Молекулярные инструменты плазмодия
Молекулярные инструменты Plasmodium представляют собой набор методов для генетических манипуляций с паразитами рода Plasmodium . Виды плазмодий трудно изучать с научной точки зрения, отчасти из-за неспособности многих стандартных биологических методов генетически изменить организм . Недавние исследования были направлены на преодоление этих технических барьеров, чтобы сделать паразита более доступным для изучения. Ниже приводится описание опубликованных методов генетического контроля паразита Plasmodium .
Трансформация
[ редактировать ]- Электропорация
- загруженные эритроциты
уровень ДНК
[ редактировать ]Регуляция транскрипции
[ редактировать ]- Трансактиваторная система на основе Tet - индуцируемый лигандами контроль транскрипции генов на основе системы Tet ( P. falciparum ) [ 1 ]
Системы интеграции
[ редактировать ]- Rep20 опосредованный
- Интеграза Bxb1 - сайт-специфическая стабильная генетическая интеграция в хромосомы , опосредованная микобактериофага Bxb1 интегразой ( P. falciparum ). [ 2 ]
Рекомбинационные системы
[ редактировать ]- Flp/FRT - индуцированная сайт-специфическая рекомбинация / мутагенез с использованием дрожжевой системы Flp/FRT ( P. berghei ) [ 3 ]
Транспозонные системы
[ редактировать ]- piggyBac - элемент чешуекрылых мобильный для случайной и эффективной интеграции ДНК в геном ( P. falciparum ) [ 4 ]
уровень РНК
[ редактировать ]- РНКи
- антисмысловой
- саморасщепляющийся рибозим . Неудачная попытка использовать индуцибельный саморасщепляющийся рибозим для контроля деградации мРНК слитых транскриптов ( P. falciparum ). [ 5 ]
Уровень белка
[ редактировать ]- FKBP Домен дестабилизации - регулируемый лигандом (Shld1) домен для содействия деградации слитого белка ( P. falciparum ) [ 6 ]
- Домен дестабилизации DHFR - регулируемый лигандом ( триметопримом ) домен, способствующий деградации слитого белка P. falciparum . Благодаря тому, что белок помечен доменом деградации DHFR из E. coli , а также GFP и HA-меткой , можно регулировать уровни белка, определять клеточную локализацию белка и очищать белок от культивируемых паразитов. . [ 7 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Мейснер, М; Крежаны, Э; Гилсон, PR; Де Конинг-Уорд, ТФ; Солдати, Д; Крэбб, Б.С. (2005). «Экспрессия трансгена, регулируемая аналогом тетрациклина, на Plasmodium falciparum стадиях крови Toxoplasma gondii с использованием трансактиваторов » . ПНАС . 102 (8): 2980–2985. Бибкод : 2005PNAS..102.2980M . дои : 10.1073/pnas.0500112102 . ПМЦ 548799 . ПМИД 15710888 .
- ^ Нкрума, LJ; Мюле, РА; Моура, Пенсильвания; Гош, П; Хэтфулл, ГФ; Джейкобс-младший, WR; Фидок, Д.А. (2006). «Эффективная сайт-специфическая интеграция в хромосомы Plasmodium falciparum, опосредованная интегразой микобактериофага Bxb1» . Природные методы . 3 (8): 615–621. дои : 10.1038/nmeth904 . ПМЦ 2943413 . ПМИД 16862136 .
- ^ Карвалью, Т.Г.; Тиберж, С; Сакамото, Х; Менар, Р. (2004). «Условный мутагенез с использованием сайт-специфической рекомбинации в трансактиваторах Plasmodium berghei » . ПНАС . 101 (41): 14931–14936. дои : 10.1073/pnas.0404416101 . ПМК 522007 . ПМИД 15465918 .
- ^ Балу, Б; Шу, округ Колумбия; Фрейзер-младший, MJ; Адамс, Дж. Х. (2005). «Высокоэффективная трансформация Plasmodium falciparum мобильным элементом чешуекрылых piggyBac » . ПНАС . 102 (45): 16391–16396. Бибкод : 2005PNAS..10216391B . дои : 10.1073/pnas.0504679102 . ПМЦ 1275597 . ПМИД 16260745 .
- ^ Агоп-Нерсесян (2008). «Функциональная экспрессия рибозимов в Apicomplexa: на пути к экзогенному контролю экспрессии генов путем индуцируемого расщепления РНК». Международный журнал паразитологии . 38 (6): 673–81. дои : 10.1016/j.ijpara.2007.10.015 . ПМИД 18062972 .
- ^ Армстронг, CM; Гольдберг, Делавэр (2007). «Домен дестабилизации FKBP модулирует уровни белка в Plasmodium falciparum » . Природные методы . 4 (12): 1007–1009. дои : 10.1038/nmeth1132 . ПМИД 17994030 . S2CID 3314981 .
- ^ Муралидхаран, В.; Гольдберг, Делавэр (2011). «Функция аспарагинового повтора в белке Plasmodium falciparum , оцененная с помощью регулируемой флуоресцентной аффинной метки» . ПНАС . 108 (11): 4411–4416. Бибкод : 2011PNAS..108.4411M . дои : 10.1073/pnas.1018449108 . ПМК 3060247 . ПМИД 21368162 .