✖


Jump to content

Водородно-дейтериевый обмен

Водород-дейтериевый обмен (также называемый обменом H-D или H/D) представляет собой химическую реакцию , в которой ковалентно связанный атом водорода заменяется атомом дейтерия или наоборот. Его легче всего применить к обменным протонам и дейтронам, где такое превращение происходит в присутствии подходящего источника дейтерия без какого-либо катализатора. Использование кислотных, основных или металлических катализаторов в сочетании с условиями повышенной температуры и давления может облегчить обмен необменных атомов водорода, если субстрат устойчив к используемым условиям и реагентам. Это часто приводит к пердейтерированию: водородно-дейтериевому обмену всех необменных атомов водорода в молекуле.

Примером обменных протонов, которые обычно исследуются таким способом, являются протоны амидов в основной цепи белка . [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] Метод дает информацию о доступности растворителя различных частей молекулы и, следовательно, о третичной структуре белка. Теоретическая основа для понимания водородного обмена в белках была впервые описана Каем Ульриком Линдерстрем-Лангом , и он был первым, кто применил обмен H/D для изучения белков. [ 4 ]

Обменная реакция

[ редактировать ]

В протонном растворе обменные протоны, например, в гидроксильной или аминной группе, обмениваются протонами с растворителем . Если D 2 O является растворителем, в эти положения будут включены дейтроны. За реакцией обмена можно следить различными методами (см. «Обнаружение»). Поскольку этот обмен является равновесной реакцией, молярное количество дейтерия должно быть большим по сравнению с обмениваемыми протонами субстрата. Например, дейтерий добавляется к белку в H 2 O путем разбавления раствора H 2 O D 2 O (например, в десять раз). Обычно обмен осуществляется при физиологическом pH (7,0–8,0), когда белки находятся в наиболее нативном ансамбле конформационных состояний. [ 5 ] [ 6 ]

Реакция обмена H/D также может катализироваться кислотными, щелочными или металлическими катализаторами, такими как платина. Для амидных атомов водорода основной цепи белков минимальная скорость обмена происходит в среднем при pH примерно 2,6. Выполняя обмен при нейтральном pH, а затем быстро изменяя pH, скорость обмена водородов основной цепи амида можно резко замедлить или погасить . Значение pH, при котором реакция гасится, зависит от метода анализа. Для обнаружения методом ЯМР pH можно повысить примерно до 4,0–4,5. Для обнаружения масс-спектрометрией pH понижают до минимума обменной кривой, pH 2,6. В самом простом эксперименте реакции дают возможность протекать в течение установленного времени, прежде чем она будет погашена.

Характер дейтерирования молекулы, подвергшейся обмену H/D, может поддерживаться в апротонной среде. Однако некоторые методы анализа дейтерирования таких молекул, как белки, выполняются в водном растворе, а это означает, что обмен будет продолжаться с медленной скоростью даже после прекращения реакции. Нежелательный дейтерий-водородный обмен называется обратным обменом , и для его устранения были разработаны различные методы.

Обнаружение

[ редактировать ]

Обмен H–D первоначально был измерен отцом водородного обмена Каем Ульриком Линдерстрем-Лангом с использованием трубок с градиентом плотности. В настоящее время обмен H–D в первую очередь контролируется методами: ЯМР-спектроскопии , масс-спектрометрии и нейтронной кристаллографии . Каждый из этих методов имеет свои преимущества и недостатки.

ЯМР-спектроскопия

[ редактировать ]

водорода и дейтерия Ядра сильно различаются по своим магнитным свойствам. Таким образом, их можно различить с помощью ЯМР-спектроскопии . Дейтроны не будут наблюдаться в 1 Спектр ЯМР Н, и наоборот, протоны не будут наблюдаться в 2 Спектр ЯМР 1Н. Если малые сигналы наблюдаются в 1 Спектр ЯМР H сильно дейтерированного образца, их называют остаточными сигналами. Их можно использовать для расчета уровня дейтерирования в молекуле. Аналогичные сигналы не наблюдаются в 2 Спектры ЯМР 1H из-за низкой чувствительности этого метода по сравнению с 1 Х-анализ. Дейтроны обычно демонстрируют химические сдвиги, очень похожие на аналогичные им протоны. Анализ через 13 Также возможна спектроскопия ЯМР С: различные значения спина водорода ( 1 / 2 ), а дейтерий (1) приводит к различной кратности расщепления. ЯМР-спектроскопию можно использовать для определения сайт-специфического дейтерирования молекул.

