Коллаген C4 типа IV
C4 | |||
---|---|---|---|
![]() Кристаллическая структура 1,9-А неколлагенового (NC1) домена Placenta Collagen IV человека демонстрирует стабилизацию с помощью нового типа ковалентных меток-сшивок | |||
Идентификаторы | |||
Символ | C4 | ||
Pfam | PF01413 | ||
PFAM клан | CL0056 | ||
InterPro | IPR001442 | ||
УМНЫЙ | C4 | ||
PROSITE | PDOC00031 | ||
Мероп | C47 | ||
Краткое содержание | 1HRA / Scope / SUPFAM | ||
TCDB | 2.A.16 | ||
|
В молекулярной биологии домен коллагена C4 типа IV (или домен Collagen IV NC1) является дублированным доменом, присутствующим на C-конце коллагенов типа IV . Каждый коллаген типа IV содержит длинный тройной коллагеновый домен, окруженный коротким доменом 7S из 25 аминокислот и глобулярным неколлагеновым доменом C4 ~ 230 аминокислот на терминале N и C, соответственно. В сборе протомеров домены C4 трех цепей взаимодействуют, образуя тример C4, чтобы выбрать и зарегистрировать цепи для формирования тройной спирали . В сетевой сборке C4 тримеры двух протомеров взаимодействуют, образуя гексамерную структуру C4, чтобы выбрать и подключить протомеры. [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ]
Домен коллагена IV C4 содержит 12 цистеинов , и все они участвуют в дисульфидных связях . Он складывается в третичную структуру с преимущественно бета-цепи. Домен коллагена IV C4 состоит из двух аналогичных сложенных субдоменов, стабилизированных 3 внутрипольными дисульфидными связями, включающими следующие пары: C1-C6, C2-C5 и C3-C4. Каждый субдомен представляет собой компактную дисульфидную, стабилизированную треугольной структурой, из которой проектирует петля, похожая на пальца, в не полностью образованный шестицепочечный бета-лист соседнего субдомена одного или смежного цепного зажима, плотно вместе. [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а беременный Чем я, Хенрих С., Хубер Р., Рис А., Манн К., Кун К., Тимпл Р., Буренков Г.П., Бартуник Х.Д., Боде В. (май 2002). «Кристаллическая структура 1.9-A неколлагенового (NC1) домена Placenta Collagen IV человека показывает стабилизацию с помощью нового типа поперечной связи с ковалентами Met-Lys» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (10): 6607–12. doi : 10.1073/pnas.062183499 . PMC 124450 . PMID 12011424 .
- ^ Jump up to: а беременный Sundaramoorthy M, Meiyappan M, Todd P, Hudson BG (август 2002 г.). «Кристаллическая структура доменов NC1. Структурная основа для сборки коллагена типа IV в подвальных мембранах» . Дж. Биол. Химический 277 (34): 31142–53. doi : 10.1074/jbc.m201740200 . PMID 11970952 .
- ^ Jump up to: а беременный Ванакор Р.М., Шанмугасундарарадж С., Фридман Д.Б., Бондар О., Хадсон Б.Г., Сундарамурти М (октябрь 2004 г.). «Сеть Alpha1.alpha2 коллагена IV. Усиленная стабилизация неколлагенового домена-1 нековалентными силами и отсутствие перекрестных связей Met-Lys» . Дж. Биол. Химический 279 (43): 44723–30. doi : 10.1074/jbc.m406344200 . PMID 15299013 .