POLR2J

POLR2J
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	5FLM, 5IY9, 5IYA, 5IYC, 5IYB, 5IY7, 5IY8, 5IYD, 5IY6
Идентификаторы
Псевдонимы	POLR2J , POLR2J1, RPB11, RPB11A, RPB11m, hRPB14, субъединица J полимеразы (РНК) II, субъединица J РНК-полимеразы II
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 604150 ; МГИ : 109582 ; Гомологен : 4542 ; Генные карты : POLR2J ; OMA : POLR2J — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 7 (human)
End	102,478,922 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	136,151,801 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	gastrocnemius muscle; ; muscle of thigh; ; apex of heart; ; left ventricle; ; right auricle; ; left adrenal cortex; ; mucosa of transverse colon; ; substantia nigra; ; putamen; ; amygdala;
	Top expressed in
	yolk sac; ; zygote; ; embryo; ; morula; ; embryo; ; otic placode; ; internal carotid artery; ; ventricular zone; ; primary oocyte; ; epiblast;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; LRR domain binding; protein dimerization activity; DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity; protein binding; RNA polymerase II activity;
Cellular component	nucleoplasm; nucleus; RNA polymerase II, core complex;
Biological process	mRNA splicing, via spliceosome; transcription elongation from RNA polymerase II promoter; 7-methylguanosine mRNA capping; transcription-coupled nucleotide-excision repair; transcription initiation from RNA polymerase II promoter; snRNA transcription by RNA polymerase II; fibroblast growth factor receptor signaling pathway; RNA metabolic process; regulation of gene silencing by miRNA; transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; somatic stem cell population maintenance; positive regulation of viral transcription;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	5439
	20022
	ENSG00000005075
	ENSMUSG00000039771
	P52435
	О08740
	НМ_006234 ; НМ_001371100 ; НМ_001393919
	НМ_011293
	НП_006225 ; НП_001358029
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Субъединица ДНК-ориентированной РНК-полимеразы II RPB11-a представляет собой фермент , который у человека кодируется POLR2J геном .

Функция

Этот ген кодирует субъединицу РНК-полимеразы II, полимеразы, ответственной за синтез информационной РНК у эукариот. Продукт этого гена существует в виде гетеродимера с другой субъединицей полимеразы; вместе они образуют основную единицу сборки полимеразы. Два подобных гена расположены рядом на хромосоме 7q22.1, а псевдоген обнаружен на хромосоме 7p13. ^{[ 5 ]}

Взаимодействия

Было показано, что POLR2J взаимодействует с:

Фактор транскрипции, антагонизирующий апоптоз , ^{[ 6 ]}
ПОЛР2С , ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} и
САТБ1 . ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000005075 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039771 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Энтреза: полипептид J полимеразы (РНК) II (ДНК) POLR2J, 13,3 кДа» .
^ Фанчулли М., Бруно Т., Ди Падова М., Де Анжелис Р., Иецци С., Якобини С., Флориди А., Пассананти С. (май 2000 г.). «Идентификация нового партнера субъединицы 11 РНК-полимеразы II, Che-1, который взаимодействует с функцией подавления роста Rb и влияет на нее» . ФАСЕБ Дж . 14 (7): 904–12. дои : 10.1096/fasebj.14.7.904 . ПМИД 10783144 . S2CID 43175069 .
^ Акер Дж., де Грааф М., Чейнель И., Хазак В., Кедингер С., Виньерон М. (июль 1997 г.). «Взаимодействие между субъединицами РНК-полимеразы II человека» . Ж. Биол. Хим . 272 (27): 16815–21. дои : 10.1074/jbc.272.27.16815 . ПМИД 9201987 .
^ Корби Н., Ди Падова М., Де Анжелис Р., Бруно Т., Либри В., Иецци С., Флориди А., Фанчулли М., Пассананти С. (октябрь 2002 г.). «Основная субъединица 3 альфа-подобной РНК-полимеразы II (RPB3) участвует в тканеспецифической транскрипции и дифференцировке мышц посредством взаимодействия с миогенным фактором миогенином» . ФАСЭБ Дж. 16 (12): 1639–41. doi : 10.1096/fj.02-0123fje . ПМИД 12207009 . S2CID 30243193 .
^ Дуррин Л.К., Кронтирис Т.Г. (июнь 2002 г.). «Тимоцит-специфичный MAR-связывающий белок, SATB1, взаимодействует in vitro с новым вариантом ДНК-направленной РНК-полимеразы II, субъединицы 11». Геномика . 79 (6): 809–17. дои : 10.1006/geno.2002.6772 . ПМИД 12036295 .