Другой метод использует спектры HSQC. Обычно спектры HSQC регистрируются в несколько моментов времени, пока водород обменивается с дейтерием. Поскольку эксперимент HSQC специфичен для водорода, сигнал будет экспоненциально затухать по мере обмена водорода. Тогда можно подогнать к данным экспоненциальную функцию и получить константу обмена. Этот метод дает специфичную для остатков информацию для всех остатков в белке одновременно. [ 7 ] [ 8 ] Основным недостатком является то, что он требует предварительного определения спектра рассматриваемого белка. Это может быть очень трудоемким и обычно ограничивает метод белками размером менее 25 кДа . Поскольку запись спектра HSQC занимает от нескольких минут до нескольких часов, амиды, которые быстро обмениваются, должны измеряться с использованием других последовательностей импульсов.

Масс-спектрометрия

[ редактировать ]
Иллюстрация экспериментального процесса обмена водорода и дейтерия, измеренного с помощью масс-спектрометрии.
Иллюстрация экспериментального рабочего процесса по обмену водорода/дейтерия, измеренного с помощью масс-спектрометрии (HDX-MS). Черная волнистая линия представляет собой белковую основу. Синяя буква « H » обозначает атомы водорода, связанные с амидами основной цепи, красная буква « D » обозначает дейтерий, связанный с амидами основной цепи. Сверху раствор белка, насыщенный водородом, разбавляется концентрированным оксидом дейтерия, после чего водород, содержащийся в амидах основной цепи, обменивается на дейтерий из раствора. В регулярные моменты времени (t 1 -t 4 ) реакция обмена гасится за счет подкисления и охлаждения. Затем полученный образец белка можно подвергнуть перевариванию и обессоливанию, а иногда и газофазной фрагментации. Если белок был переварен, полученные пептиды разделяют с помощью жидкостной хроматографии (ЖХ) в сочетании с масс-спектрометрией (МС). Для каждого момента времени, включая недейтерированный контроль (t 0 ), измеряют среднюю массу каждого пептида. Затем, хотя это и не является обычной практикой, можно подвергнуть каждый аналит фрагментации, чтобы сублокализовать содержащий водород и дейтерий. Чтобы облегчить интерпретацию, здесь в спектре МС/МС показаны только ионы c-типа. Однако можно наблюдать и другие типы осколочных ионов.

Водородно-дейтериевая обменная масс-спектрометрия (HX-MS или HDX-MS) может определить общее содержание дейтерия в молекулах, подвергшихся H/D-обмену. Поскольку требуется подготовка пробы, обычно считается, что она обеспечивает точное измерение только необменных атомов водорода. Это также может включать обмен H/D в газовой фазе. [ 9 ] или обмен фаз раствора перед ионизацией. [ 3 ] Он имеет несколько преимуществ в ЯМР-спектроскопии по отношению к анализу реакций обмена H–D: требуется гораздо меньше материала, концентрация образца может быть очень низкой (всего 0,1 мкМ), предел размера намного больше, и данные можно обычно собираются и интерпретируются гораздо быстрее. [ 10 ]

Ядро дейтерия в два раза тяжелее ядра водорода, поскольку оно содержит не только протон , но и нейтрон. Таким образом, молекула, содержащая некоторое количество дейтерия, будет тяжелее молекулы, содержащей весь водород. Поскольку белок все больше дейтерируется, его молекулярная масса соответственно увеличивается. Обнаружение изменения массы белка при дейтерировании стало возможным с помощью современной масс-спектрометрии белков, о которой впервые сообщили в 1991 году Катта и Чейт. [ 11 ]

