РАД18

РАД18
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2MRE, 2MRF, 2Y43, 2YBF
Идентификаторы
Псевдонимы	RAD18 , RNF73, убиквитинпротеинлигаза E3, убиквитинпротеинлигаза RAD18 E3
Внешние идентификаторы	Опустить : 605256 ; МГИ : 1890476 ; Гомологен : 48572 ; Генные карты : RAD18 ; ОМА : RAD18 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 3 (human)
End	8,963,773 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 6 (mouse)
End	112,673,647 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	testicle; ; Achilles tendon; ; ventricular zone; ; gonad; ; ganglionic eminence; ; jejunal mucosa; ; stromal cell of endometrium; ; epithelium of colon; ; islet of Langerhans; ; bone marrow cells;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; zygote; ; spermatocyte; ; genital tubercle; ; spermatid; ; secondary oocyte; ; primary oocyte; ; epiblast; ; lumbar spinal ganglion; ; inner renal medulla;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	metal ion binding; polyubiquitin modification-dependent protein binding; Y-form DNA binding; ubiquitin protein ligase activity; damaged DNA binding; DNA binding; ubiquitin protein ligase binding; single-stranded DNA helicase activity; protein binding; identical protein binding; transferase activity; protein-containing complex binding; single-stranded DNA binding;
Cellular component	cytoplasm; site of double-strand break; microtubule organizing center; nucleus; replication fork; centrosome; Rad6-Rad18 complex; nuclear inclusion body; cytoskeleton; nucleoplasm; nuclear body;
Biological process	protein monoubiquitination; response to UV; negative regulation of cell death; positive regulation of chromosome segregation; cellular response to DNA damage stimulus; postreplication repair; protein autoubiquitination; DNA repair; protein ubiquitination;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	56852
	58186
	ENSG00000070950
	ENSMUSG00000030254
	Q9NS91
	Q9QXK2
	НМ_020165
	НМ_001167730 ; НМ_021385 ; НМ_001381931 ; НМ_001381932 ; НМ_001381933
	НП_064550
	НП_001161202 ; НП_067360 ; НП_001368860 ; НП_001368861 ; НП_001368862
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Е3 убиквитин-протеинлигаза RAD18 представляет собой фермент , который у человека кодируется RAD18 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Также была создана нокаутная линия клеток колоректального рака человека HCT116. ^{[ 8 ]}

Функция

Белок, кодируемый этим геном, очень похож на S. cerevisiae белок восстановления повреждений ДНК Rad18. Дрожжевой Rad18 функционирует посредством взаимодействия с Rad6, который представляет собой фермент, конъюгирующий убиквитин, необходимый для пострепликационной репарации поврежденной ДНК. Подобно своему дрожжевому аналогу, этот белок способен взаимодействовать с человеческим гомологом дрожжевого белка Rad6 посредством консервативного мотива безымянного пальца . Мутация этого мотива приводит к дефектной репликации ДНК, поврежденной УФ-излучением, и гиперчувствительности к множественным мутагенам. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что RAD18 взаимодействует с HLTF . ^{[ 9 ]} BE2B ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} и УБЭ2А . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000070950 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030254 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Татейши С., Сакураба Ю., Масуяма С., Иноуэ Х., Ямаидзуми М. (июль 2000 г.). «Дисфункция Rad18 человека приводит к дефектной пострепликационной репарации и гиперчувствительности к множественным мутагенам» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (14): 7927–32. Бибкод : 2000PNAS...97.7927T . дои : 10.1073/pnas.97.14.7927 . ПМК 16647 . ПМИД 10884424 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Синь Х, Линь В, Суманасекера В, Чжан Ю, Ву Х, Ван Цзи (июль 2000 г.). «Продукт человеческого гена RAD18 взаимодействует с HHR6A и HHR6B» . Исследования нуклеиновых кислот . 28 (14): 2847–54. дои : 10.1093/нар/28.14.2847 . ПМЦ 102657 . ПМИД 10908344 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: RAD18 гомолог RAD18 (S. cerevisiae)» .
^ Сиоми Н., Мори М., Цудзи Х., Имаи Т., Иноуэ Х., Татейши С., Ямаидзуми М., Сиоми Т. (01.01.2007). «Человеческий RAD18 участвует в специфической для S-фазы репарации одноцепочечных разрывов без моноубиквитинирования PCNA» . Исследования нуклеиновых кислот . 35 (2): e9. дои : 10.1093/nar/gkl979 . ПМК 1802632 . ПМИД 17158148 .
^ Унк И, Хайду И, Фатиол К, Гурвиц Дж, Юн Дж. Х., Пракаш Л., Пракаш С., Харачка Л. (март 2008 г.). «Человеческий HLTF функционирует как убиквитинлигаза для полиубиквитинирования ядерного антигена пролиферирующих клеток» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (10): 3768–73. Бибкод : 2008PNAS..105.3768U . дои : 10.1073/pnas.0800563105 . ПМК 2268824 . ПМИД 18316726 .

