HIST1H2BD

H2BC5
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 5KGF
Идентификаторы
Псевдонимы	H2BC5 , H2B.1B, H2B/b, H2BFB, HIRIP2, dJ221C16.6, кластер гистонов 1, H2bd, кластер гистонов 1, член семейства H2B d, H2BFG, H2BFL, H2B/k, H2B/l, H2B/h, H2BFK, HIST1H2BE, HIST1H2BC, HIST1H2BG, HIST1H2BI, H2BFA, H2BFH, H2B/a, H2B/g, HIST1H2BF, HIST1H2BD, кластерный гистон 5 H2B
Внешние идентификаторы	Опустить : 602799 ; МГИ : 1925553 ; Гомологен : 134740 ; Генные карты : H2BC5 ; OMA : H2BC5 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 6 (human) Band 6p22.2 Start 26,158,122 bp End 26,171,349 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 11 (mouse) Band 11|11 B1.3 Start 58,839,746 bp End 58,840,359 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in right uterine tube Achilles tendon mucosa of transverse colon pylorus prostate epithelium of colon tendon of biceps brachii right lobe of liver right ventricle ganglionic eminence Top expressed in medial ganglionic eminence ventricular zone lens spermatid cerebellar cortex trigeminal ganglion spermatocyte embryo neural layer of retina visual cortex More reference expression data BioGPS n/a
showГенная онтология Molecular function protein heterodimerization activity DNA binding molecular function protein binding identical protein binding Cellular component chromosome nucleosome extracellular exosome nucleoplasm nucleus cytosol extracellular space Biological process nucleosome assembly protein ubiquitination innate immune response in mucosa defense response to bacterium antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 3017 78303 Вместе ENSG00000158373 ENSMUSG00000056895 ЮниПрот P58876 P62807 Q9D2U9 RefSeq (мРНК) НМ_021063 НМ_138720 НМ_030082 RefSeq (белок) НП_066407 НП_619790 НП_003517 НП_001368918 НП_084358 Местоположение (UCSC) Чр 6: 26.16 – 26.17 Мб Чр 11: 58,84 – 58,84 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Гистон H2B типа 1-D представляет собой белок , который у человека кодируется HIST1H2BD геном .

Гистоны — основные ядерные белки , отвечающие за нуклеосомную структуру хромосомного волокна у эукариот . Нуклеосомы состоят примерно из 146 пар оснований ДНК, обернутых вокруг октамера гистонов, состоящего из пар каждого из четырех основных гистонов (H2A, H2B, H3 и H4). Хроматиновое . волокно дополнительно уплотняется за счет взаимодействия линкерного гистона H1 с ДНК между нуклеосомами с образованием структур хроматина более высокого порядка Этот ген не имеет интрона и кодирует члена семейства гистонов H2B. Для этого гена были идентифицированы два транскрипта, кодирующие один и тот же белок, который находится в большом кластере генов гистонов на хромосоме 6p22-p21.3.

