ЛМО4

ЛМО4
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	2L4Z
Идентификаторы
Псевдонимы	LMO4 , только домен LIM 4
Внешние идентификаторы	Опустить : 603129 ; МГИ : 109360 ; Гомологен : 4927 ; Генные карты : LMO4 ; ОМА : LMO4 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	87,348,923 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 3 (mouse)
End	143,910,981 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	dorsolateral prefrontal cortex; ; prefrontal cortex; ; Brodmann area 46; ; superior frontal gyrus; ; parietal lobe; ; postcentral gyrus; ; Brodmann area 9; ; frontal pole; ; cingulate gyrus; ; anterior cingulate cortex;
	Top expressed in
	granulocyte; ; genital tubercle; ; cingulate gyrus; ; superior frontal gyrus; ; visual cortex; ; primary motor cortex; ; primary visual cortex; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; CA3 field; ; corneal stroma;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	DNA-binding transcription factor activity; metal ion binding; protein binding; cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; transcription factor binding;
Cellular component	transcription regulator complex; cell leading edge;
Biological process	regulation of transcription, DNA-templated; ventricular septum development; spinal cord association neuron differentiation; thymus development; negative regulation of protein-containing complex assembly; transcription, DNA-templated; ventral spinal cord interneuron differentiation; regulation of cell activation; spinal cord motor neuron differentiation; regulation of cell fate specification; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; neural tube closure; transcription by RNA polymerase II; positive regulation of kinase activity; regulation of cell migration;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	8543
	16911
	ENSG00000143013
	ENSMUSG00000028266
	P61968
	P61969
	НМ_006769 ; НМ_001369491
	НМ_001161769 ; НМ_001161770 ; НМ_010723
	НП_006760 ; НП_001356420
	НП_001155241 ; НП_001155242 ; НП_034853
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Фактор транскрипции домена LIM LMO4 представляет собой белок , который у человека кодируется LMO4 геном . ^{[ 5 ]}

Только 4-й домен LIM представляет собой богатый цистеином белок, содержащий два домена LIM, который может играть роль регулятора транскрипции или, возможно, онкогена. Его мРНК характеризуется GC-богатой 5'-областью и множеством мотивов ATTT в 3'-области. Вариант транскрипта, в котором отсутствует часть 5'-области, был идентифицирован, но не может быть подтвержден из-за богатой GC природы этой области. ^{[ 5 ]}

Взаимодействия

Было показано, что LMO4 взаимодействует с LDB1 , ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} РББП8 ^{[ 6 ]}^{[ 8 ]} и BRCA1 . ^{[ 6 ]}^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000143013 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028266 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: LMO4 LIM-домен только 4» .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Сазерленд, Кейт Д.; Висвадер Джейн Э; Чунг Дэвид Ю.Х.; Сумма Элеонора Ю.М.; Линдеман Джеффри Дж; Кэмпбелл Ян Дж. (октябрь 2003 г.). «Мутационный анализ гена LMO4, кодирующего белок, взаимодействующий с BRCA1, при карциноме молочной железы» . Межд. Дж. Рак . 107 (1): 155–8. дои : 10.1002/ijc.11343 . ISSN 0020-7136 . ПМИД 12925972 .
^ Дин, Джанет Э; Маккей Джоэл П; Кван Энн HY; Сумма Элеонора Ю.М.; Висвадер Джейн Э; Мэтьюз Жаклин М. (май 2003 г.). «Структурная основа распознавания ldb1 N-концевыми доменами LIM LMO2 и LMO4» . ЭМБО Дж . 22 (9): 2224–33. дои : 10.1093/emboj/cdg196 . ISSN 0261-4189 . ПМК 156068 . ПМИД 12727888 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Сумма, Элеонора Ю.М.; Пэн Бенджамин; Юй Синь; Чэнь Цзюньцзе; Бирн Дженнифер; Линдеман Джеффри Дж; Висвадер Джейн Э. (март 2002 г.). «Белок домена LIM LMO4 взаимодействует с кофактором CtIP и супрессором опухоли BRCA1 и ингибирует активность BRCA1» . Ж. Биол. Хим . 277 (10): 7849–56. дои : 10.1074/jbc.M110603200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 11751867 .

