ПУМ1

ПУМ1
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB показывать Список идентификационных кодов PDB 1IB2, 1M8W, 1M8X, 1M8Y, 1M8Z, 2YJY, 3BSB, 3BSX, 3Q0L, 3Q0M, 3Q0N, 3Q0O, 3Q0P
Идентификаторы
Псевдонимы	PUM1 , HSPUM, PUMH, PUMH1, PUML1, член 1 семейства РНК-связывающих pumilio, SCA47
Внешние идентификаторы	Опустить : 607204 ; МГИ : 1931749 ; Гомологен : 22830 ; Генные карты : PUM1 ; ОМА : PUM1 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 1 (human) Band 1p35.2 Start 30,931,506 bp End 31,065,991 bp
показывать экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in dorsal motor nucleus of vagus nerve Region I of hippocampus proper germinal epithelium superficial temporal artery visceral pleura tibia inferior olivary nucleus gingival epithelium hair follicle parietal pleura n/a More reference expression data BioGPS More reference expression data
показывать Генная онтология Molecular function mRNA 3'-UTR binding protein binding RNA binding miRNA binding Cellular component cytoplasm P-body cytoplasmic stress granule nucleus nucleoplasm cytosol nuclear speck Biological process regulation of gene silencing by miRNA cell differentiation regulation of mRNA stability adult locomotory behavior positive regulation of gene silencing by miRNA stem cell differentiation regulation of cell cycle posttranscriptional gene silencing regulation of chromosome segregation positive regulation of RIG-I signaling pathway mRNA destabilization spermatogenesis regulation of translation posttranscriptional regulation of gene expression production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи Разновидность Человек Мышь Входить 9698 80912 Вместе ENSG00000134644 ENSMUSG00000028580 ЮниПрот Q14671 Q80U78 RefSeq (мРНК) НМ_014676 НМ_001020658 НМ_001159603 НМ_001159604 НМ_001159605 НМ_001159606 НМ_030722 RefSeq (белок) НП_001018494 НП_055491 показывать НП_001153075 НП_001153076 НП_001153077 НП_001153078 НП_109647 NP_001343493 NP_001343494 NP_001343495 Местоположение (UCSC) Чр 1: 30,93 – 31,07 Мб н/д в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Гомолог 1 Pumilio — это белок , который у человека кодируется PUM1 геном .

Функция

Этот ген кодирует члена семейства PUF, эволюционно консервативных РНК-связывающих белков, родственных белкам Pumilio дрозофилы и белкам фактора связывания мРНК fem-3 C. elegans . Кодируемый белок содержит специфичный для последовательности РНК-связывающий домен, состоящий из восьми повторов и N- и C-концевых фланкирующих областей, и служит регулятором трансляции специфических мРНК путем связывания с их 3'-нетранслируемыми областями. Эволюционно консервативная функция кодируемого белка у беспозвоночных и низших позвоночных предполагает, что человеческий белок может участвовать в трансляционной регуляции эмбриогенеза , а также развития и дифференцировки клеток. Альтернативно были описаны варианты сплайсированных транскриптов, кодирующие разные изоформы.

Дальнейшее чтение

• Спасов Д.С., Юричич Р. (2004). «Семейство РНК-связывающих белков PUF: соответствует ли эволюционно консервативная структура консервативной функции?» . ИУБМБ Жизнь . 55 (7): 359–66. дои : 10.1080/15216540310001603093 . ПМИД   14584586 .
• Нагасе Т., Миядзима Н., Танака А. и др. (1995). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. III. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0081-KIAA0120), выведенные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1» . ДНК Рез . 2 (1): 37–43. дои : 10.1093/dnares/2.1.37 . ПМИД   7788527 .
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД   8125298 .
• Сузуки И., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД   9373149 .
• Ван X, Замор П.Д., Холл ТМ (2001). «Кристаллическая структура домена гомологии Пумилио» . Мол. Клетка . 7 (4): 855–65. дои : 10.1016/S1097-2765(01)00229-5 . ПМИД   11336708 .
• Ван X, Маклахлан Дж, Замор П.Д., Холл ТМ (2002). «Модульное распознавание РНК доменом пумилио-гомологии человека» . Клетка . 110 (4): 501–12. дои : 10.1016/S0092-8674(02)00873-5 . ПМИД   12202039 . S2CID   13644449 .
• Спасов Д.С., Юричич Р. (2003). «Клонирование и сравнительный анализ последовательностей генов PUM1 и PUM2, членов семейства РНК-связывающих белков человека Pumilio». Джин . 299 (1–2): 195–204. дои : 10.1016/S0378-1119(02)01060-0 . ПМИД   12459267 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Дазард Дж.Э., Гал Х., Амариглио Н. и др. (2003). «Полногеномное сравнение реакции кератиноцитов человека и плоскоклеточной карциномы на облучение UVB: последствия для рака кожи и эпителия» . Онкоген . 22 (19): 2993–3006. дои : 10.1038/sj.onc.1206537 . ПМИД   12771951 .
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД   14702039 .
• Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С. и др. (2005). «Описание характеристик транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Нат. Биотехнология . 22 (6): 707–16. дои : 10.1038/nbt971 . ПМИД   15146197 . S2CID   27764390 .
• Колланд Ф., Жак Икс, Труплин В. и др. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека» . Геном Рез . 14 (7): 1324–32. дои : 10.1101/гр.2334104 . ПМК   442148 . ПМИД   15231748 .
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК   528928 . ПМИД   15489334 .
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД   16189514 . S2CID   4427026 .
• Иорданова А., Ироби Дж., Томас Ф.П. и др. (2006). «Нарушение функции и аксональное распределение мутантной тирозил-тРНК-синтетазы при доминантной промежуточной невропатии Шарко-Мари-Тута» . Нат. Жене . 38 (2): 197–202. дои : 10.1038/ng1727 . ПМИД   16429158 . S2CID   16668375 .
• Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклей К.Э. и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы 1 человека» . Природа . 441 (7091): 315–21. Бибкод : 2006Natur.441..315G . дои : 10.1038/nature04727 . ПМИД   16710414 .
• Лим Дж., Хао Т., Шоу С. и др. (2006). «Сеть белок-белкового взаимодействия при наследственных атаксиях человека и нарушениях дегенерации клеток Пуркинье» . Клетка . 125 (4): 801–14. дои : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . ПМИД   16713569 . S2CID   13709685 .
• Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД   17081983 . S2CID   7827573 .