РАП1Б

РАП1Б
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB показывать Список идентификационных кодов PDB 3BRW, 3CF6, 4DXA, 4HDO, 4HDQ, 4M8N, 4MGI, 4MGK, 4MGY, 4MGZ, 4MH0
Идентификаторы
Псевдонимы	RAP1B , K-REV, RAL1B, член семейства онкогенов РАС.
Внешние идентификаторы	Опустить : 179530 ; МГИ : 894315 ; Гомологен : 68719 ; Генные карты : RAP1B ; ОМА : RAP1B – ортологи
показывать Местоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 12 (human) Band 12q15 Start 68,610,855 bp End 68,671,901 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 10 (mouse) Band 10|10 D2 Start 117,649,776 bp End 117,681,940 bp
показывать экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in monocyte Achilles tendon lymph node granulocyte appendix endometrium smooth muscle tissue gonad tibial arteries bone marrow Top expressed in left lung lobe blood decidua stroma of bone marrow right lung lobe endocardial cushion ureter dermis gastrula endothelial cell of lymphatic vessel More reference expression data BioGPS n/a
показывать Генная онтология Molecular function nucleotide binding GDP binding protein-containing complex binding GTP binding protein binding GTPase activity Cellular component cytoplasm cytosol membrane cell-cell junction plasma membrane lipid droplet intracellular anatomical structure cell junction membrane raft extracellular exosome azurophil granule membrane Biological process establishment of endothelial barrier microvillus assembly regulation of cell junction assembly Rap protein signal transduction regulation of establishment of cell polarity cellular response to cAMP signal transduction neutrophil degranulation interleukin-12-mediated signaling pathway small GTPase mediated signal transduction cell population proliferation response to carbohydrate negative regulation of calcium ion-dependent exocytosis positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade cellular response to organic cyclic compound cellular response to gonadotropin-releasing hormone negative regulation of synaptic vesicle exocytosis Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи Разновидность Человек Мышь Входить 5908 215449 Вместе ENSG00000127314 ENSMUSG00000052681 ЮниПрот P61224 Q99JI6 RefSeq (мРНК) показывать НМ_015646 НМ_001010942 НМ_001251917 НМ_001251918 НМ_001251921 NM_001251922 НМ_024457 RefSeq (белок) показывать НП_001010942 НП_001238846 НП_001238847 НП_001238850 НП_001238851 NP_056461 NP_001010942.1 NP_056461.1 НП_077777 Местоположение (UCSC) Chr 12: 68,61 – 68,67 Мб Чр 10: 117,65 – 117,68 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Связанный с Ras белок Rap-1b , также известный как GTP-связывающий белок smg p21B , представляет собой белок , который у человека кодируется RAP1B геном .

