Тип (биология)
В биологии тип — это конкретный экземпляр (или в некоторых случаях группа экземпляров) организма, с которым формально связано научное название этого организма. Другими словами, тип — это пример, который служит для закрепления или централизации определяющих особенностей этого конкретного таксона . В более старом использовании (до 1900 года в ботанике) типом считался таксон, а не образец. [1]
Таксон — это научно названная группа организмов с другими подобными организмами, совокупность , включающая одни организмы и исключающая другие, основанная на подробном опубликованном описании (например, описании вида ) и предоставлении типового материала, который обычно доступен ученых для экспертизы в исследовательской коллекции крупного музея или аналогичного учреждения. [1] [2]
Типовой образец
[ редактировать ]Согласно точному набору правил, изложенных в Международном кодексе зоологической номенклатуры (ICZN) и Международном кодексе номенклатуры водорослей, грибов и растений (ICN), научное название каждого таксона почти всегда основано на одном конкретном образце. , или в некоторых случаях образцы. Типы имеют большое значение для биологов, особенно для систематиков . Типы обычно представляют собой физические образцы, которые хранятся в музее или исследовательской коллекции гербария , но в противном случае изображение особи этого таксона иногда обозначалось как тип. [3] Описание видов и назначение типовых экземпляров является частью научной номенклатуры и альфа-таксономии .
При идентификации материала ученый пытается применить название таксона к образцу или группе образцов на основе своего понимания соответствующих таксонов. [ нужны разъяснения ] [ нужна ссылка ] на основании (по крайней мере) прочтения описания типа, [ нужна ссылка ] предпочтительно также на основе изучения всего типового материала всех соответствующих таксонов. Если существует более одного названного типа, и все они кажутся одним и тем же таксоном, то самое старое название имеет приоритет и считается правильным названием имеющегося материала. Если, с другой стороны, таксон вообще не имел названия, тогда ученый или другой квалифицированный эксперт выбирает типовой образец и публикует новое название и официальное описание. [ нужна ссылка ]
В зависимости от номенклатурного кода, применяемого к рассматриваемому организму, типом может быть образец, культура, иллюстрация или (в соответствии с бактериологическим кодом) описание. Некоторые кодексы считают типом подчиненный таксон, но согласно ботаническому кодексу тип всегда является образцом или иллюстрацией. [ нужна ссылка ]
Например, в исследовательской коллекции Музея естественной истории в Лондоне есть экземпляр птицы под номером 1886.6.24.20. Это образец птицы, широко известной как пятнистый лунь , которая в настоящее время носит научное название Circus assimilis . Этот конкретный экземпляр является голотипом этого вида; название Circus assimilis по определению относится к виду этого конкретного экземпляра. Этот вид был назван и описан Джардином и Селби в 1828 году, а голотип был помещен в музейную коллекцию, чтобы другие ученые могли ссылаться на него при необходимости. [ нужна ссылка ]
По крайней мере, для типовых образцов не требуется использовать «типичную» особь. Роды и семейства , особенно установленные ранними систематиками, имеют тенденцию называться по именам более «типичных» для них видов, но и здесь это не всегда так и в связи с изменениями в систематике не может быть. Следовательно, термин номенклатурный тип или ономатофор иногда используется для обозначения того факта, что биологические типы не определяют «типичные» особи или таксоны , а скорее фиксируют научное название для конкретной оперативной таксономической единицы . Типовые экземпляры теоретически даже могут быть аберрантными или деформированными особями или вариациями цвета, хотя это редко случается, поскольку затрудняет определение, к какой популяции принадлежал человек. [1] [2] [4]
Использование термина «тип» несколько осложняется из-за несколько разных его значений в ботанике и зоологии . В PhyloCode определения на основе типов заменены филогенетическими определениями . [ нужна ссылка ]
Старая терминология
[ редактировать ]В некоторых старых таксономических работах слово «тип» иногда использовалось по-другому. Похожий смысл был и в первых Законах ботанической номенклатуры . [5] [6] но имеет значение, более близкое к термину таксон в некоторых других работах: [7]
Уже один этот признак позволяет отличить этот тип от всех остальных видов секции. ... Изучив эти различные формы, я пришел к выводу, что они принадлежат к одному и тому же определенному типу.