Определение сайт-специфического дейтерирования с помощью масс-спектрометрии сложнее, чем с помощью ЯМР-спектроскопии. Например, расположение и относительное количество обмена дейтерия вдоль основной цепи пептида можно грубо определить, подвергая белок протеолизу после гашения реакции обмена. Затем отдельные пептиды анализируют на общее дейтерирование каждого пептидного фрагмента. При использовании этого метода разрешение обмена дейтерия определяется размером пептидов, образующихся во время пищеварения. [ 12 ] Пепсин , кислая протеаза , обычно используется для протеолиза, поскольку во время протеолитической реакции необходимо поддерживать pH гашения. Чтобы свести к минимуму обратный обмен, протеолиз и последующий масс-спектрометрический анализ необходимо проводить как можно быстрее. ВЭЖХ- разделение пептического гидролизата часто проводят при низкой температуре непосредственно перед масс-спектрометрией электрораспылением, чтобы минимизировать обратный обмен. Совсем недавно UPLC из-за его превосходных возможностей разделения. стал использоваться [ 13 ]

В 1999 году было высказано предположение, что можно достичь разрешения по одному остатку, используя вызванную столкновением фрагментацию дейтерированных пептидов, (CID), в сочетании с тандемной масс-спектрометрией . Вскоре было обнаружено, что CID вызывает «перемешивание» положения дейтерия внутри пептидов. [ 14 ] [ 15 ] Однако фрагментация, вызванная распадом MALDI в источнике (ISD), диссоциацией электронного захвата (ECD) и диссоциацией с переносом электрона (ETD), протекает с небольшим искажением или вообще без него при правильных экспериментальных условиях. [ 16 ] [ 17 ] [ 18 ] Скремблирование изотопной маркировки вызвано столкновительным нагревом перед диссоциацией иона, и хотя CID действительно вызывает скремблирование, столкновительный нагрев также может происходить во время ионизации и транспорта ионов. [ 19 ] Однако путем тщательной оптимизации параметров прибора, вызывающих нагрев ионов, скремблирование водорода можно свести к минимуму до такой степени, при которой сохраняется изотопная маркировка фазы раствора до тех пор, пока не будет выполнена фрагментация с использованием метода, при котором скремблирования не происходит. [ 17 ] [ 18 ] [ 20 ] [ 21 ] Совсем недавно ультрафиолетовая фотодиссоциация (УФФД) также была исследована как возможный метод фрагментации для локализации дейтерия в пептидах и белках. [ 22 ] [ 23 ] В связи с этим выводы были неоднозначными: хотя при определенных условиях можно получить фрагменты УФФД, не подвергшиеся скремблированию, другие показали, что скремблирование может происходить как для пептидов, так и для белков уже на самой стадии фрагментации УФФД. [ 22 ] [ 23 ] Теория, объединяющая эти кажущиеся противоречия, касается двойного пути фрагментации, который может возникать при УФ-облучении пептидов и белков, т.е. прямой и статистической диссоциации. [ 24 ] То есть, если условия эксперимента благоприятствуют прямой диссоциации и ион-предшественник поддерживается при низких внутренних энергиях до и во время фрагментации, уровень дейтерия в полученных фрагментах будет соответствовать нескремблированному предшественнику. [ 22 ] Однако экспериментальные условия могут способствовать статистической диссоциации во время УФ-облучения, особенно при длительном времени облучения и низком давлении газа, что приводит к внутренней конверсии энергии электронного возбуждения, вносимой УФ-фотонами. [ 23 ] В результате происходит колебательное возбуждение облученной молекулы, которая, в свою очередь, подвергается скремблированию.

Нейтронная кристаллография

[ редактировать ]

Водород-дейтериевый обмен быстро обменивающихся веществ (например, гидроксильных групп) можно измерить с атомным разрешением количественно с помощью нейтронной кристаллографии и в реальном времени, если обмен проводится во время дифракционного эксперимента.

