Arhgap5

Arhgap5
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	2EE4, 2EE5
Идентификаторы
Псевдонимы	ARHGAP5 , GFI2, RHOGAP5, P190-B, P190BRHOGAP, RHO GTPase Активирующий белок 5
Внешние идентификаторы	Омим : 602680 ; MGI : 1332637 ; Гомологен : 907 ; Genecards : arhgap5 ; OMA : arhgap5 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 14 (human)
End	32,159,728 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 12 (mouse)
End	52,618,758 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	Achilles tendon; ; ventricular zone; ; endothelial cell; ; Epithelium of choroid plexus; ; epithelium of colon; ; Brodmann area 23; ; corpus callosum; ; retinal pigment epithelium; ; buccal mucosa cell; ; corpus epididymis;
	Top expressed in
	lobe of cerebellum; ; ciliary body; ; retinal pigment epithelium; ; cerebellar vermis; ; spermatocyte; ; iris; ; Rostral migratory stream; ; vestibular sensory epithelium; ; parotid gland; ; deep cerebellar nuclei;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	GTP binding; SH2 domain binding; protein binding; GTPase activator activity; GTPase activity;
Cellular component	endoplasmic reticulum; membrane; cytoplasm; cytosol; plasma membrane;
Biological process	cell adhesion; regulation of small GTPase mediated signal transduction; Rho protein signal transduction; signal transduction; mammary gland development; positive regulation of GTPase activity;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	394
	11855
	ENSG00000100852
	Ensmusg00000035133
	Q13017
	P97393
	NM_001030055 ; NM_001173
	NM_009706
	NP_001025226 ; NP_001164
	NP_033836
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Активирующий Rho GTPase белок 5 является ферментом , который у людей кодируется arhgap5 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Rho GTPase, активирующий белок 5 отрицательно регулирует Rho GTPases, семейство, которое может опосредовать изменения цитоскелета, стимулируя гидролиз связанного GTP. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что arhgap5 взаимодействует с RND1 , ^{[ 7 ]} Rnd2 , ^{[ 7 ]} RND3 ^{[ 7 ]} и Роа . ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000100852 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000035133 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Burbelo PD, Miyamoto S, Utani A, Brill S, Yamada KM, Hall A, Yamada Y (1995). «P190-B, новый член семьи Rho Gap и Rho вызваны кластером после сшивки интегрина» . Дж. Биол. Химический 270 (52): 30919–26. doi : 10.1074/jbc.270.52.30919 . PMID 8537347 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: Arhgap5 Rho gtpase, активирующий белок 5» .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Веннерберг К., Забудьте М.А., Эллербрук С.М., Артур В.Т., Берридж К., Поселент Дж., Дер К.Дж., Хансен Ш.Х. (июль 2003). «RND -белки функционируют как антагонисты RHOA, активируя p190 Rhogap» . Карт Биол . 13 (13): 1106–15. doi : 10.1016/s0960-9822 (03) 00418-4 . PMC 6918695 . PMID 12842009 .

Внешние ссылки

человека Расположение генома Arhgap5 и arhgap5 страница гена в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение

