TCEA1

TCEA1
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	1TFI, 3NDQ, 5IY7, 5IYA, 5IY6, 5IYB, 5IY8, 5IYC
Идентификаторы
Псевдонимы	TCEA1 , GTF2S, SII, TCEA, TF2S, TFIIS, Фактор удлинения транскрипции A1
Внешние идентификаторы	Омим : 601425 ; MGI : 1196624 ; Гомологен : 55984 ; GeneCards : TCEA1 ; OMA : TCEA1 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 8 (human)
End	54,022,456 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 1 (mouse)
End	4,968,132 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	trabecular bone; ; Achilles tendon; ; optic nerve; ; caput epididymis; ; cartilage tissue; ; tail of epididymis; ; corpus epididymis; ; skin of thigh; ; parotid gland; ; lactiferous duct;
	Top expressed in
	zygote; ; fetal liver hematopoietic progenitor cell; ; tail of embryo; ; secondary oocyte; ; medial ganglionic eminence; ; parotid gland; ; lacrimal gland; ; hand; ; calvaria; ; human fetus;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	DNA binding; zinc ion binding; protein binding; metal ion binding; nucleic acid binding;
Cellular component	nucleolus; nucleus; nucleoplasm; transcription factor TFIID complex;
Biological process	transcription elongation from RNA polymerase II promoter; transcription-coupled nucleotide-excision repair; regulation of transcription, DNA-templated; transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; positive regulation of exoribonuclease activity; positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6917
	21399
	ENSG00000187735
	Ensmusg00000033813
	P23193
	P10711
	NM_006756 ; NM_201437
	NM_001159750 ; NM_001159751 ; NM_011541
	NP_006747 ; NP_958845
	NP_001153222 ; NP_001153223 ; NP_035671
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Фактор удлинения транскрипции A Белок 1 является белком , который у людей кодируется TCEA1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

В других организмах этот ген более известен как фактор удлинения транскрипции II S ( TFIIS ). В основном это помогает разрешить обратные комплексы удлинения, вызывая разрез в активном сайте RNAP, поэтому реакция снова становится возможной. Это также обнаруживается в предварительном комплексе эукариотической транскрипции . ^{[ 8 ]} Гомолог в археи выполняет ту же основную задачу, в то время как бактерии используют не гомологичный GRE. ^{[ 9 ]}

Взаимодействия

Было показано, что TCEA1 взаимодействует с GTF2H1 ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]} и polr2a . ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG000001877735 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg0000000033813 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Dimarco SP, Glover TW, Miller DE, Reines D, Warren St (август 1996 г.). «Фактор удлинения транскрипции SII (TCEA) отображает хромосому человека 3P22 -> P21.3». Геномика . 36 (1): 185–8. doi : 10.1006/geno.1996.0443 . PMID 8812434 .
^ Park H, Baek K, Jeon C, Agarwal K, Yoo O (февраль 1994 г.). «Характеристика гена, кодирующего фактор удлинения транскрипции человека». Ген . 139 (2): 263–7. doi : 10.1016/0378-1119 (94) 90767-6 . PMID 8112616 .
^ «Ген Entrez: TCEA1 Фактор удлинения транскрипции A (SII), 1» .
^ Kim B, Nesvizhskii AI, Rani PG, Hahn S, Aebersold R, Ranish JA (октябрь 2007 г.). «Коэффициент удлинения транскрипции TFIIS является компонентом комплексов предварительного проживания РНК -полимеразы II» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (41): 16068–73. Bibcode : 2007pnas..10416068K . doi : 10.1073/pnas.0704573104 . PMC 2042163 . PMID 17913884 .
^ Робинсон Н.П., Фукео Т., Блумбах Ф., Какетт Г., Карти А.Е., Мателска Д.М., Офер С., Пилотто С., Фунг Д.К., Вернер Ф. (14 декабря 2018 г.). «Режущий край архейной транскрипции» . Новые темы в науках о жизни . 2 (4): 517–533. doi : 10.1042/etls20180014 . PMC 7289017 . PMID 33525828 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Archambault J, Pan G, Dahmus GK, Cartier M, Marshall N, Zhang S, et al. (Октябрь 1998). «FCP1, субъединица RAP74-взаимодействия человеческой белковой фосфатазы, которая дефосфорилирует карбоксил-концевой домен РНК-полимеразы IIO» . Журнал биологической химии . 273 (42): 27593–601. doi : 10.1074/jbc.273.42.27593 . PMID 9765293 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Pan G, Aso T, Greenblatt J (сентябрь 1997 г.). «Взаимодействие факторов удлинения TFIIS и Elongin A с голоэферментом RNA-полимеразы человека II, способным к специфическому инициации промотора и реагирующим на активаторы транскрипции» . Журнал биологической химии . 272 (39): 24563–71. doi : 10.1074/jbc.272.39.24563 . PMID 9305922 .
^ Кеттенбергер Х., Армаш К.Дж., Крамер П (август 2003 г.). «Архитектура комплекса РНК-полимеразы II-TFIIS и последствия для расщепления мРНК». Клетка . 114 (3): 347–57. doi : 10.1016/s0092-8674 (03) 00598-1 . HDL : 11858/00-001M-0000-0015-8647-8 . PMID 12914699 . S2CID 17184533 .

