Пропионигений скромный
Пропионигений скромный | |
---|---|
Научная классификация | |
Домен: | |
Тип: | |
Сорт: | |
Заказ: | |
Семья: | |
Род: | |
Разновидность: | П. скромный
|
Биномиальное имя | |
Пропионигений скромный Шинк и Пфенниг, 1983 г.
|
Propionigenium скудный — вид грамотрицательных , строго анаэробных бактерий. [ 1 ] Он имеет палочковидную форму и размер около 0,5-0,6 х 0,5-2,0 мкм. [ 1 ] Это важно для выяснения механизма АТФ-синтазы .
Этимология
[ редактировать ]Слово пропионигениум происходит от латинского слова acidum propionicum, означающего пропионовую кислоту, а жанр на латыни означает «производить». [ 1 ] Модестус происходит от латинского слова, означающего скромный и обозначающего чрезвычайно скромный тип обмена веществ. [ 1 ]
Таксономическая информация
[ редактировать ]Текущая классификация Propionigenium Modestum : Bacteria, Fusobacteria, Fusobacteria, Fusobacteriales, Fusobacteriaceae, Propionigenium, Modestum. Propionigenium Modetum и Propionigenium maris , в настоящее время, являются единственными двумя видами, принадлежащими к роду Propionigenium . [ 2 ] Оба они обитают в морской среде. [ 3 ] Было обнаружено, что P. Modetum более тесно связан с Ilyobacter insuetus, чем с P. maris. P. Modetum и I. Insuetus 97±4–98±5% имеют общее количество 16S рРНК (рибосомальной рибонуклеиновой кислоты) , тогда как P. Modetum и P. maris имеют только 96±5–96±8%. [ 4 ] Только у двух видов семейства Fusobacteriaceae были секвенированы полные геномы; один из них — llyobacter Polytropus . [ 5 ]
Открытие
[ редактировать ]P. Modetum был выделен Бернхардом Шинком и Норбертом Пфеннингом в 1982 году. [ 1 ] Впервые он был выделен из черной анаэробной грязи Большого канала в Венеции, Италия, а позже был выделен из человеческой слюны. [ 1 ] Первоначальное P. выделение Modetum был получен с помощью сукцинатной среды, которая использовалась в качестве основного источника энергии. ферментированного P. Сообщалось, что на каждый моль сукцината , modesetum , из среды было выделено от 2,1 до 2,4 граммов сухой массы клеток. [ 1 ]
Характеристики
[ редактировать ]P. Modetum — неспорообразующая и неподвижная бактерия . [ 1 ] Оптимум роста — рН 7,1-7,7 и температура 33 °С. [ 1 ] Содержание G+C составляет 33,9%. [ 1 ] Он использует сукцинат, фумарат, малат, аспартат, оксалоацетат и пируват для роста и ферментирует их до пропионата (ацетата) и диоксида углерода (CO 2 ). [ 1 ] Этот организм оптимально растет в пресной и соленой воде, а также в слюне человека в анаэробных условиях. [ 1 ] Propionigenium Modetum преобразует сукцинат (а также другие источники энергии) в пропионат для выработки энергии. [ 6 ] Преобразование имеет небольшое изменение свободной энергии, поэтому нет цепи переноса электронов или фосфорилирования, связанного с субстратом. [ 1 ]
Важность
[ редактировать ]АТФазы F-типа (аденилпирофосфатаза) обычно используют протоны в качестве единственного связывающего иона, но F 1 F 0 АТФаза Propionigenium Modetum является первой обнаруженной, которая использует ионы натрия (Na + ). [ 7 ] [ 8 ]
Открытие АТФазы у P. Modetum важно, поскольку оно продемонстрировало, что теория хемиосмоса , предложенная Питером Д. Митчеллом, неверна. Митчелл предположил, что H + был использован в синтезе АТФ путем прямой реакции с O 2 с превращением его в H 2 O при получении АТФ из АДФ. [ 9 ] Вместо этого АТФаза F-типа P. Modetum использует только Na. + для запуска реакции, демонстрируя, что производство H 2 O из O 2 во время синтеза АТФ не потребляет H + используется всеми другими известными АТФазами F-типа. [ 7 ] Тем самым демонстрируя, что это H + градиент, который управляет АТФ-синтазой .
