Ядрышковый белок, член А1

GAR1
Идентификаторы
Псевдонимы	GAR1 , NOLA1, ядрышковый белок, член А1, рибонуклеопротеин GAR1
Внешние идентификаторы	Опустить : 606468 ; МГИ : 1930948 ; Гомологен : 137420 ; Генные карты : GAR1 ; ОМА : GAR1 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 4 (human)
End	109,824,740 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 3 (mouse)
End	129,625,045 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	tendon of biceps brachii; ; parotid gland; ; amniotic fluid; ; internal globus pallidus; ; germinal epithelium; ; epithelium of nasopharynx; ; endometrium; ; hair follicle; ; gingival epithelium; ; oral cavity;
	Top expressed in
	Ileal epithelium; ; otic placode; ; primitive streak; ; otic vesicle; ; yolk sac; ; saccule; ; epiblast; ; zygote; ; tail of embryo; ; hair follicle;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; telomerase RNA binding; box H/ACA snoRNA binding; RNA binding;
Cellular component	box H/ACA snoRNP complex; Cajal body; box H/ACA telomerase RNP complex; box H/ACA scaRNP complex; nucleus; telomerase holoenzyme complex; nucleoplasm; fibrillar center; nucleolus;
Biological process	rRNA processing; pseudouridine synthesis; telomere maintenance via telomerase; ribosome biogenesis; rRNA pseudouridine synthesis; snoRNA guided rRNA pseudouridine synthesis;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	54433
	68147
	ENSG00000109534
	ENSMUSG00000028010
	Q9NY12
	Q9CY66
	НМ_032993 ; НМ_018983
	НМ_026578
	НП_061856 ; НП_127460
	НП_080854
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Субъединица 1 рибонуклеопротеинового комплекса H/ACA представляет собой белок , который у человека кодируется GAR1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Этот ген является членом семейства генов snoRNP H/ACA (малых ядрышковых рибонуклеопротеинов). snoRNP участвуют в различных аспектах процессинга и модификации рРНК и подразделяются на два семейства: C/D и H/ACA. snoRNP H/ACA также включают белки DKC1, NOLA2 и NOLA3. Эти четыре белка H/ACA snoRNP локализуются в плотных фибриллярных компонентах ядрышек и в спиральных (кахалевских) тельцах ядра. Как продукция 18S рРНК, так и псевдоуридилирование рРНК нарушаются, если какой-либо из четырех белков истощается. Эти четыре белка snoRNP H/ACA также являются компонентами теломеразного комплекса. Кодируемый этим геном белок содержит два домена, богатых глицином и аргинином, и родственен Saccharomyces cerevisiae Gar1p. Для этого гена были обнаружены два варианта сплайсинга. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что ядрышковый белок, член A1, взаимодействует с SMN1 . ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000109534 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028010 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Дракон Ф, Погачич В, Филипович В (май 2000 г.). «Сборка in vitro малых ядрышковых РНП человека H/ACA обнаруживает уникальные особенности U17 и теломеразных РНК» . Мол Клеточная Биол . 20 (9): 3037–48. дои : 10.1128/MCB.20.9.3037-3048.2000 . ПМЦ 85579 . ПМИД 10757788 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: семейство ядрышковых белков NOLA1, член 1 (малые ядрышковые РНП H/ACA)» .
^ Пеллиццони Л., Баккон Дж., Шарру Б., Дрейфусс Дж. (июль 2001 г.). «Белок выживания двигательных нейронов (SMN) взаимодействует с белками snoRNP фибрилларином и GAR1» . Курс. Биол . 11 (14): 1079–88. Бибкод : 2001CBio...11.1079P . дои : 10.1016/S0960-9822(01)00316-5 . ПМИД 11509230 . S2CID 12392702 .

