CCR4-Нет
углеродного , катаболита — Репрессия который участвует в отрицательная мультибелковый On ATA- less T , или CCR4-Not , представляет собой комплекс экспрессии генов. [2] [3] Комплекс обладает множественной ферментативной активностью как поли(А) 3'-5' экзонуклеазы , так и убиквитинлигазы . [4] [5] [6] [7] Экзонуклеазная активность CCR4-Not укорачивает поли(А)-хвост, обнаруженный на 3'-конце почти каждой эукариотической мРНК. [8] Комплекс присутствует как в ядре , где он регулирует транскрипцию, так и в цитоплазме , где он связывается с транслирующими рибосомами и тельцами процессинга РНК . [2] [3] В клетках млекопитающих он участвует в регуляции клеточного цикла, модификации хроматина, активации и ингибировании инициации транскрипции, контроле элонгации транскрипции, экспорте РНК, надзоре за ядерной РНК и восстановлении повреждений ДНК в ядре. Комплекс Ccr4–Not играет важную роль в распаде мРНК и контроле качества белка в цитоплазме. [9]
Субъединицы
[ редактировать ]Комплекс CCR4-Not человека состоит из структурных (некаталитических) субъединиц и субъединиц, обладающих экзонуклеазной и E3-лигазной активностью. Некоторые, но не все, человеческие субъединицы консервативны в почкующихся дрожжах . [10] У дрожжей комплекс состоит из девяти основных субъединиц, включая Ccr4 (репрессия углеродных катаболитов), белки Caf (фактор, связанный с Ccr4) (Caf1, Caf40, Caf130) и белки Not (Not1, Not2, Not3, Not4 и Not5). [11]
| Субъединица | МВт (кДа) [А] | Ключевые особенности |
|---|---|---|
| Добродетель1 | 267 | «Скаффолд» с некаталитической функцией. Связан с поддержанием эмбриональных стволовых клеток . [12] |
| ЦНОТ2 | 60 | Структурная составляющая. Связан с поддержанием эмбриональных стволовых клеток . [12] |
| CNOT3 | 82 | Структурная составляющая. Связан с поддержанием эмбриональных стволовых клеток . [13] [12] |
| CNOT4 | 64 | Активен как убиквитинлигаза Е3 . [7] |
| Добродетель6 | 63 | 3'-5' экзонуклеаза с предпочтением полиаденилированных субсостояний мРНК. [5] Имеет человеческий паралог CNOT6L . |
| CNOT7 | 33 | 3'-5' экзонуклеаза , частично дублирующая CNOT8. [4] |
| CNOT8 | 34 | 3'-5' экзонуклеаза . [4] |
| CNOT9 | 34 | Выполняет некаталитические функции. [14] |
| CNOT10 | 82 | Некаталитическая субъединица, образующая модуль с CNOT11, отсутствующим у грибов. [15] |
| CNOT11 | 55 | Некаталитическая субъединица, образующая модуль с CNOT10, отсутствующим у грибов. [15] |
А Молекулярный вес субъединиц человека из Uniprot.
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Боланд, Андреас; Чен, Ин; Райш, Тобиас; Йонас, Стефани; Кузуоглу-Озтюрк, Дуйгу; Вулболд, Лара; Вайхенридер, Оливер; Изаурральде, Элиза (13 октября 2013 г.). «Структура и сборка НЕ-модуля комплекса CCR4 – НЕ человека». Структурная и молекулярная биология природы . 20 (11). ООО «Спрингер Сайенс энд Бизнес Медиа»: 1289–1297. дои : 10.1038/nsmb.2681 . ISSN 1545-9993 . ПМИД 24121232 . S2CID 24288483 .
- ^ Jump up to: а б Коллар, Мартин А. (29 января 2016 г.). «Комплекс Ccr4-Not является ключевым регулятором экспрессии генов эукариот» . Междисциплинарные обзоры Wiley: РНК . 7 (4). Уайли: 438–454. дои : 10.1002/wrna.1332 . ISSN 1757-7004 . ПМК 5066686 . ПМИД 26821858 .
- ^ Jump up to: а б Миллер, Джейсон Э.; Риз, Джозеф К. (15 марта 2012 г.). «Ccr4-Not complex: контроль эукариотических клеток» . Критические обзоры по биохимии и молекулярной биологии . 47 (4). Информа Великобритания Лимитед: 315–333. дои : 10.3109/10409238.2012.667214 . ISSN 1040-9238 . ПМЦ 3376659 . ПМИД 22416820 .
- ^ Jump up to: а б с Аслам, Ахмед; Миттал, Салони; Кох, Фредерик; Андрау, Жан-Кристоф; Винклер, Г. Себастьян (2009). Викенс, Марвин (ред.). «Субъединицы Ccr4-недеаденилазы CNOT7 и CNOT8 имеют перекрывающиеся роли и модулируют пролиферацию клеток» . Молекулярная биология клетки . 20 (17). Американское общество клеточной биологии (ASCB): 3840–3850. дои : 10.1091/mbc.e09-02-0146 . ISSN 1059-1524 . ПМЦ 2735483 . ПМИД 19605561 .
