АФФ3

АФФ3
Идентификаторы
Псевдонимы	AFF3 , LAF4, MLLT2-подобный, член семейства AF4/FMR2 3, KINS
Внешние идентификаторы	Опустить : 601464 ; МГИ : 106927 ; Гомологен : 1718 ; Генные карты : AFF3 ; OMA : AFF3 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	100,192,428 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 1 (mouse)
End	38,704,036 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ganglionic eminence; ; postcentral gyrus; ; lower lobe of lung; ; lactiferous duct; ; pons; ; Achilles tendon; ; superior frontal gyrus; ; testicle; ; cerebellar vermis; ; lateral nuclear group of thalamus;
	Top expressed in
	vas deferens; ; hand; ; ankle; ; Gonadal ridge; ; internal carotid artery; ; substantia nigra; ; external carotid artery; ; stria vascularis; ; Rostral migratory stream; ; sciatic nerve;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; double-stranded DNA binding; DNA-binding transcription factor activity;
Cellular component	nucleus; nucleoplasm; cytosol; nuclear body; transcription elongation factor complex; super elongation complex;
Biological process	response to tumor necrosis factor; regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; embryonic hindlimb morphogenesis;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	3899
	16764
	ENSG00000144218
	ENSMUSG00000037138
	P51826
	P51827
	НМ_001025108 ; НМ_002285 ; НМ_001386135
	НМ_001290814 ; НМ_010678
	НП_001020279 ; НП_002276
	НП_001277743
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Член 3 семейства AF4/FMR2 представляет собой белок , который у человека кодируется AFF3 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

Этот ген кодирует тканеограниченный ядерный активатор транскрипции , который преимущественно экспрессируется в лимфоидной ткани. Выделение этого белка первоначально определило высококонсервативное AF4/FMR2 семейство ядерных транскрипционных факторов , которые могут функционировать в развитии лимфоидных клеток и онкогенезе . У некоторых пациентов с ОЛЛ этот ген был обнаружен слитым с геном MLL . Для этого гена было обнаружено множество альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов, которые кодируют разные белки. ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000144218 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037138 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Ляо X, Ма С, Траск Б, Масса Х, Гилберт Д.Д., Штаудт Л.М., Дженкинс Н.А., Коупленд Н.Г. (июнь 1996 г.). «LAF4 сопоставляется с хромосомой 1 мыши и хромосомой 2q11.2-q12 человека» . Геном млекопитающих . 7 (6): 467–8. дои : 10.1007/s003359900137 . ПМИД 8662235 . S2CID 1525532 .
^ Ма С., Штаудт Л.М. (январь 1996 г.). «LAF-4 кодирует лимфоидный ядерный белок с потенциалом трансактивации, который гомологичен AF-4, гену, слитому с MLL при лейкозах t(4;11)» . Кровь . 87 (2): 734–45. doi : 10.1182/blood.V87.2.734.bloodjournal872734 . ПМИД 8555498 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: семейство AFF3 AF4/FMR2, член 3» .

Внешние ссылки

человека AFF3 Расположение генома и страница сведений о гене AFF3 в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение

Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соарес М.Б. (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геномные исследования . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД 8889548 .
фон Берг А.Р., Беверлоо Х.Б., Ромбоут П., ван Веринг Э.Р., ван Вил М.Х., Беверсток Г.К., Клюин П.М., Слейтер Р.М., Шууринг Э. (сентябрь 2002 г.). «LAF4, ген, родственный AF4, слит с MLL при остром лимфобластном лейкозе у младенцев». Гены, хромосомы и рак . 35 (1): 92–6. дои : 10.1002/gcc.10091 . ПМИД 12203795 . S2CID 20750925 .
Хиватари М., Таки Т., Такетани Т., Таниваки М., Сугита К., Окуя М., Эгучи М., Ида К., Хаяши Ю. (май 2003 г.). «Слияние гена, связанного с AF4, LAF4, с MLL при остром лимфобластном лейкозе у детей с t(2;11)(q11;q23)» . Онкоген . 22 (18): 2851–5. дои : 10.1038/sj.onc.1206389 . ПМИД 12743608 .
Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С., Лей С., Мураж Дж., Фиск Г.Дж., Ли Ю, Сюй С., Фанг Р., Гуглер К., Рао М.С., Мандалам Р., Лебковски Дж., Стэнтон Л.В. (июнь 2004 г.). «Описание характеристик транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Природная биотехнология . 22 (6): 707–16. дои : 10.1038/nbt971 . ПМИД 15146197 . S2CID 27764390 .
Доктору медицинских наук, Фасеруку С.А., Гокгозу Н., Пиннадуваге Д., Доне С.Дж., Андрулису И.Л. (июль 2005 г.). «LAF-4 аберрантно экспрессируется при раке молочной железы человека». Международный журнал рака . 115 (4): 568–74. дои : 10.1002/ijc.20881 . ПМИД 15704140 . S2CID 11311219 .

статья о гене на хромосоме 2 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000144218 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037138 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8662235-5] Ляо X, Ма С, Траск Б, Масса Х, Гилберт Д.Д., Штаудт Л.М., Дженкинс Н.А., Коупленд Н.Г. (июнь 1996 г.). «LAF4 сопоставляется с хромосомой 1 мыши и хромосомой 2q11.2-q12 человека» . Геном млекопитающих . 7 (6): 467–8. дои : 10.1007/s003359900137 . ПМИД 8662235 . S2CID 1525532 .

[pmid8555498-6] Ма С., Штаудт Л.М. (январь 1996 г.). «LAF-4 кодирует лимфоидный ядерный белок с потенциалом трансактивации, который гомологичен AF-4, гену, слитому с MLL при лейкозах t(4;11)» . Кровь . 87 (2): 734–45. doi : 10.1182/blood.V87.2.734.bloodjournal872734 . ПМИД 8555498 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: семейство AFF3 AF4/FMR2, член 3» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]