Лизидин (нуклеозид)
| |
| Имена | |
|---|---|
| Название ИЮПАК
2-Амино-6-[4-амино-1-(3,4-дигидрокси-5-гидроксиметилоксолан-2-ил)-1H - пиримидин-2-илиденамино]гексановая кислота
| |
| Другие имена
4-Амино-2-(N(6)-лизино)-1-рибофуранозилпиримидин, 2-лизилцитидин
| |
| Идентификаторы | |
3D model ( JSmol )
|
|
| ХимическийПаук | |
ПабХим CID
|
|
Панель управления CompTox ( EPA )
|
|
| Характеристики | |
| С 15 Н 25 Н 5 О 6 | |
| Молярная масса | 371.39 g/mol |
Если не указано иное, данные приведены для материалов в стандартном состоянии (при 25 °C [77 °F], 100 кПа).
| |
Лизидин – необычный нуклеозид , редко встречающийся вне тРНК . Это производное цитидина , в котором карбонил заменен аминокислотой лизином . Третье положение в антикодоне изолейцин-специфической тРНК обычно меняется с цитидина, который образует пару с гуанозином , на лизидин, который образует пару оснований с аденозином . Лизидин улучшает точность трансляции, поскольку уридин не может использоваться в этом положении, даже если он является обычным партнером аденозина, поскольку он также будет « колебать пару оснований » с гуанозином. [ 1 ] [ 2 ] Лизидин обозначается как L [ 3 ] или к 2 С [ 4 ] (лизин связан с атомом С2 цитидина).
Пары оснований лизидина с аденозином в контексте пары оснований цитидина и гуанозина. R = рибоза. Стрелки указывают водородные связи, идущие от атомов водорода к акцептору связи. Обозначение лизидина L приведено выше.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Наканиси, Котаро; Фукай, Сюя; Икеучи, Ёсихо; Сома, Акико; Секинэ, Ясухико; Сузуки, Цутому; Нуреки, Осаму (24 мая 2005 г.). «Структурная основа образования лизидина АТФ-пирофосфатазой, сопровождаемая лизин-специфической петлей и доменом распознавания тРНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (21): 7487–7492. Бибкод : 2005PNAS..102.7487N . дои : 10.1073/pnas.0501003102 . ПМК 1140429 . ПМИД 15894617 .
- ^ Салове, Скотт П.; Уилси, Джудианн; Хокинс, Хулио К.; Сонаторе, Лиза М. (апрель 2009 г.). «Каталитическая гибкость тРНК-лизидинсинтетазы может создавать альтернативные субстраты тРНК для изолейцил-тРНК-синтетазы» . Журнал биологической химии . 284 (15): 9656–9662. дои : 10.1074/jbc.M809013200 . ПМК 2665086 . ПМИД 19233850 .
- ^ Наканиси, Котаро; Боннефонд, Люк; Кимура, Сатоши; Сузуки, Цутому; Ишитани, Рюитиро; Нуреки, Осаму (октябрь 2009 г.). «Структурная основа точности трансляции, обеспечиваемая транспортной РНК-лизидинсинтетазой». Природа . 461 (7267): 1144–1148. Бибкод : 2009Natur.461.1144N . дои : 10.1038/nature08474 . ПМИД 19847269 . S2CID 4426738 .
- ^ Сонаване, Кайлас Д.; Тевари, Равиндра (19 сентября 2008 г.). «Конформационные предпочтения гипермодифицированного нуклеозида лизидина (k 2 В) Возникает в положении «колебания» в антикодоновой петле тРНК. С ". Нуклеозиды, нуклеотиды и нуклеиновые кислоты . 27 (10–11): 1158–1174. : 10.1080 /15257770802341475 . PMID 18788046. . S2CID 25220901 doi