HIST1H2BK

H2BC12
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 2CV5
Идентификаторы
Псевдонимы	H2BC12 , H2B/S, H2BFAiii, H2BFT, H2BK, кластер гистонов 1, H2bk, кластер гистонов 1, член семейства H2B k, кластерный гистон 12 H2B, HIST1H2BK
Внешние идентификаторы	Опустить : 615045 ; МГИ : 2448399 ; Гомологен : 135980 ; Генные карты : H2BC12 ; OMA : H2BC12 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 6 (human) Band 6p22.1 Start 27,146,361 bp End 27,146,855 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 13 (mouse) Band 13|13 A3.1 Start 22,220,040 bp End 22,220,515 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in bone marrow cells monocyte blood Achilles tendon placenta mucosa of transverse colon spleen gonad prostate uterine tube Top expressed in uterus zygote secondary oocyte primary oocyte white adipose tissue bone marrow adrenal gland spermatid urinary bladder embryo More reference expression data BioGPS n/a
showГенная онтология Molecular function DNA binding protein heterodimerization activity molecular function Cellular component nucleoplasm nucleosome nucleus chromosome extracellular space cytosol Biological process nucleosome assembly innate immune response in mucosa defense response to bacterium protein ubiquitination antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 85236 319184 Вместе ENSG00000197903 ENSMUSG00000062727 ЮниПрот О60814 Q8CGP1 RefSeq (мРНК) НМ_080593 НМ_001312653 НМ_175665 RefSeq (белок) НП_001299582 НП_542160 НП_783596 Местоположение (UCSC) Чр 6: 27.15 – 27.15 Мб Чр 13: 22.22 – 22.22 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Гистон H2B типа 1-K представляет собой белок , который у человека кодируется HIST1H2BK геном .

Гистоны — это основные ядерные белки, отвечающие за нуклеосомную структуру хромосомного волокна у эукариот. Две молекулы каждого из четырех основных гистонов (H2A, H2B, H3 и H4) образуют октамер, вокруг которого примерно 146 пар оснований ДНК обернуты повторяющимися единицами, называемыми нуклеосомами. Линкерный гистон H1 взаимодействует с линкерной ДНК между нуклеосомами и участвует в уплотнении хроматина в структуры более высокого порядка. Этот ген кодирует члена семейства гистонов H2B. Этот ген обнаружен в микрокластере гистонов на хромосоме 6p21.33.

Взаимодействия

Было показано, что HIST1H2BK взаимодействует с HIRA .

