Генетически закодированный индикатор напряжения
Генетически закодированный индикатор напряжения (или GEVI ) представляет собой белок , который может определять мембранный потенциал в клетке и связывать изменение напряжения с формой выходного сигнала, часто с уровнем флуоресценции . [1] Это многообещающий инструмент оптогенетической записи, который позволяет экспортировать электрофизиологические сигналы из культивируемых клеток, живых животных и, в конечном итоге, человеческого мозга. Примеры известных GEVI включают ArcLight, [2] как можно скорее1, [3] как можно скорее3, [4] Архонты, [5] СомАрхон, [6] и Ace2N-mNeon. [7]
История
[ редактировать ]Несмотря на то, что идея оптического измерения активности нейронов была предложена еще в конце 1960-х гг. [8] Первый успешный GEVI, который был достаточно удобен для практического использования, не был разработан до тех пор, пока технологии генной инженерии не стали зрелыми в конце 1990-х годов. Первый GEVI, названный FlashSh, [9] был сконструирован путем слияния модифицированного зеленого флуоресцентного белка с потенциал-чувствительным K + канал ( Шейкер ). В отличие от флуоресцентных белков, открытие новых GEVI редко было вдохновлено природой, поскольку трудно найти организм, который естественным образом обладает способностью изменять свою флуоресценцию в зависимости от напряжения. Таким образом, новые GEVI в основном являются продуктами генетической и белковой инженерии.
Для поиска новых GEVI можно использовать два метода: рациональный дизайн и направленная эволюция . Первый метод способствует созданию большинства новых вариантов GEVI, но недавние исследования с использованием направленной эволюции показали многообещающие результаты в оптимизации GEVI. [10] [11]
Структура
[ редактировать ]GEVI может иметь множество конфигураций для реализации функции измерения напряжения. [12] Существенной особенностью строения ГЭВИ является то, что он должен располагаться на клеточной мембране. Концептуально структура GEVI должна обеспечивать функцию определения разницы напряжений и сообщения о ней по изменению флуоресценции. Обычно потенциал-чувствительный домен (VSD) GEVI проходит через мембрану и соединяется с флуоресцентными белками. Однако не обязательно, чтобы зондирование и отчетность происходили в разных структурах, например, в Архонтах.
По структуре GEVI можно разделить на четыре категории на основе текущих результатов: (1) GEVI содержат пару флуоресцентных белков FRET, например, VSFP1, (2) GEVI с одним опсином, например Arch, (3) GEVI пары опсин-FP FRET, например MacQ-mCitrine, (4) одиночный FP со специальными типами доменов измерения напряжения, например ASAP1. Большинство GEVI основаны на Ciona Intinalis потенциал-чувствительной фосфатазе (Ci-VSP или Ci-VSD (домен)), которая была обнаружена в 2005 году в результате геномного исследования организма. [13] Некоторые GEVI могут иметь схожие компоненты, но с разным их расположением. Например, ASAP1 и ArcLight используют VSD и один FP, но FP ASAP1 находится снаружи ячейки, тогда как у ArcLight находится внутри, а два FP VSFP-Butterfly разделены VSD, а два ФП «Русалочки» относительно близки друг к другу.
