HLA-B Associated Transcript 3

Сумка
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	1WX9, 4DWF, 4EEW, 4WWR, 4X86, 2N9P
Идентификаторы
Псевдонимы	Bag6 , Bag-6, BAT3, D6S52E, G3, HLA-B, связанный с транскриптом 3, BCL2 Associated Athanogene 6, Bag Cochaperone 6
Внешние идентификаторы	Омим : 142590 ; MGI : 1919439 ; Гомологен : 3409 ; GeneCards : Bag6 ; OMA : Bag6 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	31,652,705 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	35,147,322 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	right testis; ; left testis; ; right lobe of thyroid gland; ; right uterine tube; ; apex of heart; ; pituitary gland; ; ganglionic eminence; ; left lobe of thyroid gland; ; anterior pituitary; ; muscle of thigh;
	Top expressed in
	seminiferous tubule; ; spermatid; ; spermatocyte; ; neural layer of retina; ; ventricular zone; ; muscle of thigh; ; superior frontal gyrus; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; yolk sac; ; lip;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	ribosome binding; misfolded protein binding; Hsp70 protein binding; polyubiquitin modification-dependent protein binding; proteasome binding; protein binding; ubiquitin-specific protease binding; ubiquitin protein ligase binding; signaling receptor binding; identical protein binding;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; membrane; intracellular membrane-bounded organelle; nucleoplasm; BAT3 complex; nucleus; extracellular region; extracellular exosome;
Biological process	regulation of apoptotic process; negative regulation of proteolysis; intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator; cell differentiation; ubiquitin-dependent protein catabolic process; kidney development; embryo development; lung development; immune system process; positive regulation of ERAD pathway; protein stabilization; negative regulation of apoptotic process; internal peptidyl-lysine acetylation; brain development; intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress; regulation of cell population proliferation; synaptonemal complex assembly; spermatogenesis; negative regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; protein localization to cytosolic proteasome complex involved in ERAD pathway; maintenance of unfolded protein involved in ERAD pathway; tail-anchored membrane protein insertion into ER membrane; ER-associated misfolded protein catabolic process; immune response-activating cell surface receptor signaling pathway; apoptotic process; natural killer cell activation; proteasomal protein catabolic process; ubiquitin-dependent ERAD pathway; endoplasmic reticulum stress-induced pre-emptive quality control; transport; chromatin organization; proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; regulation of embryonic development;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	7917
	224727
showENSG00000204463 ; ENSG00000228760 ; ENSG00000234651 ; ENSG00000229524 ; ENSG00000096155 ;
	ENSG00000227761; ENSG00000233348
	Ensmusg00000024392
	P46379
	Q9Z1R2
showNM_001098534 ; NM_001199697 ; NM_001199698 ; NM_004639 ; NM_080702 ;
	NM_080703
	NM_001252468 ; NM_001252469 ; NM_057171
	NP_001092004 ; NP_001186626 ; NP_001186627 ; NP_542433 ; NP_542434
showNP_001239397 ; NP_001239398 ; NP_476512 ; NP_001359189 ; NP_001359190 ;
	NP_001359191; NP_001359194; NP_001359195; NP_001359196; NP_001359197; NP_001359198; NP_001359199; NP_001359200; NP_001359201; NP_001359202; NP_001359203; NP_001359204; NP_001359205; NP_001359206; NP_001359207; NP_001359208; NP_001359209; NP_001359210; NP_001359211; NP_001359212; NP_001359213; NP_001359214; NP_001359215; NP_001359216; NP_001359217; NP_001359218; NP_001359219; NP_001359220; NP_001391257; NP_001391258; NP_001391259; NP_001391260; NP_001391256
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Большой пролиновый белок BAT3 -это белок , который у людей кодируется BAT3 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Кластер генов , BAT1-BAT5, был локализован в окрестностях генов для TNF Alpha и TNF Beta. Все эти гены находятся в районе основной области гистосовместимости человека . Белок, кодируемый этим геном, является ядерным белком . Это было вовлечено в контроль апоптоза и регуляции белка теплового шока . Есть три альтернативно сплайсированные варианты транскрипта, описанные для этого гена. ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ENSG00000228760, ENSG00000234651, ENSG00000229524, ENSG00000096155, ENSG00000227761, ENSG00000233348 GRCH38: ENSEMBL Release 89: ENSG0000020463, ENSG00000228760, ENSEMBL00234651242424242424242424241, ENSG.GLATCICG.G.G.G. 0096155, ENSG00000227761, ENSG00000233348 - ENSEMBL , май 2017
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000024392 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Banerji J, Sands J, Strominger JL, Spies T (Apr 1990). «Пара генов из основного комплекса гистосовместимости человека кодирует крупные пролиновые белки с множественными повторными мотивами и одним убиквитин-подобным доменом» . Proc Natl Acad Sci USA . 87 (6): 2374–8. Bibcode : 1990pnas ... 87.2374b . doi : 10.1073/pnas.87.6.2374 . PMC 53689 . PMID 2156268 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: BAT3 HLA-B Associated Transcript 3» .