Дальнейшее чтение

• Реманн Х., Ариас-Паломо Э., Хаддерс М.А. и др. (2008). «Структура Epac2 в комплексе с циклическим аналогом AMP и RAP1B». Природа . 455 (7209): 124–7. Бибкод : 2008Natur.455..124R . дои : 10.1038/nature07187 . ПМИД   18660803 . S2CID   4393652 .
• Гьян Э., Фрю М., Боуэн Д. и др. (2005). «Мутация в RAP1 является редким явлением при миелодиспластических синдромах» . Лейкемия . 19 (9): 1678–80. дои : 10.1038/sj.leu.2403882 . ПМИД   16118622 .
• Кармона Г., Геттиг С., Орланди А. и др. (2009). «Роль небольшой ГТФазы Rap1 в регуляции активности интегрина в эндотелиальных клетках и ангиогенезе» . Кровь . 113 (2): 488–97. дои : 10.1182/blood-2008-02-138438 . ПМИД   18805968 . S2CID   206868671 .
• Шаттил С.Дж. (2005). «Интегрины и Src: динамический дуэт передачи сигналов адгезии». Тенденции клеточной биологии . 15 (8): 399–403. дои : 10.1016/j.tcb.2005.06.005 . ПМИД   16005629 .
• Мальчинхуу Э., Сато К., Маехама Т. и др. (2009). «Роль Rap1B и супрессора опухоли PTEN в негативной регуляции изопротеренолом миграции, индуцированной лизофосфатидной кислотой, в клетках глиомы» . Мол. Биол. Клетка . 20 (24): 5156–65. doi : 10.1091/mbc.E09-08-0692 . ПМЦ   2793292 . ПМИД   19864456 .
• Даумке О., Вейанд М., Чакрабарти П.П. и др. (2004). «Белок Rap1GAP, активирующий ГТФазу, использует каталитический аспарагин». Природа . 429 (6988): 197–201. Бибкод : 2004Natur.429..197D . дои : 10.1038/nature02505 . ПМИД   15141215 . S2CID   4426744 .
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК   528928 . ПМИД   15489334 .
• Эдрейра М.М., Ли С., Хохбаум Д. и др. (2009). «Вызванные фосфорилированием конформационные изменения в Rap1b: аллостерические эффекты на переключающие домены и эффекторную петлю» . Ж. Биол. Хим . 284 (40): 27480–6. дои : 10.1074/jbc.M109.011312 . ПМЦ   2785677 . ПМИД   19651783 .
• Скрима А, Томас С, Дьяконеску Д, Виттингхофер А (2008). «Комплекс Rap-RapGAP: гидролиз GTP без каталитических остатков глутамина и аргинина» . ЭМБО Дж . 27 (7): 1145–53. дои : 10.1038/emboj.2008.30 . ПМК   2265111 . ПМИД   18309292 .
• Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Нуклеиновые кислоты Рез . 34 (Проблема с базой данных): D415-8. дои : 10.1093/nar/gkj139 . ПМЦ   1347501 . ПМИД   16381901 .
• Каноббио I, Трионфини П., Гуидетти Г.Ф. и др. (2008). «Нацеливание небольшой ГТФазы Rap2b, но не Rap1b, на липидные рафты обеспечивается пальмитоилированием Cys176 и Cys177 и необходимо для эффективной активации белка в тромбоцитах человека». Клетка. Сигнал . 20 (9): 1662–70. doi : 10.1016/j.cellsig.2008.05.016 . ПМИД   18582561 .
• Бернарди Б., Гуидетти Г.Ф., Кампус Ф. и др. (2006). «Маленькая ГТФаза Rap1b регулирует взаимодействие между интегрином альфа2бета1 тромбоцитов и интегрином альфаIIbbeta3» . Кровь . 107 (7): 2728–35. дои : 10.1182/кровь-2005-07-3023 . ПМЦ   1895386 . ПМИД   16357324 .
• Мацусэ М., Мицутаке Н., Рогоунович Т. и др. (2009). «Анализ мутаций гена RAP1 при папиллярном раке щитовидной железы» . Эндокр. Дж . 56 (1): 161–4. doi : 10.1507/endocrj.k08e-244 . ПМИД   18948674 .
• Виман С., Арлт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геном Рез . 14 (10Б): 2136–44. дои : 10.1101/гр.2576704 . ПМК   528930 . ПМИД   15489336 .
• Ли Й.Х., Вернер Х., Пюшель А.В. (2008). «Rheb и mTOR регулируют полярность нейронов посредством Rap1B» . Ж. Биол. Хим . 283 (48): 33784–92. дои : 10.1074/jbc.M802431200 . ПМЦ   2662285 . ПМИД   18842593 .
• Лова П., Кампус Ф., Ломбарди Р. и др. (2004). «Вклад активируемых протеазой рецепторов 1 и 4 и гликопротеина Ib-IX-V в G(i)-независимую активацию тромбоцитов Rap1B тромбином» . Ж. Биол. Хим . 279 (24): 25299–306. дои : 10.1074/jbc.M313199200 . PMID   15078882 .
• Ян Дж., Ли Ф., Ингрэм Д.А., Куильям Л.А. (2008). «Rap1a является ключевым регулятором ангиогенеза, индуцированного фактором роста фибробластов 2, и вместе с Rap1b контролирует функции эндотелиальных клеток человека» . Мол. Клетка. Биол . 28 (18): 5803–10. дои : 10.1128/MCB.00393-08 . ПМК   2546931 . ПМИД   18625726 .
• Кампус F, Лова П., Бертони А. и др. (2005). «Тромбопоэтин дополняет G(i)-, но не G(q)-зависимые пути активации интегрина {альфа}(IIb){бета}(3) и агрегации тромбоцитов» . Ж. Биол. Хим . 280 (26): 24386–95. дои : 10.1074/jbc.M501174200 . ПМИД   15863506 .
• Дефилиппи П., Ди Стефано П., Кабоди С. (2006). «p130Cas: универсальная платформа в сетях сигнализации». Тенденции клеточной биологии . 16 (5): 257–63. дои : 10.1016/j.tcb.2006.03.003 . ПМИД   16581250 .