Мотив РНК ManA
| манаА РНК | |
|---|---|
 Консенсусная вторичная структура manA РНК | |
| Идентификаторы | |
| Символ | манаА РНК |
| Рфам | RF01745 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Цис -регуляторный элемент |
| Домен(ы) | Фотобактерия |
| PDB Структуры | ПДБе |
Мотив manA РНК (также называемый manA ) относится к консервативной структуре РНК , которая была идентифицирована с помощью биоинформатики . [ 1 ] [ 2 ] Экземпляры мотива РНК manA были обнаружены у бактерий рода , Photobacterium и фагов инфицирующих определенные виды цианобактерий . Однако большинство предсказанных последовательностей РНК manA происходят из ДНК, собранной из некультивируемых морских бактерий . Почти все РНК manA расположены так, что они могут находиться в 5'-нетранслируемых областях генов белок кодирующих , , и поэтому была выдвинута гипотеза, что РНК manA функционируют как цис-регуляторные элементы . Учитывая относительную сложность их вторичной структуры и предполагаемую цис -регуляторную роль, они могут быть рибопереключателями .
Гены, которые, как полагают, регулируются РНК manA , чаще всего участвуют в метаболизме сахаров фруктозы и маннозы , синтезе нуклеотидов , бактериальном фотосинтезе и классе белков- шаперонов, известных как ibpA . РНК manA также часто соседствуют с транспортными РНК и, вероятно, транскрибируются с ними. Хотя эти гены не считаются типичными для фагов, ранее было замечено, что фаги, заражающие цианобактерии, обычно включают такие гены. [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Вайнберг З., Перро Дж., Мейер М.М., Брейкер Р.Р. (декабрь 2009 г.). «Исключительно структурированные некодирующие РНК, выявленные с помощью анализа бактериального метагенома» . Природа . 462 (7273): 656–659. Бибкод : 2009Natur.462..656W . дои : 10.1038/nature08586 . ПМК 4140389 . ПМИД 19956260 .
- ^ Вайнберг З., Ван Дж. Х., Бог Дж. и др. (март 2010 г.). «Сравнительная геномика выявила 104 кандидата в структурированные РНК из бактерий, архей и их метагеномов» . Геном Биол . 11 (3): С31. дои : 10.1186/gb-2010-11-3-r31 . ПМЦ 2864571 . ПМИД 20230605 .
- ^ Салливан М.Б., Коулман М.Л., Вейгеле П., Ровер Ф., Чисхолм С.В. (май 2005 г.). «Три генома цианофага прохлорококка: характерные особенности и экологическая интерпретация» . ПЛОС Биол . 3 (5): е144. дои : 10.1371/journal.pbio.0030144 . ПМЦ 1079782 . ПМИД 15828858 .
- ^ Ровер Ф., Тербер Р.В. (май 2009 г.). «Вирусы манипулируют морской средой». Природа . 459 (7244): 207–212. дои : 10.1038/nature08060 . ПМИД 19444207 . S2CID 4397295 .
- ^ Линделл Д., Джаффе Дж.Д., Коулман М.Л. и др. (сентябрь 2007 г.). «Динамика полногеномной экспрессии морского вируса и хозяина обнаруживает особенности коэволюции». Природа . 449 (7158): 83–86. дои : 10.1038/nature06130 . ПМИД 17805294 . S2CID 4412265 .
Внешние ссылки
[ редактировать ] | Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |