.). «Геномная организация, экспрессия и расположение хромосом человеческого гена SNAIL (SNAI1) и родственного процессированного псевдогена (SNAI1P)» . Геномика . 62 (1): 42–9. дои : 10.1006/geno.1999.6010 . ПМИД 10585766 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: гомолог 1 улитки SNAI1 (дрозофила)» .
^ Jump up to: ^а ^б Вильярехо А, Кортес-Кабрера А, Молина-Ортис П, Портильо Ф, Кано А (январь 2014 г.). «Дифференциальная роль цинковых пальцев Snail1 и Snail2 в репрессии E-кадгерина и переходе от эпителия к мезенхиме» . Журнал биологической химии . 289 (2): 930–41. дои : 10.1074/jbc.M113.528026 . ПМЦ 3887216 . ПМИД 24297167 .
^ Карвер Э.А., Цзян Р., Лан Ю, Орам К.Ф., Гридли Т. (декабрь 2001 г.). «Ген мышиной улитки кодирует ключевой регулятор эпителиально-мезенхимального перехода» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (23): 8184–8. дои : 10.1128/mcb.21.23.8184-8188.2001 . ПМК 99982 . ПМИД 11689706 .
^ Чаламаласетти Р.Б., Гарриок Р.Дж., Данти В.К., Кеннеди М.В., Джайлвала П., Си Х., Ямагути Т.П. (ноябрь 2014 г.). «Мезогенин 1 является главным регулятором параксиальной пресомитной дифференцировки мезодермы» . Разработка . 141 (22): 4285–97. дои : 10.1242/dev.110908 . ПМК 4302905 . ПМИД 25371364 .
^ Спирс К.К., Джерниган К.К., Ким Ш., Ча Й.И., Лин Ф., Сепич Д.С., Дюбуа Р.Н., Ли Э., Солника-Крезель Л. (апрель 2010 г.). «Передача сигналов простагландина Gbetagamma стимулирует движения гаструляции, ограничивая адгезию клеток посредством стабилизации Snai1a» . Разработка . 137 (8): 1327–37. дои : 10.1242/dev.045971 . ПМЦ 2847468 . ПМИД 20332150 .
^ Дэвидсон Н.Е., Сукумар С. (сентябрь 2005 г.). «Об улитке, мышах и женщинах» . Раковая клетка . 8 (3): 173–4. дои : 10.1016/j.ccr.2005.08.006 . ПМИД 16169460 .
^ Jump up to: ^а ^б Ольмеда Д., Морено-Буэно Дж., Флорес Х.М., Фабра А., Портильо Ф., Кано А. (декабрь 2007 г.). «SNAI1 необходим для роста опухоли и метастазирования в лимфатические узлы клеток карциномы молочной железы человека MDA-MB-231» . Исследования рака . 67 (24): 11721–31. дои : 10.1158/0008-5472.can-07-2318 . ПМИД 18089802 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Ву Ю, Эверс Б.М., Чжоу Б.П. (январь 2009 г.). «Маленькая фосфатаза С-концевого домена усиливает активность улитки за счет дефосфорилирования» . Журнал биологической химии . 284 (1): 640–8. дои : 10.1074/jbc.M806916200 . ПМК 2610500 . ПМИД 19004823 .
^ Уайтман Э.Л., Лю С.Дж., Фирон Э.Р., Марголис Б. (июнь 2008 г.). «Фактор транскрипции улитки подавляет экспрессию Crumbs3 и разрушает комплексы апико-базальной полярности» . Онкоген . 27 (27): 3875–9. дои : 10.1038/onc.2008.9 . ПМЦ 2533733 . ПМИД 18246119 .
^ Матури В., Морен А., Энрот С., Хелдин Ш., Мустакас А. (июнь 2018 г.). «Полногеномное связывание транскрипционного фактора Snail1 в клетках тройного негативного рака молочной железы» . Молекулярная онкология . 12 (7): 1153–1174. дои : 10.1002/1878-0261.12317 . ПМК 6026864 . ПМИД 29729076 .