ДАВАТЬ [А] | Год | зондирование | Отчетность | Предшественник |
---|---|---|---|---|
Вспышка [9] | 1997 | Шейкер (К + канал) | GFP | - |
ВСФП1 [14] | 2001 | Крыса Kv2.1 (К + канал) | Пара FRET : CFP и YFP | - |
СПАРК [15] | 2002 | Война продолжается + канал | GFP | - |
VSFP2 [16] | 2007 | Си-ВСД | Пара ладов : CFP (лазурь) и YFP (цитрин). | ВСФП1 |
Вспышка [17] | 2007 | Кв1.4 (К + канал) | YFP | Вспышка |
ВСФП3.1 [18] | 2008 | Си-ВСД | CFP | VSFP2 |
Русалка [19] | 2008 | Си-ВСД | Пара FRET : морской GFP (mUKG) и OFP (mKOκ) | VSFP2 |
ХВОС [20] | 2008 | Дипикриламин | GFP | - |
Красносмещенные VSFP [21] | 2009 | Си-ВСД | RFP/YFP (Citrine, mOrange2, TagRFP или mKate2) | ВСФП3.1 |
РЕКВИЗИТ [22] | 2011 | Модифицированный зеленый поглощающий протеородопсин (GPR) | То же, что и слева | - |
Зара, Зара 2 [23] | 2012 | Нв-ВСД, Др-ВСД | Пара ладов : CFP (лазурь) и YFP (цитрин). | VSFP2 |
ArcLight [24] | 2012 | Си-ВСД | Модифицированный суперэклиптический pHфторин | - |
Арка [25] | 2012 | Архаэродопсин 3 | То же, что и слева | - |
ЭлектрикПк [26] | 2012 | Си-ВСД | EGFP с круговой перестановкой | ВСФП3.1 |
VSFP-Бабочка [27] | 2012 | Си-ВСД | Пара FRET : YFP (mCitrine) и RFP (mKate2) | VSFP2 |
ВСФП-CR [28] | 2013 | Си-ВСД | Пара FRET : GFP (Clover) и RFP(mRuby2) | ВСФП2.3 |
Русалка2 [29] | 2013 | Си-ВСД | Пара FRET : CFP (seCFP2) и YFP | Русалка |
Mac GEVI [30] | 2014 | Мак-родопсин (акцептор FRET) | Донер FRET: mCitrine или mOrange2. | - |
КвасАр1, КвасАр2 [31] | 2014 | Модифицированный архаэродопсин 3 | То же, что и слева | Арка |
Лучник [32] | 2014 | Модифицированный архаэродопсин 3 | То же, что и слева | Арка |
как можно скорее1 [3] | 2014 | Модифицированный Гг-ВСД | Круговая перестановка GFP | - |
Туз GEVI [33] | 2015 | Модифицированный родопсин Ace | Донер FRET: mNeonGreen | Mac GEVI |
ДугаМолния [34] | 2015 | Си-ВСД | Модифицированный суперэклиптический pHфторин | ArcLight |
путь [35] | 2016 | Потенциал-управляемый протонный канал | Суперэклиптический pHфторин | - |
как можно скорее2f [36] | 2016 | Модифицированный Гг-ВСД | Круговая перестановка GFP | как можно скорее1 |
FlicR1 [37] | 2016 | Си-ВСД | Запрос предложений с круговой перестановкой (mApple) | ВСФП3.1 |
Бонгвури [38] | 2017 | Си-ВСД | Модифицированный суперэклиптический pHфторин | ArcLight |
ASAP2s [39] | 2017 | Модифицированный Гг-ВСД | Круговая перестановка GFP | как можно скорее1 |
как можно скорее-Y [40] | 2017 | Модифицированный Гг-ВСД | Круговая перестановка GFP | как можно скорее1 |
(па)КвасАр3(-ы) [41] | 2019 | Модифицированный архаэродопсин 3 | То же, что и слева | КвазАр2 |
Вольтрон(-ST) | 2019 | Модифицированный родопсин Ace (Ace2) | Донер FRET: Джанелия Флюор (химия) | - |
как можно скорее3 [4] | 2019 | Модифицированный Гг-ВСД | Круговая перестановка GFP | ASAP2s |
ЕАТ-2П [42] | 2022 | Модифицированный Гг-ВСД | Круговая перестановка GFP | ASAP2s |
- ↑ Названия, выделенные курсивом, обозначают неназванные GEVI.
Характеристики
[ редактировать ]GEVI можно оценить по его многочисленным характеристикам. Эти черты можно разделить на две категории: производительность и совместимость. Рабочие свойства включают яркость, фотостабильность , чувствительность, кинетику (скорость), линейность реакции и т. д., а свойства совместимости охватывают токсичность ( фототоксичность ), локализацию на плазматической мембране, адаптируемость изображений глубоких тканей и т. д. [43] На данный момент ни один из существующих GEVI не отвечает всем желаемым свойствам, поэтому поиск идеального GEVI по-прежнему остается весьма конкурентоспособной областью исследований.
