Rab8a

Rab8a
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	3QBT, 3TNF, 4LHV, 4LHW, 4LHX, 4LHY, 4LHZ, 4LI0
Идентификаторы
Псевдонимы	Rab8a , Mel, Rab8, член Ras oncogene Family
Внешние идентификаторы	Омим : 165040 ; MGI : 96960 ; Гомологен : 100934 ; Genecards : Rab8a ; OMA : Rab8a - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	16,134,234 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 8 (mouse)
End	72,937,748 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	monocyte; ; mucosa of ileum; ; bone marrow cells; ; duodenum; ; mucosa of sigmoid colon; ; jejunal mucosa; ; blood; ; epithelium of colon; ; granulocyte; ; human penis;
	Top expressed in
	granulocyte; ; molar; ; yolk sac; ; tibiofemoral joint; ; thymus; ; duodenum; ; right kidney; ; epithelium of small intestine; ; ventricular zone; ; medial ganglionic eminence;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	nucleotide binding; GDP binding; GTP binding; myosin V binding; protein binding; protein kinase binding; GTPase activity;
Cellular component	cytoplasm; ciliary basal body; recycling endosome; cytosol; endosome; centrosome; phagocytic vesicle membrane; Golgi apparatus; cell projection; membrane; postsynaptic density; synaptic vesicle; Golgi membrane; cilium; ciliary base; neuronal cell body; dendrite; phagocytic vesicle; centriole; extracellular exosome; cytoskeleton; cytoplasmic vesicle; extracellular matrix; plasma membrane; trans-Golgi network transport vesicle; trans-Golgi network membrane; dendritic spine; recycling endosome membrane; non-motile cilium; secretory granule membrane; midbody; synapse; glutamatergic synapse;
Biological process	regulation of long-term neuronal synaptic plasticity; regulation of protein transport; axonogenesis; vesicle docking involved in exocytosis; protein secretion; regulation of protein localization; cell projection organization; G2/M transition of mitotic cell cycle; Golgi vesicle fusion to target membrane; protein transport; protein localization to plasma membrane; cellular response to insulin stimulus; cilium assembly; ciliary basal body-plasma membrane docking; neurotransmitter receptor transport to postsynaptic membrane; regulation of autophagy; autophagy; post-translational protein modification; regulation of exocytosis; transport; intracellular protein transport; Rab protein signal transduction; neurotransmitter receptor transport, endosome to postsynaptic membrane; vesicle-mediated transport in synapse;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	4218
	17274
	ENSG00000167461
	Ensmusg00000003037
	P61006
	P55258
	NM_005370
	NM_023126
	NP_005361 ; NP_005361.2
	NP_075615
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Связанный с RAS белок Rab-8A -это белок , который у людей кодируется Rab8a геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом суперсемейства RAS, которые являются небольшими GTP/GDP-связывающими белками со средним размером 200 аминокислот. Связанные с RAS белки семейства Rab/YPT могут играть роль в транспортировке белков из эндоплазматической ретикулумы в Гольджи и плазматическую мембрану. Этот белок имеет сходство на 97%, 96%и 51%с белками Dog Rab8, мыши MEL и мыши YPT1 соответственно и содержит 4-gtp/GDP-связывающие сайты, которые присутствуют во всех белках Ras. Предполагаемый эффектор-связывающий сайт этого белка аналогичен месту белков Rab/YPT. Тем не менее, этот белок содержит C-концевой мотив CAAX, который характерен для многих членов SuperFamily RAS, но который не обнаружен в YPT1 и большинстве белков RAB. Хотя этот ген был выделен как трансформирующий ген из клеточной линии меланомы, связь между MEL и злокачественной меланомой не было продемонстрировано. Этот онкоген расположен в 800 т.п.н. дистал до My09B на хромосоме 19P13.1. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что Rab8a взаимодействует с Optineurin ^{[ 8 ]} и MAP4K2 . ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000167461 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000003037 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Nimmo ER, Sanders PG, Padua RA, Hughes D, Williamson R, Johnson KJ (август 1991). «MEL Gene: новый член класса RAB/YPT, связанных с RAS,». Онкоген . 6 (8): 1347–51. PMID 1886711 .
^ Huber LA, Pimplikar S, Parton RG, Virta H, Zerial M, Simons K (октябрь 1993). «Rab8, небольшая GTPase, связанная с везикулярным движением между TGN и базолатеральной плазматической мембраной» . Журнал клеточной биологии . 123 (1): 35–45. doi : 10.1083/jcb.123.1.35 . PMC 2119815 . PMID 8408203 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Энтрез ген: Rab8a Rab8a, член семьи Ras Oncogene» .
^ Hattula K, Peränen J (2000). «FIP-2, белок с спиральной катушкой, связывает хантингтин с Rab8 и модулирует клеточный морфогенез» . Текущая биология . 10 (24): 1603–6. Bibcode : 2000cbio ... 10.1603h . doi : 10.1016/s0960-9822 (00) 00864-2 . PMID 11137014 . S2CID 12836037 .
^ Рен М., Зенг Дж., Де Лемос-Киарандини С., Розенфельд М., Адесник М., Сабатини Д.Д. (май 1996). «В своей активной форме GTP-связывающий белок Rab8 взаимодействует с активированной стрессом протеинкиназой» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (10): 5151–5. Bibcode : 1996pnas ... 93.5151r . doi : 10.1073/pnas.93.10.5151 . PMC 39423 . PMID 8643544 .