Дальнейшее чтение

Takayama S, Reed JC (2001). «Молекулярное нацеливание и регуляцию молекулярных шаперонов белками семейства Bag». НАТ Клеточная биол . 3 (10): E237–41. doi : 10.1038/ncb1001-e237 . PMID 11584289 . S2CID 24466133 .
Cross SJ, Tonks S, Trowsdale J, Campbell Rd (1992). «Новое обнаружение полиморфизмов длины рестрикции в комплексе основной гистосовместимости человека». Иммуногенетика . 34 (6): 376–84. doi : 10.1007/bf01787488 . PMID 1684176 . S2CID 29262131 .
Spies T, Bresnahan M, Strominger JL (1989). «Основной комплекс гистосовместимости человека содержит минимум 19 генов между кластером комплемента и HLA-B» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 86 (22): 8955–8. Bibcode : 1989pnas ... 86.8955s . doi : 10.1073/pnas.86.22.8955 . PMC 298409 . PMID 2813433 .
Spies T, Blanck G, Bresnahan M, et al. (1989). «Новый кластер генов в рамках крупного человеческого комплекса гистосовместимости». Наука . 243 (4888): 214–7. Bibcode : 1989sci ... 243..214S . doi : 10.1126/science.2911734 . PMID 2911734 .
Ozaki T, Hanaoka E, Naka M, et al. (1999). «Клонирование и характеристика кДНК крысы BAT3». ДНК -клеточная биол . 18 (6): 503–12. doi : 10.1089/104454999315222 . PMID 10390159 .
Thress K, Song J, Morimoto RI, Kornbluth S (2001). «Обратимое ингибирование функции шаперона HSP70 с помощью Scythe и Reaper» . Embo j . 20 (5): 1033–41. doi : 10.1093/emboj/20.5.1033 . PMC 145500 . PMID 11230127 .
Manchen St, Hubberstey AV (2001). «Человеческая коса содержит функциональную последовательность ядерной локализации и остается в ядре во время апоптоза, вызванного стауроспорином». Биохимия. Биофиз. Резерв Общение 287 (5): 1075–82. doi : 10.1006/bbrc.2001.5701 . PMID 11587531 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Генерация и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK, et al. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы человека 6» . Природа . 425 (6960): 805–11. Bibcode : 2003natur.425..805m . doi : 10.1038/nature02055 . PMID 14574404 .
Xie T, Rowen L, Aguado B, et al. (2004). «Анализ генной области основной гистосовместимости комплексной области класса III и ее сравнения с мышей» . Геном Res . 13 (12): 2621–36. doi : 10.1101/gr.1736803 . PMC 403804 . PMID 14656967 .
Lehner B, Semple Ji, Brown SE, et al. (2004). «Анализ высокопроизводительной двухгибридной системы дрожжей и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, кодируемых в области MHC класса III человека». Геномика . 83 (1): 153–67. doi : 10.1016/s0888-7543 (03) 00235-0 . PMID 14667819 .
Wu YH, Shih SF, Lin JY (2004). «Рицин запускает апоптотические морфологические изменения через расщепление каспазы-3 BAT3» . Дж. Биол. Химический 279 (18): 19264–75. doi : 10.1074/jbc.m307049200 . PMID 14960581 .
Lehner B, Sanderson CM (2004). «Структура взаимодействия белка для деградации мРНК человека» . Геном Res . 14 (7): 1315–23. doi : 10.1101/gr.2122004 . PMC 442147 . PMID 15231747 .
Colland F, Jacq X, Trouplin V, et al. (2004). «Функциональная протеомика картирование сигнального пути человека» . Геном Res . 14 (7): 1324–32. doi : 10.1101/gr.2334104 . PMC 442148 . PMID 15231748 .
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, et al. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004pnas..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
Кумар Р., Лутц В., Фрэнк Е., Им Х.Дж. (2004). «Немедленный ранний ген X-1 взаимодействует с белками, которые модулируют апоптоз» . Биохимия. Биофиз. Резерв Общение 323 (4): 1293–8. doi : 10.1016/j.bbrc.2004.09.006 . PMC 2895269 . PMID 15451437 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). «Статус, качество и расширение полноразмерного проекта кДНК NIH: коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Res . 14 (10b): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Stelzl U, Worm U, Lalowski M, et al. (2005). «Сеть взаимодействия белка-белок-белок: ресурс для аннотирования протеома». Клетка . 122 (6): 957–68. doi : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . HDL : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID 16169070 . S2CID 8235923 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 6 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ENSG00000228760, ENSG00000234651, ENSG00000229524, ENSG00000096155, ENSG00000227761, ENSG00000233348 GRCH38: ENSEMBL Release 89: ENSG0000020463, ENSG00000228760, ENSEMBL00234651242424242424242424241, ENSG.GLATCICG.G.G.G. 0096155, ENSG00000227761, ENSG00000233348 - ENSEMBL , май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000024392 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid2156268-5] Banerji J, Sands J, Strominger JL, Spies T (Apr 1990). «Пара генов из основного комплекса гистосовместимости человека кодирует крупные пролиновые белки с множественными повторными мотивами и одним убиквитин-подобным доменом» . Proc Natl Acad Sci USA . 87 (6): 2374–8. Bibcode : 1990pnas ... 87.2374b . doi : 10.1073/pnas.87.6.2374 . PMC 53689 . PMID 2156268 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: BAT3 HLA-B Associated Transcript 3» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]