Применение и преимущества
[ редактировать ]Различные типы GEVI разрабатываются во многих областях биологических и физиологических исследований. Считается, что он превосходит традиционные методы определения напряжения, такие как на основе электродов электрофизиологические записи , визуализация кальция или чувствительные к напряжению красители . Имеет субклеточное пространственное разрешение. [44] и временное разрешение всего 0,2 миллисекунды, что примерно на порядок быстрее, чем при визуализации кальция. Это обеспечивает точность обнаружения спайков, сравнимую с электрофизиологией на основе электродов, но без инвазивности. [33] Исследователи использовали его для исследования нейронных связей неповрежденного мозга ( дрозофилы). [45] или мышь [46] ), электрический импульс бактерий ( E. coli [22] ) и кардиомиоциты, полученные из стволовых клеток человека . [47] [48]
Будущие направления
[ редактировать ]Будущее направление развития GEVI тесно связано с целевыми приложениями. Поскольку новые поколения GEVI преодолеют низкую производительность первого поколения, мы увидим больше возможностей для использования GEVI в более сложных и универсальных приложениях. Как и многие другие белковые биосенсоры и приводы, как только он преодолеет первоначальный порог практичности, будут предприняты новые попытки изменить инструмент для его использования в различных целевых приложениях, каждое из которых будет иметь разные акценты и требования к подмножеству показателей производительности. Например, авторы JEDI-2P заявили, что отрицательный датчик (от яркого к тусклому) хорош для обнаружения подпороговой деполяризации и гиперполяризации, но датчики с положительным сигналом (от тусклого к яркому) могут быть лучше для обнаружения всплесков. [42] Мы можем возразить, что для разработки (экранирования) идеального датчика требуются усилия, но часто более веская причина заключается в том, что просто не существует единодушного определения такого совершенства. Например, учёный может предпочесть, чтобы датчики разных цветов излучения и возбуждения были спектрально совместимы с другими оптогенетическими актуаторами . Недавно, чтобы компенсировать низкое отношение сигнал/шум (SNR) из-за плохой яркости GEVI, было применено несколько методов шумоподавления для увеличения SNR.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Генетически-кодированные индикаторы напряжения» . Openoptogenetics.org . Проверено 8 мая 2017 г.
- ^ Джин, Л; Хан, З; Платиса, Дж; Вултортон-младший; Коэн, Л.Б.; Пиерибоне, Вирджиния (6 сентября 2012 г.). «Одиночные потенциалы действия и подпороговые электрические события, визуализируемые в нейронах с помощью флуоресцентного белкового зонда напряжения» . Нейрон . 75 (5): 779–85. дои : 10.1016/j.neuron.2012.06.040 . ПМЦ 3439164 . ПМИД 22958819 .
- ^ Перейти обратно: а б Сен-Пьер Ф., Маршалл Дж.Д., Ян Ю. и др. (2014). «Высокоточная оптическая отчетность об электрической активности нейронов с помощью сверхбыстрого флуоресцентного датчика напряжения» . Нат. Неврология. 17 (6): 884–889. дои : 10.1038/nn.3709 . ПМЦ 4494739 . ПМИД 24755780 .
- ^ Перейти обратно: а б Виллетт, В; Чаварха, М; Димов И.К.; Брэдли, Дж; Прадхан, Л; Матье, Б; Эванс, Юго-Запад; Чемберленд, С; Ши, Д; Ян, Р; Ким, Б.Б.; Айон, А; Джалиль, А; Сен-Пьер, Ф; Шнитцер, MJ; Большой; Тот, К; Дин, Дж; Дьедонне, С; Лин, МЗ (12 декабря 2019 г.). «Сверхбыстрая двухфотонная визуализация индикатора напряжения с высоким коэффициентом усиления у мышей, ведущих себя в бодрствующем состоянии» . Клетка . 179 (7): 1590–1608.e23. дои : 10.1016/j.cell.2019.11.004 . ПМК 6941988 . ПМИД 31835034 .