Дальнейшее чтение

• Добнер Т., Вольф И., Май Б., Липп М. (1992). «Новая пара генов человеческого гистона H2A/H2B с дивергентной транскрипцией». Секв. ДНК . 1 (6): 409–13. дои : 10.3109/10425179109020799 . ПМИД   1768865 .
• Фром М., Ганн Х., Бергман А.С. и др. (1996). «Биохимический и антибактериальный анализ раневой и пузырной жидкости человека» . Евро. Дж. Биохим . 237 (1): 86–92. дои : 10.1111/j.1432-1033.1996.0086n.x . ПМИД   8620898 .
• Эль Харруби А., Пирас Г., Зенсен Р., Мартин М.А. (1998). «Транкрипционная активация интегрированного промотора вируса иммунодефицита человека типа 1, ассоциированного с хроматином» . Мол. Клетка. Биол . 18 (5): 2535–44. дои : 10.1128/mcb.18.5.2535 . ПМК   110633 . ПМИД   9566873 .
• Лорен С., Киви Дж.П., Монье-Гавель Ф. и др. (1998). «Коровые гистоны и HIRIP3, новый гистонсвязывающий белок, напрямую взаимодействуют с повторяющимся белком WD HIRA» . Мол. Клетка. Биол . 18 (9): 5546–56. дои : 10.1128/MCB.18.9.5546 . ПМК   109139 . ПМИД   9710638 .
• Альбиг В., Траппе Р., Кардалину Э. и др. (1999). «Комплемент генов гистонов человека H2A и H2B». Биол. Хим . 380 (1): 7–18. дои : 10.1515/BC.1999.002 . ПМИД   10064132 . S2CID   12807248 .
• Ан Дж., Грюн-младший (1999). «Геномная организация кластеров гистонов человека 6p21.3». Мамм. Геном . 10 (7): 768–70. дои : 10.1007/s003359901089 . ПМИД   10384058 . S2CID   28275496 .
• Дэн Л., де ла Фуэнте С., Фу П. и др. (2001). «Ацетилирование Tat ВИЧ-1 с помощью CBP/P300 увеличивает транскрипцию интегрированного генома ВИЧ-1 и усиливает связывание с основными гистонами» . Вирусология . 277 (2): 278–95. дои : 10.1006/виро.2000.0593 . ПМИД   11080476 .
• Дэн Л., Ван Д., де ла Фуэнте С. и др. (2001). «Усиление активности HAT p300 с помощью Tat ВИЧ-1 на ДНК хроматина» . Вирусология . 289 (2): 312–26. дои : 10.1006/виро.2001.1129 . ПМИД   11689053 .
• Ким Х.С., Чо Дж.Х., Пак Х.В. и др. (2002). «Эндотоксин-нейтрализующие антимикробные белки плаценты человека» . Дж. Иммунол . 168 (5): 2356–64. дои : 10.4049/jimmunol.168.5.2356 . ПМИД   11859126 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Чунг В.Л., Аджиро К., Самедзима К. и др. (2003). «Апоптотическое фосфорилирование гистона H2B опосредуется стерильной двадцать киназой млекопитающих» . Клетка . 113 (4): 507–17. дои : 10.1016/S0092-8674(03)00355-6 . ПМИД   12757711 . S2CID   21854 .
• Толлин М., Бергман П., Свенберг Т. и др. (2004). «Антимикробные пептиды в первой линии защиты слизистой оболочки толстой кишки человека». Пептиды . 24 (4): 523–30. дои : 10.1016/S0196-9781(03)00114-1 . ПМИД   12860195 . S2CID   7435936 .
• Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека» . Природа . 425 (6960): 805–11. Бибкод : 2003Natur.425..805M . дои : 10.1038/nature02055 . ПМИД   14574404 .
• Лусич М., Марчелло А., Серезето А., Джакка М. (2004). «Регуляция экспрессии гена ВИЧ-1 путем ацетилирования гистонов и рекрутирования факторов на промоторе LTR» . ЭМБО Дж . 22 (24): 6550–61. дои : 10.1093/emboj/cdg631 . ПМК   291826 . ПМИД   14657027 .
• Хауэлл С.Дж., Уилк Д., Ядав С.П., Бевинс К.Л. (2004). «Антимикробные полипептиды эпителия толстой кишки человека». Пептиды . 24 (11): 1763–70. doi : 10.1016/j.peptides.2003.07.028 . ПМИД   15019208 . S2CID   28953527 .
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК   528928 . ПМИД   15489334 .
• Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Люнг А.К. и др. (2005). «Динамика ядрышкового протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Бибкод : 2005Natur.433...77A . дои : 10.1038/nature03207 . ПМИД   15635413 . S2CID   4344740 .
• Цунака Ю., Кадзимура Н., Тейт С., Морикава К. (2005). «Изменение пути нуклеосомной ДНК в кристаллической структуре ядерной частицы нуклеосомы человека» . Нуклеиновые кислоты Рез . 33 (10): 3424–34. дои : 10.1093/nar/gki663 . ПМК   1150222 . ПМИД   15951514 .
• Голебовский Ф., Каспржак К.С. (2007). «Ингибирование ацетилирования основных гистонов канцерогенным никелем (II)» . Мол. Клетка. Биохим . 279 (1–2): 133–9. дои : 10.1007/s11010-005-8285-1 . ПМИД   16283522 . S2CID   25071586 .