Дальнейшее чтение

Фуджи Й., Чжао FX, Фу СК, Накаи Н., Лай CY (1992). «Стабильный препарат изоферментов альдозоредуктазы из плаценты человека». Экспр. белка Пуриф . 2 (5–6): 420–5. дои : 10.1016/1046-5928(91)90103-П . ПМИД 1821816 .
Адамс МД, Керлаваж А.Р., Флейшманн Р.Д., Фулднер Р.А., Балт С.Дж., Ли Н.Х., Киркнесс Э.Ф., Вайнсток К.Г., Гокейн Дж.Д., Уайт О (1995). «Первоначальная оценка разнообразия и моделей экспрессии генов человека на основе 83 миллионов нуклеотидов последовательности кДНК» (PDF) . Природа . 377 (6547 Приложение): 3–174. ПМИД 7566098 .
Арделл, доктор медицинских наук, Арагон I, Оливейра Л., Порш Дж.Е., Берк Э., Питтлер С.Дж. (1996). «Бета-субъединица цГМФ-управляемого катионного канала фоторецептора палочки человека образуется из сложной транскрипционной единицы» . ФЭБС Летт . 389 (2): 213–8. дои : 10.1016/0014-5793(96)00588-1 . PMID 8766832 . S2CID 37174534 .
Погачич В., Дракон Ф., Филипович В. (2000). «Малые ядрышковые РНП человека H/ACA и теломераза имеют общие эволюционно консервативные белки NHP2 и NOP10» . Мол. Клетка. Биол . 20 (23): 9028–40. дои : 10.1128/MCB.20.23.9028-9040.2000 . ПМК 86556 . ПМИД 11074001 .
Пеллиццони Л., Баккон Дж., Шарру Б., Дрейфус Г. (2001). «Белок выживания двигательных нейронов (SMN) взаимодействует с белками snoRNP фибрилларином и GAR1» . Курс. Биол . 11 (14): 1079–88. Бибкод : 2001CBio...11.1079P . дои : 10.1016/S0960-9822(01)00316-5 . ПМИД 11509230 . S2CID 12392702 .
Андерсен Дж.С., Лион CE, Фокс А.Х., Люнг А.К., Лам Ю.В., Стин Х., Манн М., Ламонд А.И. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека» . Курс. Биол . 12 (1): 1–11. Бибкод : 2002CBio...12....1A . дои : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . ПМИД 11790298 . S2CID 14132033 .
Уайтхед С.Э., Джонс К.В., Чжан X, Ченг X, Тернс Р.М., Тернс MP (2003). «Детерминанты взаимодействия белка SMN, вызывающего болезнь спинальной мышечной атрофии, с модифицированным диметиларгинином боксом H/ACA малым ядрышковым рибонуклеопротеином GAR1» . Ж. Биол. Хим . 277 (50): 48087–93. дои : 10.1074/jbc.M204551200 . ПМИД 12244096 .
Ван С., Мейер, Юта (2005). «Архитектура и сборка малых ядрышковых и теломеразных рибонуклеопротеинов H/ACA млекопитающих» . ЭМБО Дж . 23 (8): 1857–67. дои : 10.1038/sj.emboj.7600181 . ПМЦ 394235 . ПМИД 15044956 .
Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С., Лей С., Мураж Дж., Фиск Г.Дж., Ли Ю, Сюй С., Фанг Р., Гуглер К., Рао М.С., Мандалам Р., Лебковски Дж., Стэнтон Л.В. (2005). «Описание характеристик транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Нат. Биотехнология . 22 (6): 707–16. дои : 10.1038/nbt971 . ПМИД 15146197 . S2CID 27764390 .
Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Люнг А.К., Онг С.Е., Лион К.Э., Ламонд А.И., Манн М. (2005). «Динамика ядрышкового протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Бибкод : 2005Natur.433...77A . дои : 10.1038/nature03207 . ПМИД 15635413 . S2CID 4344740 .
Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж, Зогби Х.И., Смоляр А, Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. ( 2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .

статья о гене на хромосоме 4 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000109534 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028010 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10757788-5] Дракон Ф, Погачич В, Филипович В (май 2000 г.). «Сборка in vitro малых ядрышковых РНП человека H/ACA обнаруживает уникальные особенности U17 и теломеразных РНК» . Мол Клеточная Биол . 20 (9): 3037–48. дои : 10.1128/MCB.20.9.3037-3048.2000 . ПМЦ 85579 . ПМИД 10757788 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: семейство ядрышковых белков NOLA1, член 1 (малые ядрышковые РНП H/ACA)» .

[pmid11509230-7] Пеллиццони Л., Баккон Дж., Шарру Б., Дрейфусс Дж. (июль 2001 г.). «Белок выживания двигательных нейронов (SMN) взаимодействует с белками snoRNP фибрилларином и GAR1» . Курс. Биол . 11 (14): 1079–88. Бибкод : 2001CBio...11.1079P . дои : 10.1016/S0960-9822(01)00316-5 . ПМИД 11509230 . S2CID 12392702 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]