Перевод: Этот единственный признак позволяет [можно] отличить этот тип от всех других видов секции... Изучив разнообразные формы, я пришел к выводу, что они принадлежат к одному и тому же видовому типу.
В ботанике
[ редактировать ]В ботанической номенклатуре тип ) ( typus , номенклатурный тип «является тем элементом, к которому постоянно прикреплено название таксона». (статья 7.2) [8] В ботанике тип — это либо образец, либо иллюстрация. Образец — это настоящее растение (или одна или несколько частей растения или множество маленьких растений), мертвое и хранящееся в безопасности, «кураторе» в гербарии (или его эквиваленте для грибов). Примеры того, где иллюстрация может служить типом:
- Подробный рисунок, картина и т. д., изображающие растение, начиная с первых дней систематики растений. Засушенное растение было трудно транспортировать и трудно сохранить в будущем; многие образцы ранней ботаники с тех пор были утеряны или повреждены. Ботаники иногда нанимали высококвалифицированных художников-ботаников для создания точных и подробных иллюстраций. Некоторые из таких иллюстраций стали лучшими записями и были выбраны в качестве типа таксона.
- Подробное изображение чего-то, что можно увидеть только в микроскоп . Крошечное «растение» на предметном стекле — это плохой тип: предметное стекло может быть потеряно или повреждено, или может быть очень трудно найти рассматриваемое «растение» среди всего остального, что находится на предметном стекле. Иллюстрация делает тип гораздо более надежным (ст. 37.5 Венского кодекса , 2006 г.).
Тип не определяет границы таксона. Например, одуванчик обыкновенный — спорный таксон: одни ботаники считают, что он насчитывает более ста видов, а другие считают его одним видом. Тип названия Taraxacum officinale один и тот же, независимо от того, включает ли описание вида все эти мелкие виды ( Taraxacum officinale — «большой» вид) или ограничивается ли описание только одним мелким видом из ста ( Taraxacum officinale — «мелкий» вид). Название Taraxacum officinale то же самое, и тип названия тот же, но степень его фактического применения сильно различается. Определение границ таксона осуществляется систематиком в публикации.
Разные примечания:
- Только вид или внутривидовой таксон может иметь собственный тип. Для большинства новых таксонов (опубликованных 1 января 2007 г. или после этой даты, статья 37) этих рангов тип не должен служить иллюстрацией.
- Род . имеет тот же тип, что и один из его видов (статья 10)
- Семья имеет тот же тип , что и один из ее родов (ст. 10).
В МКП представлен перечень различных типов (статья 9 и Глоссарий). [8] наиболее важным из которых является голотип. Это
- голотип - единственный экземпляр или иллюстрация, которую автор(ы) четко указали как номенклатурный тип имени.
- лектотип - образец или иллюстрация, обозначенная по исходному материалу как номенклатурный тип, когда голотип не указан или голотип утерян или уничтожен.
- изотип – дубликат голотипа
- синтип – любой экземпляр (или иллюстрация), указанный в оригинальном описании при отсутствии голотипа, или любой из двух или более экземпляров, одновременно обозначенных как типы.
- паратип – любой экземпляр (или иллюстрация), указанный в оригинальном описании, который не является ни голотипом, ни изотипом, ни одним из синтипов.
- неотип - образец или иллюстрация, выбранная в качестве номенклатурного типа, если материал из оригинального описания недоступен.
- эпитип - образец или иллюстрация, выбранная в качестве интерпретационного типа, обычно когда другой тип типа не демонстрирует критических особенностей, необходимых для идентификации.
Слово «тип» появляется в ботанической литературе как часть некоторых старых терминов, не имеющих статуса в МКП : например, клонотип.
В зоологии
[ редактировать ]В зоологической номенклатуре типом вида или подвида является экземпляр или серия экземпляров. Тип рода или подрода является видом. Типом надродового таксона (например, семейства и т. д.) является род. Имена выше ранга надсемейства не имеют типов. «Номенклатурный тип» — это образец или изображение, которое «обеспечивает объективный эталон, с помощью которого можно определить применение названия номинального таксона». [ нужна ссылка ]
Определения
[ редактировать ]- Типовой образец — это общеупотребительный термин (а не формально определенный термин), обычно используемый для обозначения особи или окаменелости, которая представляет собой любой из различных типов, носящих название вида . Например, типовым экземпляром вида Homo neanderthalensis был экземпляр «Неандерталец-1», обнаруженный Иоганном Карлом Фульроттом в 1856 году в Фельдхофере в долине Неандер в Германии, состоящий из черепа , бедренных костей, части таза, некоторых ребер. , а также некоторые кости рук и плеч. Типовых экземпляров может быть несколько, но голотип (по крайней мере, в наше время) только один.
