РНФ216

РНФ216
Идентификаторы
Псевдонимы	RNF216 , CAHH, TRIAD3, U7I1, UBCE7IP1, ZIN, белок безымянного пальца 216
Внешние идентификаторы	Опустить : 609948 ; МГИ : 1344349 ; Гомологен : 19442 ; Генные карты : RNF216 ; ОМА : RNF216 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 7 (human)
End	5,781,696 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	143,098,749 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	testicle; ; right testis; ; left testis; ; saphenous vein; ; sperm; ; stromal cell of endometrium; ; oocyte; ; granulocyte; ; Achilles tendon; ; secondary oocyte;
	Top expressed in
	spermatid; ; hand; ; tail of embryo; ; spermatocyte; ; genital tubercle; ; otic vesicle; ; zygote; ; granulocyte; ; secondary oocyte; ; morula;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; metal ion binding; ubiquitin protein ligase activity; transferase activity;
Cellular component	cytoplasm; nucleus; nucleoplasm; cytosol; Schaffer collateral - CA1 synapse; postsynaptic endocytic zone; glutamatergic synapse;
Biological process	protein K48-linked ubiquitination; negative regulation of type I interferon production; viral process; regulation of interferon-beta production; protein ubiquitination; regulation of defense response to virus by host; proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; apoptotic process; protein catabolic process, modulating synaptic transmission;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	54476
	108086
	ENSG00000011275
	ENSMUSG00000045078
	Q9NWF9
	P58283
	НМ_019011 ; НМ_207111 ; НМ_207116 ; НМ_001377156
	НМ_080561 ; НМ_207110 ; НМ_001359851
	НП_996994 ; НП_996999 ; НП_001364085
	НП_542128 ; НП_996993 ; НП_001346780
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Е3 убиквитин-протеинлигаза RNF216 представляет собой фермент , который у человека кодируется RNF216 геном . ^{[ 5 ]}

Этот ген кодирует цитоплазматический белок, который специфически колокализуется и взаимодействует с серин/треониновой протеинкиназой, белком, взаимодействующим с рецептором (RIP). Домены цинковых пальцев кодируемого белка необходимы для его взаимодействия с RIP и для ингибирования путей активации NF-каппа B, индуцированных TNF и IL1. Кодируемый белок может также функционировать как убиквитин-белковая лигаза E3, которая принимает убиквитин от ферментов, конъюгирующих убиквитин E2, и переносит его на субстраты. Для этого локуса описано несколько вариантов транскриптов альтернативного сплайсинга, но полноразмерная природа лишь некоторых из них известна. ^{[ 5 ]}

См. также

Домен RING на пальце

Взаимодействия

Было показано, что RNF216 взаимодействует с TLR9. ^{[ 6 ]} и РИПК1 . ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000011275 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000045078 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: белок TRIAD3 TRIAD3» .
^ Чуанг, Цунг-Сянь; Улевич Ричард Дж (май 2004 г.). «Triad3A, убиквитин-белковая лигаза E3, регулирующая Toll-подобные рецепторы». Нат. Иммунол . 5 (5): 495–502. дои : 10.1038/ni1066 . ISSN 1529-2908 . ПМИД 15107846 . S2CID 39773935 .
^ Чен, Даньин; Ли Сяоянь; Чжай Чжунхэ; Шу Хун-Бин (май 2002 г.). «Новый белок цинковых пальцев взаимодействует с белком, взаимодействующим с рецепторами (RIP), и ингибирует фактор некроза опухоли (TNF) и IL1-индуцированную активацию NF-каппа B» . Ж. Биол. Хим . 277 (18): 15985–91. дои : 10.1074/jbc.M108675200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 11854271 .

