G418
![]() | |
Имена | |
---|---|
Название ИЮПАК
( 1S , 2S , 3R , 4S , 6R )-4,6-Диамино-2-гидроксициклогексан-1,3-диил-1-(3-амино-3-дезокси-4- С -метил-β - L -арабинопиранозид) 3-(2-амино-2,7-дидезокси- D - глицеро -α- D - глюко -гептопиранозид)
| |
Систематическое название ИЮПАК
(2 R ,3 S ,4 R ,5 R ,6 S )-5-Амино-6-{[(1 R ,2 S ,3 S ,4 R ,6 S )-4,6-диамино-3- {[(2 р ,3 р ,4 р ,5 р )-3,5-дигидрокси-5-метил-4-(метиламино)оксан-2-ил]окси}-2-гидроксициклогексил]окси}-2-[(1R ) -1-гидроксиэтил]оксан-3,4 -диол | |
Другие имена
Генетицин
О -2-Амино-2,7-дидезокси -D -глицеро-α -D -глюкогептопиранозил-(1→4)-О- ( 3-дезокси-4- С -метил-3-(метиламино)-β - L -арабинопиранозил- (1→6))- D -стрептамин | |
Идентификаторы | |
| |
3D model ( JSmol )
|
|
ХЭМБЛ | |
ХимическийПаук | |
Лекарственный Банк | |
ПабХим CID
|
|
НЕКОТОРЫЙ | |
Панель управления CompTox ( EPA )
|
|
Характеристики | |
С 20 Н 40 Н 4 О 10 | |
Молярная масса | 496.558 g·mol −1 |
50 мг/мл | |
Если не указано иное, данные приведены для материалов в стандартном состоянии (при 25 °C [77 °F], 100 кПа).
|
G418 ( генетицин ) — аминогликозидный антибиотик, сходный по структуре с гентамицином В1 . Его производит Micromonospora rhodorangea . [ 1 ] G418 блокирует синтез полипептидов , ингибируя стадию элонгации как в прокариотических , так и в эукариотических клетках. [ 1 ] Устойчивость к G418 обеспечивается геном neo из Tn5, кодирующим аминогликозид-3'-фосфотрансферазу, APT 3' II. [ 1 ] G418 является аналогом сульфата неомицина и имеет механизм действия, аналогичный неомицину . G418 обычно используется в лабораторных исследованиях для отбора генетически модифицированных клеток. [ 2 ] Обычно для бактерий и водорослей используют концентрации 5 мкг/мл или менее, для клеток млекопитающих используют концентрации примерно 400 мкг/мл для селекции и 200 мкг/мл для поддержания. Однако оптимальная концентрация для отбора устойчивых клонов в клетках млекопитающих зависит от используемой клеточной линии , а также от плазмиды, несущей ген устойчивости, поэтому необходимо проводить титрование антибиотика, чтобы найти наилучшие условия для каждой экспериментальной системы. Титрование следует проводить с использованием концентраций антибиотиков в диапазоне от 100 мкг/мл до 1400 мкг/мл. Селекция устойчивых клонов может занять от 1 до 3 недель. [ нужна ссылка ]
Профиль примесей G418
[ редактировать ]G418 производится посредством процессов ферментации и выделения, а штамм-продуцент G418 Micromonospora rhodorangea продуцирует многие другие гентамицины, одновременно продуцируя G418. Обычные примеси G418 включают гентамицины A, C1, C1a, C2, C2a и X2. [ 3 ] Качество G418 основано не только на эффективности, но и на селективности, определяемой кривой уничтожения чувствительных клеток по сравнению с резистентными клетками. Хороший продукт G418 имеет самую низкую ЛД 50 для чувствительных клеток (таких как NIH 3T3 ) и самую высокую ЛД 50 (может достигать 5000 мкг/мл) для резистентных клеток (NIH 3T3, трансфицированных устойчивыми генами). Гентамицины почти не обладают селективностью, за исключением гентамицина Х2. [ 4 ]
Использование в клеточной биологии
[ редактировать ]G418 обычно используется в качестве селективного агента в установках для культивирования клеток. Исследователи могут связать ген селективной устойчивости neoR со своим вектором. Затем, если вектор успешно введен в клетки, клетки могут стать клетками, устойчивыми к G418. После обработки G418 эти векторные (-) клетки погибнут, а векторные (+) клетки выживут. Этот метод может помочь исследователям выбрать векторные (+) клетки. [ 1 ] [ 5 ]
Механизм действия
[ редактировать ]Дисульфат G418 и другие аминогликозиды предотвращают синтез белка на ранних стадиях элонгации, пост-инициации, инициации трансляции. Устойчивость к дисульфату G418 обеспечивается геном устойчивости к неомицину ( neo) транспозонов Tn5 или Tn601 (903). Клетки, трансфицированные плазмидами устойчивости, содержащими ген neo , могут экспрессировать аминогликозид-3'-фосфотрансферазу (APT 3' I или APT 3' II), которая ковалентно модифицирует G418 в 3-фосфорный G418, который имеет незначительную эффективность и низкое сродство к прокариотическим и эукариотическим организмам. рибосомы. [ 6 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с д «Генетицин» . Термо Фишер Сайентифик . Архивировано из оригинала 8 августа 2017 г. Проверено 7 августа 2017 г.
- ^ «Г418» . labome.com . Архивировано из оригинала 29 декабря 2009 г. Проверено 9 января 2010 г.
- ^ «Профиль примесей G418» . Архивировано из оригинала 3 марта 2016 г. Проверено 3 октября 2011 г.
- ^ «Селективность G418» . Архивировано из оригинала 05 февраля 2016 г. Проверено 14 июля 2011 г.
- ^ Харви Лодиш; и др. (2013). «Глава 5: Молекулярно-генетические методы». Молекулярно-клеточная биология (7-е изд.). Макмиллан Высшее образование. стр. 171–223. ISBN 978-1-4641-0981-2 .
- ^ «Дисульфат G418» . ТОКУ-Э . Проверено 28 июня 2024 г.