- Типовой вид — номинальный вид , который является номенклатурным типом номинального рода или подрода .
- Типовой род — номинальный род , который является номенклатурным типом номинального таксона группы семейства.
- Типовая серия — это все экземпляры, включенные автором в формальное описание таксона, если только автор явно или неявно не исключил их из состава серии.
Использование типовых образцов
[ редактировать ]Хотя на самом деле биологи могут изучить множество экземпляров (если таковые имеются) нового таксона, прежде чем написать официальное опубликованное описание вида, тем не менее, согласно формальным правилам наименования видов (Международный кодекс зоологической номенклатуры), должен быть обозначен один тип, как часть опубликованного описания. [ нужна ссылка ]
Описание типа должно включать диагноз (обычно обсуждение сходств и отличий от близкородственных видов) и указание того, где типовой образец или образцы переданы для исследования. Географическое положение, в котором первоначально был обнаружен типовой экземпляр, называется его местом обитания. тип местность . В случае паразитов этот термин тип хозяина (или симбиотип) используется для обозначения организма-хозяина, из которого был получен типовой образец. [9]
Зоологические коллекции поддерживаются университетами и музеями. Две важные функции таких коллекций — обеспечение того, чтобы типы хранились в хорошем состоянии и были доступны для изучения систематикам. И хотя обозначен только один голотип , могут существовать и другие «типовые» экземпляры, из которых формально определены следующие:
Голотип
[ редактировать ]Если в исходном описании четко указан один экземпляр, этот экземпляр известен как голотип этого вида. [10] Голотип обычно помещается в крупный музей или аналогичную общеизвестную публичную коллекцию, чтобы он был доступен для последующего изучения другими биологами.
Паратип
[ редактировать ]Если в исходном описании указан голотип, могут существовать дополнительные экземпляры, которые автор обозначает как дополнительные представители того же вида, называемые паратипами. Это не именной тип . [ нужна ссылка ]
Аллотип
[ редактировать ]Аллотип — особь противоположного голотипу пола, выделенная из числа паратипов. Раньше это слово также использовалось для обозначения образца, имеющего особенности, не наблюдаемые в голотипе окаменелости. [11] Этот термин не регулируется МКЗН . [ нужна ссылка ]
Неотип
[ редактировать ]Неотип — это образец, позже выбранный в качестве единственного типового образца, когда исходный голотип был утерян или уничтожен или если первоначальный автор никогда не цитировал образец.
Синтип
[ редактировать ]Синтип — это любой из двух или более экземпляров, перечисленных в описании вида, где не указан голотип; исторически синтипы часто явно обозначались как таковые, и в соответствии с нынешней МКЗН это является требованием, но современные попытки опубликовать описание видов на основе синтипов обычно не одобряются практикующими систематиками, и большинство из них постепенно заменяются лектотипами. Те, которые существуют до сих пор, по-прежнему считаются именной типами. [ нужна ссылка ]
Лектотип
[ редактировать ]Лектотип — это образец, позже выбранный в качестве единственного типового образца для видов, первоначально описанных из набора синтипов .В зоологии лектотип — это разновидность номенклатурного типа . При первоначальном описании вида на основе номенклатурного типа, состоящего из нескольких экземпляров, один из них может быть обозначен как лектотип. Наличие одного номенклатурного типа снижает вероятность путаницы, особенно если учесть, что серия синтипов нередко содержит экземпляры более чем одного вида.