- ^ Пяткевич Кирилл Д.; Юнг, Эрика Э.; Штрауб, Кристоф; Линху, Чанъян; Парк, Демиан; Сук, Хо-Джун; Хохбаум, Дэниел Р.; Гудвин, Дэниел; Пневматикакис, Эфтихиос; Пак, Никита; Кавасима, Такаши; Ян, Чао-Цунг; Роудс, Джеффри Л.; Шемеш, Ор; Асано, Шо; Юн, Ён Гю; Фрайфельд, Лимор; Солнье, Джессика Л.; Риглер, Клеменс; Энгерт, Флориан; Хьюз, Том; Дробыжев Михаил; Сабо, Балинт; Аренс, Миша Б.; Флэвелл, Стивен В.; Сабатини, Бернардо Л.; Бойден, Эдвард С. (апрель 2018 г.). «Роботизированный подход многомерной направленной эволюции, примененный к флуоресцентным репортерам напряжения» . Химическая биология природы . 14 (4): 352–360. дои : 10.1038/s41589-018-0004-9 . ISSN 1552-4469 . ПМЦ 5866759 . ПМИД 29483642 .
- ^ Пяткевич Кирилл Д.; Бенсуссен, Сет; Ценг, Хуаань; Шрофф, Саная Н.; Лопес-Уэрта, Виолетта Жизель; Парк, Демиан; Юнг, Эрика Э.; Шемеш, Ор А.; Штрауб, Кристоф; Гриттон, Ховард Дж.; Романо, Майкл Ф.; Коста, Эмма; Сабатини, Бернардо Л.; Фу, Жаньян; Бойден, Эдвард С.; Хан, Сюэ (октябрь 2019 г.). «Популяционная визуализация нервной активности у бодрствующих мышей» . Природа . 574 (7778): 413–417. Бибкод : 2019Natur.574..413P . дои : 10.1038/s41586-019-1641-1 . ISSN 1476-4687 . ПМЦ 6858559 . ПМИД 31597963 .
- ^ Гонг, Ю; Хуанг, К; Ли, Джей Зи; Греве, БФ; Чжан, Ю; Эйсманн, С; Шнитцер, MJ (11 декабря 2015 г.). «Высокоскоростная запись нервных спайков у бодрствующих мышей и мух с помощью флуоресцентного датчика напряжения» . Наука . 350 (6266): 1361–6. Бибкод : 2015Sci...350.1361G . дои : 10.1126/science.aab0810 . ПМЦ 4904846 . ПМИД 26586188 .
- ^ Коэн Л.Б., Кейнс Р.Д., Хилле Б. (1968). «Изменения светорассеяния и двойного лучепреломления во время нервной деятельности». Природа . 218 (5140): 438–441. Бибкод : 1968Natur.218..438C . дои : 10.1038/218438a0 . ПМИД 5649693 . S2CID 4288546 .
- ^ Перейти обратно: а б Сигел М.С., Исакофф Э.Ю. (1997). «Генетически закодированный оптический зонд мембранного напряжения» . Нейрон . 19 (4): 735–741. дои : 10.1016/S0896-6273(00)80955-1 . ПМИД 9354320 .
- ^ Пяткевич Кирилл Д.; Юнг, Эрика Э.; Штрауб, Кристоф; Линху, Чанъян; Парк, Демиан; Сук, Хо-Джун; Хохбаум, Дэниел Р.; Гудвин, Дэниел; Пневматикакис, Эфтихиос; Пак, Никита; Кавасима, Такаши; Ян, Чао-Цунг; Роудс, Джеффри Л.; Шемеш, Ор; Асано, Шо; Юн, Ён Гю; Фрайфельд, Лимор; Солнье, Джессика Л.; Риглер, Клеменс; Энгерт, Флориан; Хьюз, Том; Дробыжев Михаил; Сабо, Балинт; Аренс, Миша Б.; Флэвелл, Стивен В.; Сабатини, Бернардо Л.; Бойден, Эдвард С. (апрель 2018 г.). «Роботизированный подход многомерной направленной эволюции, примененный к флуоресцентным репортерам напряжения» . Химическая биология природы . 14 (4): 352–360. дои : 10.1038/s41589-018-0004-9 . ISSN 1552-4469 . ПМЦ 5866759 . ПМИД 29483642 .