Пучки нейтронов высокой интенсивности обычно генерируются путем расщепления на линейных ускорителях частиц, таких как источник расщепленных нейтронов . Нейтроны дифрагируют кристаллы так же, как рентгеновские лучи, и могут использоваться для определения структуры. Атомы водорода, имеющие от одного до нуля электронов в биологических условиях, плохо дифрагируют рентгеновские лучи и фактически невидимы в нормальных экспериментальных условиях. Нейтроны рассеиваются на атомных ядрах и поэтому способны обнаруживать атомы водорода и дейтерия.

Атомы водорода обычно заменяются дейтерием, что приводит к сильному и положительному коэффициенту рассеяния. Часто бывает достаточно заменить только растворитель и подвижные атомы водорода в кристалле белка путем диффузии паров. В такой структуре заселенность обменного атома дейтерия в кристалле будет уточняться от 0 до 100%, что напрямую определяет количество обмена.

Приложения

[ редактировать ]

Рассеяние нейтронов

[ редактировать ]

Пердейтерирование одного компонента многокомпонентной системы может обеспечить контрастность в экспериментах по рассеянию нейтронов , где контраст, полученный при использовании дейтерированных растворителей, недостаточен. [ нужна ссылка ]

Структура белка

[ редактировать ]

Невозможно определить структуру белка с помощью обмена H/D, кроме нейтронной кристаллографии, а также невозможно определить вторичные структурные элементы. Причины этого связаны с тем, как структура белка замедляет обмен. Курсы обмена являются функцией двух параметров: доступности растворителя и водородной связи. Таким образом, амид, который является частью внутримолекулярной водородной связи, будет обмениваться медленно, если вообще будет обмениваться, тогда как амид на поверхности белка, связанного водородом с водой, будет обмениваться быстро. Амиды, захороненные в растворителе, но не связанные водородными связями, также могут иметь очень медленную скорость обмена. Поскольку как доступность растворителя, так и водородные связи способствуют скорости обмена, становится трудно приписать данную скорость обмена структурному элементу без структурных данных кристаллографии или ЯМР.

Обмен H – D использовался для характеристики пути сворачивания белков путем рефолдинга белка в условиях обмена. В эксперименте по прямому обмену (от H до D) импульс дейтерия добавляется после различного времени рефолдинга. Части структуры, которые формируются быстро, будут защищены и, следовательно, не будут обмениваться, тогда как области, которые складываются поздно на пути, будут подвергаться обмену в течение более длительных периодов времени. Таким образом, обмен H/D можно использовать для определения последовательности различных событий сворачивания. Факторами, определяющими временное разрешение этого подхода, являются эффективность смешивания и то, насколько быстро можно выполнить гашение после маркировки.

Обмен H – D использовался для характеристики белковых структур. [ 25 ] и белок-белковые взаимодействия. [ 26 ] Реакцию обмена необходимо проводить как с изолированными белками, так и с комплексом. Затем обменивающиеся регионы сравниваются. Если область скрыта связыванием, амиды в этой области могут быть защищены в комплексе и медленно обмениваться. Однако следует иметь в виду, что обмен H–D не может быть использован для определения местонахождения интерфейсов связывания для всех белок-белковых взаимодействий. Некоторые белок-белковые взаимодействия обусловлены электростатическими силами боковых цепей и вряд ли изменят скорость обмена амидных водородов основной цепи, особенно если амидные водороды расположены в стабильных структурных элементах, таких как альфа-спирали .

Наконец, обмен H–D можно использовать для мониторинга конформационных изменений белков, связанных с их функцией. Если конформация изменяется в результате посттрансляционной модификации , активации фермента, связывания лекарственного средства или других функциональных событий, вероятно, произойдет изменение обмена H/D, которое можно будет обнаружить. [ 27 ]

Онлайн-веб-сервер HDXsite

[ редактировать ]

HDXsite — это онлайн-веб-сервер, который включает в себя некоторые приложения, такие как средство моделирования HDX, повышающее разрешение экспериментальных данных HDX и моделирующее факторы защиты для отдельных остатков. [ 28 ] [ 29 ]