Примером может служить предположение, что Карл Линней должен составлять лектотип вида Homo sapiens . [12]
Паралектотип
[ редактировать ]Паралектотипом называется любой дополнительный экземпляр из множества синтипов после выделения из них лектотипа. Это не именной тип. [13]
Кислый азот
[ редактировать ]Особый случай у протистанов , когда тип состоит из двух или более экземпляров «прямородственных особей» в подготовительной среде, такой как мазок крови. Термины парагапантотип и лектогапантотип относятся к дополнительным к гапантотипу типовым препаратам, обозначенным автором описания. [14] Как и в случае с другими обозначениями типов, использование префикса «Нео-», например «Неохапантотип» , используется, когда обозначается замена исходного гапантотипа или когда исходное описание не включало обозначенный типовой образец. [15]
Иконотип
[ редактировать ]Иллюстрация, на основе которой был создан новый вид или подвид. Например, бирманский питон Python bivittatus — один из многих видов, созданных на основе иллюстраций Альбертуса Себы (1734). [16] [17]
Эргатотип
[ редактировать ]Эргатотип — это образец, выбранный для обозначения рабочего члена перепончатокрылых , имеющих полиморфные касты. [11]
Гипотип
[ редактировать ]Гипотип — это экземпляр, сведения о котором ранее были опубликованы и который используется в дополнительных рисунках или описаниях вида. [18]
Клептотип
[ редактировать ]Термин « клептотип » неофициально относится к типовому экземпляру или его части, которые были украдены или неправильно перемещены. [19] [20] [21] [22]
Альтернативы сохранившимся образцам
[ редактировать ]Типовые иллюстрации также использовались зоологами, как в случае с попугаем Реюньона , который известен только по историческим иллюстрациям и описаниям. [23] : 24
Недавно были описаны некоторые виды, типовой экземпляр которых был выпущен живым обратно в дикую природу, например, Bulo Burti boubou ( кустарник ), описанный как Laniarius liberatus , у которого описание вида включало последовательности ДНК из образцов крови и перьев. Предполагая, что в будущем не возникнет вопроса о статусе такого вида, отсутствие типового экземпляра не делает название недействительным, но в будущем может возникнуть необходимость обозначить неотип для такого таксона, если возникнут какие-либо вопросы. Однако в случае с кустарниковым сорокопутом орнитологи, используя только доступные образцы крови и перьев, утверждали, что этот экземпляр представлял собой редкую и до сих пор неизвестную цветовую морфу давно известного вида. Хотя до сих пор ведутся споры о необходимости хранения фактически убитых особей в качестве типовых образцов, можно заметить, что при правильном оформлении и хранении образцы тканей могут быть столь же ценными, если возникнет спор о достоверности вида. [ нужна ссылка ]
Формализация системы типов
[ редактировать ]Различные типы, перечисленные выше, необходимы [ нужна ссылка ] потому что многие виды были описаны одно или два столетия назад, когда один типовой экземпляр - голотип - часто не обозначался. Кроме того, шрифты не всегда тщательно сохранялись, а промежуточные события, такие как войны и пожары, приводили к уничтожению исходного шрифтового материала. Действительность названия вида часто зависит от наличия оригинальных типовых экземпляров; или, если тип не может быть найден или он никогда не существовал, при ясности описания.
МКЗН существует только с 1961 года, когда было опубликовано первое издание Кодекса. МКЗН не всегда требует типового образца для исторической достоверности вида, и многие «бестиповые» виды действительно существуют. Действующая редакция Кодекса, статья 75.3, запрещает обозначение неотипа, за исключением случаев «исключительной необходимости» для «уточнения таксономического статуса» вида (статья 75.2).
