Brd8

Brd8
Идентификаторы
Псевдонимы	BRD8 , SMAP, SMAP2, P120, Bromodomain, содержащий 8
Внешние идентификаторы	Омим : 602848 ; MGI : 1925906 ; Гомологен : 41790 ; GeneCards : BRD8 ; OMA : BRD8 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	138,178,953 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 18 (mouse)
End	34,757,654 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	right testis; ; left testis; ; ventricular zone; ; pituitary gland; ; anterior pituitary; ; right lobe of thyroid gland; ; right uterine tube; ; left lobe of thyroid gland; ; middle temporal gyrus; ; buccal mucosa cell;
	Top expressed in
	neural layer of retina; ; Rostral migratory stream; ; ventricular zone; ; tail of embryo; ; genital tubercle; ; spermatocyte; ; blastocyst; ; ganglionic eminence; ; primitive streak; ; yolk sac;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	DNA-binding transcription factor activity; protein binding; nuclear receptor activity;
Cellular component	mitochondrion; nucleus; nucleoplasm; Swr1 complex; NuA4 histone acetyltransferase complex;
Biological process	regulation of transcription by RNA polymerase II; histone H2A acetylation; regulation of growth; cell surface receptor signaling pathway; regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; signal transduction; histone H4 acetylation; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; intracellular receptor signaling pathway; chromatin organization;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	10902
	78656
	ENSG00000112983
	Ensmusg00000003778
	Q9H0E9
	Q8R3B7
showNM_001164326 ; NM_001300961 ; NM_001300962 ; NM_001300966 ; NM_006696 ;
	NM_139199; NM_183359
	NM_001289606 ; NM_001289607 ; NM_030147 ; NM_001361136
showNP_001157798 ; NP_001287890 ; NP_001287891 ; NP_001287895 ; NP_006687 ;
	NP_631938
	NP_001276535 ; NP_001276536 ; NP_084423 ; NP_001348065
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Бромодомен, содержащий белок 8, является белком , который у людей кодируется BRD8 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Белок, кодируемый этим геном, взаимодействует с рецептором гормонов щитовидной железы в зависимости от лиганда и усиливает зависимую активацию гормон щитовидной железы из элементов ответа щитовидной железы. Этот белок содержит бромодомен и, как считается, является коактиватором ядерного рецептора. Были идентифицированы три альтернативных варианта сплайсированных транскриптов, которые кодируют различные изоформы. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что BRD8 взаимодействует с бета -версией рецептора гормонов щитовидной железы ^{[ 6 ]} и рецептор retinoid x альфа . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000112983 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000003778 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Нильсен М.С., Петерсен С.М., Глиман Дж., Мэдсен П (апрель 1996 г.). «Клонирование и секвенирование человеческой кДНК, кодирующей предполагаемый транскрипционный фактор, содержащий бромодомен». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - структура и экспрессия гена . 1306 (1): 14–6. doi : 10.1016/0167-4781 (95) 00239-1 . PMID 8611617 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Monden T, Wondisford Fe, Hollenberg AN (ноябрь 1997 г.). «Выделение и характеристика нового лиганд-зависимого белка, включающего рецептор щитовидной железы» . Журнал биологической химии . 272 (47): 29834–41. doi : 10.1074/jbc.272.47.29834 . PMID 9368056 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} "Entrez Gene: Brd8 Bromodomain, содержащий 8" .
^ Монден Т., Киши М., Хосоя Т., Сато Т., Уондисфорд Ф.Е., Холленберг А.Н., Ямада М., Мори М (октябрь 1999). «P120 действует как специфический коактиватор для рецептора 9-цис-ретиновой кислоты (RXR) на пролифератор-пролифератор, активируемая пероксисом, гетеродимеры-гамма/RXR» . Молекулярная эндокринология . 13 (10): 1695–703. doi : 10.1210/mend.13.10.0353 . PMID 10517671 . S2CID 25098867 .

Внешние ссылки

человека Местоположение генома BRD8 и BRD8 страница гена в браузере UCSC Genome .
Расположение генома человека SMAP2 и SMAP2 страница гена в браузере UCSC Genome .