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Ингландер SW, Мейн Л (1 июня 1992 г.). «Сворачивание белков изучается с помощью водородного обмена и двумерного ЯМР». Ежегодный обзор биофизики и биомолекулярной структуры . 21 (1): 243–65. дои : 10.1146/annurev.bb.21.060192.001331 . ПМИД   1525469 .
  2. ^ Ингландер С.В., Сосник Т.Р., Ингландер Дж.Дж., Мейн Л. (февраль 1996 г.). «Механизмы и применение водородного обмена» . Современное мнение в области структурной биологии . 6 (1): 18–23. дои : 10.1016/s0959-440x(96)80090-x . ПМК   3412065 . ПМИД   8696968 .
  3. ^ Jump up to: а б Конерманн Л., Пан Дж., Лю Ю.Х. (март 2011 г.). «Водородообменная масс-спектрометрия для изучения структуры и динамики белков». Обзоры химического общества . 40 (3): 1224–34. дои : 10.1039/C0CS00113A . ПМИД   21173980 .
  4. ^ Ингландер С.В., Мейн Л., Бай Ю., Сосник Т.Р. (май 1997 г.). «Водородный обмен: современное наследие Линдерстрем-Ланга» . Белковая наука . 6 (5): 1101–9. дои : 10.1002/pro.5560060517 . ПМК   2143687 . ПМИД   9144782 .
  5. ^ Ингландер SW, Калленбах NR (ноябрь 1983 г.). «Водородный обмен и структурная динамика белков и нуклеиновых кислот». Ежеквартальные обзоры биофизики . 16 (4): 521–655. дои : 10.1017/S0033583500005217 . ПМИД   6204354 . S2CID   37407781 .
  6. ^ Джонсон Р.С., Уолш К.А. (декабрь 1994 г.). «Масс-спектрометрическое измерение амидного водородного обмена белков апо- и голо-миоглобина» . Белковая наука . 3 (12): 2411–2418. дои : 10.1002/pro.5560031224 . ПМК   2142783 . ПМИД   7756994 .
  7. ^ Демура М (2006). «ЯМР-анализ структурной стабильности и сворачивания кальцийсвязывающего лизоцима» . В Уэбб Г.А. (ред.). Современный магнитный резонанс . Дордрехт: Спрингер. стр. 497–501. дои : 10.1007/1-4020-3910-7_62 . ISBN  978-1-4020-3894-5 .
  8. ^ Чандак М.С., Накамура Т., Макабе К., Такенака Т., Мукаяма А., Чаудхури Т.К. и др. (июль 2013 г.). «Кинетика H/D-обмена ко-шаперонина GroES Escherichia coli, изученная методами 2D ЯМР и обмена, подавленного ДМСО». Журнал молекулярной биологии . 425 (14): 2541–60. дои : 10.1016/j.jmb.2013.04.008 . ПМИД   23583779 .
  9. ^ Стюарт Дж. Х., Шапиро Р. Х., ДеПюй Ч., Бирбаум В. Х. (1977). «Реакции водородо-дейтериевого обмена карбанионов с водой-d2 в газовой фазе». Журнал Американского химического общества . 99 (23): 7650–3. дои : 10.1021/ja00465a037 .
  10. ^ Уэльс Т.Э., Энген-младший (2006). «Водородообменная масс-спектрометрия для анализа динамики белков». Обзоры масс-спектрометрии . 25 (1): 158–70. Бибкод : 2006MSRv...25..158W . дои : 10.1002/mas.20064 . ПМИД   16208684 .
  11. ^ Катта В., Хаит Б.Т. (апрель 1991 г.). «Конформационные изменения в белках, исследованные с помощью водородообменной масс-спектрометрии с ионизацией электрораспылением». Быстрая связь в масс-спектрометрии . 5 (4): 214–7. Бибкод : 1991RCMS....5..214K . дои : 10.1002/rcm.1290050415 . ПМИД   1666528 .
  12. ^ Чжан З, Смит Д.Л. (апрель 1993 г.). «Определение амидного водородного обмена методом масс-спектрометрии: новый инструмент для выяснения структуры белка» . Белковая наука . 2 (4): 522–31. дои : 10.1002/pro.5560020404 . ПМЦ   2142359 . ПМИД   8390883 .