Существует множество других перестановок и вариаций терминов, использующих суффикс «-тип» (например, аллотип , котип, топотип , генитип , изотип , изонеотип, изолектотип и т. д.), но они формально не регламентированы Кодексом, и их очень много. являются устаревшими и/или уникальными. Однако некоторые из этих категорий потенциально могут применяться к подлинным типовым образцам, таким как неотип; например, изотипические/топотипические образцы предпочтительнее других образцов, если они доступны на момент выбора неотипа (поскольку они происходят из того же времени и/или места, что и исходный тип). [ нужна ссылка ] Топотип – это образец, добытый из того же места, откуда прибыл исходный типовой образец. [24]
Термин «фиксация» используется в Кодексе для объявления номенклатурного типа посредством первоначального или последующего обозначения. [ нужна ссылка ]
Типовой вид
[ редактировать ]Каждый род должен иметь обозначенный типовой вид (когда-то для этого использовался термин «генотип», но от него отказались, поскольку это слово стало гораздо более известным как термин, обозначающий другое понятие в генетике ). Описание рода обычно основывается преимущественно на его типовом виде, модифицированном и расширенном за счет признаков других входящих в него видов. Родовое название постоянно связано с номенклатурным типом своего типового вида. [ нужна ссылка ]
В идеале типовой вид лучше всего отражает основные характеристики рода, к которому он принадлежит, но это субъективно и, в конечном счете, технически нерелевантно, поскольку это не является требованием Кодекса. Если при более внимательном рассмотрении оказывается, что типовой вид принадлежит к ранее существовавшему роду (обычное явление), то все составляющие виды должны быть либо перемещены в ранее существовавший род, либо отделены от исходного типового вида и им присвоен статус новое родовое название; старое родовое название переходит в синонимию и от него отказываются, если только нет острой необходимости сделать исключение (решается в каждом конкретном случае посредством обращения в Международную комиссию по зоологической номенклатуре). [ нужна ссылка ]
Типовой род
[ редактировать ]название семейства или Типовой род — род, от которого образовано подсемейства. Как и в случае с типовыми видами, типовой род не обязательно является наиболее репрезентативным, но обычно является самым ранним описанным, крупнейшим или наиболее известным родом. Нередко в основе названия семейства лежит название типового рода, перешедшее в синонимию; фамилию в такой ситуации менять не нужно. [ нужна ссылка ]
См. также
[ редактировать ]- Архетип
- Глоссарий научных названий
- Название задачи (зоология)
- Голое имя
- Генотипы - данные о генетической последовательности из типовых образцов.
- Патотип – разновидность внутриподвидового таксона болезнетворных бактерий.
- Принцип типизации
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с Хичкок, А.С. (1921), «Понятие типа в систематической ботанике» , Американский журнал ботаники , 8 (5): 251–255, doi : 10.2307/2434993 , JSTOR 2434993
- ^ Jump up to: а б Николсон, Дэн Х. «Ботаническая номенклатура, типы и стандартные справочные материалы» . Смитсоновский национальный музей естественной истории, отдел ботаники . Проверено 17 ноября 2015 г.
- ^ Маршалл, Стивен А.; Эвенхейс, Нил Л. (2015). «Новые виды без трупов: аргументы в пользу описаний на основе фотографий, проиллюстрированных поразительным новым видом Marleyimyia Hesse (Diptera, Bombyliidae) из Южной Африки» . ZooKeys (525): 117–127. дои : 10.3897/zookeys.525.6143 . ISSN 1313-2970 . ПМЦ 4607853 . ПМИД 26487819 .
- ^ «Названия растений – базовое введение» . Австралийский национальный ботанический сад, Центр австралийских национальных исследований биоразнообразия . Проверено 17 ноября 2015 г.
- ^ де Кандоль, AP (1867). Законы ботанической номенклатуры, принятые Международным ботаническим конгрессом, состоявшимся в Париже в августе 1867 года, сопровождались вторым изданием исторического введения и комментариями, сопровождавшими подготовительный текст, представленный конгрессу . Женева и Базель: Ж.-Б. Байьер и сыновья.
- ^ Уэдделл (1868 г.). «Законы ботанической номенклатуры, принятые Международным ботаническим конгрессом, состоявшимся в Париже в августе 1867 года; вместе с историческим введением и комментариями Альфонса де Кандоля, перевод с французского; перепечатано с английского перевода, опубликованного L. Reeve and Co., Лондон». , 1868 (с трехстраничным комментарием Асы Грея)» . Американский журнал науки и искусства . Серия II, Том 46 (63–74, 75–77).
- ^ Крепен, Ф. (1886). «Rosa Synstylae: исследования роз из секции Synstyleés» . Бюллетень Королевского ботанического общества Бельгии . 25 (2: Протоколы заседаний Королевского ботанического общества Бельгии): 163–217.
- ^ Jump up to: а б Макнил, Дж.; Барри, Франция; Бак, WR; Демулен, В.; Гройтер, В.; Хоксворт, ДЛ; Херендин, PS; Кнапп, С.; Мархольд, К.; Прадо, Дж.; Прюдом Ван Рейн, WF; Смит, Г.Ф.; Виерсема, Дж. Х.; Терланд, Нью-Джерси (2012). Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений (Мельбурнский кодекс), принятый Восемнадцатым Международным ботаническим конгрессом в Мельбурне, Австралия, июль 2011 г. Том. Regnum Vegetabile 154. ARG Gantner Verlag KG. ISBN 978-3-87429-425-6 .
