CXXC1

CXXC1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3QMB, 3QMC, 3QMD, 3QMG, 3QMH, 3QMI
Идентификаторы
Псевдонимы	CXXC1 , 2410002I16Rik, 5830420C16Rik, CFP1, CGBP, HsT2645, PCCX1, PHF18, SPP1, ZCGPC1, hCGBP, белок пальца 1 CXXC
Внешние идентификаторы	Опустить : 609150 ; МГИ : 1921572 ; Гомологен : 32221 ; Генные карты : CXXC1 ; ОМА : CXXC1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 18 (human)
End	50,287,839 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 18 (mouse)
End	74,354,567 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right hemisphere of cerebellum; ; body of pancreas; ; right uterine tube; ; pancreatic ductal cell; ; granulocyte; ; right lobe of thyroid gland; ; skin of leg; ; sural nerve; ; skin of abdomen; ; left lobe of thyroid gland;
	Top expressed in
	Ileal epithelium; ; tail of embryo; ; genital tubercle; ; neural layer of retina; ; choroid plexus of fourth ventricle; ; lactiferous gland; ; entorhinal cortex; ; perirhinal cortex; ; secondary oocyte; ; otic vesicle;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; zinc ion binding; protein binding; cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; histone methyltransferase activity (H3-K4 specific); metal ion binding; unmethylated CpG binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	nuclear matrix; nuclear speck; nucleus; nucleoplasm; histone methyltransferase complex; cytosol; Set1C/COMPASS complex;
Biological process	positive regulation of transcription, DNA-templated; IRE1-mediated unfolded protein response; histone H3-K4 methylation; regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	30827
	74322
	ENSG00000154832
	ENSMUSG00000024560
	Q9P0U4
	Q9CWW7
	НМ_001101654 ; НМ_014593
	НМ_028868 ; НМ_001378844
	НП_001095124 ; НП_055408
	НП_083144 ; НП_001365773
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

CpG-связывающий белок (CGBP), также известный как белок 1 цинкового пальца типа CXXC (CXXC1) или белок 1, содержащий домен PHD и CXXC (PCCX1), представляет собой белок , который у людей кодируется CXXC1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Белки, которые содержат мотив CXXC в своем ДНК-связывающем домене , такие как CXXC1, распознают последовательности CpG и регулируют экспрессию генов . ^{[ 6 ]}

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000154832 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024560 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Фуджино Т., Хасегава М., Сибата С., Кишимото Т., Имаи С., Такано Т. (июнь 2000 г.). «PCCX1, новый ДНК-связывающий белок с пальцем PHD и доменом CXXC, регулируется путем протеолиза». Биохимия Биофиз Рес Коммьюнити . 271 (2): 305–310. дои : 10.1006/bbrc.2000.2614 . ПМИД 10799292 .
^ Jump up to: ^а ^б Воо К.С., Карлоне Д.Л., Якобсен Б.М., Флодин А., Скальник Д.Г. (март 2000 г.). «Клонирование активатора транскрипции млекопитающих, который связывает неметилированные мотивы CpG и разделяет домен CXXC с ДНК-метилтрансферазой, тритораксом человека и белком 1 домена связывания метил-CpG» . Мол Клеточная Биол . 20 (6): 2108–2121. дои : 10.1128/MCB.20.6.2108-2121.2000 . ПМЦ 110827 . PMID 10688657 .
^ «Ген Энтреза: CXXC1 CXXC палец 1 (домен PHD)» .

Внешние ссылки

человека Местоположение генома CXXC1 и CXXC1 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .
человека Расположение генома SPP1 и страница сведений о гене SPP1 в браузере генома UCSC .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q9P0U4 (белок цинковых пальцев 1 типа CXXC) на PDBe-KB .