  13. ^ Уэльс Т.Э., Фадген К.Е., Герхардт Г.К., Энген-младший (сентябрь 2008 г.). «Высокоскоростное разделение UPLC с высоким разрешением при нуле градусов Цельсия» . Аналитическая химия . 80 (17): 6815–20. дои : 10.1021/ac8008862 . ПМК   2562353 . ПМИД   18672890 .
  14. ^ Йоргенсен Т.Дж., Гордсволл Х., Плауг М., Ропсторфф П. (март 2005 г.). «Внутримолекулярная миграция амидных атомов водорода в протонированных пептидах при столкновительной активации». Журнал Американского химического общества . 127 (8): 2785–93. дои : 10.1021/ja043789c . ПМИД   15725037 .
  15. ^ Йоргенсен Т.Дж., Баче Н., Ропсторфф П., Гордсволл Х., Плауг М. (декабрь 2005 г.). «Столкновительная активация с помощью тандемной времяпролетной масс-спектрометрии MALDI индуцирует внутримолекулярную миграцию амидных атомов водорода в протонированных пептидах» . Молекулярная и клеточная протеомика . 4 (12): 1910–9. дои : 10.1074/mcp.M500163-MCP200 . ПМИД   16127176 .
  16. ^ Бач Н., Рэнд К.Д., Ропсторфф П., Йоргенсен Т.Дж. (август 2008 г.). «Газофазная фрагментация пептидов путем распада MALDI в источнике с ограниченным амидным водородным скремблированием (1H/2H)». Аналитическая химия . 80 (16): 6431–5. дои : 10.1021/ac800902a . ПМИД   18642878 .
  17. ^ Jump up to: а б Рэнд К.Д., Адамс К.М., Зубарев Р.А., Йоргенсен Т.Дж. (январь 2008 г.). «Диссоциация электронного захвата протекает с низкой степенью внутримолекулярной миграции водородов пептидных амидов». Журнал Американского химического общества . 130 (4): 1341–9. дои : 10.1021/ja076448i . ПМИД   18171065 .
  18. ^ Jump up to: а б Зель М., Рэнд К.Д., Йенсен О.Н., Йоргенсен Т.Дж. (декабрь 2008 г.). «Диссоциация с переносом электрона облегчает измерение включения дейтерия в селективно меченные пептиды с разрешением по одному остатку». Журнал Американского химического общества . 130 (51): 17453–9. дои : 10.1021/ja805573h . ПМИД   19035774 .
  19. ^ Рэнд К.Д., Зель М., Йоргенсен Т.Дж. (октябрь 2014 г.). «Измерение обмена водорода/дейтерия в белках с высоким пространственным разрешением с помощью масс-спектрометрии: преодоление газофазного скремблирования водорода/дейтерия». Отчеты о химических исследованиях . 47 (10): 3018–27. дои : 10.1021/ar500194w . ПМИД   25171396 .
  20. ^ Волленберг Д.Т., Пенгелли С., Моуритсен Дж.К., Сукау Д., Йоргенсен К.И., Йоргенсен Т.Дж. (июнь 2020 г.). «Избежание скремблирования H/D с минимальными потерями при передаче ионов для анализа HDX-MS/MS-ETD на Q-TOF масс-спектрометре высокого разрешения» (PDF) . Аналитическая химия . 92 (11): 7453–7461. дои : 10.1021/acs.analchem.9b05208 . ПМИД   32427467 . S2CID   218759759 .
  21. ^ Рэнд К.Д., Прингл С.Д., Моррис М., Энген Дж.Р., Браун Дж.М. (октябрь 2011 г.). «ЭТД в ионоводе с бегущей волной при настроенных условиях источника ионов Z-распыления позволяет проводить измерения обмена водорода/дейтерия в конкретных местах» . Журнал Американского общества масс-спектрометрии . 22 (10): 1784–93. Бибкод : 2011JASMS..22.1784R . дои : 10.1007/s13361-011-0196-7 . ПМЦ   3438897 . ПМИД   21952892 .