- ^ Фрей, Дженнифер К.; Йейтс, Терри Л.; Душинский, Дональд В.; Ганнон, Уильям Л. и Гарднер, Скотт Л. (1992). «Выделение и кураторское управление образцами типовых хозяев (симбиотипами) новых видов паразитов». Журнал паразитологии . 78 (5): 930–993. дои : 10.2307/3283335 . JSTOR 3283335 . S2CID 82003952 .
- ^ «Код онлайн | Международная комиссия по зоологической номенклатуре» . www.iczn.org .
- ^ Jump up to: а б Хоксворт, Д.Л. (2010). Термины, используемые в биономенклатуре. Наименование организмов (и растительных сообществ) . Копенгаген: Глобальный информационный фонд по биоразнообразию. п. 216. ИСБН 978-87-92020-09-3 .
- ^ Стерн, WT (1 марта 1959 г.). «История вклада Линнея в номенклатуру и методы систематической биологии». Систематическая биология . 8 (1): 4–22. дои : 10.2307/sysbio/8.1.4 . ISSN 1063-5157 .
- ^ Хансен, Ганс В.; Себерг, Оле (1984). «Паралектотип, новый типовой термин в ботанике». Таксон . 33 (4): 707–711. дои : 10.2307/1220790 . JSTOR 1220790 .
- ^ Бишоп, MAW (1989). "введение". Таксономическое исследование Haemoproteidae (Apicomplexa: Haemosporina) отряда птиц Strigiformes (PDF) (докторская диссертация). Мемориальный университет Ньюфаундленда. п. 3 . Проверено 18 апреля 2024 г.
- ^ Пирс, Массачусетс; Беннетт, Г. Ф. (1992). «Неогапантотип и паранеогапантотипы Haemoproteus passeris Kruse, 1890». Журнал естественной истории . 26 (3): 689–690. дои : 10.1080/00222939200770431 .
- ^ Себа, Альберт (1734). Подробное описание богатейших сокровищ природы и наиболее художественное выражение икон за всю историю физики. Произведение, которому не было равных в этом жанре вещей . Амстердам: Янссонио-Вайсбергиос.
- ^ Бауэр, Аарон М. (2002). «Альбертус Себа, Кабинет диковинок природы. Полное собрание цветных пластин, 1734–1765. 2001». Международное общество истории и библиографии герпетологии . 3 .
- ^ «Сборник типов» . Базельский университет.
- ^ Бейкер, NT, и Тимм, RM (1976). «Современные типовые понятия в энтомологии». Журнал Нью-Йоркского энтомологического общества, 201–205.
- ^ Глайм, Дж. М. и Вагнер, Д. Х. (2013). «Гербарные методы и обмены».
- ^ Клептотип. (без даты). Академические словари и энциклопедии. Получено 21 ноября 2022 г. с https://en_ichthyology.en-academic.com/9763/kleptotype .
- ^ «Термины, используемые в биономенклатуре: наименование организмов и растительных сообществ: включая термины, используемые в ботанической, культивируемых растениях, филогенетической, фитосоциологической, прокариотной (бактериологической), вирусной и зоологической номенклатуре». (2010). Великобритания: Глобальный информационный фонд по биоразнообразию.
- ^ Хьюм, Джулиан Пендер (25 июня 2007 г.). «Переоценка попугаев (Aves: Psittacidae) с Маскаренских островов с комментариями по их экологии, морфологии и сходству» (PDF) . Зоотакса . 1513 (1513): 1–76. дои : 10.11646/zootaxa.1513.1.1 . ISSN 1175-5334 . Проверено 13 января 2011 г.
- ^ «Определение и значение топотипа» . Мерриам-Вебстер . Проверено 18 апреля 2024 г.
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Кодекс ICZN : Международный кодекс зоологической номенклатуры , официальный сайт.
- Раздел глоссария Fishbase (в архиве)
- Сборник терминов (в архиве)
- Номенклатура зоологических типов (Evenhuis) (PDF)