Дальнейшее чтение

Твигг С.Р., Уилки А.О. (октябрь 1999 г.). «Характеристика гена человеческой улитки (SNAI1) и исключение его как гена основного заболевания при краниосиностозе». Генетика человека . 105 (4): 320–6. дои : 10.1007/s004390051108 . ПМИД 10543399 .
Батль Е, Санчо Э, Франси С, Домингес Д, Монфар М, Баулида Х, Гарсиа Де Эррерос А (февраль 2000 г.). «Транскрипционный фактор улитки является репрессором экспрессии гена E-кадгерина в эпителиальных опухолевых клетках». Природная клеточная биология . 2 (2): 84–9. дои : 10.1038/35000034 . ПМИД 10655587 . S2CID 23809509 .
Смит С., Меткалф Дж. А., Элгар Дж. (апрель 2000 г.). «Идентификация и анализ двух генов улитки у рыбы-фугу (Fugu Rubripes) и картирование СНК человека до 20q». Джин . 247 (1–2): 119–28. дои : 10.1016/S0378-1119(00)00110-4 . ПМИД 10773451 .
Окубо Т., Труонг Т.К., Ю Б., Ито Т., Чжао Дж., Грубе Б., Чжоу Д., Чен С. (февраль 2001 г.). «Понижение активности промотора 1.3 гена ароматазы человека в тканях молочной железы с помощью белка цинковых пальцев улитки (SnaH)». Исследования рака . 61 (4): 1338–46. ПМИД 11245431 .
Уайт М.Дж., Браун-Гуд Дж., Саррио Д., Локасио А., Кано А., Пэлас Дж., Грансон М.А. (май 2002 г.). «Корреляция экспрессии улитки с гистологической степенью и состоянием лимфатических узлов при раке молочной железы». Онкоген . 21 (20): 3241–6. дои : 10.1038/sj.onc.1205416 . ПМИД 12082640 . S2CID 25027761 .
Гуайта С., Пуиг И., Франси С., Гарридо М., Домингес Д., Батль Е., Санчо Е., Дедхар С., Де Эррерос А.Г., Баулида Дж. (октябрь 2002 г.). «Индукция улиткой эпителиально-мезенхимального перехода в опухолевых клетках сопровождается репрессией MUC1 и экспрессией ZEB1» . Журнал биологической химии . 277 (42): 39209–16. дои : 10.1074/jbc.M206400200 . ПМИД 12161443 .
Ёкояма К., Камата Н., Фудзимото Р., Цуцуми С., Томонари М., Таки М., Хосокава Х., Нагаяма М. (апрель 2003 г.). «Увеличенная инвазия и экспрессия матриксной металлопротеиназы-2 за счет мезенхимального перехода, индуцированного улиткой, при плоскоклеточном раке». Международный журнал онкологии . 22 (4): 891–8. дои : 10.3892/ijo.22.4.891 . ПМИД 12632084 .
Икеноути Дж., Мацуда М., Фурусе М., Цукита С. (май 2003 г.). «Регуляция плотных соединений во время перехода эпителий-мезенхима: прямая репрессия экспрессии генов клаудинов/окклюдина улиткой» . Журнал клеточной науки . 116 (Часть 10): 1959–67. дои : 10.1242/jcs.00389 . ПМИД 12668723 .
Домингес Д., Монтсеррат-Сентис Б., Виргос-Солер А., Гуайта С., Груэсо Х., Порта М., Пуиг И., Баулида Х., Франси С., Гарсиа де Эррерос А. (июль 2003 г.). «Фосфорилирование регулирует субклеточное расположение и активность репрессора транскрипции улитки» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (14): 5078–89. дои : 10.1128/MCB.23.14.5078-5089.2003 . ПМК 162233 . ПМИД 12832491 .
Имаи Т., Хориучи А., Ван С., Ока К., Охира С., Никайдо Т., Кониши I (октябрь 2003 г.). «Гипоксия ослабляет экспрессию E-кадгерина за счет активации SNAIL в клетках карциномы яичника» . Американский журнал патологии . 163 (4): 1437–47. дои : 10.1016/S0002-9440(10)63501-8 . ПМЦ 1868286 . ПМИД 14507651 .
Миёси А., Китадзима Ю., Суми К., Сато К., Хагивара А., Кога Ю., Миядзаки К. (март 2004 г.). «Улитка и SIP1 усиливают инвазию рака за счет активации семейства MMP в клетках гепатоцеллюлярной карциномы» . Британский журнал рака . 90 (6): 1265–73. дои : 10.1038/sj.bjc.6601685 . ПМК 2409652 . ПМИД 15026811 .
Окубо Т., Одзава М. (апрель 2004 г.). «Фактор транскрипции Snail подавляет компоненты плотных соединений независимо от подавления E-кадгерина». Журнал клеточной науки . 117 (Часть 9): 1675–85. дои : 10.1242/jcs.01004 . ПМИД 15075229 . S2CID 17991221 .
Барбера М.Х., Пуиг И., Домингес Д., Жюльен-Гриль С., Гуайта-Эстеруэлас С., Пейро С., Баулида Х., Франси С., Дедхар С., Ларю Л., Гарсиа де Эррерос А. (сентябрь 2004 г.). «Регуляция транскрипции улитки во время эпителиально-мезенхимального перехода опухолевых клеток». Онкоген . 23 (44): 7345–54. дои : 10.1038/sj.onc.1207990 . ПМИД 15286702 . S2CID 42944945 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж.Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кэнтли Л.К., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК 514446 . ПМИД 15302935 .
Каджита М., Макклиник К.Н., Уэйд П.А. (сентябрь 2004 г.). «Аберрантная экспрессия факторов транскрипции улитки и слизняка изменяет реакцию на генотоксический стресс» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (17): 7559–66. дои : 10.1128/MCB.24.17.7559-7566.2004 . ПМК 506998 . ПМИД 15314165 .
Чжоу Б.П., Дэн Дж., Ся В., Сюй Дж., Ли Ю.М., Гундуз М., Хунг М.С. (октябрь 2004 г.). «Двойная регуляция улитки посредством GSK-3бета-опосредованного фосфорилирования в контроле эпителиально-мезенхимального перехода». Природная клеточная биология . 6 (10): 931–40. дои : 10.1038/ncb1173 . ПМИД 15448698 . S2CID 10189439 .
Сайто Т., Ода Ю., Кавагути К., Сугимачи К., Ямамото Х., Татейши Н., Танака К., Мацуда С., Ивамото Ю., Ладани М., Цунеёси М. (ноябрь 2004 г.). «Мутация E-кадгерина и сверхэкспрессия улитки как альтернативные механизмы инактивации E-кадгерина при синовиальной саркоме». Онкоген . 23 (53): 8629–38. дои : 10.1038/sj.onc.1207960 . ПМИД 15467754 . S2CID 20273927 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000124216 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042821 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10585766-5] Пазнекас В.А., Окадзима К., Шерцер М., Вуд С., Джабс Э.В. (ноябрь 1999 г.). «Геномная организация, экспрессия и расположение хромосом человеческого гена SNAIL (SNAI1) и родственного процессированного псевдогена (SNAI1P)» . Геномика . 62 (1): 42–9. дои : 10.1006/geno.1999.6010 . ПМИД 10585766 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: гомолог 1 улитки SNAI1 (дрозофила)» .