- ^ Платиса Дж., Васан Г., Ян А. и др. (2017). «Направленная эволюция ключевых остатков во флуоресцентном белке меняет полярность чувствительности к напряжению в генетически закодированном индикаторе ArcLight» . АКС хим. Неврология. 8 (3): 513–523. дои : 10.1021/acschemneuro.6b00234 . ПМЦ 5355904 . ПМИД 28045247 .
- ^ Гонг Й (2015). «Развивающиеся возможности генетически закодированных индикаторов напряжения на основе родопсина» . Курс. Мнение. хим. Биол. 27 : 84–89. дои : 10.1016/j.cbpa.2015.05.006 . ПМК 4571180 . ПМИД 26143170 .
- ^ Мурата Ю., Ивасаки Х., Сасаки М. и др. (2005). «Активность фосфоинозитидфосфатазы, связанная с датчиком внутреннего напряжения». Природа . 435 (7046): 1239–1243. Бибкод : 2005Natur.435.1239M . дои : 10.1038/nature03650 . ПМИД 15902207 . S2CID 4427755 .
- ^ Сакаи Р., Репунте-Канониго В., Радж С.Д. и др. (2001). «Разработка и характеристика кодируемого ДНК чувствительного к напряжению флуоресцентного белка». Евро. Дж. Нейроски. 13 (12): 2314–2318. дои : 10.1046/j.0953-816x.2001.01617.x . ПМИД 11454036 . S2CID 10969720 .
- ^ Атака К., Пиерибоне В.А. (2002). «Генетически нацеливаемый флуоресцентный зонд открытия каналов с быстрой кинетикой» . Биофиз. Дж. 82 (1, часть 1): 509–516. Бибкод : 2002BpJ....82..509A . дои : 10.1016/S0006-3495(02)75415-5 . ПМК 1302490 . ПМИД 11751337 .
- ^ Димитров Д., Хе Ю., Муто Х. и др. (2007). «Разработка и характеристика улучшенного датчика напряжения флуоресцентного белка» . ПЛОС Один . 2 (5): е440. Бибкод : 2007PLoSO...2..440D . дои : 10.1371/journal.pone.0000440 . ПМК 1857823 . ПМИД 17487283 .
- ^ Бейкер Б.Дж., Ли Х., Пирибоне В.А. и др. (2007). «Три датчика напряжения флуоресцентных белков демонстрируют низкую экспрессию плазматической мембраны в клетках млекопитающих». Дж. Нейроски. Методы . 161 (1): 32–38. дои : 10.1016/j.jneumeth.2006.10.005 . ПМИД 17126911 . S2CID 8540453 .
- ^ Лундби А., Муто Х., Димитров Д. и др. (2008). «Разработка генетически кодируемого флуоресцентного датчика напряжения, использующего быстрые движения, чувствительные к напряжению Ci-VSP» . ПЛОС Один . 3 (6): е2514. Бибкод : 2008PLoSO...3.2514L . дои : 10.1371/journal.pone.0002514 . ПМК 2429971 . ПМИД 18575613 .
- ^ Цуцуи Х., Карасава С., Окамура Ю. и др. (2008). «Улучшение измерения мембранного напряжения с использованием FRET с новыми флуоресцентными белками». Нат. Методы . 5 (8): 683–685. дои : 10.1038/nmeth.1235 . ПМИД 18622396 . S2CID 30661869 .
- ^ Сьюлсон Л., Мизенбёк Г. (2008). «Рациональная оптимизация и визуализация in vivo генетически закодированного репортера оптического напряжения» . Дж. Нейроски. 28 (21): 5582–5593. doi : 10.1523/JNEUROSCI.0055-08.2008 . ПМЦ 2714581 . ПМИД 18495892 .
