CFAP157
| CFAP157 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | CFAP157 , C9orf117, белок 157, связанный с ресничками и жгутиками | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | МГИ : 2447809 ; Гомологен : 53056 ; Генные карты : CFAP157 ; ОМА : CFAP157 — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Белок 157, связанный с ресничками и жгутиками (CFAP157), также известный как 117 хромосомы 9 открытая рамка считывания (c9orf117), представляет собой белок , который у людей кодируется геном CFAP157.
Ген CFAP157 «особенно необходим во время сперматогенеза для морфогенеза жгутика и подвижности сперматозоидов и может потребоваться для подавления образования дополнительных аксонем и обеспечения правильной ультраструктуры». [ 4 ] По данным UniProt .
Ген
[ редактировать ]Расположение
[ редактировать ]CFAP157 расположен на хромосоме 9, 9q34.11 у человека, от пары оснований 127 706 989 до пары оснований 127 716 002. [ 5 ]
Функции
[ редактировать ]Размер гена составляет 9013 оснований, ориентация плюс-цепь. [ 5 ] Ген содержит 9 экзонов . [ 6 ]
мРНК
[ редактировать ]Наиболее распространенный вариант мРНК CFAP157 содержит 1722 пары оснований . [ 6 ]
Выражение
[ редактировать ]CFAP157 экспрессируется во многих тканях человеческого организма, таких как шейка матки , легкие , яички и матка . Люди с опухолью матки, скорее всего, будут иметь экспрессию CFAP157. Этот ген экспрессируется как у взрослых, так и у плода. [ 7 ]
Белок
[ редактировать ]В CFAP157 человека содержится 520 аминокислот. [ 8 ] Белок чрезвычайно богат глютамином и беден глицином . Белок достаточно нейтрален с изоэлектрической точкой pH 7,4. [ 9 ] Средняя масса белка оценивается в 60 531,748 Да, а коэффициент поглощения - 25 440 М. −1 см −1 .
CFAP157 в основном состоит из α-спиралей отсутствует , трансмембранная спираль . Программа создания структуры белка под названием Phyre используется для создания предсказанной структуры CFAP157.
Гомология
[ редактировать ]Не существует известного аналога CFAP157 у человека. CFAP157 имеет множество ортологов. В следующей таблице приведены некоторые ортологи, включая человека, обыкновенного шимпанзе, макаку-резус, крупный рогатый скот, собаку, мышь, крысу, тропическую когтистую лягушку и рыбу-зебру. [ 10 ]
| Разновидность | Общее имя | Инвентарный номер | Идентификация последовательности | Сходство последовательностей |
|---|---|---|---|---|
| Мудрый человек | Человек | НП_001012520 | 100% | 100% |
| Пан-троглодиты | Обыкновенный шимпанзе | XP_001143084 | 98.5% | 99.0% |
| Макака мулатта | Макака-резус | XP_001095281 | 95.2% | 96.4% |
| Бос Телец | Крупный рогатый скот | XP_005213477 | 70.5% | 84.0% |
| Знакомая волчья собака | Собака | XP_005625392 | 71.5% | 80.9% |
| Мышиная мышца | Мышь | НП_079895 | 64.6% | 79.0% |
| Раттус норвегикус | Крыса | НП_001094339 | 64.2% | 78.4% |
| Ксенопус тропический | Тропическая когтистая лягушка | НП_001072774 | 41.5% | 60.5% |
| Дания рерио | данио | НП_001103638 | 34.0% | 54.9% |
Взаимодействующие белки
[ редактировать ]P14335 ( штамм вируса Кунджин MRM61C) — это вирус, который взаимодействует с CFAP157 посредством двухгибридного скрининга . Вирус Кунджин не так опасен, как другие вирусы, но это заметное открытие, поскольку его взаимодействие можно использовать для разработки новых типов лекарств. В 2005 году исследователи из Университета Квинсленда обнаружили новое медицинское применение вируса Кунджин, и возможные методы лечения включают вакцины против ВИЧ/рака. [ 11 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038987 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «CFAP157 — Белок 157, связанный с ресничками и жгутиками — Homo sapiens (Человек) — Ген и белок CFAP157» . www.uniprot.org . Проверено 5 февраля 2018 г.
- ^ Jump up to: а б База данных GeneCards Human Gene. «Ген CFAP157 — GeneCards | Белок CF157 | Антитело CF157» . www.genecards.org . Проверено 20 февраля 2018 г.
- ^ Jump up to: а б «Белок 157, связанный с ресничками и жгутиками человека (CFAP157), транс-нуклеотид - NCBI» человека sapiens . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 23 апреля 2018 г.
- ^ Группа Шулер. «Профиль EST — Hs.652519» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 23 апреля 2018 г.
{{cite web}}:|last=имеет общее имя ( справка ) - ^ «Белок 157, связанный с ресничками и жгутиками [Homo sapiens] - Белок - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 20 февраля 2018 г.
- ^ «Прот пи | Биоинформатический калькулятор» . www.protpi.ch . Проверено 23 апреля 2018 г.
- ^ «BLAST: базовый инструмент поиска локального выравнивания» . blast.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 23 апреля 2018 г.
- ^ «Новые медицинские применения вируса Кунджин» . Новости-Medical.net . 12 апреля 2005 г. Проверено 06 мая 2018 г.