Дальнейшее чтение

Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Малдер Л.К., Чакрабарти Л.А., Мюсинг М.А. (июль 2002 г.). «Взаимодействие интегразы ВИЧ-1 с белком репарации ДНК hRad18» . Журнал биологической химии . 277 (30): 27489–93. дои : 10.1074/jbc.M203061200 . ПМИД 12016221 .
Никифоров А.А., Сасина Л.К., Светлова М.П., Соловьева Л.В., Оей С.Л., Брэдбери Э.М., Томилин Н.В. (2004). «Ранняя иммобилизация нуклеазы FEN1 и накопление белка hRAD18 на остановленных вилках репликации ДНК в клетках млекопитающих». Доклады биохимии и биофизики . 389 : 122–5. дои : 10.1023/А:1023696425171 . ПМИД 12856420 . S2CID 2646911 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж.Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кэнтли Л.К., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК 514446 . ПМИД 15302935 .
Ватанабэ К., Татейши С., Кавасудзи М., Цуримото Т., Иноуэ Х., Ямаидзуми М. (октябрь 2004 г.). «Rad18 направляет полеты к местам остановки репликации посредством физического взаимодействия и моноубиквитинирования PCNA» . Журнал ЭМБО . 23 (19): 3886–96. дои : 10.1038/sj.emboj.7600383 . ПМК 522788 . ПМИД 15359278 .
Никифоров А, Светлова М, Соловьева Л, Сасина Л, Сиино Дж, Назаров И, Брэдбери М, Томилин Н (октябрь 2004 г.). «Вызванное повреждением ДНК накопление белка Rad18 в остановленных вилках репликации в клетках млекопитающих включает фосфорилирование белка вверху». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 323 (3): 831–7. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.08.165 . ПМИД 15381075 .
Миясе С., Татейши С., Ватанабэ К., Томита К., Судзуки К., Иноуэ Х., Ямаидзуми М. (январь 2005 г.). «Дифференциальная регуляция Rad18 посредством Rad6-зависимого моно- и полиубиквитинирования» . Журнал биологической химии . 280 (1): 515–24. дои : 10.1074/jbc.M409219200 . ПМИД 15509568 .
Масуяма С., Татейши С., Ёмогида К., Нишимунэ Ю., Судзуки К., Сакураба Ю., Иноуэ Х., Огава М., Ямаидзуми М. (август 2005 г.). «Регулируемая экспрессия и динамические изменения субъядерной локализации Rad18 млекопитающих в нормальных и генотоксических условиях» . Гены в клетки . 10 (8): 753–62. дои : 10.1111/j.1365-2443.2005.00874.x . ПМИД 16098139 . S2CID 41733250 .
Ноусиайнен М., Силье Х.Х., Зауэр Г., Нигг Э.А., Кернер Р. (апрель 2006 г.). «Фосфопротеомный анализ митотического веретена человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (14): 5391–6. Бибкод : 2006PNAS..103.5391N . дои : 10.1073/pnas.0507066103 . ПМЦ 1459365 . ПМИД 16565220 .
Би X, Баркли Л.Р., Слейтер Д.М., Татейши С., Ямаидзуми М., Омори Х., Вазири С. (май 2006 г.). «Rad18 регулирует каппа ДНК-полимеразу и необходим для восстановления после остановки, опосредованной контрольной точкой S-фазы» . Молекулярная и клеточная биология . 26 (9): 3527–40. дои : 10.1128/MCB.26.9.3527-3540.2006 . ПМЦ 1447421 . ПМИД 16611994 .
Ллойд А.Г., Татейши С., Биениас П.Д. , Мьюсинг М.А., Ямаидзуми М., Малдер Л.К. (май 2006 г.). «Влияние белка репарации ДНК Rad18 на вирусную инфекцию» . ПЛОС Патогены . 2 (5): е40. дои : 10.1371/journal.ppat.0020040 . ПМК 1463017 . ПМИД 16710452 .
Юаса М.С., Масутани С., Хирано А., Кон М.А., Ямаидзуми М., Накатани Ю., Ханаока Ф. (июль 2006 г.). «Эта-комплекс ДНК-полимеразы человека, содержащий Rad18, Rad6 и Rev1; протеомный анализ и нацеливание комплекса на связанную с хроматином фракцию клеток, подвергающихся остановке репликационной вилки» . Гены в клетки . 11 (7): 731–44. дои : 10.1111/j.1365-2443.2006.00974.x . ПМИД 16824193 . S2CID 32695133 .
Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (октябрь 2006 г.). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Природная биотехнология . 24 (10): 1285–92. дои : 10.1038/nbt1240 . ПМИД 16964243 . S2CID 14294292 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф., Мачек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000070950 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030254 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10884424-5] Jump up to: ^а ^б ^с Татейши С., Сакураба Ю., Масуяма С., Иноуэ Х., Ямаидзуми М. (июль 2000 г.). «Дисфункция Rad18 человека приводит к дефектной пострепликационной репарации и гиперчувствительности к множественным мутагенам» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (14): 7927–32. Бибкод : 2000PNAS...97.7927T . дои : 10.1073/pnas.97.14.7927 . ПМК 16647 . ПМИД 10884424 .