  22. ^ Jump up to: а б с Мистарц У.Х., Беллина Б., Дженсен П.Ф., Браун Дж.М., Барран П.Е., Рэнд К.Д. (январь 2018 г.). «Масс-спектрометрия УФ-фотодиссоциации точно локализует участки дейтерирования основной цепи в пептидах» . Аналитическая химия . 90 (2): 1077–1080. дои : 10.1021/acs.analchem.7b04683 . ПМИД   29266933 .
  23. ^ Jump up to: а б с Модзель М., Волленберг Д.Т., Трелле М.Б., Ларсен М.Р., Йоргенсен Т.Дж. (декабрь 2020 г.). «Ультрафиолетовая фотодиссоциация протонированных пептидов и белков может протекать с H/D-скремблированием» (PDF) . Аналитическая химия . 93 (2): 691–696. дои : 10.1021/acs.analchem.0c02957 . ПМИД   33295747 . S2CID   228078945 .
  24. ^ Р. Джулиан Р. (сентябрь 2017 г.). «Механизм, лежащий в основе нисходящих экспериментов с UVPD: понимание очевидных противоречий» . Журнал Американского общества масс-спектрометрии . 28 (9): 1823–1826. Бибкод : 2017JASMS..28.1823J . дои : 10.1007/s13361-017-1721-0 . ПМК   5711567 . ПМИД   28702929 .
  25. ^ Уайт М.Р., Хан М.М., Дередж Д., Росс Ч.Р., Квинтин Р., Зуккони Б.Е., Высоцкий В.Х., Уинтрод П.Л., Уилсон Г.М., Гарсин Э.Д. (январь 2015 г.). «Мутация димерного интерфейса в глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназе регулирует ее связывание с РНК, богатой AU» . Журнал биологической химии . 290 (3): 1770–85. дои : 10.1074/jbc.M114.618165 . ПМК   4340419 . ПМИД   25451934 .
  26. ^ Манделл Дж.Г., Баерга-Ортис А., Фалик А.М., Комивес Е.А. (2005). «Измерение доступности растворителя на границах раздела белок-белок». Белково-лигандные взаимодействия . Методы молекулярной биологии. Том. 305. стр. 65–80. дои : 10.1385/1-59259-912-5:065 . ISBN  1-59259-912-5 . ПМИД   15939994 .
  27. ^ Гуттман М., Купо А., Жюльен Дж.П., Сандерс Р.В., Уилсон И.А., Мур Дж.П., Ли К.К. (февраль 2015 г.). «Потенциал антител связан со способностью распознавать закрытую форму оболочки ВИЧ до слияния» . Природные коммуникации . 6 : 6144. Бибкод : 2015NatCo...6.6144G . дои : 10.1038/ncomms7144 . ПМЦ   4338595 . ПМИД   25652336 .
  28. ^ Салмас Р.Э., Борисик А.Ю. (февраль 2021 г.). «HDXmodeller: онлайн-веб-сервер для HDX-MS высокого разрешения с автоматической проверкой» . Коммуникационная биология . 4 (1): 199. дои : 10.1038/s42003-021-01709-x . ПМЦ   7884430 . ПМИД   33589746 .
  29. ^ Салмас Р.Э., Борисик А.Ю. (май 2021 г.). «Характеристика и управление шумом при моделировании данных HDX-MS». Аналитическая химия . 93 (19): 7323–7331. дои : 10.1021/acs.analchem.1c00894 . ПМИД   33961396 . S2CID   233998906 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Hydrogen–deuterium_exchange&oldid=1226389325"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 7718ef75bd5e9ae6b745c45b4f6cb3b3__1717051200
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/77/b3/7718ef75bd5e9ae6b745c45b4f6cb3b3.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Hydrogen–deuterium exchange - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)