Дальнейшее чтение

Ньюпорт Дж, Ромер Ми (март 1975 г.). «Сравнительная перинатальная смертность в рамках фондов медицинской помощи и других моделей доставки». Расследование . 12 (1): 10–7. PMID 123217 .
Nimmo E, Padua RA, Hughes D, Brook JD, Williamson R, Johnson KJ (март 1989). «Подтверждение и уточнение локализации локуса C-Mel на хромосоме 19 с помощью физического и генетического картирования». Человеческая генетика . 81 (4): 382–4. doi : 10.1007/bf00283697 . PMID 2564840 . S2CID 25002878 .
Zahraoui A, Joberty G, Arpin M, Fontaine JJ, Hellio R, Tavitian A, Louvard D (январь 1994). «Небольшая Rab GTPase распределяется в цитоплазматических везикулах в не поляризованных клетках, но колокализируется с маркером жесткого соединения ZO-1 в поляризованных эпителиальных клетках» . Журнал клеточной биологии . 124 (1–2): 101–15. doi : 10.1083/jcb.124.1.101 . PMC 2119893 . PMID 8294494 .
Joberty G, Tavitian A, Zahraoui A (сентябрь 1993). «Изопренилирование белков Rab, обладающих C-концевым мотивом CAAX» . Письма Febs . 330 (3): 323–8. doi : 10.1016/0014-5793 (93) 80897-4 . PMID 8375503 . S2CID 29047580 .
Рен М., Зенг Дж., Де Лемос-Киарандини С., Розенфельд М., Адесник М., Сабатини Д.Д. (май 1996). «В своей активной форме GTP-связывающий белок Rab8 взаимодействует с активированной стрессом протеинкиназой» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (10): 5151–5. Bibcode : 1996pnas ... 93.5151r . doi : 10.1073/pnas.93.10.5151 . PMC 39423 . PMID 8643544 .
Bähler M, Kehrer I, Gordon L, Stoffler HE, Olsen As (Jul 1997). «Физическое картирование миозин-IXB человека (MYO9B), человеческого ортолога крысы Myosin Myr 5, к хромосоме 19P13.1». Геномика . 43 (1): 107–9. doi : 10.1006/geno.1997.4776 . PMID 9226381 .
Уилсон А.Л., Эрдман Р.А., Кастеллано Ф., Мальтийский Вашингтон (август 1998 г.). «Преналирование Gtpase Rab8 по геранилгеранилтрансферазам типа I и типа II» . Биохимический журнал . 333 (Pt 3): 497–504. doi : 10.1042/bj3330497 . PMC 1219609 . PMID 9677305 .
Bao S, Zhu J, Garvey WT (ноябрь 1998). «Клонирование Rab GTPases, экспрессируемые в скелетных мышцах человека: исследования устойчивых к инсулину субъектам». Гормона и метаболические исследования . 30 (11): 656–62. doi : 10.1055/s-2007-978953 . PMID 9918381 . S2CID 23540699 .
Шишева А., Чинни С.Р., Демарко С (сентябрь 1999). «Общая роль ингибитора диссоциации GDP 2 в мембране высвобождения белков Rab: модуляции его функциональных взаимодействий с помощью структурных модификаций in vitro и in vivo». Биохимия . 38 (36): 11711–21. doi : 10.1021/bi990200r . PMID 10512627 .
Hattula K, Peränen J (2001). «FIP-2, белок с спиральной катушкой, связывает хантингтин с Rab8 и модулирует клеточный морфогенез» . Текущая биология . 10 (24): 1603–6. Bibcode : 2000cbio ... 10.1603h . doi : 10.1016/s0960-9822 (00) 00864-2 . PMID 11137014 . S2CID 12836037 .
Курода Т.С., Фукуда М., Арига Х, Микосиба К (март 2002 г.). «Домен гомологии SLP синаптотагмин-подобных белков 1-4 и SLAC2 функционирует как новый домен связывания Rab27a» . Журнал биологической химии . 277 (11): 9212–8. doi : 10.1074/jbc.m112414200 . PMID 11773082 .
Hattula K, Furuhjelm J, Arffman A, Peränen J (сентябрь 2002 г.). «Специфичный для Rab8 фактор обмена ВВП/GTP участвует в ремоделировании актина и поляризованном мембранном транспорте» . Молекулярная биология клетки . 13 (9): 3268–80. doi : 10.1091/mbc.e02-03-0143 . PMC 124888 . PMID 12221131 .
Фукуда М (апрель 2003 г.). «Отдельная специфичность связывания Rab Rim1, Rim2, Rabphilin и Noc2. Идентификация критической детерминанты распознавания Rab3a/Rab27a с помощью Rim2» . Журнал биологической химии . 278 (17): 15373–80. doi : 10.1074/jbc.m212341200 . PMID 12578829 .
Lau AS, MRUK DD (апрель 2003 г.). «Раб8B GTPase и динамика соединения в яичке». Эндокринология . 144 (4): 1549–63. doi : 10.1210/en.2002-220893 . PMID 12639940 .
Linder MD, Uronen RL, Hölttä-Vuori M, Van der Sluijs P, Peränen J, Ikonen E (январь 2007 г.). «RAB8-зависимая рециркуляция способствует удалению эндосомального холестерина в нормальных и сфинголипидозе» . Молекулярная биология клетки . 18 (1): 47–56. doi : 10.1091/mbc.e06-07-0575 . PMC 1751315 . PMID 17050734 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 19 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000167461 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000003037 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid1886711-5] Nimmo ER, Sanders PG, Padua RA, Hughes D, Williamson R, Johnson KJ (август 1991). «MEL Gene: новый член класса RAB/YPT, связанных с RAS,». Онкоген . 6 (8): 1347–51. PMID 1886711 .