[pmid10908344-6] Jump up to: ^а ^б ^с Синь Х, Линь В, Суманасекера В, Чжан Ю, Ву Х, Ван Цзи (июль 2000 г.). «Продукт человеческого гена RAD18 взаимодействует с HHR6A и HHR6B» . Исследования нуклеиновых кислот . 28 (14): 2847–54. дои : 10.1093/нар/28.14.2847 . ПМЦ 102657 . ПМИД 10908344 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: RAD18 гомолог RAD18 (S. cerevisiae)» .

[8] Сиоми Н., Мори М., Цудзи Х., Имаи Т., Иноуэ Х., Татейши С., Ямаидзуми М., Сиоми Т. (01.01.2007). «Человеческий RAD18 участвует в специфической для S-фазы репарации одноцепочечных разрывов без моноубиквитинирования PCNA» . Исследования нуклеиновых кислот . 35 (2): e9. дои : 10.1093/nar/gkl979 . ПМК 1802632 . ПМИД 17158148 .

[pmid18316726-9] Унк И, Хайду И, Фатиол К, Гурвиц Дж, Юн Дж. Х., Пракаш Л., Пракаш С., Харачка Л. (март 2008 г.). «Человеческий HLTF функционирует как убиквитинлигаза для полиубиквитинирования ядерного антигена пролиферирующих клеток» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (10): 3768–73. Бибкод : 2008PNAS..105.3768U . дои : 10.1073/pnas.0800563105 . ПМК 2268824 . ПМИД 18316726 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]