ПДКД2

ПДКД2
Идентификаторы
Псевдонимы	PDCD2 , RP8, ZMYND7, запрограммированная гибель клеток 2
Внешние идентификаторы	Опустить : 600866 ; МГИ : 104643 ; Гомологен : 1951 ; GeneCards : PDCD2 ; OMA : PDCD2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	170,584,692 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	15,747,563 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	gonad; ; body of pancreas; ; rectum; ; granulocyte; ; Achilles tendon; ; body of stomach; ; monocyte; ; right coronary artery; ; ganglionic eminence; ; islet of Langerhans;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; fossa; ; primitive streak; ; epiblast; ; facial motor nucleus; ; genital tubercle; ; condyle; ; medial ganglionic eminence; ; embryo; ; embryo;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	enzyme binding; DNA binding; protein binding; metal ion binding;
Cellular component	cytoplasm; extracellular exosome; nucleus;
Biological process	positive regulation of apoptotic process; positive regulation of hematopoietic stem cell proliferation; regulation of hematopoietic progenitor cell differentiation; activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; programmed cell death; apoptotic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	5134
	18567
	ENSG00000071994
	ENSMUSG00000014771
	Q16342
	P46718
showНМ_001199461 ; НМ_001199462 ; НМ_001199463 ; НМ_001199464 ; НМ_002598 ;
	NM_144781; NM_001363655
	НМ_008799
showНП_001186390 ; НП_001186391 ; НП_001186392 ; НП_001186393 ; НП_002589 ;
	NP_659005; NP_001350584
	НП_032825
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 2 запрограммированной клеточной смерти — это белок , который у человека кодируется PDCD2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Этот ген кодирует ядерный белок, экспрессирующийся в различных тканях. Крысиный гомолог Rp8 временно экспрессируется в незрелых тимоцитах и, как полагают, участвует в запрограммированной гибели клеток. Было показано, что экспрессия человеческого гена подавляется BCL6, репрессором транскрипции, необходимым для развития зародышевого центра лимфатических узлов, что позволяет предположить, что BCL6 регулирует апоптоз посредством своего воздействия на PDCD2. Этот ген тесно связан на хромосоме 6 с геном TBP, ТАТА-связывающего белка. Идентифицировано шесть транскриптов, кодирующих разные белки. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что PDCD2 взаимодействует с фактором C1 клетки-хозяина. ^{[ 7 ]} и Паркин (лигаза) . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000071994 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000014771 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Каваками Т., Фурукава Ю., Судо К., Сайто Х., Таками С., Такахаши Э., Накамура Ю. (август 1995 г.). «Выделение и картирование человеческого гена (PDCD2), который в высокой степени гомологичен Rp8, крысиному гену, связанному с запрограммированной гибелью клеток». Цитогенетика и клеточная генетика . 71 (1): 41–3. дои : 10.1159/000134058 . ПМИД 7606924 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: гибель клеток, запрограммированная PDCD2 2» .
^ Скарр Р.Б., Sharp PA (август 2002 г.). «PDCD2 является негативным регулятором HCF-1 (C1)» . Онкоген . 21 (34): 5245–54. дои : 10.1038/sj.onc.1205647 . ПМИД 12149646 .
^ Фукаэ Дж., Сато С., Шиба К., Сато К., Мори Х., Шарп П.А., Мизуно Ю., Хаттори Н. (февраль 2009 г.). «Изоформа 1 запрограммированной клеточной смерти-2 убиквитинируется паркином и увеличивается в черной субстанции пациентов с аутосомно-рецессивной болезнью Паркинсона». Письма ФЭБС . 583 (3): 521–5. дои : 10.1016/j.febslet.2008.12.055 . hdl : 1721.1/96274 . ПМИД 19146857 . S2CID 7121769 .