Дальнейшее чтение

Лейк Дж.А., Карр Дж., Фэн Ф. и др. (2003). «Роль Vif во время инфекции ВИЧ-1: взаимодействие с новыми клеточными факторами хозяина». Дж. Клин. Вирол . 26 (2): 143–52. дои : 10.1016/S1386-6532(02)00113-0 . ПМИД 12600646 .
Матоба Р., Окубо К., Хори Н. и др. (1994). «Добавление информации о 5'-кодировании в 3'-направленную библиотеку кДНК улучшает анализ экспрессии генов». Джин . 146 (2): 199–207. дои : 10.1016/0378-1119(94)90293-3 . ПМИД 8076819 .
ван дер Рейден Б.А., Эрпелинк-Вершуерен К.А., Левенберг Б., Янсен Дж.Х. (1999). «ТРИАДЫ: новый класс белков с новой богатой цистеином сигнатурой» . Белковая наука . 8 (7): 1557–61. дои : 10.1110/ps.8.7.1557 . ПМК 2144383 . ПМИД 10422847 .
Ван X, Столлар Б.Д. (1999). «Экспрессия гена иммуноглобулина VH при старении человека». Клин. Иммунол . 93 (2): 132–42. дои : 10.1006/clim.1999.4781 . ПМИД 10527689 .
Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш М.А. (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геном Рез . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Геном Рез . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК 311072 . ПМИД 11230166 .
Симпсон Дж.К., Велленройтер Р., Пустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, выявленная с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК» . Представитель ЭМБО . 1 (3): 287–92. дои : 10.1093/embo-reports/kvd058 . ПМЦ 1083732 . ПМИД 11256614 .
Чен Д., Ли Х., Чжай З., Шу Х.Б. (2002). «Новый белок цинковых пальцев взаимодействует с белком, взаимодействующим с рецепторами (RIP), и ингибирует фактор некроза опухоли (TNF) и IL1-индуцированную активацию NF-каппа B» . Ж. Биол. Хим . 277 (18): 15985–91. дои : 10.1074/jbc.M108675200 . ПМИД 11854271 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Хиллер Л.В., Фултон Р.С., Фултон Л.А. и др. (2003). «Последовательность ДНК 7-й хромосомы человека» . Природа . 424 (6945): 157–64. Бибкод : 2003Natur.424..157H . дои : 10.1038/nature01782 . ПМИД 12853948 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Чуанг Т.Х., Улевич Р.Дж. (2004). «Triad3A, убиквитин-белковая лигаза E3, регулирующая Toll-подобные рецепторы». Нат. Иммунол . 5 (5): 495–502. дои : 10.1038/ni1066 . ПМИД 15107846 . S2CID 39773935 .
Фэн Ф., Дэвис А., Лейк Дж.А. и др. (2004). «Белок безымянного пальца ZIN взаимодействует с вирусом иммунодефицита человека типа 1 Vif» . Дж. Вирол . 78 (19): 10574–81. doi : 10.1128/JVI.78.19.10574-10581.2004 . ПМК 516435 . ПМИД 15367624 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Виман С., Арлт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геном Рез . 14 (10Б): 2136–44. дои : 10.1101/гр.2576704 . ПМК 528930 . ПМИД 15489336 .
О Дж.Х., Ян Дж.О., Хан Ю. и др. (2006). «Транскриптомный анализ рака желудка человека». Мамм. Геном . 16 (12): 942–54. дои : 10.1007/s00335-005-0075-2 . ПМИД 16341674 . S2CID 69278 .
Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Нуклеиновые кислоты Рез . 34 (Проблема с базой данных): D415–8. дои : 10.1093/nar/gkj139 . ПМЦ 1347501 . ПМИД 16381901 .
Фернс С., Пан К., Мэтисон Дж.К., Чуанг Т.Х. (2006). «Triad3A регулирует убиквитинирование и протеасомную деградацию RIP1 после нарушения связывания Hsp90» . Ж. Биол. Хим . 281 (45): 34592–600. дои : 10.1074/jbc.M604019200 . ПМИД 16968706 .

Внешние ссылки

RNF216+белок+человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 7 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000011275 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000045078 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: белок TRIAD3 TRIAD3» .

[pmid15107846-6] Чуанг, Цунг-Сянь; Улевич Ричард Дж (май 2004 г.). «Triad3A, убиквитин-белковая лигаза E3, регулирующая Toll-подобные рецепторы». Нат. Иммунол . 5 (5): 495–502. дои : 10.1038/ni1066 . ISSN 1529-2908 . ПМИД 15107846 . S2CID 39773935 .

[pmid11854271-7] Чен, Даньин; Ли Сяоянь; Чжай Чжунхэ; Шу Хун-Бин (май 2002 г.). «Новый белок цинковых пальцев взаимодействует с белком, взаимодействующим с рецепторами (RIP), и ингибирует фактор некроза опухоли (TNF) и IL1-индуцированную активацию NF-каппа B» . Ж. Биол. Хим . 277 (18): 15985–91. дои : 10.1074/jbc.M108675200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 11854271 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]