ХНРНПАБ

ХНРНПАБ
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3S7R
Идентификаторы
Псевдонимы	HNRNPAB , ABBP1, HNRPAB, гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин A/B
Внешние идентификаторы	Опустить : 602688 ; МГИ : 1330294 ; Гомологен : 74950 ; GeneCards : HNRNPAB ; ОМА : HNRNPAB — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	178,211,163 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	51,497,674 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	mucosa of sigmoid colon; ; embryo; ; ganglionic eminence; ; human penis; ; mucosa of ileum; ; ventricular zone; ; mucosa of transverse colon; ; rectum; ; vulva; ; skin of thigh;
	Top expressed in
	primitive streak; ; abdominal wall; ; medial ganglionic eminence; ; condyle; ; hair follicle; ; vas deferens; ; endothelial cell of lymphatic vessel; ; Rostral migratory stream; ; renal corpuscle; ; Gonadal ridge;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA-binding transcription factor activity; nucleic acid binding; sequence-specific DNA binding; protein binding; mRNA binding; RNA binding; sequence-specific double-stranded DNA binding;
Cellular component	cytoplasm; RNA polymerase II transcription regulator complex; nucleus; nucleoplasm; ribonucleoprotein complex;
Biological process	positive regulation of transcription, DNA-templated; epithelial to mesenchymal transition;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	3182
	15384
	ENSG00000197451
	ENSMUSG00000020358
	Q99729
	Q99020
	НМ_031266 ; НМ_004499
	НМ_001048061 ; НМ_010448
	НП_004490 ; НП_112556
	НП_001041526 ; НП_034578
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин A/B , также известный как HNRNPAB , представляет собой белок, который у человека кодируется HNRNPAB геном . ^{[ 5 ]} Хотя этот ген назван HNRNPAB в связи с его первым клонированием в качестве РНК-связывающего белка, сходного с HNRNP A и HNRNP B, ^{[ 6 ]} он не является членом подсемейства HNRNP A/B HNRNP , но тесно группируется с HNRNPD/AUF1 и HNRNPDL. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

Функция

Этот ген принадлежит к подсемейству повсеместно экспрессируемых гетерогенных ядерных рибонуклеопротеинов (hnRNP). hnRNP продуцируются РНК-полимеразой II и являются компонентами гетерогенных комплексов ядерной РНК (hnRNA). Они связаны с пре-мРНК в ядре и, по-видимому, влияют на процессинг пре-мРНК и другие аспекты метаболизма и транспорта мРНК. Хотя все hnRNP присутствуют в ядре, некоторые, по-видимому, перемещаются между ядром и цитоплазмой . Белки hnRNP обладают отличными свойствами связывания нуклеиновых кислот. Кодируемый этим геном белок, связывающийся с одним из компонентов мультибелкового эдитосомного комплекса, имеет два повтора доменов квази-RRM (мотив распознавания РНК), которые связываются с РНК. Для этого гена описаны два альтернативно сплайсированных варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. ^{[ 5 ]}

Взаимодействия

Было показано, что HNRNPAB взаимодействует с TP63 . ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000197451 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000020358 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б «HNRNPAB гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин A/B [Homo sapiens (человек)]» .
^ Хан Ф.А., Джайсвал А.К., Сзер В. (сентябрь 1991 г.). «Клонирование и анализ последовательности белка hnRNP человека типа A/B» . Письма ФЭБС . 290 (1–2): 159–61. дои : 10.1016/0014-5793(91)81249-8 . ПМИД 1717314 . S2CID 11348906 .
^ Акиндахунси А.А., Бандиера А., Манзини Дж. (февраль 2005 г.). «Белки 2xRBD hnRNP позвоночных: сравнительный анализ генома, мРНК и белковых последовательностей». Вычислительная биология и химия . 29 (1): 13–23. doi : 10.1016/j.compbiolchem.2004.11.002 . ПМИД 15680582 .
^ Чаплински К., Кехер Т., Шелдер М., Сегреф А., Вильм М., Маттай И.В. (апрель 2005 г.). «Идентификация 40LoVe, белка семейства hnRNP D Xenopus, участвующего в локализации мРНК, связанной с TGF-бета, во время оогенеза» . Развивающая клетка . 8 (4): 505–15. дои : 10.1016/j.devcel.2005.01.012 . ПМИД 15809033 .
^ Фоменков А, Хуанг Ю.П., Топалоглу О, Брехман А, Осада М, Фоменкова Т и др. (июнь 2003 г.). «Мутации P63-альфа приводят к аберрантному сплайсингу рецептора фактора роста кератиноцитов при синдроме Хей-Уэллса» . Журнал биологической химии . 278 (26): 23906–14. дои : 10.1074/jbc.M300746200 . ПМИД 12692135 .