- ^ Перрон А., Муто Х., Лоуни Т. и др. (2009). «Смещенные в красный цвет чувствительные к напряжению флуоресцентные белки» . хим. Биол. 16 (12): 1268–1277. doi : 10.1016/j.chembiol.2009.11.014 . ПМЦ 2818747 . ПМИД 20064437 .
- ^ Перейти обратно: а б Краль Дж.М., Хохбаум Д.Р., Дуглас А.Д. и др. (2011). «Электрический импульс в Escherichia coli, исследованный с помощью флуоресцентного белка, указывающего напряжение». Наука . 333 (6040): 345–348. Бибкод : 2011Sci...333..345K . дои : 10.1126/science.1204763 . ПМИД 21764748 . S2CID 2195943 .
- ^ Бейкер Б.Дж., Джин Л., Хан З. и др. (2012). «Генетически закодированные флуоресцентные датчики напряжения, использующие потенциал-чувствительный домен фосфатаз Nematostella и Danio, демонстрируют быструю кинетику» . Дж. Нейроски. Методы . 208 (2): 190–196. дои : 10.1016/j.jneumeth.2012.05.016 . ПМК 3398169 . ПМИД 22634212 .
- ^ Джин Л., Хан З., Платиса Дж. и др. (2012). «Одиночные потенциалы действия и подпороговые электрические события, визуализируемые в нейронах с помощью флуоресцентного белкового зонда напряжения» . Нейрон . 75 (5): 779–785. дои : 10.1016/j.neuron.2012.06.040 . ПМЦ 3439164 . ПМИД 22958819 .
- ^ Краль Дж.М., Дуглас А.Д., Хохбаум Д.Р. и др. (2011). «Оптическая регистрация потенциалов действия в нейронах млекопитающих с использованием микробного родопсина» . Нат. Методы . 9 (1): 90–95. дои : 10.1038/nmeth.1782 . ПМЦ 3248630 . ПМИД 22120467 .
- ^ Барнетт Л., Платиса Дж., Попович М. и др. (2012). «Флуоресцентный генетически закодированный датчик напряжения, способный распознавать потенциалы действия» . ПЛОС Один . 7 (9): е43454. Бибкод : 2012PLoSO...743454B . дои : 10.1371/journal.pone.0043454 . ПМЦ 3435330 . ПМИД 22970127 .
- ^ Акеманн В., Муто Х., Перрон А. и др. (2012). «Визуализация динамики нейронных цепей с помощью чувствительного к напряжению флуоресцентного белка». Дж. Нейрофизиология. 108 (8): 2323–2337. дои : 10.1152/jn.00452.2012 . ПМИД 22815406 .
- ^ Лам А.Дж., Сен-Пьер Ф., Гонг Ю. и др. (2013). «Улучшение динамического диапазона FRET с помощью ярко-зеленых и красных флуоресцентных белков» . Биофиз. Дж. 104 (2): 1005–1012. Бибкод : 2013BpJ...104..683L . дои : 10.1016/j.bpj.2012.11.3773 . ПМЦ 3461113 . ПМИД 22961245 .
- ^ Цуцуи Х., Джинно Ю., Томита А. и др. (2013). «Улучшенное обнаружение электрической активности с помощью зонда напряжения на основе потенциал-чувствительной фосфатазы» . Дж. Физиол. (Лондон.) . 591 (18): 4427–4437. дои : 10.1113/jphysicalol.2013.257048 . ПМЦ 3784191 . ПМИД 23836686 .
- ^ Гонг Ю, Вагнер М.Дж., Чжун Ли Дж. и др. (2014). «Визуализация нейронных импульсов в тканях головного мозга с помощью датчиков напряжения белка FRET-опсин» . Нат. Коммун. 5 : 3674. Бибкод : 2014NatCo...5.3674G . дои : 10.1038/ncomms4674 . ПМЦ 4247277 . ПМИД 24755708 .
