FXR1

FXR1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	2CPQ, 3KUF, 3O8V
Идентификаторы
Псевдонимы	FXR1 , FXR1P, аутосомный гомолог 1 FMR1, MYORIBF, MYOPMIL
Внешние идентификаторы	Опустить : 600819 ; МГИ : 104860 ; Гомологен : 3573 ; Генные карты : FXR1 ; OMA : FXR1 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 3 (human)
End	180,982,753 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 3 (mouse)
End	34,124,471 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	sperm; ; muscle of thigh; ; gastrocnemius muscle; ; Skeletal muscle tissue of biceps brachii; ; Skeletal muscle tissue of rectus abdominis; ; triceps brachii muscle; ; glutes; ; ventricular zone; ; left testis; ; right testis;
	Top expressed in
	seminiferous tubule; ; spermatid; ; temporal muscle; ; muscle of thigh; ; ankle; ; spermatocyte; ; sternocleidomastoid muscle; ; tail of embryo; ; triceps brachii muscle; ; digastric muscle;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	protein homodimerization activity; G-quadruplex RNA binding; mRNA 3'-UTR binding; protein binding; protein heterodimerization activity; nucleic acid binding; mRNA binding; RNA strand annealing activity; RNA binding; translation regulator activity;
Cellular component	membrane; ribonucleoprotein granule; dendritic spine; axon; dendrite; nucleolus; perinuclear region of cytoplasm; costamere; nucleus; cytosol; cytoplasm; polysome; postsynaptic density; cytoplasmic ribonucleoprotein granule; neuronal cell body; postsynapse; glutamatergic synapse;
Biological process	cell differentiation; muscle organ development; multicellular organism development; apoptotic process; positive regulation of gene silencing by miRNA; negative regulation of translation; regulation of translation; regulation of mRNA stability; positive regulation of translation;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	8087
	14359
	ENSG00000114416
	ENSMUSG00000027680
	P51114
	Q61584
	НМ_001013438 ; НМ_001013439 ; НМ_005087 ; НМ_001363882
	НМ_001113188 ; НМ_001113189 ; НМ_008053
	НП_001013456 ; НП_001013457 ; НП_005078 ; НП_001350811
	НП_001106659 ; НП_001106660 ; НП_032079
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 1, связанный с синдромом умственной отсталости хрупкой Х-хромосомы, представляет собой белок , который у людей кодируется FXR1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой РНК-связывающий белок, который взаимодействует с функционально сходными белками FMR1 и FXR2. Эти белки перемещаются между ядром и цитоплазмой и связываются с полирибосомами, преимущественно с субъединицей рибосомы 60S. Для этого гена обнаружено три варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что FXR1 взаимодействует с FXR2 , ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} ФМР1 ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} и CYFIP2 . ^{[ 10 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000114416 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027680 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Сиоми MC, Сиоми Х., Зауэр В.Х., Сринивасан С., Нуссбаум Р.Л., Дрейфус Г. (июль 1995 г.). «FXR1, аутосомный гомолог хрупкого гена умственной отсталости X» . ЭМБО Дж . 14 (11): 2401–8. дои : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07237.x . ПМЦ 398353 . ПМИД 7781595 .
^ Боливар Дж., Гельман С., Иглесиас К., Ортис М., Вальдивия М.М. (август 1998 г.). «Ген FXR1, родственный хрупкому X, представляет собой человеческий аутоантиген, процессируемый во время апоптоза» . J Биол Хим . 273 (27): 17122–7. дои : 10.1074/jbc.273.27.17122 . ПМИД 9642279 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: FXR1 хрупкий X умственная отсталость, аутосомный гомолог 1» .
^ Перейти обратно: ^а ^б Сиоми, MC; Чжан Ю; Сиоми Х; Дрейфус Г. (июль 1996 г.). «Специфические последовательности в белке FMR1 синдрома хрупкой X и белках FXR опосредуют их связывание с 60S рибосомальными субъединицами и взаимодействия между ними» . Мол. Клетка. Биол . 16 (7): 3825–32. дои : 10.1128/mcb.16.7.3825 . ISSN 0270-7306 . ПМК 231379 . ПМИД 8668200 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Чжан, Ю; О'Коннор JP; Сиоми MC; Шринивасан С; Дутра А; Нуссбаум Р.Л.; Дрейфус Г. (ноябрь 1995 г.). «Хрупкий белок синдрома умственной отсталости X взаимодействует с новыми гомологами FXR1 и FXR2» . ЭМБО Дж . 14 (21): 5358–66. дои : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb00220.x . ISSN 0261-4189 . ПМЦ 394645 . ПМИД 7489725 .
^ Шенк А., Бардони Б., Моро А., Баньи С., Мандель Дж.Л. (июль 2001 г.). «Высококонсервативное семейство белков, взаимодействующее с хрупким X-белком умственной отсталости (FMRP) и демонстрирующее избирательное взаимодействие с FMRP-родственными белками FXR1P и FXR2P» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (15): 8844–9. Бибкод : 2001PNAS...98.8844S . дои : 10.1073/pnas.151231598 . ПМЦ 37523 . ПМИД 11438699 .