[pmid8408203-6] Huber LA, Pimplikar S, Parton RG, Virta H, Zerial M, Simons K (октябрь 1993). «Rab8, небольшая GTPase, связанная с везикулярным движением между TGN и базолатеральной плазматической мембраной» . Журнал клеточной биологии . 123 (1): 35–45. doi : 10.1083/jcb.123.1.35 . PMC 2119815 . PMID 8408203 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^{беременный} «Энтрез ген: Rab8a Rab8a, член семьи Ras Oncogene» .

[pmid11137014-8] Hattula K, Peränen J (2000). «FIP-2, белок с спиральной катушкой, связывает хантингтин с Rab8 и модулирует клеточный морфогенез» . Текущая биология . 10 (24): 1603–6. Bibcode : 2000cbio ... 10.1603h . doi : 10.1016/s0960-9822 (00) 00864-2 . PMID 11137014 . S2CID 12836037 .

[pmid8643544-9] Рен М., Зенг Дж., Де Лемос-Киарандини С., Розенфельд М., Адесник М., Сабатини Д.Д. (май 1996). «В своей активной форме GTP-связывающий белок Rab8 взаимодействует с активированной стрессом протеинкиназой» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (10): 5151–5. Bibcode : 1996pnas ... 93.5151r . doi : 10.1073/pnas.93.10.5151 . PMC 39423 . PMID 8643544 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]