Пателламид А
| |
| Идентификаторы | |
|---|---|
3D model ( JSmol )
|
|
| ХимическийПаук | |
ПабХим CID
|
|
Панель управления CompTox ( EPA )
|
|
| Характеристики | |
| С 35 Ч 50 Н 8 О 6 С 2 | |
| Молярная масса | 742.96 g·mol −1 |
Если не указано иное, данные приведены для материалов в стандартном состоянии (при 25 °C [77 °F], 100 кПа).
| |
Пателламид А пептидный — природный продукт, вырабатываемый Prochromon Didemni , цианобактериальным симбионтом Lissoclinum patella , и впервые был выделен в 1981 году. [ 1 ] Пателламид А — один из многих дидемнидных пептидов. Другие близкородственные пептиды включают пателламиды B , C и D и транкамид . Пателламиды и транкамид проявляют умеренную цитотоксичность и активность в отношении линий раковых клеток с множественной лекарственной устойчивостью. [ 2 ]
История
[ редактировать ]Пателламид А был впервые выделен в 1981 году из оболочника L. patella, собранного на рифах острова Коррор, острова Палау . [ 1 ] L. patella является богатым источником натуральных пептидов. Помимо надколенников, из L. patella были выделены лиссоклинамиды, улицикламид, улитиацикламид и асцидиацикламид . [ 3 ] Абсолютная стереохимия была позже определена методом рентгеновской кристаллографии . [ 4 ]
Биосинтез
[ редактировать ]Пателламид А происходит из рибосомального пептида, что делает его членом RiPP суперсемейства натуральных продуктов . Это было установлено после того, как секвенирование генома P. Didemi выявило отсутствие нерибосомальных пептидсинтетаз. [ 2 ] Кластер биосинтетических генов пателламида А содержит гены patA , patB , patC , patD , patE , patF и patG . [ 2 ] Эти гены, будучи введены в E. coli , вызывают продукцию пателламида А, окончательно подтверждая их ответственность за биосинтез пателламида А. Ген patE кодирует пептид-предшественник, который содержит первичные последовательности пателламидов A и C. Это было предложено Schmidt et al. что этот препателламид гетероциклизуется с образованием оксазолинового и тиазолинового колец под действием PatD2. Предполагается, что PatG1 впоследствии участвует в окислении тиазолиновых колец до тиазольных колец, обнаруженных в пателламиде А. Затем пептид расщепляется, возможно, с помощью PatA или PatG2, и циклизуется, циклизации, вероятно, способствует аденилирование с помощью PatD1, образуя два циклические пептиды, пателламиды А и С. [ 2 ] Хотя все аминокислоты, используемые при производстве пателламида А, представляют собой L-аминокислоты, некоторые аминокислоты, обнаруженные в природном пателламиде А, представляют собой D-эпимеры. Предполагается, что эпимеризация этих аминокислот происходит спонтанно. Это было определено путем сравнения с аналогичной системой лиссоклинамидом 7. [ 5 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Ирландия, К.; Дюрсо, А.; Ньюман, Р.; Хакер, Д. (1982). «Противоопухолевые циклические пептиды из морской оболочника Lissoclinum patella». Дж. Орг. Хим . 47 (10): 1807–1811. дои : 10.1021/jo00349a002 .
- ^ Jump up to: а б с д и Шмидт, Э.; Нельсон, Дж.; Раско, Д.; Судек, С.; Эйзен, Дж.; Хейгуд, М.; Равель, Дж. (2005). «Биосинтез пателламида А и С по микроцин-подобному пути у Prochromon Didemni, цианобактериального симбионта Lissoclinum patella» . Учеб. Натл. акад. Наука . 102 (20): 7315–7320. Бибкод : 2005PNAS..102.7315S . дои : 10.1073/pnas.0501424102 . ПМЦ 1091749 . ПМИД 15883371 .
- ^ Дегнан, Б.; Хокинс, К.; Лавин, М.; Маккафри, Э.; Парри, Д.; Ванденбренк, А.; Уоттерс Д. (1989). «Новые циклические пептиды с цитотоксической активностью из надколенника асцидии Lissoclinum». Дж. Мед. Хим . 32 (6): 1349–1354. дои : 10.1021/jm00126a034 . ПМИД 2724305 .
- ^ В, Ю.; Дой, М.; Иноуэ, М.; Исида, Т. (1994). «Пателламид А, цитотоксический циклический пептид из асцидии Lissoclinum patella» . Акта Кристаллогр . 50 (3): 432–434. дои : 10.1107/s010827019300811x . ПМИД 8018309 .
- ^ Милн, Б.; Лонг, П.; Старцевич, А.; Грануэли, Д.; Джаспарс, М. (2006). «Спонтанность пути биосинтеза пателламида». Орг. Биомол. Хим . 4 (4): 631–638. CiteSeerX 10.1.1.1027.4259 . дои : 10.1039/b515938e . ПМИД 16467937 .