- ^ Jump up to: а б Чен Дж., Чан Ю.К., Денис К.Л. (март 2002 г.). «CCR4, 3’-5’ экзонуклеаза поли(А) РНК и оцДНК, является каталитическим компонентом цитоплазматической деаденилазы» . ЭМБО Дж . 21 (6): 1414–26. дои : 10.1093/emboj/21.6.1414 . ПМЦ 125924 . ПМИД 11889047 .
- ^ «Ген Энтрез: транскрипционный комплекс CNOT6 CCR4-NOT, субъединица 6» .
- ^ Jump up to: а б Альберт, Томас К.; Ханзава, Хироюки; Легтенберг, Ивонн ИА; де Рюве, Маржолейн Дж.; ван ден Хеувел, Фиона Эй Джей; Коллар, Мартина А.; Боэленс, Рольф; Тиммерс, Х.Т.Марк (1 февраля 2002 г.). «Идентификация субъединицы убиквитин-протеинлигазы в комплексе репрессора транскрипции CCR4-NOT» . Журнал ЭМБО . 21 (3). Уайли: 355–364. дои : 10.1093/emboj/21.3.355 . ISSN 0261-4189 . ПМК 125831 . ПМИД 11823428 .
- ^ Стоуэлл, Джеймс AW; Вебстер, Майкл В.; Кегель, Александр; Вольф, Яна; Шелли, Кэтрин Л.; Пассмор, Лори А. (15 ноября 2016 г.). «Восстановление целевого деаденилирования с помощью комплекса Ccr4-Not и белка домена YTH Mmi1» . Отчеты по ячейкам . 17 (8): 1978–1989. дои : 10.1016/j.celrep.2016.10.066 . ISSN 2211-1247 . ПМК 5120349 . ПМИД 27851962 .
- ^ Чалаби Хагкарим, Нафисе; Гранд, Роджер Дж. (29 октября 2020 г.). «Регуляторные свойства комплекса Ccr4–Not» . Клетки . 9 (11): 2379. doi : 10.3390/cells9112379 . ISSN 2073-4409 . ПМЦ 7692201 . ПМИД 33138308 .
- ^ Альберт, ТК (1 февраля 2000 г.). «Выделение и характеристика человеческих ортологов субъединиц дрожжевого комплекса CCR4-NOT» . Исследования нуклеиновых кислот . 28 (3). Издательство Оксфордского университета (OUP): 809–817. дои : 10.1093/нар/28.3.809 . ISSN 1362-4962 . ПМЦ 102560 . ПМИД 10637334 .
- ^ Колларт, Мартина А. (14 августа 2003 г.). «Глобальный контроль экспрессии генов в дрожжах с помощью комплекса Ccr4-Not» . Джин . 313 : 1–16. дои : 10.1016/S0378-1119(03)00672-3 . ISSN 0378-1119 .
- ^ Jump up to: а б с Чжэн, Сяофэн; Думитру, Ралука; Лэкфорд, Брэд Л.; Фройденберг, Йоханнес М.; Сингх, Аджит П.; Арчер, Тревор К.; Джоти, Раджа; Ху, Гуан (9 апреля 2012 г.). «Cnot1, Cnot2 и Cnot3 поддерживают идентичность ЭСК мыши и человека и ингибируют внеэмбриональную дифференцировку» . Стволовые клетки . 30 (5). Уайли: 910–922. дои : 10.1002/stem.1070 . ISSN 1066-5099 . ПМЦ 3787717 . ПМИД 22367759 .
- ^ Обнимать.; Ким, Дж.; Сюй, Кью; Ленг, Ю.; Оркин, С.Х.; Элледж, SJ (1 апреля 2009 г.). «Полногеномный скрининг РНКи идентифицирует новый транскрипционный модуль, необходимый для самообновления» . Гены и развитие . 23 (7). Лаборатория Колд-Спринг-Харбор: 837–848. дои : 10.1101/gad.1769609 . ISSN 0890-9369 . ПМЦ 2666338 . ПМИД 19339689 .
- ^ Паванелло, Лоренцо; Холл, Бенджамин; Аирхиэн, Благословение; Винклер, Герлоф Себастьян (9 ноября 2018 г.). Центральная область CNOT1 и CNOT9 стимулирует деаденилирование с помощью нуклеазного модуля Ccr4-Not «Центральная область CNOT1 и CNOT9 стимулирует деаденилирование с помощью нуклеазного модуля Ccr4-Not» . Биохимический журнал . 475 (21). Портленд Пресс Лтд.: 3437–3450. дои : 10.1042/bcj20180456 . ISSN 0264-6021 . ПМИД 30309886 . S2CID 52962278 .
{{cite journal}}: Проверять|url=ценность ( помощь ) - ^ Jump up to: а б Мосион, Фабьен; Прев, Бриджит; Серафин, Бертран (2013). «C2ORF29/CNOT11 и CNOT10 образуют новый модуль комплекса CCR4-NOT» . Биология РНК . 10 (2). Информа UK Limited: 267–276. дои : 10.4161/rna.23065 . ISSN 1547-6286 . ПМЦ 3594285 . ПМИД 23232451 .