PCDH8

PCDH8
Идентификаторы
Псевдонимы	PCDH8 , Arcadlin, на ПК, протокадерин 8
Внешние идентификаторы	Омим : 603580 ; MGI : 1306800 ; Гомологен : 1943 ; GeneCards : PCDH8 ; OMA : PCDH8 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 13 (human)
End	52,848,641 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 14 (mouse)
End	80,008,752 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	Brodmann area 23; ; frontal pole; ; endothelial cell; ; middle temporal gyrus; ; Brodmann area 10; ; dorsolateral prefrontal cortex; ; primary visual cortex; ; Brodmann area 9; ; superior frontal gyrus; ; nucleus accumbens;
	Top expressed in
	anterior amygdaloid area; ; lateral septal nucleus; ; substantia nigra; ; subiculum; ; Region I of hippocampus proper; ; superior colliculus; ; dorsomedial hypothalamic nucleus; ; ventral tegmental area; ; paraventricular nucleus of hypothalamus; ; lateral hypothalamus;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	calcium ion binding;
Cellular component	cell projection; cell junction; postsynaptic membrane; plasma membrane; membrane; presynaptic membrane; integral component of membrane; synapse; dendrite; integral component of plasma membrane; glutamatergic synapse; integral component of postsynaptic membrane;
Biological process	morphogenesis of embryonic epithelium; somitogenesis; chemical synaptic transmission; homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; cell-cell signaling; cell adhesion; nervous system development; regulation of synaptic membrane adhesion;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	5100
	18530
	ENSG00000136099
	Ensmusg00000036422
	O95206
	Qilsk3
	NM_032949 ; NM_002590
	NM_001042726 ; NM_021543
	NP_002581 ; NP_116567
	NP_001036191 ; NP_067518
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Протокадгерин-8 -это белок , который у людей кодируется PCDH8 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Этот ген принадлежит к семейству генов протокадерина, подсемейству суперсемейства кадгерина. Ген кодирует интегральный мембранный белок, который, как полагают, функционирует в клеточной адгезии специфичным для ЦНС. В отличие от классических кадгеринов, которые обычно кодируются 15-17 экзонами, этот ген включает только 3 экзона. Примечательным является большой первый экзон, кодирующий внеклеточную область, в том числе 6 доменов кадгерина и трансмембранную область. Альтернативный сплайсинг дает изоформы с уникальными цитоплазматическими хвостами. ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000136099 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000036422 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Стрел С., Глатт К., Лю QM, Глатт Х, Лаланде М (декабрь 1998). «Характеристика двух новых протокадеринов (PCDH8 и PCDH9) локализована на хромосоме человека 13 и мышиной хромосоме 14». Геномика . 53 (1): 81–9. doi : 10.1006/geno.1998.5467 . PMID 9787079 .
^ Стрел С., Ласалле Дж. М., Лаланде М (октябрь 1997). «Анализ с высоким разрешением организации домена репликации ДНК через границу R/G-диапазона» . Мол -клеточная биол . 17 (10): 6157–66. doi : 10.1128/mcb.17.10.6157 . PMC 232466 . PMID 9315676 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: PCDH8 Protocadherin 8» .

Дальнейшее чтение

Яги Т., Такечи М (2000). «Гены суперсемейства кадгерина: функции, геномная организация и неврологическое разнообразие» . Гены Дев . 14 (10): 1169–80. doi : 10.1101/gad.14.10.1169 . PMID 10817752 . S2CID 44844497 .
Nollet F, Kools P, Van Roy F (2000). «Филогенетический анализ суперсемейства кадгерина позволяет идентифицировать шесть основных подсемейств, кроме нескольких одиночных членов». J. Mol. Биол . 299 (3): 551–72. doi : 10.1006/jmbi.2000.3777 . PMID 10835267 .
Wu Q, Maniatis T (1999). «Поразительная организация крупной семейства нейронных генов клеток-адгезии, подобных человеческим нейровым кадгерином» . Клетка . 97 (6): 779–90. doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 80789-8 . PMID 10380929 . S2CID 6014717 .
Yamagata K, Andreasson Ki, Sugiura H, et al. (1999). «Arcadlin-это кадгерин, регулируемый нейронной деятельностью, участвующий в долгосрочном потенциале» . Дж. Биол. Химический 274 (27): 19473–1979. doi : 10.1074/jbc.274.27.19473 . PMID 10383464 .
Wu Q, Maniatis T (2000). «Большие экзоны, кодирующие множественные эктодомены, являются характерной особенностью генов протокадерина» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 97 (7): 3124–9. doi : 10.1073/pnas.060027397 . PMC 16203 . PMID 10716726 .
Wu Q, Zhang T, Cheng JF, et al. (2001). «Сравнительный анализ последовательности ДНК кластеров генов протокадерина мыши и человека» . Геном Res . 11 (3): 389–404. doi : 10.1101/gr.167301 . PMC 311048 . PMID 11230163 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Генерация и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Bray NJ, Kirov G, Owen RJ, et al. (2003). «Скрининг гена протокадерина человека 8 (PCDH8) при шизофрении» . Гены, мозг и поведение . 1 (3): 187–91. doi : 10.1034/j.1601-183X.2002.10307.x . PMID 12884975 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). «Статус, качество и расширение полноразмерного проекта кДНК NIH: коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Res . 14 (10b): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Lim J, Hao T, Shaw C, et al. (2006). «Белковая сеть взаимодействия для унаследованных человеческих атаксий и расстройства дегенерации клеток Пуркинье» . Клетка . 125 (4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569 . S2CID 13709685 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 13 представляет собой заглушку . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000136099 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000036422 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid9787079-5] Стрел С., Глатт К., Лю QM, Глатт Х, Лаланде М (декабрь 1998). «Характеристика двух новых протокадеринов (PCDH8 и PCDH9) локализована на хромосоме человека 13 и мышиной хромосоме 14». Геномика . 53 (1): 81–9. doi : 10.1006/geno.1998.5467 . PMID 9787079 .

[pmid9315676-6] Стрел С., Ласалле Дж. М., Лаланде М (октябрь 1997). «Анализ с высоким разрешением организации домена репликации ДНК через границу R/G-диапазона» . Мол -клеточная биол . 17 (10): 6157–66. doi : 10.1128/mcb.17.10.6157 . PMC 232466 . PMID 9315676 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: PCDH8 Protocadherin 8» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]