Эллис С., Моран М., Маккормик Ф., Поусон Т. (1990). «Фосфорилирование белков, ассоциированных с зазором, путем трансформации и митогенных тирозинкиназ». Природа . 343 (6256): 377–81. Bibcode : 1990natur.343..377e . doi : 10.1038/343377a0 . HDL : 1807/9436 . PMID 1689011 . S2CID 4350408 .
Foster R, Hu KQ, Shaywitz DA, Settleman J (1994). «P190 RHOGAP, основной белок, связанный с RASGAP, напрямую связывает GTP» . Мол Клетка. Биол . 14 (11): 7173–81. doi : 10.1128/mcb.14.11.7173 . PMC 359251 . PMID 7935432 .
McGlade J, Brunkhorst B, Anderson D, Mbamalu G, Settleman J, Dedhar S, Rozakis-Adcock M, Chen LB, Pawson T (1993). «N-концевая область GAP регулирует цитоскелетную структуру и клеточную адгезию» . Embo j . 12 (8): 3073–81. doi : 10.1002/j.1460-2075.1993.tb05976.x . PMC 413572 . PMID 8344248 .
Бональдо М.Ф., Леннон Г., Соарс М.Б. (1996). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов» . Геном Res . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
Zrihan-Licht S, Fu Y, Settleman J, Schinkmann K, Shaw L, Keydar I, Avraham S, Avraham H (2000). «Raftk/Pyk2 Тирозинкиназа опосредует связь P190 Rhogap с Rasgap и участвует в инвазии клеток рака молочной железы» . Онкоген . 19 (10): 1318–28. doi : 10.1038/sj.onc.1203422 . PMID 10713673 .
Kulkarni SV, Gish G, Van Der Geer P, Henkemeyer M, Pawson T (2000). «Роль P120 RAS-GAP в направленном движении клеток» . J. Cell Biol . 149 (2): 457–70. doi : 10.1083/jcb.149.2.457 . PMC 2175152 . PMID 10769036 .
Чакраварти Г., Рой Д., Гонсалес М., Гей Дж., Контрерас А., Розен Дж. М. (2000). «P190-B, активирующий Rho-Gtpase белок, дифференциально экспрессируется в терминальных концевых почках и раке молочной железы». Рост клеток отличается . 11 (7): 343–54. PMID 10939588 .
Шиота М., Танихиро Т., Накагава Ю., Аоки Н., Ишида Н., Миядзаки К., Ульрих А., Миядзаки Х (2003). «Белковая тирозинфосфатаза PTP20 индуцирует реорганизацию актинового цитоскелета путем дефосфорилирования р190 RhoGAP в клетках гранулозы яичника крысы, стимулированных фолликулом, стимулирующим гормоном» . Мол Эндокринол . 17 (4): 534–49. doi : 10.1210/me.2002-0187 . PMID 12554790 .
Веннерберг К., Забудьте М.А., Эллербрук С.М., Артур В.Т., Берридж К., Поселент Дж., Дер К.Дж., Хансен Ш.Х. (2003). «RND -белки функционируют как антагонисты RHOA, активируя p190 Rhogap» . Карт Биол . 13 (13): 1106–15. doi : 10.1016/s0960-9822 (03) 00418-4 . PMC 6918695 . PMID 12842009 .
Su L, Agati JM, Parsons SJ (2003). «P190RHOGAP регулируется клеточным циклом и влияет на цитокинез» . J. Cell Biol . 163 (3): 571–82. doi : 10.1083/jcb.200308007 . PMC 2173658 . PMID 14610059 .
Colland F, Jacq X, Truplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, Meil A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (2004). «Функциональная протеомика картирование сигнального пути человека» . Геном Res . 14 (7): 1324–32. doi : 10.1101/gr.2334104 . PMC 442148 . PMID 15231748 .
Blanchetot C, Chagnon M, Dubé N, Hallé M, Tremblay ML (2005). «Методы защелкивания субстрата при идентификации клеточных мишеней PTP». Методы 35 (1): 44–53. doi : 10.1016/j.ymeth.2004.07.007 . PMID 15588985 .
Варго Гогола Т., Хекман Б.М., Гюнтер Э.Дж., Чодош Л.А., Розен Дж. М. (2006). «Сверхэкспрессия белка P190-B RHO GTPase нарушает морфогенез протоков и вызывает гиперпластические поражения в развивающейся молочной железе» . Мол Эндокринол . 20 (6): 1391–405. doi : 10.1210/me.2005-0426 . PMID 16469769 .
Zhan X, Desiderio DM (2006). «Нитропротеины из ткани аденомы гипофиза человека, обнаруженные с аффинной колонкой нитротирозина и тандемной масс -спектрометрией». Анальный. Биохимия . 354 (2): 279–89. doi : 10.1016/j.ab.2006.05.024 . PMID 16777052 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 14 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000100852 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000035133 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid8537347-5] Burbelo PD, Miyamoto S, Utani A, Brill S, Yamada KM, Hall A, Yamada Y (1995). «P190-B, новый член семьи Rho Gap и Rho вызваны кластером после сшивки интегрина» . Дж. Биол. Химический 270 (52): 30919–26. doi : 10.1074/jbc.270.52.30919 . PMID 8537347 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: Arhgap5 Rho gtpase, активирующий белок 5» .

[pmid12842009-7] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Веннерберг К., Забудьте М.А., Эллербрук С.М., Артур В.Т., Берридж К., Поселент Дж., Дер К.Дж., Хансен Ш.Х. (июль 2003). «RND -белки функционируют как антагонисты RHOA, активируя p190 Rhogap» . Карт Биол . 13 (13): 1106–15. doi : 10.1016/s0960-9822 (03) 00418-4 . PMC 6918695 . PMID 12842009 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]