Транспортин-3

ТНПО3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4C0O, 4C0P, 4C0Q, 4OL0
Идентификаторы
Псевдонимы	TNPO3 , IPO12, LGMD1F, MTR10A, TRN-SR, TRN-SR2, TRNSR, транспортин 3, LGMDD2
Внешние идентификаторы	Опустить : 610032 ; МГИ : 1196412 ; Гомологен : 40848 ; Генные карты : TNPO3 ; ОМА : ТНПО3 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 7 (human)
End	129,055,173 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 6 (mouse)
End	29,609,886 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	secondary oocyte; ; tendon of biceps brachii; ; internal globus pallidus; ; pars reticulata; ; Pars compacta; ; lateral nuclear group of thalamus; ; external globus pallidus; ; olfactory bulb; ; dorsal motor nucleus of vagus nerve; ; beta cell;
	Top expressed in
	epiblast; ; maxillary prominence; ; mandibular prominence; ; spermatocyte; ; Ileal epithelium; ; ventricular zone; ; Rostral migratory stream; ; tail of embryo; ; epithelium of lens; ; renal corpuscle;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	nuclear localization sequence binding; protein binding; identical protein binding; signaling receptor activity; nuclear import signal receptor activity;
Cellular component	cytoplasm; nuclear membrane; intracellular membrane-bounded organelle; nucleus;
Biological process	protein transport; signal transduction; protein import into nucleus; transport;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	23534
	320938
	ENSG00000064419
	ENSMUSG00000012535
	Q9Y5L0
	Q6P2B1
	НМ_001191028 ; НМ_012470
	НМ_177296 ; НМ_001347079 ; НМ_001361290
showНП_001177957 ; НП_036602 ; НП_001369145 ; НП_001369146 ; НП_001369147 ;
	NP_001369148; NP_001369149; NP_001369150; NP_001369151; NP_001369152; NP_036602.1
	НП_001334008 ; НП_796270 ; НП_001348219
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Транспортин-3 — это белок , который у человека кодируется TNPO3 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

TNPO3 является рецептором ядерного импорта белков, богатых серином/аргинином (SR), включая фактор сплайсинга, богатый серином/аргинином 1 , который является важным фактором сплайсинга предшественников мРНК . ^{[ 5 ]}^{[ 7 ]}

Клиническое значение

Локус TNPO3-IRF5 участвует в первичном билиарном циррозе печени и системной склеродермии . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000064419 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000012535 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б Катаока Н., Бачорик Дж.Л., Дрейфус Г. (июль 1999 г.). «Транспортин-SR, рецептор ядерного импорта белков SR» . J Клеточная Биол . 145 (6): 1145–52. дои : 10.1083/jcb.145.6.1145 . ПМК 2133142 . PMID 10366588 .
^ Лай MC, Линь Р.И., Хуан С.Ю., Цай CW, Тарн, Вайоминг (апрель 2000 г.). «Белок семейства импортина-бета человека, транспортин-SR2, взаимодействует с фосфорилированным доменом RS белков SR» . J Биол Хим . 275 (11): 7950–7. дои : 10.1074/jbc.275.11.7950 . ПМИД 10713112 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: транспортин 3 TNPO3» .
^ Радстейк Т.Р., Горлова О., Руэда Б. и др. (май 2010 г.). «Полногеномное исследование ассоциаций системной склеродермии идентифицирует CD247 как новый локус восприимчивости» . Нат. Жене . 42 (5): 426–9. дои : 10.1038/ng.565 . ПМК 2861917 . ПМИД 20383147 .

Дальнейшее чтение

Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Сузуки И., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Лай MC, Лин Р.И., Тарн, Вайоминг (2001). «Транспортин-SR2 опосредует ядерный импорт фосфорилированных белков SR» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 98 (18): 10154–9. дои : 10.1073/pnas.181354098 . ПМК 56931 . ПМИД 11517331 .
Аллеманд Э., Докудовская С., Бордонне Р., Тази Дж. (2003). «Консервативный белок, богатый транспортином серином/аргинином (SR) дрозофилы, позволяет импортировать в ядро факторы сплайсинга белка SR дрозофилы и фактор сплайсинга их антагониста-репрессора 1» . Мол. Биол. Клетка . 13 (7): 2436–47. дои : 10.1091/mbc.E02-02-0102 . ПМЦ 117325 . ПМИД 12134081 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Шерер С.В., Чунг Дж., Макдональд Дж.Р. и др. (2003). «Хромосома человека 7: последовательность ДНК и биология» . Наука . 300 (5620): 767–72. Бибкод : 2003Sci...300..767S . дои : 10.1126/science.1083423 . ПМК 2882961 . ПМИД 12690205 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Колланд Ф., Жак Икс, Труплин В. и др. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека» . Геном Рез . 14 (7): 1324–32. дои : 10.1101/гр.2334104 . ПМК 442148 . ПМИД 15231748 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Цанг Х.Т., Коннелл Дж.В., Браун С.Е. и др. (2006). «Систематический анализ взаимодействий белков CHMP человека: дополнительные белки, содержащие домен MIT, связываются с несколькими компонентами комплекса ESCRT III человека» . Геномика . 88 (3): 333–46. дои : 10.1016/j.ygeno.2006.04.003 . ПМИД 16730941 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 7 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000064419 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000012535 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10366588-5] Jump up to: ^а ^б Катаока Н., Бачорик Дж.Л., Дрейфус Г. (июль 1999 г.). «Транспортин-SR, рецептор ядерного импорта белков SR» . J Клеточная Биол . 145 (6): 1145–52. дои : 10.1083/jcb.145.6.1145 . ПМК 2133142 . PMID 10366588 .

[pmid10713112-6] Лай MC, Линь Р.И., Хуан С.Ю., Цай CW, Тарн, Вайоминг (апрель 2000 г.). «Белок семейства импортина-бета человека, транспортин-SR2, взаимодействует с фосфорилированным доменом RS белков SR» . J Биол Хим . 275 (11): 7950–7. дои : 10.1074/jbc.275.11.7950 . ПМИД 10713112 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: транспортин 3 TNPO3» .

[pmid20383147-8] Радстейк Т.Р., Горлова О., Руэда Б. и др. (май 2010 г.). «Полногеномное исследование ассоциаций системной склеродермии идентифицирует CD247 как новый локус восприимчивости» . Нат. Жене . 42 (5): 426–9. дои : 10.1038/ng.565 . ПМК 2861917 . ПМИД 20383147 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]