Дальнейшее чтение

Жанг КТ (1998). «Tat, Tat-ассоциированная киназа и транскрипция». Дж. Биомед. Наука . 5 (1): 24–7. дои : 10.1007/BF02253352 . ПМИД 9570510 .
Янкулов К, Бентли Д (1998). «Транкрипционный контроль: кофакторы Tat и элонгация транскрипции» . Курс. Биол . 8 (13): Р447–9. Бибкод : 1998CBio....8.R447Y . дои : 10.1016/S0960-9822(98)70289-1 . ПМИД 9651670 . S2CID 15480646 .
Романо Дж., Кастен М., Де Фалько Дж., Микели П., Халили К., Джордано А. (2000). «Регуляторные функции Cdk9 и циклина T1 в экспрессии гена пути трансактивации tat ВИЧ». Дж. Селл. Биохим . 75 (3): 357–68. doi : 10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID-JCB1>3.0.CO;2-K . ПМИД 10536359 . S2CID 43685090 .
Марчелло А., Зоппе М., Джакка М. (2002). «Множественные способы регуляции транскрипции с помощью трансактиватора Tat ВИЧ-1» . ИУБМБ Жизнь . 51 (3): 175–81. дои : 10.1080/152165401753544241 . ПМИД 11547919 . S2CID 10931640 .
Стивенс М., Де Клерк Э., Бальзарини Дж. (2007). «Регуляция транскрипции ВИЧ-1: молекулярные мишени для химиотерапевтического вмешательства» . Медресе преп . 26 (5): 595–625. дои : 10.1002/мед.20081 . ПМЦ 7168390 . ПМИД 16838299 .
Харрич Д., Макмиллан Н., Муньос Л., Аполлони А., Мередит Л. (2007). «Приведут ли разнообразные взаимодействия Tat к созданию новых мишеней для антиретровирусных препаратов?». Текущие цели по борьбе с наркотиками . 7 (12): 1595–606. дои : 10.2174/138945006779025338 . PMID 17168834 .
Като Х., Сумимото Х., Поньонек П., Чен Ч., Розен К.А., Редер Р.Г. (1992). «Тат ВИЧ-1 действует как фактор процессивности in vitro в сочетании с факторами клеточной элонгации» . Генс Дев . 6 (4): 655–66. дои : 10.1101/gad.6.4.655 . ПМИД 1559613 .
Саутгейт С., Зепп М.Л., Грин М.Р. (1990). «Активация транскрипции белком Tat ВИЧ-1, привязанным к зарождающейся РНК через другой белок». Природа . 345 (6276): 640–2. Бибкод : 1990Natur.345..640S . дои : 10.1038/345640a0 . ПМИД 2190099 . S2CID 4233742 .
Ву-Баер Ф., Сигман Д., Гейнор Р.Б. (1995). «Специфическое связывание РНК-полимеразы II с РНК трансактивирующей области вируса иммунодефицита человека регулируется клеточными кофакторами и Tat» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 92 (16): 7153–7. Бибкод : 1995PNAS...92.7153W . дои : 10.1073/pnas.92.16.7153 . ПМК 41297 . ПМИД 7638159 .
Херрманн Ч., Райс А.П. (1995). «Белки Tat лентивируса специфически связываются с клеточной протеинкиназой ТАК, которая гиперфосфорилирует карбоксил-концевой домен большой субъединицы РНК-полимеразы II: кандидат на роль кофактора Tat» . Дж. Вирол . 69 (3): 1612–20. doi : 10.1128/JVI.69.3.1612-1620.1995 . ЧВК 188757 . ПМИД 7853496 .
Кин, Нью-Джерси, Гейт М.Дж., Карн Дж. (1996). «Tat вируса иммунодефицита человека типа 1 является неотъемлемым компонентом активированного комплекса транскрипции-элонгации» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 93 (6): 2505–10. Бибкод : 1996PNAS...93.2505K . дои : 10.1073/pnas.93.6.2505 . ПМК 39827 . ПМИД 8637904 .
Ян X, Херрманн CH, Райс А.П. (1996). «Белки Tat вируса иммунодефицита человека специфически связываются с TAK in vivo и для функционирования требуют карбоксильно-концевого домена РНК-полимеразы II» . Дж. Вирол . 70 (7): 4576–84. doi : 10.1128/JVI.70.7.4576-4584.1996 . ПМК 190394 . ПМИД 8676484 .
Фанчулли М, Бруно Т, Чербони С, Бонетто Ф, Якобини С, Фрати Л, Пикколи М, Флориди А, Сантони А, Пунтурьери А (1996). «Клонирование новой субъединицы человеческой РНК-полимеразы II, активность которой снижается доксорубицином: новые потенциальные механизмы токсичности, связанной с лекарственными средствами». ФЭБС Летт . 384 (1): 48–52. дои : 10.1016/0014-5793(96) 00277-3 ПМИД 8797801 . S2CID 7809458 .
Агостини I, Наварро Дж. М., Рей Ф., Бухамдан М., Спайр Б., Вин Р., Сир Дж. (1996). «Трансактиватор Vpr вируса иммунодефицита человека типа 1: сотрудничество со связанными с промотором активаторными доменами и связывание с TFIIB». Дж. Мол. Биол . 261 (5): 599–606. дои : 10.1006/jmbi.1996.0485 . ПМИД 8800208 .
Чжоу Ц, Шарп, Пенсильвания (1996). «Tat-SF1: кофактор стимуляции элонгации транскрипции с помощью Tat ВИЧ-1». Наука . 274 (5287): 605–10. Бибкод : 1996Sci...274..605Z . дои : 10.1126/science.274.5287.605 . ПМИД 8849451 . S2CID 13266489 .
Окамото Х., Шелин К.Т., Корден Дж.Л., Джонс К.А., Петерлин Б.М. (1996). «Транс-активация белка Tat вируса иммунодефицита человека требует С-концевого домена РНК-полимеразы II» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 93 (21): 11575–9. Бибкод : 1996PNAS...9311575O . дои : 10.1073/pnas.93.21.11575 . ПМК 38099 . ПМИД 8876177 .
Чун РФ, Жанг КТ (1996). «Требования к карбоксильному домену РНК-полимеразы II для активированной транскрипции ретровирусов человека, Т-клеточного лимфотропного вируса человека I и ВИЧ-1» . Ж. Биол. Хим . 271 (44): 27888–94. дои : 10.1074/jbc.271.44.27888 . ПМИД 8910388 .
Парада Калифорния, Редер Р.Г. (1996). «Повышенная процессивность РНК-полимеразы II, запускаемая Tat-индуцированным фосфорилированием ее карбокси-концевого домена». Природа . 384 (6607): 375–8. Бибкод : 1996Natur.384..375P . дои : 10.1038/384375a0 . ПМИД 8934526 . S2CID 4278432 .
Гарсиа-Мартинес Л.Ф., Иванов Д., Гейнор Р.Б. (1997). «Ассоциация Tat с очищенными комплексами преинициации транскрипции ВИЧ-1 и ВИЧ-2» . Ж. Биол. Хим . 272 (11): 6951–8. дои : 10.1074/jbc.272.11.6951 . ПМИД 9054383 .
Кужек Т.П., Чо Х., Мальдонадо Э., Мейер Дж., Рейнберг Д., Петерлин Б.М. (1997). «Трансактиватор вируса иммунодефицита человека Tat взаимодействует с голоферментом РНК-полимеразы II» . Мол. Клетка. Биол . 17 (4): 1817–23. дои : 10.1128/mcb.17.4.1817 . ПМК 232028 . ПМИД 9121429 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 7 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000005075 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039771 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[5] «Ген Энтреза: полипептид J полимеразы (РНК) II (ДНК) POLR2J, 13,3 кДа» .