- ^ Хохбаум Д.Р., Чжао Ю., Фархи С.Л. и др. (2014). «Полностью оптическая электрофизиология нейронов млекопитающих с использованием сконструированных микробных родопсинов» . Нат. Методы . 11 (8): 825–833. дои : 10.1038/nmeth.3000 . ПМК 4117813 . ПМИД 24952910 .
- ^ Flytzanis NC, Bedbrook CN, Chiu H и др. (2014). «Варианты архаэрродопсина с усиленной вольточувствительной флуоресценцией в нейронах млекопитающих и Caenorhabditis elegans» . Нат. Коммун. 5 : 4894. Бибкод : 2014NatCo...5.4894F . дои : 10.1038/ncomms5894 . ПМК 4166526 . ПМИД 25222271 .
- ^ Перейти обратно: а б Гун Ю, Хуан С., Ли Цз.З. и др. (2015). «Высокоскоростная запись нервных спайков у бодрствующих мышей и мух с помощью флуоресцентного датчика напряжения» . Наука . 350 (6266): 1361–1366. Бибкод : 2015Sci...350.1361G . дои : 10.1126/science.aab0810 . ПМЦ 4904846 . ПМИД 26586188 .
- ^ Трегер Дж.С., Прист М.Ф., Безанилья Ф. (2015). «Одномолекулярная флуориметрия и стробирующие токи способствуют созданию улучшенного индикатора оптического напряжения» . электронная жизнь . 4 : е10482. дои : 10.7554/eLife.10482 . ПМК 4658195 . ПМИД 26599732 .
- ^ Кан Б.Е., Бейкер Б.Дж. (2016). «Падо, флуоресцентный белок с активностью протонных каналов, может оптически контролировать мембранный потенциал, внутриклеточный pH и картировать щелевые контакты» . наук. Реп.6 Бибкод : 23865. : 2016NatSR ...623865K . дои : 10.1038/srep23865 . ПМЦ 4878010 . ПМИД 27040905 .
- ^ Ян Х.Х., Сен-Пьер Ф., Сунь Х и др. (2016). «Субклеточная визуализация сигналов напряжения и кальция выявляет нейронную обработку in vivo» . Клетка . 166 (1): 245–257. дои : 10.1016/j.cell.2016.05.031 . ПМК 5606228 . ПМИД 27264607 .
- ^ Абдельфаттах А.С., Фархи С.Л., Чжао Й. и др. (2016). «Яркий и быстрый красный флуоресцентный индикатор напряжения белка, который сообщает об активности нейронов в органотипических срезах мозга» . Дж. Нейроски. 36 (8): 2458–2472. doi : 10.1523/JNEUROSCI.3484-15.2016 . ПМЦ 4764664 . ПМИД 26911693 .
- ^ Ли С., Гейллер Т., Юнг А. и др. (2017). «Улучшение генетически закодированного индикатора напряжения путем изменения состава заряда цитоплазмы» . наук. Реп.7 ( 1 ): 8286. Бибкод : 2017NatSR...7.8286L . дои : 10.1038/s41598-017-08731-2 . ПМЦ 5557843 . ПМИД 28811673 .
- ^ Чемберленд, С; Ян, ХХ; Пан, ММ; Эванс, Юго-Запад; Гуань, С; Чаварха, М; Ян, Ю; Салес, К; Ву, Х; Ву, Джей Си; Кландинин, ТР; Тот, К; Лин, МЗ; Сен-Пьер, француз (27 июля 2017 г.). «Быстрая двухфотонная визуализация динамики субклеточного напряжения в нейрональной ткани с генетически закодированными индикаторами» . электронная жизнь . 6 . doi : 10.7554/eLife.25690 . ПМК 5584994 . ПМИД 28749338 .
- ^ Ли Э.Э., Безанилья Ф (2017). «Биофизическая характеристика генетически закодированного датчика напряжения ASAP1: улучшение динамического диапазона» . Биофиз. Дж. 113 (10): 2178–2181. Бибкод : 2017BpJ...113.2178L . дои : 10.1016/j.bpj.2017.10.018 . ПМК 5700382 . ПМИД 29108650 .