Дальнейшее чтение

Хан Ф.А., Джайсвал А.К., Сзер В. (сентябрь 1991 г.). «Клонирование и анализ последовательности белка hnRNP человека типа A/B» . Письма ФЭБС . 290 (1–2): 159–61. дои : 10.1016/0014-5793(91)81249-8 . ПМИД 1717314 . S2CID 11348906 .
Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Гресс Т.М., Мюллер-Пиллаш Ф., Генг М., Циммерхакль Ф., Зехетнер Г., Фрисс Х. и др. (октябрь 1996 г.). «Профиль экспрессии, специфичный для рака поджелудочной железы». Онкогены . 13 (8): 1819–30. ПМИД 8895530 .
Лау П.П., Чжу Х.Дж., Накамута М., Чан Л. (январь 1997 г.). «Клонирование белка, связывающего Apobec-1, который также взаимодействует с мРНК аполипопротеина B, и доказательства его участия в редактировании РНК» . Журнал биологической химии . 272 (3): 1452–5. дои : 10.1074/jbc.272.3.1452 . ПМИД 8999813 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Хэй, округ Колумбия, Кемп, Г.Д., Даргемонт С., Хэй RT (май 2001 г.). «Взаимодействие между hnRNPA1 и IkappaBalpha необходимо для максимальной активации NF-kappaB-зависимой транскрипции» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (10): 3482–90. дои : 10.1128/MCB.21.10.3482-3490.2001 . ПМЦ 100270 . ПМИД 11313474 .
Лау П.П., Чанг Б.Х., Чан Л. (апрель 2001 г.). «Двугибридное клонирование идентифицирует РНК-связывающий белок GRY-RBP как компонент эдитосомы апобек-1». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 282 (4): 977–83. дои : 10.1006/bbrc.2001.4679 . ПМИД 11352648 .
Андерсен Дж.С., Лион К.Э., Фокс А.Х., Люнг А.К., Лам Ю.В., Стин Х. и др. (январь 2002 г.). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека» . Современная биология . 12 (1): 1–11. Бибкод : 2002CBio...12....1A . дои : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . ПМИД 11790298 . S2CID 14132033 .
Перципалле П., Йонссон А., Нащекин Д., Карлссон С., Бергман Т., Гиалис А. и др. (апрель 2002 г.). «Ядерный актин связан со специфическим подмножеством белков hnRNP A/B-типа» . Исследования нуклеиновых кислот . 30 (8): 1725–34. дои : 10.1093/нар/30.8.1725 . ПМЦ 113215 . ПМИД 11937625 .
Ангенштейн Ф., Эванс А.М., Сеттлейдж Р.Э., Моран С.Т., Линг С.К., Клинцова А.Ю. и др. (октябрь 2002 г.). «Рецептор активированной C-киназы является частью рибонуклеопротеиновых комплексов, связанных с полиА-мРНК в нейронах» . Журнал неврологии . 22 (20): 8827–37. doi : 10.1523/jneurosci.22-20-08827.2002 . ПМК 6757688 . ПМИД 12388589 .
Фоменков А, Хуанг Ю.П., Топалоглу О, Брехман А, Осада М, Фоменкова Т и др. (июнь 2003 г.). «Мутации P63-альфа приводят к аберрантному сплайсингу рецептора фактора роста кератиноцитов при синдроме Хей-Уэллса» . Журнал биологической химии . 278 (26): 23906–14. дои : 10.1074/jbc.M300746200 . ПМИД 12692135 .
Чжан С., Шлотт Б., Герлах М., Гросс Ф. (2004). «ДНК-зависимая протеинкиназа (ДНК-ПК) фосфорилирует ядерную ДНК-хеликазу II/РНК-хеликазу А и белки hnRNP РНК-зависимым образом» . Исследования нуклеиновых кислот . 32 (1): 1–10. дои : 10.1093/нар/gkg933 . ПМК 373260 . ПМИД 14704337 .
Онг С.Е., Миттлер Г., Манн М. (ноябрь 2004 г.). «Идентификация и количественная оценка сайтов метилирования in vivo тяжелым метилсилаком». Природные методы . 1 (2): 119–26. дои : 10.1038/nmeth715 . ПМИД 15782174 . S2CID 6654604 .
Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (октябрь 2006 г.). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Природная биотехнология . 24 (10): 1285–92. дои : 10.1038/nbt1240 . ПМИД 16964243 . S2CID 14294292 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 5 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000197451 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000020358 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^б «HNRNPAB гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин A/B [Homo sapiens (человек)]» .

[pmid1717314-6] Хан Ф.А., Джайсвал А.К., Сзер В. (сентябрь 1991 г.). «Клонирование и анализ последовательности белка hnRNP человека типа A/B» . Письма ФЭБС . 290 (1–2): 159–61. дои : 10.1016/0014-5793(91)81249-8 . ПМИД 1717314 . S2CID 11348906 .

[pmid15680582-7] Акиндахунси А.А., Бандиера А., Манзини Дж. (февраль 2005 г.). «Белки 2xRBD hnRNP позвоночных: сравнительный анализ генома, мРНК и белковых последовательностей». Вычислительная биология и химия . 29 (1): 13–23. doi : 10.1016/j.compbiolchem.2004.11.002 . ПМИД 15680582 .

[pmid15809033-8] Чаплински К., Кехер Т., Шелдер М., Сегреф А., Вильм М., Маттай И.В. (апрель 2005 г.). «Идентификация 40LoVe, белка семейства hnRNP D Xenopus, участвующего в локализации мРНК, связанной с TGF-бета, во время оогенеза» . Развивающая клетка . 8 (4): 505–15. дои : 10.1016/j.devcel.2005.01.012 . ПМИД 15809033 .

[pmid12692135-9] Фоменков А, Хуанг Ю.П., Топалоглу О, Брехман А, Осада М, Фоменкова Т и др. (июнь 2003 г.). «Мутации P63-альфа приводят к аберрантному сплайсингу рецептора фактора роста кератиноцитов при синдроме Хей-Уэллса» . Журнал биологической химии . 278 (26): 23906–14. дои : 10.1074/jbc.M300746200 . ПМИД 12692135 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]