ДДЕФ2

как можно скорее2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1DCQ
Идентификаторы
Псевдонимы	ASAP2 , AMAP2, CENTB3, DDEF2, PAG3, PAP, Pap-альфа, SHAG1, ArfGAP с доменом SH3, анкириновым повтором и доменом PH 2
Внешние идентификаторы	Опустить : 603817 ; МГИ : 2685438 ; Гомологен : 2888 ; GeneCards : ASAP2 ; OMA : ASAP2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	9,405,683 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 12 (mouse)
End	21,320,172 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	secondary oocyte; ; sperm; ; synovial joint; ; renal medulla; ; amniotic fluid; ; cartilage tissue; ; buccal mucosa cell; ; skin of hip; ; mucosa of colon; ; mucosa of sigmoid colon;
	Top expressed in
	lumbar subsegment of spinal cord; ; ascending aorta; ; tail of embryo; ; epithelium of stomach; ; hand; ; genital tubercle; ; endothelial cell of lymphatic vessel; ; aortic valve; ; secondary oocyte; ; lateral geniculate nucleus;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; metal ion binding; GTPase activator activity;
Cellular component	cytoplasm; Golgi cisterna membrane; plasma membrane; Golgi apparatus; membrane;
Biological process	positive regulation of GTPase activity;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	8853
	211914
	ENSG00000151693
	ENSMUSG00000052632
	О43150
	Q7SIG6
	НМ_001135191 ; НМ_003887
	НМ_001004364 ; НМ_001098168 ; НМ_001135192
	НП_001128663 ; НП_003878
	НП_001004364 ; НП_001091637 ; НП_001128664
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Arf-GAP с доменом SH3, повтором ANK и белком 2, содержащим домен PH, представляет собой белок , который у человека кодируется ASAP2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Этот ген кодирует мультидоменный белок, содержащий N-концевую альфа-спиральную область с мотивом спиральной спирали, за которой следуют домен гомологии плекстрина (PH), домен Arf-GAP, область гомологии анкирина, богатая пролином область и С-концевой домен гомологии Src 3 (SH3). Белок локализуется в аппарате Гольджи и на плазматической мембране, где он колокализуется с протеинтирозинкиназой 2-бета (PYK2). Кодируемый белок образует стабильный комплекс с PYK2 in vivo. Это взаимодействие, по-видимому, опосредовано связыванием его домена SH3 с C-концевым, богатым пролином доменом PYK2. Кодируемый белок представляет собой тирозин, фосфорилированный активированным PYK2. In vitro он демонстрирует сильную активность белка, активирующего ГТФазу (GAP), по отношению к малым ГТФазам, фактору АДФ-рибозилирования (ARF) 1 и ARF5, и слабую активность по отношению к ARF6. Считается, что кодируемый белок функционирует как ARF GAP, который контролирует ARF-опосредованное отпочкование везикул при их рекрутировании на мембраны Гольджи. Кроме того, он действует как субстрат и нижестоящая мишень для PYK2 и SRC, пути, который может участвовать в регуляции везикулярного транспорта. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что DDEF2 взаимодействует с PTK2B . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000151693 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000052632 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Андреев Дж., Саймон Дж.П., Сабатини Д.Д., Кам Дж., Плауман Г., Рандаццо П.А., Шлессингер Дж. (март 1999 г.). «Идентификация нового целевого белка Pyk2 с активностью Arf-GAP» . Мол Клеточная Биол . 19 (3): 2338–50. дои : 10.1128/MCB.19.3.2338 . ПМК 84026 . ПМИД 10022920 .
^ Исикава К., Нагасе Т., Накадзима Д., Секи Н., Охира М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (февраль 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. VIII. 78 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . ДНК Рез . 4 (5): 307–13. дои : 10.1093/dnares/4.5.307 . ПМИД 9455477 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: фактор 2, усиливающий развитие и дифференцировку DDEF2» .
^ Андреев Ю; Саймон Дж. П.; Сабатини Д.Д.; Кам Дж; Пахарь Г; Рандаццо, Пенсильвания; Шлессинджер Дж. (март 1999 г.). «Идентификация нового целевого белка Pyk2 с активностью Arf-GAP» . Мол. Клетка. Биол . 19 (3): 2338–50. дои : 10.1128/MCB.19.3.2338 . ISSN 0270-7306 . ПМК 84026 . ПМИД 10022920 .