Дальнейшее чтение

Кенни Д.А., Юрата Л.В., Сага Ю., Гилл Г.Н. (1998). «Идентификация и характеристика LMO4, гена LMO с новым характером экспрессии во время эмбриогенеза» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 95 (19): 11257–62. Бибкод : 1998PNAS...9511257K . дои : 10.1073/pnas.95.19.11257 . ПМК 21629 . ПМИД 9736723 .
Рачевскис Дж., Дилл А., Спарано Дж.А., Руан Х. (1999). «Молекулярное клонирование LMO41, нового гена домена LIM человека». Биохим. Биофиз. Акта . 1445 (1): 148–53. дои : 10.1016/s0167-4781(99)00037-8 . ПМИД 10209267 .
Це Э., Грутц Г., Гарнер А.А. и др. (2000). «Характеристика гена Lmo4, кодирующего белок только LIM: геномная организация и сравнительное хромосомное картирование». Мамм. Геном . 10 (11): 1089–94. дои : 10.1007/s003359901167 . ПМИД 10556429 . S2CID 19479121 .
Сум Э.Ю., Пэн Б., Юй Х и др. (2002). «Белок домена LIM LMO4 взаимодействует с кофактором CtIP и супрессором опухоли BRCA1 и ингибирует активность BRCA1» . Ж. Биол. Хим . 277 (10): 7849–56. дои : 10.1074/jbc.M110603200 . ПМИД 11751867 .
Дин Дж. Э., Висвадер Дж. Э., Маккей Дж. П., Мэтью Дж. М. (2003). «Назначения 1H, 15N и 13C FLIN4, внутримолекулярного комплекса LMO4: ldb1». Дж. Биомол. ЯМР . 23 (2): 165–6. дои : 10.1023/А:1016363414644 . ПМИД 12153047 . S2CID 30891765 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ву Д., Марин П., Уолцер С. и др. (2003). «Регулятор транскрипции LMO4 препятствует нейрогенезу в клетках нейробластомы человека SH-SY5Y». Мозговой Рес. Мол. Мозговой Рес . 115 (2): 93–103. дои : 10.1016/S0169-328X(03)00119-0 . ПМИД 12877980 .
Манетопулос С., Ханссон А., Карлссон Дж. и др. (2003). «Белок LMO4, содержащий только LIM, модулирует транскрипционную активность HEN1». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 307 (4): 891–9. дои : 10.1016/S0006-291X(03)01298-1 . ПМИД 12878195 .
Сазерленд К.Д., Висвадер Дж.Э., Чунг Д.Ю. и др. (2003). «Мутационный анализ гена LMO4, кодирующего белок, взаимодействующий с BRCA1, при карциноме молочной железы» . Межд. Дж. Рак . 107 (1): 155–8. дои : 10.1002/ijc.11343 . ПМИД 12925972 .
Колланд Ф., Жак Икс, Труплин В. и др. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека» . Геном Рез . 14 (7): 1324–32. дои : 10.1101/гр.2334104 . ПМК 442148 . ПМИД 15231748 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Новотны-Дирмайр В., Лин Б., Гу Л., Цао Х (2005). «Модуляция гликопротеинового комплекса 130 субъединицы рецептора интерлейкина-6 и его передача сигналов посредством взаимодействия LMO4» . Ж. Биол. Хим . 280 (13): 12747–57. дои : 10.1074/jbc.M500175200 . ПМИД 15677447 .
Сан Т., Патуан С., Абу-Халил А. и др. (2005). «Ранняя асимметрия транскрипции генов в левой и правой коре головного мозга эмбриона человека» . Наука . 308 (5729): 1794–8. Бибкод : 2005Sci...308.1794S . дои : 10.1126/science.1110324 . ПМЦ 2756725 . ПМИД 15894532 .
Сум Э.Ю., Сегара Д., Душио Б. и др. (2005). «Сверхэкспрессия LMO4 индуцирует гиперплазию молочной железы, способствует инвазии клеток и является предиктором плохого исхода при раке молочной железы» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 102 (21): 7659–64. Бибкод : 2005PNAS..102.7659S . дои : 10.1073/pnas.0502990102 . ПМК 1140463 . ПМИД 15897450 .
Джеффрис CM, Грэм SC, Стоукс PH и др. (2007). «Стабилизация бинарного белкового комплекса путем интеин-опосредованной циклизации» . Белковая наука . 15 (11): 2612–8. дои : 10.1110/ps.062377006 . ПМК 2242402 . ПМИД 17001033 .

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000143013 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028266 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: LMO4 LIM-домен только 4» .

[pmid12925972-6] Перейти обратно: ^а ^б ^с Сазерленд, Кейт Д.; Висвадер Джейн Э; Чунг Дэвид Ю.Х.; Сумма Элеонора Ю.М.; Линдеман Джеффри Дж; Кэмпбелл Ян Дж. (октябрь 2003 г.). «Мутационный анализ гена LMO4, кодирующего белок, взаимодействующий с BRCA1, при карциноме молочной железы» . Межд. Дж. Рак . 107 (1): 155–8. дои : 10.1002/ijc.11343 . ISSN 0020-7136 . ПМИД 12925972 .

[pmid12727888-7] Дин, Джанет Э; Маккей Джоэл П; Кван Энн HY; Сумма Элеонора Ю.М.; Висвадер Джейн Э; Мэтьюз Жаклин М. (май 2003 г.). «Структурная основа распознавания ldb1 N-концевыми доменами LIM LMO2 и LMO4» . ЭМБО Дж . 22 (9): 2224–33. дои : 10.1093/emboj/cdg196 . ISSN 0261-4189 . ПМК 156068 . ПМИД 12727888 .

[pmid11751867-8] Перейти обратно: ^а ^б Сумма, Элеонора Ю.М.; Пэн Бенджамин; Юй Синь; Чэнь Цзюньцзе; Бирн Дженнифер; Линдеман Джеффри Дж; Висвадер Джейн Э. (март 2002 г.). «Белок домена LIM LMO4 взаимодействует с кофактором CtIP и супрессором опухоли BRCA1 и ингибирует активность BRCA1» . Ж. Биол. Хим . 277 (10): 7849–56. дои : 10.1074/jbc.M110603200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 11751867 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]