Дальнейшее чтение

Чжан Ю, О'Коннор Дж.П., Сиоми М.С. и др. (1996). «Хрупкий белок синдрома умственной отсталости X взаимодействует с новыми гомологами FXR1 и FXR2» . ЭМБО Дж . 14 (21): 5358–66. дои : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb00220.x . ПМЦ 394645 . ПМИД 7489725 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Кой Дж. Ф., Седлачек З., Бэхнер Д. и др. (1996). «Высококонсервативная 3'-UTR и характер экспрессии FXR1 указывают на различную регуляцию генов FXR1 и FMR1». Хм. Мол. Жене . 4 (12): 2209–18. дои : 10.1093/hmg/4.12.2209 . ПМИД 8634689 .
Сиоми MC, Чжан Й, Сиоми Х, Дрейфус Дж (1996). «Специфические последовательности в белке синдрома хрупкой Х-хромосомы FMR1 и белках FXR опосредуют их связывание с 60S рибосомальными субъединицами и взаимодействие между ними» . Мол. Клетка. Биол . 16 (7): 3825–32. дои : 10.1128/mcb.16.7.3825 . ПМК 231379 . ПМИД 8668200 .
Таманини Ф., Виллемсен Р., ван Унен Л. и др. (1997). «Дифференциальная экспрессия белков FMR1, FXR1 и FXR2 в мозге и семенниках человека» . Хм. Мол. Жене . 6 (8): 1315–22. дои : 10.1093/hmg/6.8.1315 . hdl : 1765/8709 . ПМИД 9259278 .
Сузуки И., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Ханджян Э.В., Бардони Б., Корбин Ф. и др. (1999). «Новые изоформы хрупкого X-родственного белка FXR1P экспрессируются во время миогенеза». Хм. Мол. Жене 7 (13): 2121–8. дои : 10.1093/hmg/7.13.2121 . ПМИД 9817930 .
Таманини Ф., Бонтекое С., Баккер С.Э. и др. (1999). «Различные мишени для хрупких X-родственных белков определяются их различной ядерной локализацией» . Хм. Мол. Жене . 8 (5): 863–9. дои : 10.1093/hmg/8.5.863 . hdl : 1765/9073 . ПМИД 10196376 .
Таманини Ф., Ван Унен Л., Баккер С. и др. (2000). «Свойства олигомеризации белка умственной отсталости хрупкого-X (FMRP) и родственных хрупкому-X белков FXR1P и FXR2P» . Биохим. Дж . 343 (3): 517–23. дои : 10.1042/0264-6021:3430517 . ПМЦ 1220581 . ПМИД 10527928 .
Бардони Б., Шенк А., Мандель Дж.Л. (2000). «Новый РНК-связывающий ядерный белок, который взаимодействует с хрупким белком X умственной отсталости (FMR1)» . Хм. Мол. Жене . 8 (13): 2557–66. дои : 10.1093/hmg/8.13.2557 . ПМИД 10556305 .
Семан С., Браун В., Уоррен С.Т. (2000). «Выделение FMRP-ассоциированной рибонуклеопротеиновой частицы и идентификация нуклеолина и хрупких X-родственных белков как компонентов комплекса» . Мол. Клетка. Биол . 19 (12): 7925–32. дои : 10.1128/mcb.19.12.7925 . ПМЦ 84877 . ПМИД 10567518 .
Таманини Ф., Киркпатрик Л.Л., Шонкерен Дж. и др. (2000). «Хрупкие Х-родственные белки FXR1P и FXR2P содержат функциональный сигнал, направляющий в ядрышки, эквивалентный регуляторным белкам ВИЧ-1» . Хм. Мол. Жене . 9 (10): 1487–93. дои : 10.1093/hmg/9.10.1487 . hdl : 1765/9408 . ПМИД 10888599 .
Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш М.А. (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геном Рез . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Шенк А., Бардони Б., Моро А. и др. (2001). «Высококонсервативное семейство белков, взаимодействующее с хрупким X-белком умственной отсталости (FMRP) и демонстрирующее избирательное взаимодействие с FMRP-родственными белками FXR1P и FXR2P» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 98 (15): 8844–9. Бибкод : 2001PNAS...98.8844S . дои : 10.1073/pnas.151231598 . ПМЦ 37523 . ПМИД 11438699 .
Киркпатрик Л.Л., Макилвейн К.А., Нельсон Д.Л. (2002). «Сравнительный анализ геномных последовательностей семейства генов FXR: FMR1, FXR1 и FXR2». Геномика . 78 (3): 169–77. дои : 10.1006/geno.2001.6667 . ПМИД 11735223 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Имабаяши Х., Мори Т., Годжо С. и др. (2003). «Редифференциация дедифференцированных хондроцитов и хондрогенез стромальных клеток костного мозга человека посредством образования хондросфер с профилированием экспрессии с помощью крупномасштабного анализа кДНК». Эксп. Сотовый Res . 288 (1): 35–50. дои : 10.1016/S0014-4827(03)00130-7 . ПМИД 12878157 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .

статья о гене на хромосоме 3 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000114416 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027680 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7781595-5] Сиоми MC, Сиоми Х., Зауэр В.Х., Сринивасан С., Нуссбаум Р.Л., Дрейфус Г. (июль 1995 г.). «FXR1, аутосомный гомолог хрупкого гена умственной отсталости X» . ЭМБО Дж . 14 (11): 2401–8. дои : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07237.x . ПМЦ 398353 . ПМИД 7781595 .

[pmid9642279-6] Боливар Дж., Гельман С., Иглесиас К., Ортис М., Вальдивия М.М. (август 1998 г.). «Ген FXR1, родственный хрупкому X, представляет собой человеческий аутоантиген, процессируемый во время апоптоза» . J Биол Хим . 273 (27): 17122–7. дои : 10.1074/jbc.273.27.17122 . ПМИД 9642279 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: FXR1 хрупкий X умственная отсталость, аутосомный гомолог 1» .

[pmid8668200-8] Перейти обратно: ^а ^б Сиоми, MC; Чжан Ю; Сиоми Х; Дрейфус Г. (июль 1996 г.). «Специфические последовательности в белке FMR1 синдрома хрупкой X и белках FXR опосредуют их связывание с 60S рибосомальными субъединицами и взаимодействия между ними» . Мол. Клетка. Биол . 16 (7): 3825–32. дои : 10.1128/mcb.16.7.3825 . ISSN 0270-7306 . ПМК 231379 . ПМИД 8668200 .

[pmid7489725-9] Перейти обратно: ^а ^б Чжан, Ю; О'Коннор JP; Сиоми MC; Шринивасан С; Дутра А; Нуссбаум Р.Л.; Дрейфус Г. (ноябрь 1995 г.). «Хрупкий белок синдрома умственной отсталости X взаимодействует с новыми гомологами FXR1 и FXR2» . ЭМБО Дж . 14 (21): 5358–66. дои : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb00220.x . ISSN 0261-4189 . ПМЦ 394645 . ПМИД 7489725 .

[pmid11438699-10] Шенк А., Бардони Б., Моро А., Баньи С., Мандель Дж.Л. (июль 2001 г.). «Высококонсервативное семейство белков, взаимодействующее с хрупким X-белком умственной отсталости (FMRP) и демонстрирующее избирательное взаимодействие с FMRP-родственными белками FXR1P и FXR2P» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (15): 8844–9. Бибкод : 2001PNAS...98.8844S . дои : 10.1073/pnas.151231598 . ПМЦ 37523 . ПМИД 11438699 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]