Дальнейшее чтение

Браун М.Т., Андраде Дж., Радхакришна Х. и др. (1998). «ASAP1, фосфолипид-зависимый белок, активирующий Arf-GTPase, который связывается с Src и фосфорилируется им» . Мол. Клетка. Биол . 18 (12): 7038–51. дои : 10.1128/MCB.18.12.7038 . ПМК 109286 . ПМИД 9819391 .
Кондо А., Хашимото С., Яно Х. и др. (2000). «Новый паксиллин-связывающий белок, PAG3/Papα/KIAA0400, несущий белковую активность, активирующую фактор АДФ-рибозилирования ГТФазу, участвует в привлечении паксиллина к фокальным адгезиям и миграции клеток» . Мол. Биол. Клетка . 11 (4): 1315–27. дои : 10.1091/mbc.11.4.1315 . ПМК 14849 . ПМИД 10749932 .
Учида Х., Кондо А., Ёсимура Ю. и др. (2001). «Pag3/Papα/Kiaa0400, белок, активирующий Gtpase для фактора адп-рибозилирования (Arf), регулирует Arf6 в фагоцитозе макрофагов, опосредованном рецептором Fcγ» . Дж. Эксп. Мед . 193 (8): 955–66. дои : 10.1084/jem.193.8.955 . ПМК 2193405 . ПМИД 11304556 .
Ким Х, Ли Ю (2002). «Взаимодействие поли(А)-полимеразы с субъединицей фактора расщепления I массой 25 кДа». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 289 (2): 513–8. дои : 10.1006/bbrc.2001.5992 . ПМИД 11716503 .
Осиро Т., Кояма С., Сугияма С. и др. (2002). «Взаимодействие POB1, нижестоящей молекулы небольшого G-белка Ral, с PAG2, паксиллин-связывающим белком, участвует в миграции клеток» . Ж. Биол. Хим . 277 (41): 38618–26. дои : 10.1074/jbc.M203453200 . ПМИД 12149250 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Хасимото С., Хашимото А., Ямада А. и др. (2004). «Новый механизм действия ArfGAP, AMAP2/PAG3/Papa lpha, в функции Arf6» . Ж. Биол. Хим . 279 (36): 37677–84. дои : 10.1074/jbc.M404196200 . ПМИД 15231847 .
Кодзима С., Хасимото А., Ябута И. и др. (2005). «Регуляция связывания домена SH3 Bin1 с помощью фосфоинозитидов» . ЭМБО Дж . 23 (22): 4413–22. дои : 10.1038/sj.emboj.7600442 . ПМК 526460 . ПМИД 15483625 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Онодера И., Хашимото С., Хашимото А. и др. (2005). «Экспрессия AMAP1, ArfGAP, обеспечивает новые цели для ингибирования инвазивной активности рака молочной железы» . ЭМБО Дж . 24 (5): 963–73. дои : 10.1038/sj.emboj.7600588 . ПМЦ 554134 . ПМИД 15719014 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

статья о гене на хромосоме 2 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000151693 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000052632 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10022920-5] Андреев Дж., Саймон Дж.П., Сабатини Д.Д., Кам Дж., Плауман Г., Рандаццо П.А., Шлессингер Дж. (март 1999 г.). «Идентификация нового целевого белка Pyk2 с активностью Arf-GAP» . Мол Клеточная Биол . 19 (3): 2338–50. дои : 10.1128/MCB.19.3.2338 . ПМК 84026 . ПМИД 10022920 .

[pmid9455477-6] Исикава К., Нагасе Т., Накадзима Д., Секи Н., Охира М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (февраль 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. VIII. 78 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . ДНК Рез . 4 (5): 307–13. дои : 10.1093/dnares/4.5.307 . ПМИД 9455477 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: фактор 2, усиливающий развитие и дифференцировку DDEF2» .

[autogenerated1-8] Андреев Ю; Саймон Дж. П.; Сабатини Д.Д.; Кам Дж; Пахарь Г; Рандаццо, Пенсильвания; Шлессинджер Дж. (март 1999 г.). «Идентификация нового целевого белка Pyk2 с активностью Arf-GAP» . Мол. Клетка. Биол . 19 (3): 2338–50. дои : 10.1128/MCB.19.3.2338 . ISSN 0270-7306 . ПМК 84026 . ПМИД 10022920 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]