Активность
[ редактировать ]АТФаза P. Modetum действует примерно в 6 раз сильнее, чем бактериальные мембраны, при 6,6 ед./мг белка. [ 10 ] АТФаза состоит из субъединиц а, b и с. Было обнаружено, что субъединица c чрезвычайно стабильна и не диссоциирует во время гель-электрофореза с SDS (додецилсульфатом натрия) до 120 ° C. [ 10 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с д и ж г час я дж к л м Шинк, Бернхард; Пфенниг, Норберт (1982). «Propionigenium Modestum Gen. Nov. Sp. Nov. Новая строго анаэробная неспорящая бактерия, растущая на сукцинате» (PDF) . Архив микробиологии . 133 (3): 209–216. дои : 10.1007/bf00415003 . S2CID 12948118 .
- ^ Шинк, Бернхард (2006). «Род Propionigenium» . Прокариоты . 7 : 955–959. дои : 10.1007/0-387-30747-8_41 . ISBN 9780387254975 .
- ^ Янссен, Питер Х.; Лисак, Вернер (1995). «Декарбоксилирование сукцината Propionigenium maris sp. nov., новой анаэробной бактерией из устьевых отложений». Арка Микробиол . 164 (1): 29–35. дои : 10.1007/s002030050232 . ПМИД 7646317 .
- ^ Брюн, Андреас; Людвиг, Вольфганг; Каим, Георг; Шинк, Бернхард; Эверс, Стефан (2002). «Ilyobacter insuetus Sp. Nov., ферментативная бактерия, специализирующаяся на разложении гидроароматических соединений» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 52 (2): 429–432. дои : 10.1099/00207713-52-2-429 . ПМИД 11931152 .
- ^ Сикорский, Йоханнес; Черткова, Ольга; Лапидус, Алла; и др. (2010). «Полная последовательность генома штамма типа Ilyobacter polytropus (CuHbu1T)» . Стандарты в геномных науках . 3 (3): 304–314. дои : 10.4056/sigs.1273360 . ПМК 3035301 . ПМИД 21304735 .
- ^ Хильперт, Вильгельм; Шинк, Бернхард; Димрот, Питер (1984). «Жизнь за счет нового механизма сохранения энергии, зависящего от декарбоксилирования, с Na + в качестве связывающего иона» . Журнал ЭМБО . 3 (8): 1655–1670. дои : 10.1002/j.1460-2075.1984.tb02030.x . ПМК 557580 . ПМИД 16453537 .
- ^ Jump up to: а б Лаубингер, Вернер; Димрот, Питер (1988). «Характеристика АТФ-синтазы Propionigenium Modetum как первичного натриевого насоса». Биохимия . 27 (19): 7531–7537. дои : 10.1021/bi00419a053 . ПМИД 2905167 .
Вернер Лаубингер и Питер Димрот
- ^ Каим, Георг (2001). «Na-транслокирующая F1F0 АТФ-синтаза Propionigenium Modestum: механохимический взгляд на двигатель F0, который управляет синтезом АТФ» . Биоэнергетика . 1505 (1): 94–107. дои : 10.1016/s0005-2728(00)00280-2 . ПМИД 11248192 .
- ^ Митчелл, Питер Д. (1974). «Хемиосмотический молекулярный механизм протонтранслокации аденозинтрифосфатаз» . ФЭБС Летт . 43 (2). Амстердам: Издательство Северной Голландии: 189–94. дои : 10.1016/0014-5793(74)80997-x . ПМИД 4277328 . S2CID 12695073 .
- ^ Jump up to: а б Лаубингер, Вернер; Димрот, Питер (1988). «Характеристика АТФ-синтазы Propionigenium Modetum как первичного натриевого насоса». Биохимия . 27 (19): 7531–7537. дои : 10.1021/bi00419a053 . ПМИД 2905167 .
Митчелл Febs Lett 43 189
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- П. Димрот (июль 1992 г.). «АТФазы Propionigenium Modetum и Bacillus alcalophilus. Стратегии синтеза АТФ в условиях низкой энергии». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) — Биоэнергетика . 1101 (2): 236–239. дои : 10.1016/0005-2728(92)90234-с . ПМИД 1385980 .
- Лаубингер, Вернер; Димрот, Питер (1989). «Аденозинтрифосфатаза Propionigenium Modetum, транслоцирующая ионы натрия, перекачивает протоны при низких концентрациях ионов натрия». Биохимия . 28 (18): 7194–7198. дои : 10.1021/bi00444a010 . ISSN 0006-2960 . ПМИД 2554965 .
- Димрот, П.; Ван, Х.; Грабе, М.; Остер, Г. (1999). «Трансдукция энергии в натриевой F-АТФазе Propionigenium Modetum» . Труды Национальной академии наук . 96 (9): 4924–4929. Бибкод : 1999PNAS...96.4924D . дои : 10.1073/pnas.96.9.4924 . ISSN 0027-8424 . ПМК 21793 . ПМИД 10220395 .