ГГА1

ГГА1
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 1J2J, 1JWF, 1JWG, 1NA8, 1NAF, 1NWM, 1O3X, 1OM9, 1OXZ, 1PY1, 1UJJ, 1UJK, 1X79, 2DWX, 2DWY, 3G2S, 3G2T, 3G2U, 3G2V, 3G2W
Идентификаторы
Псевдонимы	GGA1 , ассоциированный с аппаратом Гольджи, содержащий гамма-адаптин, ARF-связывающий белок 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 606004 ; МГИ : 2146207 ; Гомологен : 39250 ; Генные карты : GGA1 ; ОМА : GGA1 – ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 22 (human) Band 22q13.1 Start 37,608,725 bp End 37,633,564 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 15 (mouse) Band 15|15 E1 Start 78,761,390 bp End 78,778,785 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in pancreatic ductal cell left testis right testis endothelial cell right uterine tube mucosa of ileum right hemisphere of cerebellum pituitary gland gingival epithelium anterior pituitary Top expressed in granulocyte muscle of thigh lip pyloric antrum yolk sac superior frontal gyrus ventricular zone dentate gyrus of hippocampal formation granule cell primary visual cortex esophagus More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function protein binding protein heterodimerization activity molecular function Cellular component endosome Golgi apparatus endosome membrane intracellular anatomical structure membrane intracellular membrane-bounded organelle clathrin adaptor complex nucleoplasm early endosome membrane early endosome cytosol protein-containing complex Biological process protein transport intracellular protein transport toxin transport positive regulation of protein catabolic process vesicle-mediated transport transport Golgi to plasma membrane transport protein localization protein localization to cell surface retrograde transport, endosome to Golgi Golgi to plasma membrane protein transport protein localization to ciliary membrane Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 26088 106039 Вместе ENSG00000100083 ENSMUSG00000033128 ЮниПрот Q9UJY5 Q8R0H9 RefSeq (мРНК) showНМ_001001560 НМ_001001561 НМ_001172687 НМ_001172688 НМ_013365 NM_001363771 НМ_145929 RefSeq (белок) НП_001001560 НП_001166158 НП_001166159 НП_037497 НП_001350700 НП_666041 Местоположение (UCSC) Чр 22: 37,61 – 37,63 Мб Чр 15: 78,76 – 78,78 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Белок, связывающий фактор АДФ-рибозилирования GGA1, представляет собой белок , который у человека кодируется GGA1 геном .

Этот ген кодирует член семейства локализованных в Гольджи гамма-адаптина, содержащих ухо, ARF-связывающих (GGA) белков. Члены этого семейства представляют собой повсеместно встречающиеся белки оболочки, которые регулируют транспорт белков между сетью транс-Гольджи и лизосомой . Эти белки имеют общий аминоконцевой домен VHS , который опосредует сортировку рецепторов маннозо-6-фосфата в транс-сети Гольджи. Они также содержат карбокси-концевую область, гомологичную ушному домену гамма-адаптинов. Для этого гена было обнаружено множество альтернативно сплайсированных вариантов транскрипта, кодирующих разные изоформы.

Взаимодействия

Было показано, что GGA1 взаимодействует с Сортилином 1 . БАСЕ2 , РАБЕП1 и АРФ3 .

Дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД   8125298 .
• Сузуки И., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД   9373149 .
• Данэм И., Симидзу Н., Роу Б.А. и др. (1999). «Последовательность ДНК 22 хромосомы человека» . Природа . 402 (6761): 489–95. Бибкод : 1999Natur.402..489D . дои : 10.1038/990031 . ПМИД   10591208 .
• Боман А.Л., Чжан С., Чжу X, Кан Р.А. (2000). «Семейство эффекторов фактора АДФ-рибозилирования, которые могут изменять мембранный транспорт через транс-Гольджи» . Мол. Биол. Клетка . 11 (4): 1241–55. дои : 10.1091/mbc.11.4.1241 . ПМК   14844 . ПМИД   10749927 .
• Такацу Х., Ёсино К., Накаяма К. (2000). «Домен гомологичности гамма-уха адаптера консервативен в гамма-адаптине и белках GGA, которые взаимодействуют с гамма-синергином». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 271 (3): 719–25. дои : 10.1006/bbrc.2000.2700 . ПМИД   10814529 .
• Жданкина О, Стрэнд Н.Л., Редмонд Дж.М., Боман А.Л. (2001). «Дрожжевые белки GGA взаимодействуют с GTP-связанным Arf и облегчают транспорт через Гольджи» . Дрожжи . 18 (1): 1–18. doi : 10.1002/1097-0061(200101)18:1<1::AID-YEA644>3.0.CO;2-5 . ПМИД   11124697 . S2CID   10348751 .
• Пуэртоллано Р., Рандаццо П.А., Пресли Дж.Ф. и др. (2001). «GGA способствуют ARF-зависимому рекрутированию клатрина в TGN» . Клетка . 105 (1): 93–102. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00299-9 . ПМИД   11301005 .
• Пуэртольяно Р., Агилар Р.К., Горшкова И. и др. (2001). «Сортировка маннозо-6-фосфатных рецепторов, опосредованная GGA». Наука . 292 (5522): 1712–6. Бибкод : 2001Sci...292.1712P . дои : 10.1126/science.1060750 . ПМИД   11387475 . S2CID   30836125 .
• Такацу Х., Като Ю., Шиба Ю., Накаяма К. (2001). «Локализирующийся по Гольджи домен гомологии уха гамма-адаптина, белки, связывающие фактор ADP-рибозилирования (GGA), взаимодействуют с кислыми дилейциновыми последовательностями в цитоплазматических доменах сортирующих рецепторов через их домены Vps27p/Hrs/STAM (VHS)» . Ж. Биол. Хим . 276 (30): 28541–5. дои : 10.1074/jbc.C100218200 . ПМИД   11390366 .
• Якобсен Л., Мэдсен П., Нильсен М.С. и др. (2002). «Цитоплазматический домен sorLA взаимодействует с GGA1 и -2 и определяет минимальные требования для связывания GGA» . ФЭБС Летт . 511 (1–3): 155–8. дои : 10.1016/S0014-5793(01)03299-9 . ПМИД   11821067 . S2CID   21977507 .
• Шиба Т., Такацу Х., Ноги Т. и др. (2002). «Структурная основа распознавания дилейциновой последовательности кислотного кластера с помощью GGA1». Природа . 415 (6874): 937–41. Бибкод : 2002Natur.415..937S . дои : 10.1038/415937a . ПМИД   11859376 . S2CID   4395774 .
• Такацу Х, Ёсино К, Тода К, Накаяма К (2002). «Белки GGA связываются с мембранами Гольджи посредством взаимодействия между их доменами GGAH и факторами ADP-рибозилирования» . Биохим. Дж . 365 (Часть 2): 369–78. дои : 10.1042/BJ20020428 . ПМЦ   1222692 . ПМИД   11950392 .
• Дорэй Б., Брунс К., Гош П., Корнфельд С.А. (2002). «Аутоингибирование сайта связывания лиганда доменов VHS GGA1/3 с помощью внутреннего кислотного кластер-дилейцинового мотива» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (12): 8072–7. Бибкод : 2002PNAS...99.8072D . дои : 10.1073/pnas.082235699 . ПМК   123022 . ПМИД   12060753 .
• Он X, Чанг В.П., Кельш Г., Тан Дж. (2002). «Цитозольный домен мемапсина 2 (бета-секретаза) связывается с доменами VHS GGA1 и GGA2: влияние на механизм эндоцитоза мемапсина 2» . ФЭБС Летт . 524 (1–3): 183–7. дои : 10.1016/S0014-5793(02)03052-1 . ПМИД   12135764 .
• Боман А.Л., Сало П.Д., Хауглунд М.Дж. и др. (2003). «Взаимодействие ADP-фактора рибозилирования (ARF) недостаточно для функции или локализации дрожжевого белка GGA» . Мол. Биол. Клетка . 13 (9): 3078–95. дои : 10.1091/mbc.E02-02-0078 . ПМК   124144 . ПМИД   12221117 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Маттера Р., Ариги К.Н., Лодж Р. и др. (2003). «Двувалентное взаимодействие GGA с комплексом Рабаптин-5-Рабекс-5» . ЭМБО Дж . 22 (1): 78–88. дои : 10.1093/emboj/cdg015 . ПМК   140067 . ПМИД   12505986 .
• Миллс И.Г., Праефке Г.Дж., Валлис Ю. и др. (2003). «EpsinR: белок, взаимодействующий с AP1/клатрином, участвующий в транспортировке везикул» . Дж. Клеточная Биол . 160 (2): 213–22. дои : 10.1083/jcb.200208023 . ПМК   2172650 . ПМИД   12538641 .