Дальнейшее чтение

Барон Б.В., Анастаси Дж., Тирман М.Дж., Фурукава Ю., Фиерс С., Ким Д.С., Симона Ф., Биркенбах М., Монтаг А., Садху А., Железник-Ле Н., Маккейтан Т.В. (март 2002 г.). «Ген запрограммированной гибели клеток человека-2 (PDCD2) является мишенью репрессии BCL6: значение роли BCL6 в подавлении апоптоза» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (5): 2860–5. Бибкод : 2002PNAS...99.2860B . дои : 10.1073/pnas.042702599 . ПМЦ 122438 . ПМИД 11854457 .
Скарр Р.Б., Sharp PA (август 2002 г.). «PDCD2 является негативным регулятором HCF-1 (C1)» . Онкоген . 21 (34): 5245–54. дои : 10.1038/sj.onc.1205647 . ПМИД 12149646 .
Баумистер Т , Баух А , Раффнер Х , Ангранд ПО , Бергамини Г , Кротон К , Круциат С , Эберхард Д , Гагнер Дж , Гиделли С , Хопф С , Хузе Б , Мангано Р , Мишон А.М. , Ширле М , Шлегль Дж , Шваб М , Стейн М.А. , Бауэр А. , Казари Дж. , Древес Дж. , Гэвин А.С. , Джексон Д.Б. , Джоберти Дж., Нойбауэр Дж., Рик Дж., Кастер Б., Суперти-Фурга Дж. (февраль 2004 г.). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Природная клеточная биология . 6 (2): 97–105. дои : 10.1038/ncb1086 . ПМИД 14743216 . S2CID 11683986 .
Ленер Б., Сандерсон К.М. (июль 2004 г.). «Схема взаимодействия белков для деградации мРНК человека» . Геномные исследования . 14 (7): 1315–23. дои : 10.1101/гр.2122004 . ПМК 442147 . ПМИД 15231747 .
Чен Ц, Цянь К, Ян С (декабрь 2005 г.). «Клонирование кДНК с доменом PDCD2 (C) и их экспрессия во время апоптоза клеток HEK293T». Молекулярная и клеточная биохимия . 280 (1–2): 185–91. дои : 10.1007/s11010-005-8910-z . ПМИД 16311922 . S2CID 6208880 .
Барон Б.В., Железник-Ле Н., Барон М.Дж., Тейслер С., Хо Д., Красовский М.Д., Тирман М.Дж., Барон Р.М., Барон Дж.М. (май 2007 г.). «Репрессия гена PDCD2 с помощью BCL6 и значение патогенеза В- и Т-клеточных лимфом человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (18): 7449–54. Бибкод : 2007PNAS..104.7449B . дои : 10.1073/pnas.0701770104 . ПМК 1863460 . ПМИД 17468402 .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000071994 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000014771 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7606924-5] Каваками Т., Фурукава Ю., Судо К., Сайто Х., Таками С., Такахаши Э., Накамура Ю. (август 1995 г.). «Выделение и картирование человеческого гена (PDCD2), который в высокой степени гомологичен Rp8, крысиному гену, связанному с запрограммированной гибелью клеток». Цитогенетика и клеточная генетика . 71 (1): 41–3. дои : 10.1159/000134058 . ПМИД 7606924 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: гибель клеток, запрограммированная PDCD2 2» .

[pmid12149646-7] Скарр Р.Б., Sharp PA (август 2002 г.). «PDCD2 является негативным регулятором HCF-1 (C1)» . Онкоген . 21 (34): 5245–54. дои : 10.1038/sj.onc.1205647 . ПМИД 12149646 .

[pmid19146857-8] Фукаэ Дж., Сато С., Шиба К., Сато К., Мори Х., Шарп П.А., Мизуно Ю., Хаттори Н. (февраль 2009 г.). «Изоформа 1 запрограммированной клеточной смерти-2 убиквитинируется паркином и увеличивается в черной субстанции пациентов с аутосомно-рецессивной болезнью Паркинсона». Письма ФЭБС . 583 (3): 521–5. дои : 10.1016/j.febslet.2008.12.055 . hdl : 1721.1/96274 . ПМИД 19146857 . S2CID 7121769 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]