Дальнейшее чтение

Doyon Y, Côté J (апрель 2004 г.). «Высококонсервативный и многофункциональный комплекс шляпы Nua4». Текущее мнение в области генетики и развития . 14 (2): 147–54. doi : 10.1016/j.gde.2004.02.009 . PMID 15196461 .
Maruyama K, Sugano S (январь 1994 г.). «Олиго-капитализация: простой метод замены структуры крышки эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (октябрь 1997 г.). «Строительство и характеристика обогащенной полной длиной и библиотекой кДНК с 5'-эндом». Ген . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/s0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Монден Т., Киши М., Хосоя Т., Сато Т., Уондисфорд Ф.Е., Холленберг А.Н., Ямада М., Мори М (октябрь 1999). «P120 действует как специфический коактиватор для рецептора 9-цис-ретиновой кислоты (RXR) на пролифератор-пролифератор, активируемая пероксисом, гетеродимеры-гамма/RXR» . Молекулярная эндокринология . 13 (10): 1695–703. doi : 10.1210/mend.13.10.0353 . PMID 10517671 . S2CID 25098867 .
Лай Ф., Годли Л.А., Джослин Дж., Фернальд А.А., Лю Дж., Эспиноса Р., Чжао Н., Паминтуан Л., Тилль Б.Г., Ларсон Р.А., Цянь З, Ле Бо М.М. (январь 2001 г.). «Карта транскрипта и сравнительный анализ 1,5 МБ, обычно удаленного сегмента человека 5Q31 при злокачественных миелоидных заболеваниях с DEL (5Q)». Геномика . 71 (2): 235–45. doi : 10.1006/geno.2000.6414 . PMID 11161817 .
Wiemann S, потому что B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes, Ottenwälder B, Behrer K, Strack N, Mewes, Ottenwälder B, Köhreer K, Strack N, Mewes, Ottenwälder B, Köhrer K, Strack N, Mewes, Ottenwälder B, Köhrer K, Strack N, Mewes, Ottenwälder A, Köhreer K, Strack N, Mewes, Ottenwälder. , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (март 2001 г.). «На пути к каталогу генов человека и белка: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Исследование генома . 11 (3): 422–35. Doi : 10.1101/gr.gr1547r . PMC 311072 . PMID 11230166 .
Cai Y, Jin J, Tomomori-Sato C, Sato S, Sorokina I, Parmely TJ, Conaway RC, Conaway JW (октябрь 2003 г.). «Идентификация новых субъединиц мультипротеинового TRRAP/TIP60-содержащего гистонцетилтрансфераза» . Журнал биологической химии . 278 (44): 42733–6. doi : 10.1074/jbc.c300389200 . PMID 12963728 .
Doyon Y, Selleck W, Lane WS, Tan S, Côté J (март 2004 г.). «Структурное и функциональное сохранение комплекса гистон ацетилтрансферазы NUA4 от дрожжей до людей» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (5): 1884–96. doi : 10.1128/mcb.24.5.1884-1896.2004 . PMC 350560 . PMID 14966270 .
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (август 2004 г.). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004pnas..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
Cai Y, Jin J, Florens L, Swanson SK, Kusch T, Li B, Workman JL, Washburn MP, Conaway RC, Conaway JW (апрель 2005 г.). «Белок YL1 млекопитающего является общей субъединицей комплексов гистон ацетилтрансферазы TRRAP/TIP60 и SRCAP» . Журнал биологической химии . 280 (14): 13665–70. doi : 10.1074/jbc.m500001200 . PMID 15647280 .
Gengevolenskaya EV, Murray HL, Branton P, Young RA, Kaelin WG (июнь 2005 г.). «Связывание PRB с PHD -белком RBP2 способствует клеточной дифференцировке» . Молекулярная клетка . 18 (6): 623–35. doi : 10.1016/j.molcel.2005.05.012 . PMID 15949438 .
Rual JF, Vengate K, Hao T, Hirth-Christ-Christ, Dricot A, Li N, Berriz GF, FD Gibbons, Dress M, Ayvi-gedehossou N, Click N, Simon C, Boxem M, Silthern S, Roenberg J, Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Лим Дж.С., Книги Дж., Фротон С., Уэлш Е., Севик С., Бекс С., Сирорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х. Х., Смолььяр А., Босак С., Проявление Р, Растяжение примеси L, Cusick ME, Hid DE, FP Roth, Vidal M (Octoo 2005). «На пути к протеому белково-белок-белковой сетевой белок. Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005 Natur . doi : 10.1038/nature04209 . 16189514PMID S2CID 4427026 .
Natsume W, Tanabe K, Kon S, Yoshida N, Watanabe T, Torii T, Satake M (июнь 2006 г.). «SMAP2, новый ARF GTPase-активирующий белок, взаимодействует с белком клатрина и клатрина и функционирует в AP-1-позитивной сети ранней эндосомы/транс-Гольги» . Молекулярная биология клетки . 17 (6): 2592–603. doi : 10.1091/mbc.e05-10-0909 . PMC 1475504 . PMID 16571680 .
Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, Rush J, Gygi SP (октябрь 2006 г.). «Основанный на вероятности подход для высокопроизводительного анализа фосфорилирования белка и локализации сайта». Nature Biotechnology . 24 (10): 1285–92. doi : 10.1038/nbt1240 . PMID 16964243 . S2CID 14294292 .
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (ноябрь 2006 г.). «Глобальная динамика фосфорилирования в Global, in vivo и сайт в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 5 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000112983 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000003778 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid8611617-5] Нильсен М.С., Петерсен С.М., Глиман Дж., Мэдсен П (апрель 1996 г.). «Клонирование и секвенирование человеческой кДНК, кодирующей предполагаемый транскрипционный фактор, содержащий бромодомен». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - структура и экспрессия гена . 1306 (1): 14–6. doi : 10.1016/0167-4781 (95) 00239-1 . PMID 8611617 .

[pmid9368056-6] Jump up to: ^а ^{беременный} Monden T, Wondisford Fe, Hollenberg AN (ноябрь 1997 г.). «Выделение и характеристика нового лиганд-зависимого белка, включающего рецептор щитовидной железы» . Журнал биологической химии . 272 (47): 29834–41. doi : 10.1074/jbc.272.47.29834 . PMID 9368056 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^{беременный} "Entrez Gene: Brd8 Bromodomain, содержащий 8" .

[pmid10517671-8] Монден Т., Киши М., Хосоя Т., Сато Т., Уондисфорд Ф.Е., Холленберг А.Н., Ямада М., Мори М (октябрь 1999). «P120 действует как специфический коактиватор для рецептора 9-цис-ретиновой кислоты (RXR) на пролифератор-пролифератор, активируемая пероксисом, гетеродимеры-гамма/RXR» . Молекулярная эндокринология . 13 (10): 1695–703. doi : 10.1210/mend.13.10.0353 . PMID 10517671 . S2CID 25098867 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]