Дальнейшее чтение

• Альбиг В., Киошис П., Пустка А. и др. (1997). «Организация генов гистонов человека: нерегулярное расположение внутри большого кластера». Геномика . 40 (2): 314–22. дои : 10.1006/geno.1996.4592 . ПМИД   9119399 .
• Альбиг В., Денеке Д. (1998). «Кластер генов гистонов человека в локусе D6S105». Хм. Жене . 101 (3): 284–94. дои : 10.1007/s004390050630 . ПМИД   9439656 . S2CID   38539096 .
• Эль Харруби А., Пирас Г., Зенсен Р., Мартин М.А. (1998). «Транскрипционная активация интегрированного промотора вируса иммунодефицита человека типа 1, ассоциированного с хроматином» . Мол. Клетка. Биол . 18 (5): 2535–44. дои : 10.1128/mcb.18.5.2535 . ПМК   110633 . ПМИД   9566873 .
• Лорен С., Киви Дж.П., Монье-Гавель Ф. и др. (1998). «Коровые гистоны и HIRIP3, новый гистонсвязывающий белок, напрямую взаимодействуют с повторяющимся белком WD HIRA» . Мол. Клетка. Биол . 18 (9): 5546–56. дои : 10.1128/MCB.18.9.5546 . ПМЦ   109139 . ПМИД   9710638 .
• Дэн Л., де ла Фуэнте С., Фу П. и др. (2001). «Ацетилирование Tat ВИЧ-1 с помощью CBP/P300 увеличивает транскрипцию интегрированного генома ВИЧ-1 и усиливает связывание с основными гистонами» . Вирусология . 277 (2): 278–95. дои : 10.1006/виро.2000.0593 . ПМИД   11080476 .
• Дэн Л., Ван Д., де ла Фуэнте С. и др. (2001). «Усиление активности HAT p300 с помощью Tat ВИЧ-1 на ДНК хроматина» . Вирусология . 289 (2): 312–26. дои : 10.1006/виро.2001.1129 . ПМИД   11689053 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Чунг В.Л., Аджиро К., Самедзима К. и др. (2003). «Апоптотическое фосфорилирование гистона H2B опосредовано стерильной двадцать киназой млекопитающих» . Клетка . 113 (4): 507–17. дои : 10.1016/S0092-8674(03)00355-6 . ПМИД   12757711 . S2CID   21854 .
• Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека» . Природа . 425 (6960): 805–11. Бибкод : 2003Natur.425..805M . дои : 10.1038/nature02055 . ПМИД   14574404 .
• Лусич М., Марчелло А., Серезето А., Джакка М. (2004). «Регуляция экспрессии гена ВИЧ-1 путем ацетилирования гистонов и рекрутирования факторов на промоторе LTR» . ЭМБО Дж . 22 (24): 6550–61. дои : 10.1093/emboj/cdg631 . ПМК   291826 . ПМИД   14657027 .
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК   528928 . ПМИД   15489334 .
• Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Люнг А.К. и др. (2005). «Динамика ядрышкового протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Бибкод : 2005Natur.433...77A . дои : 10.1038/nature03207 . ПМИД   15635413 . S2CID   4344740 .
• Голебовский Ф., Каспржак К.С. (2007). «Ингибирование ацетилирования основных гистонов канцерогенным никелем (II)» . Мол. Клетка. Биохим . 279 (1–2): 133–9. дои : 10.1007/s11010-005-8285-1 . ПМИД   16283522 . S2CID   25071586 .
• Чжу Б., Чжэн Ю., Фам А.Д. и др. (2006). «Моноубиквитинирование человеческого гистона H2B: вовлеченные факторы и их роль в регуляции гена HOX» . Мол. Клетка . 20 (4): 601–11. doi : 10.1016/j.molcel.2005.09.025 . ПМИД   16307923 .
• Боненфант Д., Куло М., Таубин Х. и др. (2006). «Характеристика вариантов гистонов H2A и H2B и их посттрансляционных модификаций методом масс-спектрометрии» . Мол. Клетка. Протеомика . 5 (3): 541–52. дои : 10.1074/mcp.M500288-MCP200 . ПМИД   16319397 .
• Сиути Н., Рот М.Дж., Миззен К.А. и др. (2006). «Ген-специфическая характеристика человеческого гистона H2B путем диссоциации электронного захвата». J. Протеом Рез . 5 (2): 233–9. дои : 10.1021/pr050268v . ПМИД   16457587 .
• Бек Х.К., Нильсен Э.К., Маттисен Р. и др. (2006). «Количественный протеомный анализ посттрансляционных модификаций гистонов человека» . Мол. Клетка. Протеомика . 5 (7): 1314–25. дои : 10.1074/mcp.M600007-MCP200 . ПМИД   16627869 .
• Паври Р., Чжу Б., Ли Г. и др. (2006). «Моноубиквитинирование гистона H2B действует совместно с FACT, регулируя удлинение с помощью РНК-полимеразы II» . Клетка . 125 (4): 703–17. дои : 10.1016/j.cell.2006.04.029 . ПМИД   16713563 . S2CID   2614680 .