Дальнейшее чтение

Чен Х.К., Англия Л., Кейн С.М. (июль 1992 г.). «Характеристика клона кДНК Hela, кодирующего белок SII человека, фактор удлинения РНК -полимеразы II». Ген . 116 (2): 253–8. doi : 10.1016/0378-1119 (92) 90522-q . PMID 1378807 .
Розен Ч. Ч., Розен К.А., Редер Р.Г. (апрель 1992 г.). ТАТ действует как фактор клеточного удлинения» «ВИЧ -1 ген и развитие 6 (4): 655–66. doi : 10.1101/gaded.6.4.4.655 . 1559613PMID
Yoo Oj, Yoon HS, Baek KH, Jeon CJ, Miyamoto K, Ueno A, Agarwal K (март 1991 г.). «Клонирование, экспрессия и характеристика фактора удлинения транскрипции человека, tfiis» . Исследование нуклеиновых кислот . 19 (5): 1073–9. doi : 10.1093/nar/19.5.1073 . PMC 333783 . PMID 1708494 .
Рейнс Д., Чемберлин М.Дж., Кейн С.М. (июнь 1989 г.). «Фактор удлинения транскрипции SII (TFIIS) позволяет РНК -полимеразу II удлиняться через блок к транскрипции в человеческом гене in vitro» . Журнал биологической химии . 264 (18): 10799–809. doi : 10.1016/s0021-9258 (18) 81692-1 . PMID 2471707 .
Qian X, Jeon C, Yoon H, Agarwal K, Weiss MA (сентябрь 1993 г.). «Структура нового нуклеинового связывающего мотива в эукариотическом факторе удлинения транскрипции Tfiis». Природа . 365 (6443): 277–9. Bibcode : 1993natur.365..277q . doi : 10.1038/365277A0 . HDL : 10356/94482 . PMID 7626141 . S2CID 4367997 .
Yeh Ch, Shatkin AJ (июнь 1994 г.). «Кодированный HeLa-Cell P21 гомологичен фактору удлинения транскрипции SII». Ген . 143 (2): 285–7. doi : 10.1016/0378-1119 (94) 90112-0 . PMID 8206389 .
Умехара Т., Кида С., Ямамото Т., Хорикоши М (декабрь 1995 г.). «Выделение и характеристика кДНК, кодирующей новый тип фактора удлинения транскрипции человека S-II». Ген . 167 (1–2): 297–302. doi : 10.1016/0378-1119 (95) 00634-6 . PMID 8566795 .
Пауэлл В., Варфоломей Б., Рейнс Д. (сентябрь 1996 г.). «Фактор удлинения SII контактирует 3'-конец РНК в комплексе удлинения РНК-полимеразы II» . Журнал биологической химии . 271 (37): 22301–4. doi : 10.1074/jbc.271.37.22301 . PMC 3371613 . PMID 8798387 .
Pan G, Aso T, Greenblatt J (сентябрь 1997 г.). «Взаимодействие факторов удлинения TFIIS и Elongin A с голоэферментом RNA-полимеразы человека II, способным к специфическому инициации промотора и реагирующим на активаторы транскрипции» . Журнал биологической химии . 272 (39): 24563–71. doi : 10.1074/jbc.272.39.24563 . PMID 9305922 .
Li XY, Green MR (октябрь 1998 г.). «Коактиватор TAT-клеток ВИЧ-1 TAT-SF1 является общим фактором удлинения транскрипции» . Гены и развитие . 12 (19): 2992–6. doi : 10.1101/gad.12.19.2992 . PMC 317190 . PMID 9765201 .
Archambault J, Pan G, Dahmus GK, Cartier M, Marshall N, Zhang S, et al. (Октябрь 1998). «FCP1, субъединица RAP74-взаимодействия человеческой белковой фосфатазы, которая дефосфорилирует карбоксил-концевой домен РНК-полимеразы IIO» . Журнал биологической химии . 273 (42): 27593–601. doi : 10.1074/jbc.273.42.27593 . PMID 9765293 .
Suzuki H, Fukunishi Y, Kagawa I, Saito R, Oda H, Endo T, et al. (Октябрь 2001 г.). «Панель взаимодействия белка-белка с использованием кДНК с полной длиной мыши» . Исследование генома . 11 (10): 1758–65. doi : 10.1101/gr.180101 . PMC 311163 . PMID 11591653 .
Saso K, Ito T, Natori S, Sekimizu K (апрель 2003 г.). «Идентификация нового тканевого специфического транскрипционного активатора Festa как белка, который взаимодействует с фактором удлинения транскрипции S-II». Журнал биохимии . 133 (4): 493–500. doi : 10.1093/jb/mvg065 . PMID 12761297 .
Imabayashi H, Mori T, Gojo S, Kiyono T, Sugiyama T, Irie R, et al. (Август 2003 г.). «Redifferentiation дедифференцированных хондроцитов и хондрогенез стромальных клеток костного мозга человека посредством образования хондросферы с профилированием экспрессии с помощью крупномасштабного анализа кДНК». Экспериментальные исследования клеток . 288 (1): 35–50. doi : 10.1016/s0014-4827 (03) 00130-7 . PMID 12878157 .
Кеттенбергер Х., Армаш К.Дж., Крамер П (август 2003 г.). «Архитектура комплекса РНК-полимеразы II-TFIIS и последствия для расщепления мРНК». Клетка . 114 (3): 347–57. doi : 10.1016/s0092-8674 (03) 00598-1 . HDL : 11858/00-001M-0000-0015-8647-8 . PMID 12914699 . S2CID 17184533 .
Тамура К., Мията К., Сугахара К., Ониши С., Шуин Т., Асо Т (сентябрь 2003 г.). «Идентификация Eloa-BP1, нового белка, связывающего элгин, с доменом гомологии экзонуклеазы». Биохимическая и биофизическая исследовательская коммуникация . 309 (1): 189–95. doi : 10.1016/s0006-291x (03) 01556-0 . PMID 12943681 .
Чжан С., Ян Х, Бертон З.Ф. (декабрь 2003 г.). «Комбинаторный контроль РНК -полимеразы человека II (RNAP II) пауза и расщепление транскрипта с помощью транскрипционного фактора IIF, дельта -антигена гепатита и стимулирующего фактора II» . Журнал биологической химии . 278 (50): 50101–11. doi : 10.1074/jbc.m307590200 . PMID 14506279 .

Эта статья о гене на хромосоме человека 3 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG000001877735 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg0000000033813 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid8812434-5] Dimarco SP, Glover TW, Miller DE, Reines D, Warren St (август 1996 г.). «Фактор удлинения транскрипции SII (TCEA) отображает хромосому человека 3P22 -> P21.3». Геномика . 36 (1): 185–8. doi : 10.1006/geno.1996.0443 . PMID 8812434 .

[pmid8112616-6] Park H, Baek K, Jeon C, Agarwal K, Yoo O (февраль 1994 г.). «Характеристика гена, кодирующего фактор удлинения транскрипции человека». Ген . 139 (2): 263–7. doi : 10.1016/0378-1119 (94) 90767-6 . PMID 8112616 .

[entrez-7] «Ген Entrez: TCEA1 Фактор удлинения транскрипции A (SII), 1» .

[8] Kim B, Nesvizhskii AI, Rani PG, Hahn S, Aebersold R, Ranish JA (октябрь 2007 г.). «Коэффициент удлинения транскрипции TFIIS является компонентом комплексов предварительного проживания РНК -полимеразы II» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (41): 16068–73. Bibcode : 2007pnas..10416068K . doi : 10.1073/pnas.0704573104 . PMC 2042163 . PMID 17913884 .

[edge-9] Робинсон Н.П., Фукео Т., Блумбах Ф., Какетт Г., Карти А.Е., Мателска Д.М., Офер С., Пилотто С., Фунг Д.К., Вернер Ф. (14 декабря 2018 г.). «Режущий край архейной транскрипции» . Новые темы в науках о жизни . 2 (4): 517–533. doi : 10.1042/etls20180014 . PMC 7289017 . PMID 33525828 .

[pmid9765293-10] Jump up to: ^а ^{беременный} Archambault J, Pan G, Dahmus GK, Cartier M, Marshall N, Zhang S, et al. (Октябрь 1998). «FCP1, субъединица RAP74-взаимодействия человеческой белковой фосфатазы, которая дефосфорилирует карбоксил-концевой домен РНК-полимеразы IIO» . Журнал биологической химии . 273 (42): 27593–601. doi : 10.1074/jbc.273.42.27593 . PMID 9765293 .

[pmid9305922-11] Jump up to: ^а ^{беременный} Pan G, Aso T, Greenblatt J (сентябрь 1997 г.). «Взаимодействие факторов удлинения TFIIS и Elongin A с голоэферментом RNA-полимеразы человека II, способным к специфическому инициации промотора и реагирующим на активаторы транскрипции» . Журнал биологической химии . 272 (39): 24563–71. doi : 10.1074/jbc.272.39.24563 . PMID 9305922 .

[pmid12914699-12] Кеттенбергер Х., Армаш К.Дж., Крамер П (август 2003 г.). «Архитектура комплекса РНК-полимеразы II-TFIIS и последствия для расщепления мРНК». Клетка . 114 (3): 347–57. doi : 10.1016/s0092-8674 (03) 00598-1 . HDL : 11858/00-001M-0000-0015-8647-8 . PMID 12914699 . S2CID 17184533 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]