Дальнейшее чтение

Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Геном Рез . 11 (3): 422–435. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК 311072 . ПМИД 11230166 .
Симпсон Дж.К., Велленройтер Р., Пустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, выявленная с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК» . Представитель ЭМБО . 1 (3): 287–292. дои : 10.1093/embo-reports/kvd058 . ПМЦ 1083732 . ПМИД 11256614 .
Ли Дж. Х., Ву К. С., Скальник Д. Г. (2002). «Идентификация и характеристика ДНК-связывающего домена CpG-связывающего белка» . Ж. Биол. Хим . 276 (48): 44669–44676. дои : 10.1074/jbc.M107179200 . ПМИД 11572867 .
Карлоне Д.Л., Скальник Д.Г. (2001). «Белок, связывающий CpG, имеет решающее значение для раннего эмбрионального развития» . Мол. Клетка. Биол . 21 (22): 7601–7606. дои : 10.1128/MCB.21.22.7601-7606.2001 . ПМК 99931 . ПМИД 11604496 .
Ли Дж. Х., Скальник Д. Г. (2003). «CpG-связывающий белок представляет собой белок, связанный с ядерным матриксом и эухроматином, локализованный в ядерных спеклах, содержащих триторакс человека. Идентификация сигналов нацеливания на ядерный матрикс» . Ж. Биол. Хим . 277 (44): 42259–42267. дои : 10.1074/jbc.M205054200 . ПМИД 12200428 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–16903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–2127. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Барриос-Родилес М., Браун К.Р., Оздамар Б. и др. (2005). «Высокопроизводительное картирование динамической сигнальной сети в клетках млекопитающих». Наука . 307 (5715): 1621–1625. Бибкод : 2005Sci...307.1621B . дои : 10.1126/science.1105776 . ПМИД 15761153 . S2CID 39457788 .
Ли Дж. Х., Скальник Д. Г. (2006). «CpG-связывающий белок (белок пальца CXXC 1) является компонентом метилтрансферазного комплекса Set1 гистона H3-Lys4 млекопитающих, аналога дрожжевого комплекса Set1/COMPASS» . Ж. Биол. Хим . 280 (50): 41725–41731. дои : 10.1074/jbc.M508312200 . ПМИД 16253997 .
Лим Дж., Хао Т., Шоу С. и др. (2006). «Сеть белок-белкового взаимодействия при наследственных атаксиях человека и нарушениях дегенерации клеток Пуркинье» . Клетка . 125 (4): 801–814. дои : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . ПМИД 16713569 . S2CID 13709685 .
Молодой эсер, Скальник Д.Г. (2007). «Белок 1 пальца CXXC необходим для нормальной пролиферации и дифференцировки миелоидной клеточной линии PLB-985». ДНК Клеточная Биол . 26 (2): 80–90. дои : 10.1089/dna.2006.0535 . ПМИД 17328666 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 18 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000154832 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024560 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10799292-5] Фуджино Т., Хасегава М., Сибата С., Кишимото Т., Имаи С., Такано Т. (июнь 2000 г.). «PCCX1, новый ДНК-связывающий белок с пальцем PHD и доменом CXXC, регулируется путем протеолиза». Биохимия Биофиз Рес Коммьюнити . 271 (2): 305–310. дои : 10.1006/bbrc.2000.2614 . ПМИД 10799292 .

[pmid10688657-6] Jump up to: ^а ^б Воо К.С., Карлоне Д.Л., Якобсен Б.М., Флодин А., Скальник Д.Г. (март 2000 г.). «Клонирование активатора транскрипции млекопитающих, который связывает неметилированные мотивы CpG и разделяет домен CXXC с ДНК-метилтрансферазой, тритораксом человека и белком 1 домена связывания метил-CpG» . Мол Клеточная Биол . 20 (6): 2108–2121. дои : 10.1128/MCB.20.6.2108-2121.2000 . ПМЦ 110827 . PMID 10688657 .

[entrez-7] «Ген Энтреза: CXXC1 CXXC палец 1 (домен PHD)» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]