[ReferenceB-7] Jump up to: ^а ^б Вильярехо А, Кортес-Кабрера А, Молина-Ортис П, Портильо Ф, Кано А (январь 2014 г.). «Дифференциальная роль цинковых пальцев Snail1 и Snail2 в репрессии E-кадгерина и переходе от эпителия к мезенхиме» . Журнал биологической химии . 289 (2): 930–41. дои : 10.1074/jbc.M113.528026 . ПМЦ 3887216 . ПМИД 24297167 .

[8] Карвер Э.А., Цзян Р., Лан Ю, Орам К.Ф., Гридли Т. (декабрь 2001 г.). «Ген мышиной улитки кодирует ключевой регулятор эпителиально-мезенхимального перехода» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (23): 8184–8. дои : 10.1128/mcb.21.23.8184-8188.2001 . ПМК 99982 . ПМИД 11689706 .

[9] Чаламаласетти Р.Б., Гарриок Р.Дж., Данти В.К., Кеннеди М.В., Джайлвала П., Си Х., Ямагути Т.П. (ноябрь 2014 г.). «Мезогенин 1 является главным регулятором параксиальной пресомитной дифференцировки мезодермы» . Разработка . 141 (22): 4285–97. дои : 10.1242/dev.110908 . ПМК 4302905 . ПМИД 25371364 .

[10] Спирс К.К., Джерниган К.К., Ким Ш., Ча Й.И., Лин Ф., Сепич Д.С., Дюбуа Р.Н., Ли Э., Солника-Крезель Л. (апрель 2010 г.). «Передача сигналов простагландина Gbetagamma стимулирует движения гаструляции, ограничивая адгезию клеток посредством стабилизации Snai1a» . Разработка . 137 (8): 1327–37. дои : 10.1242/dev.045971 . ПМЦ 2847468 . ПМИД 20332150 .

[pmid16169460-11] Дэвидсон Н.Е., Сукумар С. (сентябрь 2005 г.). «Об улитке, мышах и женщинах» . Раковая клетка . 8 (3): 173–4. дои : 10.1016/j.ccr.2005.08.006 . ПМИД 16169460 .

[ReferenceA-12] Jump up to: ^а ^б Ольмеда Д., Морено-Буэно Дж., Флорес Х.М., Фабра А., Портильо Ф., Кано А. (декабрь 2007 г.). «SNAI1 необходим для роста опухоли и метастазирования в лимфатические узлы клеток карциномы молочной железы человека MDA-MB-231» . Исследования рака . 67 (24): 11721–31. дои : 10.1158/0008-5472.can-07-2318 . ПМИД 18089802 .

[pmid19004823-13] Jump up to: ^а ^б ^с Ву Ю, Эверс Б.М., Чжоу Б.П. (январь 2009 г.). «Маленькая фосфатаза С-концевого домена усиливает активность улитки за счет дефосфорилирования» . Журнал биологической химии . 284 (1): 640–8. дои : 10.1074/jbc.M806916200 . ПМК 2610500 . ПМИД 19004823 .

[pmid18246119-14] Уайтман Э.Л., Лю С.Дж., Фирон Э.Р., Марголис Б. (июнь 2008 г.). «Фактор транскрипции улитки подавляет экспрессию Crumbs3 и разрушает комплексы апико-базальной полярности» . Онкоген . 27 (27): 3875–9. дои : 10.1038/onc.2008.9 . ПМЦ 2533733 . ПМИД 18246119 .

[15] Матури В., Морен А., Энрот С., Хелдин Ш., Мустакас А. (июнь 2018 г.). «Полногеномное связывание транскрипционного фактора Snail1 в клетках тройного негативного рака молочной железы» . Молекулярная онкология . 12 (7): 1153–1174. дои : 10.1002/1878-0261.12317 . ПМК 6026864 . ПМИД 29729076 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]