- ^ Адам Ю., Ким Дж.Дж., Лу С. и др. (2019). «Визуализация напряжения и оптогенетика выявляют зависящие от поведения изменения в динамике гиппокампа» . Природа . 569 (7756): 413–417. Бибкод : 2019Natur.569..413A . дои : 10.1038/s41586-019-1166-7 . ПМК 6613938 . ПМИД 31043747 .
«Мы объединили paQuasAr3 с мотивом транспортировки из локализованного в соме калиевого канала KV2.1, что привело к экспрессии, локализованной в основном в соме (рис. 2a, b). Мы назвали эту конструкцию paQuasAr3-s».
«Мы назвали QuasAr3(V59A) «фотоактивированным QuasAr3» (paQuasAr3)».
«QuasAr2(K171R)-TS-citrine-TS-TS-TS-ER2, который мы называем QuasAr3».{{cite journal}}
: CS1 maint: постскриптум ( ссылка ) - ^ Перейти обратно: а б Лю, Чжохэ; Лу, Сяоюй; Виллетт, Винсент; Гоу, Юэян; Кольбер, Кевин Л.; Лай, Шуцзюань; Гуань, Сыхуэй; Лэнд, Мишель А.; Ли, Джихван; Ассефа, Тенсаэ; Золлингер, Дэниел Р.; Коримпиду, Мария М.; Власиц, Анна Л.; Панг, Мишель М.; Су, Шэрон (18 августа 2022 г.). «Запись устойчивого напряжения в глубоких тканях с использованием быстрого индикатора, разработанного для двухфотонной микроскопии» . Клетка . 185 (18): 3408–3425.e29. дои : 10.1016/j.cell.2022.07.013 . ISSN 0092-8674 . ПМЦ 9563101 . ПМИД 35985322 .
- ^ Ян Х.Х., Сен-Пьер Ф. (2016). «Генетически закодированные индикаторы напряжения: возможности и проблемы» . Дж. Нейроски. 36 (39): 9977–9989. doi : 10.1523/JNEUROSCI.1095-16.2016 . ПМК 5039263 . ПМИД 27683896 .
- ^ Кашула Р., Салекер I (2016). «Нейрональные вычисления стали видимыми благодаря субклеточному разрешению» . Клетка . 166 (1): 18–20. дои : 10.1016/j.cell.2016.06.022 . ПМИД 27368098 .
- ^ Цао Г., Платиса Дж., Пирибоне В.А. и др. (2013). «Генетически направленная оптическая электрофизиология в интактных нейронных цепях» . Клетка . 154 (4): 904–913. дои : 10.1016/j.cell.2013.07.027 . ПМЦ 3874294 . ПМИД 23932121 .
- ^ Кнопфель Т., Галлеро-Салас Ю., Сонг С. (2015). «Генетически закодированные индикаторы напряжения для крупномасштабной визуализации коры достигают совершеннолетия». Курс. Мнение. хим. Биол. 27 : 75–83. дои : 10.1016/j.cbpa.2015.06.006 . ПМИД 26115448 .
- ^ Кестнер Л., Тиан К., Кайзер Э. и др. (2015). «Генетически закодированные индикаторы напряжения в исследованиях кровообращения» . Межд. Дж. Мол. наук. 16 (9): 21626–21642. дои : 10.3390/ijms160921626 . ПМЦ 4613271 . ПМИД 26370981 .
- ^ Чжан, Джо З.; Термглинчан, Виттават; Шао, Нин-И; Ицхаки, Иланит; Лю, Чун; Ма, Нин; Тиан, Лей; Ван, Вики Ю.; Чанг, Алекс Сай; Го, Хунчао; Китани, Томоя (2 мая 2019 г.). «Система двойного репортера iPSC человека позволяет очищать субпопуляции сердечного происхождения с различными функциями и профилями реакции на лекарства» . Клеточная стволовая клетка . 24 (5): 802–811.e5. дои : 10.1016/j.stem.2019.02.015 . ISSN 1934-5909 . ПМК 6499654 . ПМИД 30880024 .