Трех-таксонный анализ
Анализ трех таксонов (или TTS , трехэлементный анализ , 3ia ) — это кладистический метод филогенетической реконструкции. Представлен Нельсоном и Платником в 1991 году. [2] Для реконструкции филогении организмов этот метод также можно применить к биогеографическим областям . Он пытается реконструировать сложные филогенетические деревья, разбивая проблему на более простые части. Вместо того, чтобы пытаться решить взаимоотношения всех таксонов X одновременно, он рассматривает таксоны 3 одновременно. Относительно легко составить отчеты по трем таксонам (3is); то есть высказывания вида «А и В более тесно связаны друг с другом, чем с С». [3] После рассмотрения каждой группы из трех таксонов метод строит дерево, соответствующее как можно большему количеству утверждений из трех элементов. [3]
С теоретической точки зрения у метода есть три основные проблемы: (1) эволюция характера априори считается необратимой; (2) 3is, которые не являются логически независимыми, рассматриваются так, как если бы они были независимыми; (3) 3is, которые считаются независимой поддержкой для данного дерева, могут быть взаимоисключающими в этом дереве. [4]
Компьютерная программа, реализующая трехтаксонный анализ, - LisBeth. [5] (для систематических и биогеографических исследований). ЛисБет были свободно освобождены. [6] Недавнее исследование, основанное на моделировании, показало, что анализ трех таксонов дает хорошую мощность и средний уровень ошибок между экономией с упорядоченными состояниями и экономией с неупорядоченными состояниями. [1]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б Гранд, Анаис; Корвез, Адель; Дуке Велес, Лина Мария; Лорен, Мишель (2013). «Филогенетический вывод с использованием дискретных символов: выполнение упорядоченной и неупорядоченной экономии и утверждений из трех пунктов» . Биологический журнал Линнеевского общества . 110 (4): 914–930. дои : 10.1111/bij.12159 .
- ^ Нельсон, Г.; Платник, Н.И. (1991). «Заявления о трех таксонах: более точное использование экономии?» . Кладистика . 7 (4): 351. doi : 10.1111/j.1096-0031.1991.tb00044.x . S2CID 86270478 .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б Сарагета-Багилс, Р.; Бурдон, Э. (2007). «Анализ по трем пунктам: иерархическое представление и обработка недостающих и неприменимых данных». Comptes Рендус Палевол . 6 (6–7): 527. doi : 10.1016/j.crpv.2007.09.013 .
- ^ Де Лаэт, Дж.; Сметс, Э. (1998). «О трехтаксонном подходе к анализу экономии» . Кладистика . 14 (4): 363–381. дои : 10.1111/j.1096-0031.1998.tb00344.x . ПМИД 34929915 . S2CID 221583681 .
- ^ Багилс, РЗЭ; Унг, В.; Гранд, А.С.; Винь-Леббе, Р.Г.; Цао, Нидерланды; Дюкасс, Дж. (2012). «ЛисБет: Новая кладистика для филогенетики и биогеографии». Comptes Рендус Палевол . 11 (8): 563. doi : 10.1016/j.crpv.2012.07.002 .
- ^ «Пакет ЛисБет» .
| Соответствующие поля | ||
|---|---|---|
| Основные понятия | ||
| Методы вывода | ||
| Текущие темы | ||
| Групповые черты | ||
| Типы групп | ||
| Номенклатура | ||