[pmid10783144-6] Фанчулли М., Бруно Т., Ди Падова М., Де Анжелис Р., Иецци С., Якобини С., Флориди А., Пассананти С. (май 2000 г.). «Идентификация нового партнера субъединицы 11 РНК-полимеразы II, Che-1, который взаимодействует с функцией подавления роста Rb и влияет на нее» . ФАСЕБ Дж . 14 (7): 904–12. дои : 10.1096/fasebj.14.7.904 . ПМИД 10783144 . S2CID 43175069 .

[pmid9201987-7] Акер Дж., де Грааф М., Чейнель И., Хазак В., Кедингер С., Виньерон М. (июль 1997 г.). «Взаимодействие между субъединицами РНК-полимеразы II человека» . Ж. Биол. Хим . 272 (27): 16815–21. дои : 10.1074/jbc.272.27.16815 . ПМИД 9201987 .

[pmid12207009-8] Корби Н., Ди Падова М., Де Анжелис Р., Бруно Т., Либри В., Иецци С., Флориди А., Фанчулли М., Пассананти С. (октябрь 2002 г.). «Основная субъединица 3 альфа-подобной РНК-полимеразы II (RPB3) участвует в тканеспецифической транскрипции и дифференцировке мышц посредством взаимодействия с миогенным фактором миогенином» . ФАСЭБ Дж. 16 (12): 1639–41. doi : 10.1096/fj.02-0123fje . ПМИД 12207009 . S2CID 30243193 .

[pmid12036295-9] Дуррин Л.К., Кронтирис Т.Г. (июнь 2002 г.). «Тимоцит-специфичный MAR-связывающий белок, SATB1, взаимодействует in vitro с новым вариантом ДНК-направленной РНК-полимеразы II, субъединицы 11». Геномика . 79 (6): 809–17. дои : 10.1006/geno.2002.6772 . ПМИД 12036295 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]